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题名几种天然产物与CASP3靶点的相互作用机制探索
被引量:16
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作者
张静晓
刘晓洁
杨春
陈盼盼
张丽雷
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机构
湖北民族学院化学与环境工程学院
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出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
2017年第11期1824-1828,共5页
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基金
湖北省教育厅科学技术研究计划项目:鄂西地区特色中药治疗心血管疾病的多尺度计算研究(B2016095)
负责人:张丽雷
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文摘
目的:研究几种中药有效成分与CASP3靶点的相互作用,分析其作用机理及结构特征,为CASP3抑制剂的开发提供参考。方法:基于前期研究,本文选择几种天然产物的有效成分,采用分子对接和分子动力学方法模拟其与CASP3靶点之间的相互作用,通过作用力分析配体和靶点的作用机制。结果:筛选出的丹参酮IIA和野黄芩苷与CASP3靶点的结合能力较强,通过分子动力学方法分别获取了丹参酮IIA和野黄芩苷与CASP3结合的理论稳定结构。丹参酮IIA与CASP3中的Phe256、Ser205、Trp206等4个氨基酸残基具有疏水作用,形成1个氢键。野黄芩苷与CASP3靶点中的Ser249、Trp214、Trp206等9个氨基酸残基具有疏水作用,形成了7个稳定性不同的氢键,其中静电相互作用是其结合更为稳定的主要原因。结论:丹参酮IIA和野黄芩苷能与CASP3靶点形成较为稳定的结合结构,探索相似的结构有利于设计更有效的CASP3抑制剂。
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关键词
天然产物
casp3靶点
细胞凋亡
分子对接
分子动力学
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Keywords
natural products, casp3 target, apoptosis, molecular docking, molecular dynamics
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分类号
R285
[医药卫生—中药学]
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