西藏青稞品系藏青13氮胁迫的蛋白组学分析

氮元素过多过少都可能导致植株表型发生明显变化,甚至影响植株的正常生长发育。为了探究西藏青稞对不同氮浓度的响应,本研究采用藏青13作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, Itraq)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对适氮、缺氮、低氮和高氮处理样品的蛋白谱进行分析。iTRAQ测序结果表明,在根组织共鉴定得到8589个蛋白质,肽链长度主要分布在6～18个氨基酸之间;在叶组织中鉴定得到4608个蛋白质,肽链长度主要分布在6～16个氨基酸之间。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及次生代谢生物合成、信号转导、防御机制等多个方面。在不同氮素浓度处理下,其中缺氮处理与对照(适氮处理)相比,所筛选到的差异蛋白最多,有1518个蛋白,其中810个上调,708个下调。四个处理共同筛选到的差异蛋白共富集到47个功能项中,包含20个生物过程GO功能项,15个细胞组分GO功能项,12个分子功能GO功能项。