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白菜种子cDNA酵母文库的构建及BrTTG1互作蛋白的筛选及分析
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作者 任延靖 张鲁刚 +2 位作者 赵孟良 李江 邵登魁 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期223-232,共10页
【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库... 【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库,通过gateway技术构建诱饵载体pGBKT7-TTG1并进行酵母双杂交筛库。【结果】酵母文库库容为1.2×10^(7)CFU,文库滴度是5.0×10^(7)CFU/mL,插入片段平均长度大于1000 bp,诱饵载体在酵母中无自激活活性。通过构建的诱饵载体pGBKT7-TTG1与构建的cDNA文库杂交,共获得了38个阳性互作蛋白,功能预测显示其中一个蛋白注释为MYB转录因子,注释为MYB73,序列分析结果显示该基因含有R2R3-MYB型抑制子保守基序C1和C2,推测该基因为白菜中参与种皮颜色形成的R2R3-MYB型抑制子,暗示着白菜中可能存在不同MYB转录因子参与的调控网络,影响着原花青素的形成。【结论】本研究构建了白菜种子组织的酵母双杂交cDNA文库,获得了38个TTG1阳性互作蛋白,首次挖掘到了可能影响白菜种皮颜色原花青素形成的R2R3-MYB型抑制子MYB73,为后期探究白菜种皮原花青素的调控网络奠定良好的基础。 展开更多
关键词 白菜种皮颜色 cdna文库 酵母双杂交 互作蛋白 MYB73 基因克隆 表达分析
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CONSTRUCTION AND SIGNIFICANCE OF DIRECTIONAL cDNA EXPRESSION LIBRARY FROM HUMAN MYELOMA CELL
2
作者 陈刚 张王刚 +7 位作者 付杰 曹星梅 赵万红 韩月恒 赵爱志 李福洋 刘新平 药立波 《Journal of Shanghai Second Medical University(Foreign Language Edition)》 2003年第2期87-91,共5页
Objective To construct human myeloma cell cDNA expression library as to screen myeloma tumor antigen. Methods Total RNA and purified mRNA were extracted from human myeloma cell line HMy2. First and second strand cDNA ... Objective To construct human myeloma cell cDNA expression library as to screen myeloma tumor antigen. Methods Total RNA and purified mRNA were extracted from human myeloma cell line HMy2. First and second strand cDNA were synthesized through reverse transcription. After blunting, the cDNA fragments were ligated with EcoR I adapters. Then the cDNAs were digested by Xho I, and smaller than 400bp were removed by Sephacryl-S400 spin column, the remaining were ligated with λZAP vector. The recombinants were packaged in vitro, and a small portion of packaged phage was used to infect E.coli XL1-Blue-MRF for titration. The recombinants were examined by color selection. In order to evaluate the size of cDNA inserts and the diversity of library, the pBK-CMV phagemid were excised from the ZAP express vector by using ExAssist helper phage with XLOLR strain , and then the pBK-CMV phagemid were digested by Xho I and EcoR I. Results The HMy2 cell line cDNA library consisting of 1.58×10 6 recombinant bacteriophages was constructed with the recombinant ratio 99.6%. The average length of the recombinant exogenous inserts was about 1.7kb.Conclusion The constructed cDNA library are deserved to screen target clones. 展开更多
关键词 myeloma HMy2 λZAP cdna library clone
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人胚鼻咽上皮细胞cDNA文库的构建及鼻咽癌相关基因的筛选 被引量:8
3
作者 张必成 曹利 +4 位作者 钱骏 余鹰 李伟芳 向娟娟 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第2期302-306,共5页
为了进一步分离人鼻咽组织特异性表达基因和鼻咽癌特异相关基因 ,采用SMART (switchingmechanismat 5′endofRNAtranscript)技术 ,构建了人胚鼻咽上皮cDNA文库 .从原代培养的人胚鼻咽上皮分离总RNA并纯化mRNA ,利用经修饰的oligo (dT)引... 为了进一步分离人鼻咽组织特异性表达基因和鼻咽癌特异相关基因 ,采用SMART (switchingmechanismat 5′endofRNAtranscript)技术 ,构建了人胚鼻咽上皮cDNA文库 .从原代培养的人胚鼻咽上皮分离总RNA并纯化mRNA ,利用经修饰的oligo (dT)引物 (含sfiⅠB酶切位点 )合成cDNA第一链 ,同时根据真核生物mRNA5′端帽子结构特点 ,利用SMART核苷酸 (含sfiⅠA酶切位点 )作为cDNA第一链在mRNA 5′端延伸出去的模板 ,进而以此序列为引物利用LD PCR (long distance PCR)合成双链cDNA ,双链cDNA经sfiⅠ (ⅠA和ⅠB)酶切和过柱分级分离后 ,克隆入经sfiⅠ酶切的λTrip1EX2载体后经体外包装而成cDNA文库 .结果表明 ,原始人胚鼻咽上皮cDNA文库获得 1 0× 10 6个重组子 ,重组率达 96 % .文库扩增后 ,滴度达 7 8× 10 9pfu ml,插入cDNA平均长度为 1 2kb ,用PCR从该文库扩增出本实验室新克隆的鼻咽癌相关基因NAG4的全长cDNA .构建的人胚鼻咽上皮cDNA文库具有良好的质量 ,该cDNA文库为进一步筛选。 展开更多
关键词 鼻咽上皮细胞 cdna文库 鼻咽癌 筛选 胚胎 基因克隆 NAG4
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猪带绦虫六钩蚴cDNA文库的构建及免疫原基因的筛选与克隆 被引量:6
4
作者 景志忠 郭爱疆 +2 位作者 海岗 宗瑞谦 才学鹏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期391-396,共6页
研究避开庞大的猪带绦虫基因组DNA,以构建六钩蚴发育阶段的cDNA表达文库为策略,利用pSPORT1质粒表达载体首次成功构建了表达文库。经库容量、重组率和代表性测定,库容量达5.0×106,重组率100%,用特异性引物能扩增出六钩蚴发育阶段1... 研究避开庞大的猪带绦虫基因组DNA,以构建六钩蚴发育阶段的cDNA表达文库为策略,利用pSPORT1质粒表达载体首次成功构建了表达文库。经库容量、重组率和代表性测定,库容量达5.0×106,重组率100%,用特异性引物能扩增出六钩蚴发育阶段10ku基因、18ku基因和45W基因家族的A型、B型、C型转录本,说明文库质量高,代表性强。应用快速筛选质粒表达文库和克隆免疫原基因的技术,成功地筛选和克隆到TsO1基因,其完整阅读框架(ORF)为393bp。将其登录到GenBank(AY327451),经BLAST分析,证实是猪带绦虫六钩蚴发育阶段的1个新免疫原基因。 展开更多
关键词 猪带绦虫 六钩蚴 免疫原 cdna文库 克隆 构建 cdna表达文库 基因组DNA 发育阶段 质粒表达载体 特异性引物 BLAST 基因家族 快速筛选 库容量 代表性 重组率 转录本
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紫杆柽柳cDNA文库构建与硫氧还蛋白基因的克隆 被引量:10
5
作者 王玉成 杨传平 +1 位作者 刘桂丰 姜静 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第5期667-673,共7页
以NaHCO3胁迫的紫杆柽柳(Tamarix androssowii)为材料建立了cDNA文库.经检测,文库的初始滴度为5.7×105pfu,重组率为96%,插入片段的长度在0.3~3.0kb之间,平均长度为1.2kb,扩增后文库的滴度为4.0×109pfu/ml.对文库克隆进行随... 以NaHCO3胁迫的紫杆柽柳(Tamarix androssowii)为材料建立了cDNA文库.经检测,文库的初始滴度为5.7×105pfu,重组率为96%,插入片段的长度在0.3~3.0kb之间,平均长度为1.2kb,扩增后文库的滴度为4.0×109pfu/ml.对文库克隆进行随机测序,获得了紫杆柽柳的硫氧还蛋白(Thioredoxin)基因序列.生物信息学分析表明获得的硫氧还蛋白基因全长683bp,其中5'非翻译区长56bp,3'非翻译区长204bp,开放读码框长423bp,编码140个氨基酸,蛋白的分子量为15.1kD,理论等电点为5.59,其氨基酸序列中具有硫氧还蛋白的保守活性位点'WCGPC'序列,Clustal分析表明该硫氧还蛋白与蓖麻(Ricinus communis)的硫氧还蛋白氨基酸序列同源性高,达65%.本研究构建的cDNA文库为柽柳基因克隆和系统研究柽柳抗逆分子机理奠定了基础. 展开更多
关键词 紫杆柽柳 cdna 文库构建 硫氧还蛋白基因 基因克隆
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弓形虫昆山分离株速殖子期表达型cDNA文库的构建及鉴定 被引量:12
6
作者 杨秋林 陆惠民 +1 位作者 邬敏辰 黄伟达 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2000年第5期25-27,共3页
目的 构建弓形虫速殖子期表达的基因的完整长度cDNA文库。方法 用CF - 11纤维素柱快速提纯速殖子 ,以盐酸异硫氰酸胍 (AGPC)一步法抽提总RNA ,oligo -dT纤维素分离mRNA后 ,用ClonTech公司的SmartTMPCRcDNA文库构建试剂盒 ,构建了弓形... 目的 构建弓形虫速殖子期表达的基因的完整长度cDNA文库。方法 用CF - 11纤维素柱快速提纯速殖子 ,以盐酸异硫氰酸胍 (AGPC)一步法抽提总RNA ,oligo -dT纤维素分离mRNA后 ,用ClonTech公司的SmartTMPCRcDNA文库构建试剂盒 ,构建了弓形虫昆山分离株的表达型文库。结果 获得 5× 10 6个独立克隆 ,重组率为 99% ,插入片段的平均长度为 1kb。 展开更多
关键词 弓形虫 cdna文库 克隆 速殖子期
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植酸酶基因表达与调控机制研究(Ⅱ)──番茄幼苗cDNA文库构建与植酸酶基因筛选 被引量:4
7
作者 李明刚 刘迅 +3 位作者 张敏 龚雪琴 郝亚桓 姬生健 《烟台大学学报(自然科学与工程版)》 CAS 1999年第1期34-41,共8页
采用异硫氰酸胍法从发芽3~4d的番茄幼苗中提取出总RNA,用Oligo(dT)纤维素亲和层析分离纯化mRNA.以mRNA为模板,Oligo(dT)为引物用逆转录法合成双链cDNA.将cDNA与EcoRI接头连接后克隆... 采用异硫氰酸胍法从发芽3~4d的番茄幼苗中提取出总RNA,用Oligo(dT)纤维素亲和层析分离纯化mRNA.以mRNA为模板,Oligo(dT)为引物用逆转录法合成双链cDNA.将cDNA与EcoRI接头连接后克隆到表达载体λgt11的单一EcoRI位点,经体外包装后感染宿主菌Y1090,成功地构建了完整的番茄幼苗cDNA文库.用颜色筛选法筛选重组子,然后用植酸酶抗体做探针进行免疫筛选,得到两个阳性克隆.挑取阳性克隆噬菌斑扩增后纯化DNA,经琼脂糖凝胶电泳鉴定,显示确有外源DNA存在.该插入片断序列测定正在进行. 展开更多
关键词 番茄 植酸酶 cdna文库 克隆 基因表达 幼苗
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鳜碱性肌球蛋白轻链基因cDNA的克隆及其发育表达分析 被引量:10
8
作者 周瑞雪 黄斌 +6 位作者 蒙涛 褚武英 成嘉 赵发兰 陈敦学 宾石玉 张建社 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期927-934,共8页
肌球蛋白轻链是构成鱼类肌纤维主要组成部分,在鱼类肌肉生长和收缩过程中具有重要作用。鳜鱼具有生长快、肉质细嫩、味道鲜美、营养成分高等优良的性状。研究通过构建鳜肌肉组织cDNA文库分离到两个碱性肌球蛋白轻链基因,即MLC1和MLC3基... 肌球蛋白轻链是构成鱼类肌纤维主要组成部分,在鱼类肌肉生长和收缩过程中具有重要作用。鳜鱼具有生长快、肉质细嫩、味道鲜美、营养成分高等优良的性状。研究通过构建鳜肌肉组织cDNA文库分离到两个碱性肌球蛋白轻链基因,即MLC1和MLC3基因。序列分析显示MLC1和MLC3基因cDNA序列全长分别为1237bp和1070bp,分别编码192和150个氨基酸,除去MLC1N端多出的42个氨基酸残基,MLC1与MLC3氨基酸序列同源性为80.3%。通过PROSITEtools软件预测显示两种轻链都具有两个保守的EF-手相结构,其中第二个EF-hand结构除前三个氨基酸外同源性达100%。鱼类MLC3轻链N端没有高等脊椎动物MLC3特有标志序列。采用实时荧光定量PCR方法对鳜鱼MLC1和MLC3发育性表达分析表明,在原肠期开始有低量表达,与原肠期、尾芽期和肌肉效应期相比,心搏期和仔鱼期MLC1和MLC3表达量显著升高。研究结果首次提供了鳜肌肉组织肌球蛋白主要结构基因的分子生物学信息以及它们在鳜肌肉组织发生和功能的相关性。 展开更多
关键词 碱性肌球蛋白轻链 克隆 cdna文库 发育表达
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弓形虫RH株速殖子期表达型cDNA文库的构建及鉴定 被引量:7
9
作者 杨秋林 陆惠民 +1 位作者 邬敏辰 黄伟达 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2001年第2期82-86,共5页
为构建弓形虫速殖子期表达的基因的完整长度cDNA文库 ,用CF 11纤维素柱快速提纯速殖子 ,以盐酸异硫氰酸胍 (AGPC)一步法抽提总RNA ,oligo dT纤维素分离mRNA后 ,用ClonTech公司的SmartTMPCRcDNA文库构建试剂盒 ,构建了弓形虫RH株的表达... 为构建弓形虫速殖子期表达的基因的完整长度cDNA文库 ,用CF 11纤维素柱快速提纯速殖子 ,以盐酸异硫氰酸胍 (AGPC)一步法抽提总RNA ,oligo dT纤维素分离mRNA后 ,用ClonTech公司的SmartTMPCRcDNA文库构建试剂盒 ,构建了弓形虫RH株的表达型文库。获得 5× 10 6个独立克隆 ,重组率为 99% ,插入片段的平均长度约为 1kb。根据已知序列设计引物 ,从cDNA文库中扩增出编码棒状体蛋白 1(ROP1)的基因 (不含编码信号肽的序列 ) ,本文库可望用于弓形虫疫苗研究的候选基因的筛选。 展开更多
关键词 弓形虫 cdna文库 克隆 速殖期
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花鳗鲡脑cDNA文库的构建及GnRH基因克隆与表达分析 被引量:5
10
作者 黄海 张勇 +5 位作者 刘晓春 尹绍武 杨丽萍 朱培 齐兴柱 林浩然 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期214-221,共8页
以花鳗鲡脑组织为材料,提取总RNA,应用CloneminerTM文库构建试剂盒构建cDNA文库。经检测,文库的滴度为4.3×106cfu/mL,总容量为5.16×107cfu/mL,阳性克隆率为99.6%,插入片段0.43—3.2kb之间,平均插入片段大小为1532bp。以文库... 以花鳗鲡脑组织为材料,提取总RNA,应用CloneminerTM文库构建试剂盒构建cDNA文库。经检测,文库的滴度为4.3×106cfu/mL,总容量为5.16×107cfu/mL,阳性克隆率为99.6%,插入片段0.43—3.2kb之间,平均插入片段大小为1532bp。以文库为模板,克隆获得花鳗鲡两种类型的促性腺激素释放激素(mGnRH和cGnRH-II)cDNA序列。序列分析表明,花鳗鲡mGnRHcDNA开放阅读框(ORF)包含276个碱基,编码91个氨基酸,其中包括22个氨基酸的蛋白质前体信号肽(1—22位氨基酸)、mGnRH十肽(23—32位氨基酸)、一个三肽裂解位点(33—35位氨基酸)和56个氨基酸的GnRH相关肽(36—91位氨基酸);花鳗鲡cGnRH-IIcDNA开放阅读框包含264个碱基,编码87个氨基酸,其中包括24个氨基酸的蛋白质前体信号肽(1—24位氨基酸)、cGnRH-II十肽(25—34位氨基酸)、一个三肽裂解位点(34—36位氨基酸)和50个氨基酸的GnRH相关肽(37—87位氨基酸)。序列同源性分析表明,花鳗鲡mGnRH、cGnRH-IIcDNA与日本鳗鲡之间的相似性率高达98%;与鲑形目、鲈形目、鲽形目鱼类的相似率为73%—78%;而与鲤形目鱼类的相似性相对较低(63%—67%)。采用RT-PCR方法分析了两种GnRH基因在花鳗鲡雌雄个体中的表达,结果表明两基因在雌雄个体的组织表达模式无明显差异;但mGnRH基因在雌雄个体内表达部位多于cGnRH-II的。 展开更多
关键词 花鳗鲡 cdna文库 促性腺激素释放激素 克隆 基因表达
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南移养殖的刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库的构建及原肌球蛋白基因的研究 被引量:5
11
作者 崔静 李太武 +6 位作者 苏秀榕 李晔 徐静 周君 应琪 王中华 李松伟 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期850-856,共7页
以南移养殖的刺参为实验材料,采用非均一化的Oliga-dT引物定向克隆技术构建了南移刺参混合组织的cDNA文库。对文库质量的分析结果表明,cDNA文库的库容量为2.2×107cfu,重组率达95.8%,平均插入片段长度750bp左右。挑取cDNA克隆进行5... 以南移养殖的刺参为实验材料,采用非均一化的Oliga-dT引物定向克隆技术构建了南移刺参混合组织的cDNA文库。对文库质量的分析结果表明,cDNA文库的库容量为2.2×107cfu,重组率达95.8%,平均插入片段长度750bp左右。挑取cDNA克隆进行5’端测序,成功测序185个反应,分析得到136个单基因簇(Unigene),其中包括40个重叠群(Contigs)、96个单拷贝EST(Singletons)。结果表明,克隆南移养殖的刺参原肌球蛋白(tropomyosin,Trp)cDNA全长序列为1112bp,ORF编码284个氨基酸,其预测蛋白的分子量为33.27kDa,等电点为4.56。该氨基酸序列与紫石海胆、南极大磷虾、锯缘青蟹、文昌鱼、河蟹、家蚕同源性分别为62%、51%、46%、49%、47%、46%。 展开更多
关键词 刺参 cdna文库 基因克隆 原肌球蛋白基因
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应用抑制性消减杂交技术构建人肝癌组织特异表达cDNA文库 被引量:4
12
作者 王顺启 冯占宁 +6 位作者 刘国红 王广良 程华 王同顺 倪虹 宋文芹 陈力 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期115-118,共4页
为克隆和筛选肝癌特异表达基因.应用抑制消减杂交技术对肝癌及癌旁组织进行消减杂交,产物PCR扩增后,进行克隆.共得到1820个克隆,1776个克隆有100~800 bp的插入片断,阳性率达98%,说明人肝癌组织特异表达cDNA消减文库构建成功,同时我们对... 为克隆和筛选肝癌特异表达基因.应用抑制消减杂交技术对肝癌及癌旁组织进行消减杂交,产物PCR扩增后,进行克隆.共得到1820个克隆,1776个克隆有100~800 bp的插入片断,阳性率达98%,说明人肝癌组织特异表达cDNA消减文库构建成功,同时我们对cDNA克隆进行测序,证明这些克隆的功能是和肝癌的发生高度相关的.抑制消减杂交是克隆特异表达基因的有效方法. 展开更多
关键词 抑制消减杂交 肝癌 基因文库 cdna克隆
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用RACE结合cDNA文库筛选的方法获取新的锌指蛋白基因 被引量:8
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作者 杜占文 刘立仁 张俊武 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期329-331,共3页
大多数有重要功能的蛋白质都含相应的由保守氨基酸顺序组成的功能结构域。本文首先根据蛋白质功能结构域保守氨基酸序列设计简并引物 ,用PCR方法扩增出基因EST序列 ,再利用改进的快速扩增cDNA末端(RACE)方法从cDNA文库中扩增出基因非同... 大多数有重要功能的蛋白质都含相应的由保守氨基酸顺序组成的功能结构域。本文首先根据蛋白质功能结构域保守氨基酸序列设计简并引物 ,用PCR方法扩增出基因EST序列 ,再利用改进的快速扩增cDNA末端(RACE)方法从cDNA文库中扩增出基因非同源部位 ,然后以非同源序列为探针 ,筛选cDNA文库。利用此方法成功地从人骨髓cDNA文库中克隆到几个编码锌指蛋白并代表原有EST的新的全长cDNA。这一策略也应适用于筛选编码具有其他序列保守性功能结构域蛋白的基因。 展开更多
关键词 RACE cdna文库 筛选 锌指蛋白基因 非同源DNA序列 新基因
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cDNA文库构建及其在植物抗性研究中的应用 被引量:6
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作者 许兰珍 何永睿 +2 位作者 姜国金 刘小丰 陈善春 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第3期660-662,664,共4页
cDNA文库是指生物不同生长发育时期特定组织或器官所转录的全部mRNA经反转录形成的cDNA与载体连接后形成的克隆的集合,cDNA文库是在基因组水平上研究某一生物特定器官、组织和发育时期基因表达的前提和基础。笔者就近年来cDNA文库的构... cDNA文库是指生物不同生长发育时期特定组织或器官所转录的全部mRNA经反转录形成的cDNA与载体连接后形成的克隆的集合,cDNA文库是在基因组水平上研究某一生物特定器官、组织和发育时期基因表达的前提和基础。笔者就近年来cDNA文库的构建及其在植物抗性研究中的应用作一综述。 展开更多
关键词 cdna文库 植物抗性 基因克隆 基因表达 EST
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利用SMART技术构建疣缟芋螺毒管cDNA噬菌体文库及芋螺毒素新基因的克隆 被引量:4
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作者 李宝珠 高炳淼 +4 位作者 吴勇 于津鹏 吴潇洒 罗素兰 长孙东亭 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期484-488,共5页
利用RNA 5'末端移动反转录(switching mechanism at 5'end RNA transcription,SMART)技术构建及鉴定疣缟芋螺毒管cDNA噬菌体文库,克隆新型芋螺毒素基因.提取疣缟芋螺毒管总RNA,用RT-PC反转录成单链cDNA(single-stranded cDNA,ss... 利用RNA 5'末端移动反转录(switching mechanism at 5'end RNA transcription,SMART)技术构建及鉴定疣缟芋螺毒管cDNA噬菌体文库,克隆新型芋螺毒素基因.提取疣缟芋螺毒管总RNA,用RT-PC反转录成单链cDNA(single-stranded cDNA,ss-cDNA),长距离PCR(long-distance PCR,LD-PCR)扩增合成双链cDNA(double-stranded cDNA,ds-cDNA),依次用蛋白酶K和SfiⅠ酶进行酶切孵育,用CHROMA SPIN-400柱进行分级分离.得到的ds-cDNA与λTripIE×2噬菌体载体体外连接并体外包装,感染大肠杆菌E.coli XL1-blue,测定原始文库滴度和重组率.进行文库扩增,测定扩增文库滴度.用PCR鉴定插入cDNA片段的大小,构建的疣缟芋螺毒管cDNA噬菌体原始文库滴度为1.47×106pfu/mL,重组率为90.72%,扩增文库的滴度为4.07×108pfu/mL,插入cDNA片段为200~1 200 bp.利用SMART技术成功构建了疣缟芋螺毒管cDNA噬菌体文库并克隆出新型芋螺毒素基因,为芋螺毒素基因的筛选和鉴定奠定了基础. 展开更多
关键词 疣缟芋螺 噬菌体 cdna文库 SMART技术 基因克隆
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大鼠脑cDNA文库的构建 被引量:4
16
作者 宋学文 赵崇 +2 位作者 周仁 郭善一 张镜宇 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第2期169-172,共4页
采用简单高效的cDNA合成技术制备Wistar大鼠脑cDNA基因文库,以纯化的poly(A)+-RNA为模板,含NotI切点的oligo-(dT)15为引物,在反转录酶的作用下,合成第一股单链cDNA;用E。coli... 采用简单高效的cDNA合成技术制备Wistar大鼠脑cDNA基因文库,以纯化的poly(A)+-RNA为模板,含NotI切点的oligo-(dT)15为引物,在反转录酶的作用下,合成第一股单链cDNA;用E。coliRNaseH除去模板RNA,并以E.coliDNA聚合酶I,E.coliDNA连接酶和T4DNA聚合酶催化合成cDNA第二条链,即成为双链cDNA;此双股cDNA除0.5μg用于插入pSPORTI载体,转入E.coliDH5α,建成cDNA文库外,其余保存在-20℃,以此cDNA为模板,应用PCR方法,先后克隆了谷氨酸脱羧酶(GAD,1800bP)、神经元特异性烯醇化酶(NSE,1340bP),甲状腺激素受体(T3-receptor,1230bp)、胆囊收缩素(CCK,345bp)的全编码基因. 展开更多
关键词 cdna文库 Wistar大鼠脑 分子克隆
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油茶种子cDNA文库的构建 被引量:44
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作者 胡芳名 谭晓风 +1 位作者 石明旺 乌云塔娜 《中南林学院学报》 CSCD 2004年第5期1-4,共4页
 以湘林1号和湘林4号油茶优良无性系近成熟种子为材料,采用裂解法和改良的CTAB法提取总RAN;用磁珠法分离得到纯化的mRNA;在反转录酶和其他酶的作用下合成一链cDNA和二链cDNA;经与质料载体重组和转化大肠杆菌,成功地构建了世界上第一个...  以湘林1号和湘林4号油茶优良无性系近成熟种子为材料,采用裂解法和改良的CTAB法提取总RAN;用磁珠法分离得到纯化的mRNA;在反转录酶和其他酶的作用下合成一链cDNA和二链cDNA;经与质料载体重组和转化大肠杆菌,成功地构建了世界上第一个油茶种子cDNA文库.经检测,文库存容量达106,重组率为88.21%.测序结果表明:克隆片段长度一般都大于600bp,说明构建的文库质量较高,能够满足ESTs文库构建及从文库中分离筛选重要基因等研究工作的需要,为进一步研究奠定了很好的物质和技术基础. 展开更多
关键词 林学 经济林 油茶 cdna 文库构建
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银杏雌树成熟叶cDNA文库的构建 被引量:8
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作者 王义强 谭晓风 +2 位作者 陈介南 周小慧 孙吉康 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期6-9,31,共5页
银杏是第四纪冰川时期孑遗的现存地球最古老的植物,为我国特有的经济树种,银杏cDNA文库的构建有助于其分子生物学研究进一步深入.以湖南银杏梅核品种优良单株成熟叶为材料,经变性裂解液分解细胞,提取总RNA,Oligotex mRNA midi ki... 银杏是第四纪冰川时期孑遗的现存地球最古老的植物,为我国特有的经济树种,银杏cDNA文库的构建有助于其分子生物学研究进一步深入.以湖南银杏梅核品种优良单株成熟叶为材料,经变性裂解液分解细胞,提取总RNA,Oligotex mRNA midi kit分离纯化出mRNA,用SuperScipt TM Ⅱ RnaseH2 Reverse Transcriptase将其反转录成cDNA,与EcoRI接头连接后插入pBluescript Ⅱ SK(+)XR载体,电转化感受态细胞DH10B中,进行菌落PCR文库质量检测.结果表明:文库总库容量为8.12×10^5克隆子,重组率为90%,文库插入片段长度约为500~2000bp.构建的银杏雌树成熟叶cDNA文库符合标准,该文库为进一步构建银杏EST文库、筛选目的基因及基因芯片制备等提供了资源基础和有效工具. 展开更多
关键词 经济林学 cdna文库 构建 银杏 雌树 成熟叶
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cDNA文库及其在原虫研究中的应用 被引量:4
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作者 闫晓菲 韩红玉 +1 位作者 岳城 黄兵 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第1期52-55,60,共5页
cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。由于cDNA文库在基因分离和克隆中具有重要作用,因此其应用也日益广泛。简要介绍自... cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。由于cDNA文库在基因分离和克隆中具有重要作用,因此其应用也日益广泛。简要介绍自cDNA文库创建以来,发展起来的各类文库及其构建cDNA文库的方法。作者重点阐述了弓形虫、利什曼原虫、阴道毛滴虫、疟原虫等原虫cDNA文库的构建及其应用。 展开更多
关键词 cdna文库 原虫 筛选 基因克隆
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栉孔扇贝急性病毒性坏死症病毒cDNA文库的构建及部分序列分析 被引量:3
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作者 王崇明 艾海新 +2 位作者 刘英杰 王秀华 李赟 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期421-425,共5页
急性病毒性坏死症病毒(Acute Virus Necrobiotic Virus,AVNV)已被证实是一种对养殖栉孔扇贝(Chlamys farreri)危害极大的致病病原。本研究应用基因克隆技术对AVNV基因组进行cDNA合成、克隆,并对部分克隆进行序列分析。采用差速和蔗糖密... 急性病毒性坏死症病毒(Acute Virus Necrobiotic Virus,AVNV)已被证实是一种对养殖栉孔扇贝(Chlamys farreri)危害极大的致病病原。本研究应用基因克隆技术对AVNV基因组进行cDNA合成、克隆,并对部分克隆进行序列分析。采用差速和蔗糖密度梯度离心法,分离纯化AVNV。用Trizol试剂抽提病毒RNA,采用随机引物和Oligo(dT)双引物法,SuperScriptⅡ反转录酶合成cDNA,并克隆于pUC118质粒上,利用蓝白斑筛选阳性克隆子,PCR法快速鉴定重组质粒。经筛选得到2个阳性克隆23#、52#,插入片段大小约为1 200 bp和800 bp。测序结果与GenBank的比对分析显示,尚未有类似的序列报道,提示该病毒可能为一种新发现的病毒。 展开更多
关键词 栉孔扇贝 急性病毒性坏死病毒 cdna文库 克隆 序列分析
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