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生态旅游型乡村的乡土景观植物遗传多样性
1
作者
冯致
姚志
+10 位作者
孙全
李萌
吴秀忠
陈大华
蒋龙
范开放
唐建路
李锴
米小琴
于咏
王义强
《中国生态农业学报(中英文)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期1896-1908,共13页
乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游...
乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游型乡村为研究对象,选取了8个乡土景观物种,采集了整体村域的植物样品,对表型性状进行了测量并开展了ISSR-PCR试验:通过表型性状和分子标记遗传多样性检测分析,计算植物表型Shan-non指数和Nei’s基因多样性指数等,揭示乡土景观植物在不同区域的遗传多样性水平。研究结果表明:基于表型性状聚类分析划分出5类枫香、6类福建青冈、4类青冈、16类榉树、7类香椿、10类马兰、5类野菊和6类蓬蘽的品系资源。8个乡土景观植物的表型变异系数为0.23~0.58,Shannon指数为1.51~6.74。8种植物在整体村域、人工区域和自然区域的Nei’s基因多样性指数分别为0.240~0.536、0.244~0.540和0.193~0.367,多态性位点百分率范围为45.00%~100.00%,等位基因数范围为1.45~2.00,有效等位基因数范围为1.30~1.64。讨论分析表明,8个乡土景观植物的表型(Shannon指数)和分子(Nei’s基因多样性指数)遗传多样性水平总体高于多种景观植物的平均水平,遗传变异丰富;部分乡土植物总体遗传多样性高,但自然区域和人工区域的遗传多样性水平有所差异。在乡村景观建设中应关注乡土景观植物群体的遗传多样性水平的变化,采取相应措施提高群体的遗传多态性和基因分布均匀度,维护乡土景观植物遗传多样性水平,保证乡村生态景观的稳定性和长效性。
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关键词
生态旅游型乡村
乡土景观植物
遗传
多样性
表型Shannon
指数
nei
’s
基因
多样性
指数
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职称材料
西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析
被引量:
3
2
作者
陈集成
蒋钦扬
+1 位作者
陈宝剑
韦英明
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期2270-2273,共4页
【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene3...
【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。
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关键词
西林水牛
RAPD
多态性条带
有效等位
基因
数
nei氏基因多样性指数
SHANNON
多样性
指数
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职称材料
河南益母草野生居群遗传多样性的SCoT分析
被引量:
10
3
作者
张维瑞
韩远记
+2 位作者
薛愧玲
袁王俊
尚富德
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期1022-1026,共5页
目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%...
目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%。Nei’s遗传多样性指数(H)平均值为0.264 2,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为0.39,遗传分化系数(Gst)为0.294 6,种群间基因流为1.197。Mantel Test分析表明,河南益母草居群间的亲缘关系与它们之间的地理距离有着明显的相关性(r=0.366 3,P<0.05)。结论河南野生益母草种群具有较高的遗传多样性,其遗传距离与地理距离存在明显的相关性。
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关键词
益母草
遗传
多样性
nei
’s遗传
多样性
指数
遗传分化系数
基因
流
原文传递
蒲公英遗传多样性的ISSR分析
被引量:
7
4
作者
李喜凤
邱天宝
+4 位作者
张红梅
胡春月
胡利欣
郑楠楠
唐露
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期2025-2029,共5页
目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出16...
目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出166条条带,其中多态性条带152条,平均多态性百分率为90.4%,平均H为0.286 5,平均I为0.437 0;遗传距离和遗传一致度分别为0.156 2~0.590 2和0.554 2~0.855 4;UPMGA法进行聚类分析显示,聚类结果与地理来源有较强的一致性,可以看出来源于同一地区的蒲公英种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论采用ISSR分析蒲公英遗传多样性,蒲公英表现出丰富的多态性,表明可以用ISSR标记技术对蒲公英进行分子水平的遗传多样性分析。
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关键词
蒲公英
ISSR
聚类分析
遗传
多样性
nei
’s
基因
多样性
指数
(H)
Shannon信息
指数
(I)
原文传递
壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析
被引量:
7
5
作者
熊忠臣
史艳财
+3 位作者
漆小雪
邹蓉
蒋运生
韦记青
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期2040-2044,共5页
目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226...
目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226 5,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数(Gst)为0.348 4,基因流(Nm)为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。
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关键词
战骨
种质资源
遗传
多样性
nei
’s
基因
多样
度
指数
Shannon’s
多样性
信息
指数
ISSR
原文传递
我国黄花蒿天然群体遗传多样性的SRAP分析
被引量:
7
6
作者
陈大霞
彭锐
+2 位作者
李隆云
崔广林
吴叶宽
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1591-1595,共5页
目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类...
目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树状图。结果 24对SRAP引物组合扩增出232条带,多态性比率(PPB)为81.47%。SRAP标记的Nei’s基因多样性(H)为0.190 5,Shannon’s信息指数(I)为0.300 0。青蒿素量高的4个地区之间,多态位点百分率在50.00%~61.21%,平均为55.82%,SRAP标记的H值为0.155 7~0.179 3,I值为0.237 9~0.276 6;SRAP检测不同材料间遗传相似系数为0.643 2~0.872 7,平均为0.754 7。结论 SRAP标记能有效地揭示我国野生黄花蒿丰富的遗传多样性,为黄花蒿新品种选育提供了物质基础。
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关键词
黄花蒿
SRAP
遗传
多样性
nei
’s
基因
多样性
(H)
Shannon’S信息
指数
(I)
原文传递
题名
生态旅游型乡村的乡土景观植物遗传多样性
1
作者
冯致
姚志
孙全
李萌
吴秀忠
陈大华
蒋龙
范开放
唐建路
李锴
米小琴
于咏
王义强
机构
中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室
岳麓山实验室碳汇林品种创制中心
湖南省湘西自治州林业局
湖南省湘西自治州森林生态实验站
出处
《中国生态农业学报(中英文)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期1896-1908,共13页
基金
国家自然科学基金项目(32171842)
国家重点研发项目(2019YFD11004031)
中南林业科技大学创新课题(90102-63223068)资助。
文摘
乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游型乡村为研究对象,选取了8个乡土景观物种,采集了整体村域的植物样品,对表型性状进行了测量并开展了ISSR-PCR试验:通过表型性状和分子标记遗传多样性检测分析,计算植物表型Shan-non指数和Nei’s基因多样性指数等,揭示乡土景观植物在不同区域的遗传多样性水平。研究结果表明:基于表型性状聚类分析划分出5类枫香、6类福建青冈、4类青冈、16类榉树、7类香椿、10类马兰、5类野菊和6类蓬蘽的品系资源。8个乡土景观植物的表型变异系数为0.23~0.58,Shannon指数为1.51~6.74。8种植物在整体村域、人工区域和自然区域的Nei’s基因多样性指数分别为0.240~0.536、0.244~0.540和0.193~0.367,多态性位点百分率范围为45.00%~100.00%,等位基因数范围为1.45~2.00,有效等位基因数范围为1.30~1.64。讨论分析表明,8个乡土景观植物的表型(Shannon指数)和分子(Nei’s基因多样性指数)遗传多样性水平总体高于多种景观植物的平均水平,遗传变异丰富;部分乡土植物总体遗传多样性高,但自然区域和人工区域的遗传多样性水平有所差异。在乡村景观建设中应关注乡土景观植物群体的遗传多样性水平的变化,采取相应措施提高群体的遗传多态性和基因分布均匀度,维护乡土景观植物遗传多样性水平,保证乡村生态景观的稳定性和长效性。
关键词
生态旅游型乡村
乡土景观植物
遗传
多样性
表型Shannon
指数
nei
’s
基因
多样性
指数
Keywords
Ecotourism village
Rural landscape plants
Genetic diversity
Phenotypic Shannon index
nei
’s genetic diversity index
分类号
Q14 [生物学—生态学]
S7 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析
被引量:
3
2
作者
陈集成
蒋钦扬
陈宝剑
韦英明
机构
广西大学动物科学技术学院
亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期2270-2273,共4页
基金
广西科学与技术开发计划项目(10100007-4)
广西自然科学基金项目(2013GXNSFAA019095)
文摘
【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。
关键词
西林水牛
RAPD
多态性条带
有效等位
基因
数
nei氏基因多样性指数
SHANNON
多样性
指数
Keywords
Xilin buffalo
RAPD
polymorphic band
allele's effective number
genetic diversity
nei
's gene diversity index
Shannon's information index
分类号
S823.83 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
河南益母草野生居群遗传多样性的SCoT分析
被引量:
10
3
作者
张维瑞
韩远记
薛愧玲
袁王俊
尚富德
机构
河南大学中药研究所
河南大学生命科学学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期1022-1026,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(30971076)
河南省高校创新人才基金资助项目(094100510018)
文摘
目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%。Nei’s遗传多样性指数(H)平均值为0.264 2,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为0.39,遗传分化系数(Gst)为0.294 6,种群间基因流为1.197。Mantel Test分析表明,河南益母草居群间的亲缘关系与它们之间的地理距离有着明显的相关性(r=0.366 3,P<0.05)。结论河南野生益母草种群具有较高的遗传多样性,其遗传距离与地理距离存在明显的相关性。
关键词
益母草
遗传
多样性
nei
’s遗传
多样性
指数
遗传分化系数
基因
流
Keywords
Leonurus artemisia (Lour.) S. Y. Hu
genetic diversity
nei
's genetic diversity index
genetic differentiation coefficient
gene flow
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
蒲公英遗传多样性的ISSR分析
被引量:
7
4
作者
李喜凤
邱天宝
张红梅
胡春月
胡利欣
郑楠楠
唐露
机构
河南中医学院药学院
河南省兽药监察所
郑州大学医药科学研究院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期2025-2029,共5页
基金
河南省教育厅自然科学研究项目(2010A360010)
郑州市普通科技攻关计划(10PTGS485-1)
文摘
目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出166条条带,其中多态性条带152条,平均多态性百分率为90.4%,平均H为0.286 5,平均I为0.437 0;遗传距离和遗传一致度分别为0.156 2~0.590 2和0.554 2~0.855 4;UPMGA法进行聚类分析显示,聚类结果与地理来源有较强的一致性,可以看出来源于同一地区的蒲公英种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论采用ISSR分析蒲公英遗传多样性,蒲公英表现出丰富的多态性,表明可以用ISSR标记技术对蒲公英进行分子水平的遗传多样性分析。
关键词
蒲公英
ISSR
聚类分析
遗传
多样性
nei
’s
基因
多样性
指数
(H)
Shannon信息
指数
(I)
Keywords
Taraxaci Herba.
ISSR
cluster analysis
genetic diversity
nei
’s genetic diversity index(H)
Shannon’s information index(I)
分类号
R282.2 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析
被引量:
7
5
作者
熊忠臣
史艳财
漆小雪
邹蓉
蒋运生
韦记青
机构
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期2040-2044,共5页
基金
广西科技攻关项目(桂科重1298001-1-5)
广西自然科学基金项目(0991227)
+1 种基金
广西科技创新能力建设项目(0992028-10)
广西植物研究所基本业务费项目(桂植业12011)
文摘
目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226 5,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数(Gst)为0.348 4,基因流(Nm)为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。
关键词
战骨
种质资源
遗传
多样性
nei
’s
基因
多样
度
指数
Shannon’s
多样性
信息
指数
ISSR
Keywords
Premna fulva Craib.
germplasm resources
genetic diversity
nei
’s genetic diversity index(H)
Shannon’s information index(I)
ISSR
分类号
R282.7 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
我国黄花蒿天然群体遗传多样性的SRAP分析
被引量:
7
6
作者
陈大霞
彭锐
李隆云
崔广林
吴叶宽
机构
重庆市中药研究院中药种植研究所重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1591-1595,共5页
基金
国家科技攻关计划(2004BA721A32)
国家科技支撑计划(2006BAI09B01-04
+1 种基金
2006BAI09B02-04)
国家中医药管理局行业专项(201107011)
文摘
目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树状图。结果 24对SRAP引物组合扩增出232条带,多态性比率(PPB)为81.47%。SRAP标记的Nei’s基因多样性(H)为0.190 5,Shannon’s信息指数(I)为0.300 0。青蒿素量高的4个地区之间,多态位点百分率在50.00%~61.21%,平均为55.82%,SRAP标记的H值为0.155 7~0.179 3,I值为0.237 9~0.276 6;SRAP检测不同材料间遗传相似系数为0.643 2~0.872 7,平均为0.754 7。结论 SRAP标记能有效地揭示我国野生黄花蒿丰富的遗传多样性,为黄花蒿新品种选育提供了物质基础。
关键词
黄花蒿
SRAP
遗传
多样性
nei
’s
基因
多样性
(H)
Shannon’S信息
指数
(I)
Keywords
drtemisia annua L.
SRAP
genetic diversity
nei
's gene diversity (H)
Shannon's information index (I)
分类号
R282.7 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生态旅游型乡村的乡土景观植物遗传多样性
冯致
姚志
孙全
李萌
吴秀忠
陈大华
蒋龙
范开放
唐建路
李锴
米小琴
于咏
王义强
《中国生态农业学报(中英文)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析
陈集成
蒋钦扬
陈宝剑
韦英明
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
下载PDF
职称材料
3
河南益母草野生居群遗传多样性的SCoT分析
张维瑞
韩远记
薛愧玲
袁王俊
尚富德
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2013
10
原文传递
4
蒲公英遗传多样性的ISSR分析
李喜凤
邱天宝
张红梅
胡春月
胡利欣
郑楠楠
唐露
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012
7
原文传递
5
壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析
熊忠臣
史艳财
漆小雪
邹蓉
蒋运生
韦记青
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012
7
原文传递
6
我国黄花蒿天然群体遗传多样性的SRAP分析
陈大霞
彭锐
李隆云
崔广林
吴叶宽
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2011
7
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