江西省三个地方鸡种群体有效规模的估算

在鸡1号染色体(GGA1)的Contig.060226.1上一个500 kb的区域选取30个SNP位点,研究江西省三个地方鸡种(宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡)的单核苷酸多态性及连锁不平衡模式,估算其不同世代的群体有效规模大小。结果显示:在鸡驯养的较早期阶段(t=769),各品种的群体有效规模较大,宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡分别为4 074、3 090、1 480;在鸡驯养的较晚期阶段,宁都黄鸡(t≤59)的群体有效规模为550,白耳黄鸡、安义瓦灰鸡(t≤45)分别为300、277。使用Sved模型对连锁不平衡系数r^2及传递的物理距离进行拟合,结果发现:宁都黄鸡、安义瓦灰鸡拟合状况良好(P=0.0272,R2=0.9196;P=0.0193,R^2=0.7276);白耳黄鸡虽未达到显著水平(P=0.3837,R^2=0.2541),但也表现出逐步递减的趋势,其r^2总变异方差的25.41%是由传递距离引起的。表明对宁都黄鸡、安义瓦灰鸡群体有效规模的估算相对准确,对白耳黄鸡群体有效规模的估算可能有偏。研究结果对于江西省三个地方鸡种特别是宁都黄鸡、安义瓦灰鸡的原位保存有重要的理论指导意义。

宁都黄鸡粪便基因组DNA提取方法比较及盲肠微生物组成分析

要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探索肠道微生物在宁都黄鸡生长中的作用,乃至未来禽微生态制剂的研发奠定基础。结果表明:QIAGEN、BioTeke或BIOMIGA公司试剂盒提取的基因组DNA用于扩增子测序,所得肠道微生物菌群Beta多样性分析结果无显著差异(P>0.05),而Shannon指数和Simpson指数组间差异显著(P<0.05),提示采用不同试剂盒可能对高通量测序分析结果产生影响。宁都黄鸡肠道微生物组成丰富,共检测到21个门、50个纲、80个目、134个科、268个属,相对丰度较高的菌群是拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria),相对丰度较高的前3个属分别是甲烷杆菌属(Methanobrevibacter)、理研菌科RC9肠菌群(Rikenellaceae RC9 gut group)和拟杆菌属(Bacteroides)。宁都黄鸡盲肠菌群组成特征再次证明了宿主系统发生地位对肠道菌群结构起到的重要影响作用。

生化指标值与宁都黄鸡饲养方式的相关性研究

为探索饲养方式对宁都黄鸡生长的影响,采集笼养和散养2种不同饲养方式下宁都黄鸡的血清和盲肠内容物,对多项血清生化指标值以及盲肠消化酶活性进行检测,并使用SPSS软件对检测指标值与饲养方式进行双变量相关性分析。结果表明:血清中的葡萄糖含量、总胆固醇含量及肠道胰蛋白酶活性与饲养方式间均有极显著相关性;血清中白蛋白含量与饲养方式间有显著相关性。散养组血清白蛋白和肠道胰蛋白酶活性均极显著(P<0.01)高于笼养组;而血清中的总胆固醇和葡萄糖含量均极显著(P<0.01)低于笼养组。可见,与笼养饲养方式相比,散养条件更能促进宁都黄鸡对蛋白质、葡萄糖和脂类的吸收和代谢。

宁都黄鸡生化指标与体重的相关性研究

[目的]以宁都黄鸡为试验对象,分析宁都黄鸡血清营养物质含量和血清免疫活性物质及盲肠消化酶活性与体重的相关性。[方法]选取健康状态良好的雄性宁都黄鸡150羽,散养条件下饲养至72日龄,按照体重由高到低分为较重组、中等组和较轻组。每组随机抽取样本10只,当日屠宰取血、静置并离心取血清,解剖后无菌取盲肠段内容物,以上样品置于-70℃冰箱中保存。血清总蛋白含量采用双缩脲常规法检测;血清白蛋白含量采用溴甲酚绿法检测;血清葡萄糖含量采用邻甲苯胺法检测,血清总胆固醇和甘油三酯含量采用GPO-PAP法测定;血清超氧化物歧化酶活性采用羟胺法测定;过氧化氢酶活性采用钼酸铵法测定;血清谷胱甘肽过氧化物酶和盲肠脂肪酶、胰蛋白酶活性均采用比色法测定;盲肠α淀粉酶活性采用淀粉-碘显色法测定。[结果]各体重组甘油三酯含量以及过氧化氢酶、总超氧化物歧化酶、胰蛋白酶和α淀粉酶活性均无显著差异,各生化指标与体重无相关性;各体重组总胆固醇含量和脂肪酶活性无显著差异,但与体重分别呈极显著正相关(P<0.01)和显著负相关(P<0.05);各体重组谷胱甘肽过氧化物酶活性存在极显著差异(P<0.01),且与体重呈极显著负相关。[结论]该研究结果对宁都黄鸡饲料中营养的合理配比及外源性消化酶的适时添加具有一定的指导作用。

宁都黄鸡冠齿数与生产性能的关系分析

为了探讨宁都黄鸡冠齿数是否能辅助鸡育种,试验以485只宁都黄鸡为研究对象,分析了0~16周龄不同鸡冠齿数与生产性能的关系。结果表明:在0~16周龄时,冠齿数多的鸡体重与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在4,6,8,10,12,14,16周龄时,冠齿数多的鸡冠高、冠长、冠厚和胫长与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在4,6,8,16周龄时,冠齿数多的鸡胫围与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在10,12,14,16周龄时,冠齿数多的鸡肉垂长和肉垂厚与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在16周龄时,冠齿数多的鸡胸深、龙骨长、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重均与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05)。宁都黄鸡冠齿数与4,6,8,10,12,14,16周龄的冠高、冠长、冠厚和胫长以及0~16周龄的体重关联紧密,说明宁都黄鸡冠齿数能辅助育种。