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Improvement on molecular sex identification primers for Passeriform bird species 被引量:2
1
作者 王宁 李建强 +1 位作者 张正旺 zhengwang zhang 《Chinese Birds》 2010年第1期65-69,共5页
The primer pair sex1/sex2,which can be widely applied for sex identification in Galliform species,was used to determine the sex of 17 Passeriform species.As CHD-W fragments tended to be preferentially amplified,which ... The primer pair sex1/sex2,which can be widely applied for sex identification in Galliform species,was used to determine the sex of 17 Passeriform species.As CHD-W fragments tended to be preferentially amplified,which may cause unnecessary misidentification in bird species with little difference between CHD-Z and CHD-W,we modified sex1 and sex2,obtaining sex1' and sex-mix respectively.Primer sets were then recombined to conduct sex identification.After testing several Passeriforme birds of known sex,we found that the primer pair sex1'/sex2 was better at limiting the preferential amplification of CHD-W fragments.As they are being frequently used in sex allocation study of Aegithalos concinnus and song learning research of Lonchura striata,we can expect more applications of this primer pair to further studies in Passeriformes. 展开更多
关键词 PASSERIFORMES sex1'/sex2 chd genes sex identification
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CHD基因与非平胸鸟类性别鉴定 被引量:16
2
作者 刘铸 白素英 田秀华 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第C00期147-150,共4页
自1995年CHD基因被应用于鸟类性别的分子鉴定以来,非平胸类鸟类性别鉴定问题正逐步被解决,CHD基因已经成为非平胸鸟类性别鉴定最重要的分子标记。阐述和分析了CHD基因在扩增目标及引物设计、取样范围及辅助技术和所涉足的科研领域等方... 自1995年CHD基因被应用于鸟类性别的分子鉴定以来,非平胸类鸟类性别鉴定问题正逐步被解决,CHD基因已经成为非平胸鸟类性别鉴定最重要的分子标记。阐述和分析了CHD基因在扩增目标及引物设计、取样范围及辅助技术和所涉足的科研领域等方面的发展及现状。期望随着CHD基因研究的深入,建立起完善的基于CHD基因的鸟类性别鉴定体系,通过更广泛的应用,促使涉及鸟类性别鉴定的科学研究向着更深、更广的方向发展。 展开更多
关键词 非平胸鸟类 性别鉴定 chd基因 分子标记
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朱鹮性别分子鉴定的研究进展
3
作者 邱国强 杜美衡 +4 位作者 白洪青 刘小甜 杨永春 宋厚辉 牛冬 《野生动物学报》 北大核心 2024年第3期670-674,共5页
朱鹮(Nipponia nippon)为世界濒危物种,也是国家一级重点保护鸟类。虽然一系列的保护措施显著增加了朱鹮种群规模和分布区域,但近交衰退、低繁殖力和雏鸟高致残率等问题一直制约着朱鹮种群的发展。朱鹮由于雌雄同型,难以从外观区分性别... 朱鹮(Nipponia nippon)为世界濒危物种,也是国家一级重点保护鸟类。虽然一系列的保护措施显著增加了朱鹮种群规模和分布区域,但近交衰退、低繁殖力和雏鸟高致残率等问题一直制约着朱鹮种群的发展。朱鹮由于雌雄同型,难以从外观区分性别,因此性别鉴定将对其人工繁殖具有重要意义。本文综述了朱鹮性别的分子鉴定方法,主要包括基于性染色体连锁的染色体解旋酶DNA结合蛋白CHD基因及EcoRⅠ片段的PCR鉴定方法,以期进行有效的人工繁育工作,实现对朱鹮种群的保护及规模重建。 展开更多
关键词 朱鹮 性别鉴定 chd基因 EE0.6序列 分子鉴定
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基于CHD基因序列分析的帝企鹅性别鉴定研究 被引量:3
4
作者 沈玮 潘少坤 +3 位作者 罗红梅 刘伟 朱标 曹祥荣 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第3期1167-1168,1214,共3页
[目的]分析帝企鹅(Aptenodytes forsteri)CHD基因序列,以鉴定性别。[方法]采用苯酚∶氯仿抽提法提取6只未知性别的帝企鹅血液中的基因组DNA,运用P2/P8引物扩增CHD基因片段,将PCR产物克隆到T-Vector,利用NCBI的Blast程序,以短趾鹰(Circae... [目的]分析帝企鹅(Aptenodytes forsteri)CHD基因序列,以鉴定性别。[方法]采用苯酚∶氯仿抽提法提取6只未知性别的帝企鹅血液中的基因组DNA,运用P2/P8引物扩增CHD基因片段,将PCR产物克隆到T-Vector,利用NCBI的Blast程序,以短趾鹰(Circaetus gal-licus)同源序列为比对参照,将帝企鹅CHD基因片段序列与GenBank中的基因片段序列进行同源性比较分析,鉴定帝企鹅的性别。[结果]测序结果表明,CHD-Z和CHD-W基因的PCR产物大小分别为378、387 bp,雌雄结果并不明显,不易区分开来。Blast比对结果表明,帝企鹅LD、EK、ZF为雄性,帝企鹅DG、YA、YY为雌性。[结论]结合PCR扩增和测序分析CHD基因,是单态性鸟类性别鉴定的有效和准确的方法。 展开更多
关键词 帝企鹅 chd基因 测序 性别鉴定
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五种基于CHD基因的性别鉴定方法对雀形目鸟类有效性的实验评估 被引量:5
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作者 苏倡 李显达 +4 位作者 邢晓莹 李波 马跃 吴伟 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2019年第3期643-651,共9页
性别鉴定是鸟类研究和保护中的一项基础工作。对于单态型鸟类,通过外观判定性别比较困难。已有的一些方法,如体尺测量、鸣声判定、翻肛鉴别、腹腔镜检、类固醇水平测定和核型分析等,要么可靠性不高,要么操作过程繁琐,要么对鸟体带来伤... 性别鉴定是鸟类研究和保护中的一项基础工作。对于单态型鸟类,通过外观判定性别比较困难。已有的一些方法,如体尺测量、鸣声判定、翻肛鉴别、腹腔镜检、类固醇水平测定和核型分析等,要么可靠性不高,要么操作过程繁琐,要么对鸟体带来伤害。染色体螺旋蛋白结合基因( CHD )在Z和W染色体上内含子的大小存在差异,设计PCR引物来同时扩增Z、W染色体上的内含子片段,有差异者便可判定为雌性,无差异者判定为雄性。目前,常用的引物有5对,分别是P2/P8、2550F/2718R、CHD1F/CHD1R、sex1 /sex-mix和IntP2/IntP8,在24个科中均有尝试,但结果千差万别,实际工作常被误导。本研究以树鹨( Anthus hodgsoni,n =20 )、棕眉山岩鹨( Prunella montanella,n =35 )、黄眉柳莺( Phylloscopus inornatus,n =76 )、黄腰柳莺( Ph.proregulus,n =36 )、褐柳莺( Ph.fuscatus,n =20 )和灰脚柳莺( Ph.tenellipes,n =27 )等6种雌雄同型的雀形目鸟类为材料,从鉴定正确率、PCR体系灵敏度和扩增成功率3个方面对这5对引物的有效性进行了评估。结果表明,引物对sex1 /sex-mix的鉴定正确率为95%,PCR体系灵敏度为 10 pg/μL 模板浓度,PCR扩增成功率为97%,是性别鉴定的最优选择;引物IntP2/IntP8的正确率达到95%,体系灵敏度为100 pg/μL,但扩增成功率仅为63%,应慎用;2550F/2718R的体系灵敏度为100 pg/μL,扩增成功率仅为85%,但正确率为80%,更应慎用;引物P2/P8的正确率为80%,体系灵敏度为500 pg/μL,但扩增成功率仅为58%,不建议使用;引物CHD1F/CHD1R体系灵敏度为100 pg/μL,但正确率和扩增成功率分别为65%和56%,亦不建议使用。 展开更多
关键词 雀形目 chd基因 性别鉴定 有效性评估
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鹌鹑性别鉴定的分子标记方法 被引量:11
6
作者 付晶 孙洪霞 白秀娟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期77-80,共4页
采用PCR方法扩增北京白羽蛋用鹌鹑基因组中性别基因CHD相关片段,探讨鹌鹑性别的分子标记方法。通过特异引物2550F/2718R,对3对已知性别和14只未知性别鹌鹑性别基因片段进行特异性扩增。结果表明,这对引物从雄性鹌鹑中扩增出1条片段,从... 采用PCR方法扩增北京白羽蛋用鹌鹑基因组中性别基因CHD相关片段,探讨鹌鹑性别的分子标记方法。通过特异引物2550F/2718R,对3对已知性别和14只未知性别鹌鹑性别基因片段进行特异性扩增。结果表明,这对引物从雄性鹌鹑中扩增出1条片段,从雌性鹌鹑中扩增出2条片段,可以对鹌鹑的性别作出准确鉴定。该方法可以应用于初生鹌鹑的性别筛选,降低饲养成本,提高经济效益。对2条片段进行克隆测序,片段长度分别为613和446bp。 展开更多
关键词 鹌鹑 性别鉴定 chd基因
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蛋鸽早期性别DNA分子鉴定 被引量:2
7
作者 任晋东 张昊 +8 位作者 原爱平 王德前 田勇 钟声亮 温积辉 章纪地 林传海 丁育云 卢立志 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期170-173,共4页
蛋鸽早期性别的鉴定一直是制约蛋鸽业发展的瓶颈问题。在本研究中,我们采用PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测的方法,对20日龄期的100只蛋鸽的性别连锁基因染色体解旋酶DNA结合基因CHD(chromo-helicase DNA binding)进行跨内含子扩增检测。... 蛋鸽早期性别的鉴定一直是制约蛋鸽业发展的瓶颈问题。在本研究中,我们采用PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测的方法,对20日龄期的100只蛋鸽的性别连锁基因染色体解旋酶DNA结合基因CHD(chromo-helicase DNA binding)进行跨内含子扩增检测。蛋鸽早期DNA分子电泳检测结果与成年后的真实性别核对结果表明:所有雌性蛋鸽扩增结果含有两条带,其大小分别为280bp和250bp,雄性蛋鸽仅有一条280bp的条带;泊松统计分析发现,蛋鸽早期DNA分子判定结果达到统计学上显著水平,可以作为蛋鸽早期性别鉴定的一种方法。本实验实现了以DNA分子为基础的早期蛋鸽性别鉴定,将对蛋鸽业早期的饲养成本降低和早期雄性蛋鸽的淘汰起到准确的指导作用。 展开更多
关键词 蛋鸽 性别鉴定 chd基因 PCR扩增
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猛禽非损伤性取样的性别分子鉴定方法 被引量:2
8
作者 刘铸 杨春文 +1 位作者 田恒久 金建丽 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期99-101,共3页
利用性染色体上CHD基因的P2/P8和2550F/2718R两对引物及微卫星位点(NVHfp102),对多种猛禽通过非损伤性取样进行性别分子鉴定研究。结果显示:2550F/2718R引物适用于隼形目脱落的有羽根羽毛和无羽根的不完整羽毛,拔取标本的羽毛可以进行... 利用性染色体上CHD基因的P2/P8和2550F/2718R两对引物及微卫星位点(NVHfp102),对多种猛禽通过非损伤性取样进行性别分子鉴定研究。结果显示:2550F/2718R引物适用于隼形目脱落的有羽根羽毛和无羽根的不完整羽毛,拔取标本的羽毛可以进行鉴定尝试,适用于鸮形目脱落的有羽根羽毛,脱落的无羽根不完整羽毛和拔取标本的羽毛不必进行鉴定尝试;利用P2/P8引物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳性别鉴定适用于猛禽脱落的无羽根不完整羽毛和拔取的标本羽毛;微卫星位点(NVHfp102)适用于隼科鸟类各种样本。 展开更多
关键词 鸮形目 隼形目 非损伤性取样 性别鉴定 chd基因
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扩增性别基因片段的鹭类性别鉴定方法的研究 被引量:9
9
作者 江杉 陈小麟 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第B05期152-155,共4页
以鹳形目5种鹭科鸟类和1种鹮科鸟类的组织为实验材料,采用PCR方法扩增其性别基因相关片段,探讨鹭科鸟类性别的分子鉴定方法.通过测定3对已知性别的白鹭(Egretta garzetta)、岩鹭(Egretta sacra)和黄嘴白鹭(Egretta eulo-photes)以及12... 以鹳形目5种鹭科鸟类和1种鹮科鸟类的组织为实验材料,采用PCR方法扩增其性别基因相关片段,探讨鹭科鸟类性别的分子鉴定方法.通过测定3对已知性别的白鹭(Egretta garzetta)、岩鹭(Egretta sacra)和黄嘴白鹭(Egretta eulo-photes)以及12只未知性别的夜鹭(Nycticorax nycticorax)、池鹭(Ardeola bacchus)、白鹭、牛背鹭(Bubulcus ibis)黑脸琵鹭(Platalea m inor)的性别基因CHD或EE0.6上的基因相关片段并进行比较.结果表明,通过扩增EE0.6或CHD基因片段的性别鉴定分子方法都能够适用于鹭科鸟类的性别鉴定,由此能够解决鹭科鸟类雌雄外形同色而难以从外貌上区分其性别的问题. 展开更多
关键词 鹭科鸟类 性别鉴定 EE0.6 chd
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利用PCR鉴定四川雉鹑性别 被引量:2
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作者 周鑫 杨楠 +2 位作者 岳碧松 冉江洪 李静 《四川动物》 CSCD 北大核心 2008年第4期645-647,共3页
四川雉鹑是我国特有珍稀濒危雉类,为国家Ⅰ级保护动物。本文通过设计引物,扩增四川雉鹑W染色体上雌性特异基因HINTW,利用PCR产物有无对其进行性别鉴定,发现在四川雉鹑中雄性个体无阳性产物,而雌性扩增出500 bp和300 bp 2条条带。应用通... 四川雉鹑是我国特有珍稀濒危雉类,为国家Ⅰ级保护动物。本文通过设计引物,扩增四川雉鹑W染色体上雌性特异基因HINTW,利用PCR产物有无对其进行性别鉴定,发现在四川雉鹑中雄性个体无阳性产物,而雌性扩增出500 bp和300 bp 2条条带。应用通用引物扩增四川雉鹑基因组CHD基因,其中雄性个体扩增出约500 bp的条带,而雌性个体则扩增出500 bp和750 bp 2条条带,通过其Z/W染色体上基因片段长度差异可进行性别鉴定。上述两种方法对9个四川雉鹑的性别鉴定结果均一致。 展开更多
关键词 四川雉鹑 chd基因 HINTW基因 性别鉴定PCR
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两种观赏鸟性别的快速鉴定研究 被引量:5
11
作者 盖玉林 路迪 周材权 《西华师范大学学报(自然科学版)》 2014年第2期166-171,共6页
虽然CHD基因的保守性和性特异性引物已被广泛应用于性别鉴定领域,但羽毛样以及PCR体系等的选择却会产生不同的鉴定效果,因此如何对这些影响单性态观赏性鸟类性别鉴定的多重因素进行最优化处理以达到快速鉴定的目的,就成了人工繁育过程... 虽然CHD基因的保守性和性特异性引物已被广泛应用于性别鉴定领域,但羽毛样以及PCR体系等的选择却会产生不同的鉴定效果,因此如何对这些影响单性态观赏性鸟类性别鉴定的多重因素进行最优化处理以达到快速鉴定的目的,就成了人工繁育过程中最亟待解决的问题.本文用固定影响因素(PCR体系除外)的方法,对PCR体系进行优化处理,羽毛提取DNA,然后CHD基因的相关引物进行性别鉴定.结果表明:所有雌性鸟类得到CHD-Z和CHD-W的两条带,雄性1条CHD-Z带的高效鉴定.因此,确立了此类鸟的快速鉴定体系,即画眉鸟性别鉴定体系,用于鉴定换羽季的画眉鸟的性别;以及红嘴相思鸟性别鉴定体系,用于鉴定红嘴相思鸟的性别;同时可为多种体型相似的鸟类的快速鉴定提供参考. 展开更多
关键词 chd基因 红嘴相思鸟性别鉴定体系 画眉鸟性别鉴定体系 最优化处理 快速鉴定
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3种鸫科鸟类的性别鉴定研究
12
作者 王东权 刘丽 +1 位作者 安博洋 李波 《安徽农业科学》 CAS 2020年第15期92-95,共4页
通过形态学与分子生物学方法对3种鸫科(Turdidae)鸟类赤颈鸫(Turdus ruficollis)、红尾鸫(Turdus naumanni)、斑鸫(Turdus eunomus)进行性别鉴定。以CHD基因性别鉴定为基准,讨论形态学与微卫星性别鉴定的准确率与可行性。结果表明,3种... 通过形态学与分子生物学方法对3种鸫科(Turdidae)鸟类赤颈鸫(Turdus ruficollis)、红尾鸫(Turdus naumanni)、斑鸫(Turdus eunomus)进行性别鉴定。以CHD基因性别鉴定为基准,讨论形态学与微卫星性别鉴定的准确率与可行性。结果表明,3种鸫科鸟类中赤颈鸫能够通过形态学进行性别鉴定,其准确率为0.89%;红尾鸫与斑鸫的性别鉴定准确率仅为0.57%和0.38%,无法通过形态学进行有效的性别鉴定。形态学性别鉴定存在局限性,受鸟类年龄、季节、地区的影响明显,并且对个体特征不清晰或个体残缺样本不能进行有效鉴定。此次试验中99只个体仅73只具有完整形态,剩余个体只能通过分子生物学方法进行性别鉴定。微卫星鉴定与CHD基因性别鉴定结果存在不一致的现象,总体准确率仅0.88%,且鉴定错误的12只个体均是将雄性鉴定为雌性,原因可能是该微卫星位点跨物种使用时与性别连锁度降低。相较于微卫星鉴定需要毛细管电泳分型,CHD基因性别鉴定方法只需要对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,该鉴定方法更简便、成本更低。 展开更多
关键词 鸫科鸟类 性别鉴定 形态学 微卫星 chd基因
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金刚鹦鹉性别的快速分子生物学鉴定
13
作者 朱向蕾 王瑛莹 周立晨 《安徽农业科学》 CAS 2022年第1期99-101,共3页
应用引物2550F/2718R对上海动物园内蓝黄金刚鹦鹉和红绿金刚鹦鹉的CHD基因进行PCR扩增,进行性别鉴定。经过琼脂糖凝胶电泳发现:雄性个体扩增出1条片段,大小647 bp;雌性个体扩增出2条片段,大小分别为630和411 bp。蓝黄金刚鹦鹉群体的雌... 应用引物2550F/2718R对上海动物园内蓝黄金刚鹦鹉和红绿金刚鹦鹉的CHD基因进行PCR扩增,进行性别鉴定。经过琼脂糖凝胶电泳发现:雄性个体扩增出1条片段,大小647 bp;雌性个体扩增出2条片段,大小分别为630和411 bp。蓝黄金刚鹦鹉群体的雌雄比为10∶17,红绿金刚鹦鹉群体的雌雄比为5∶4。该方法能准确、快速、有效地进行2种金刚鹦鹉的性别鉴定,为该鸟类种群饲养繁育提供基础性别信息。 展开更多
关键词 金刚鹦鹉 性别鉴定 chd基因
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利用CHD基因鉴定鸽子性别的研究 被引量:4
14
作者 王玲彩 董萌萌 +5 位作者 王青 杭柏林 刘保国 胡建和 赵坤 徐彦召 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第8期1-5,共5页
为了能够快速并准确地鉴定鸽子性别,试验利用CHD基因鉴定引物,通过PCR技术对鸽子CHD基因进行特异性扩增,经琼脂糖凝胶电泳,分别从待检鸽子PCR产物中检测到2条带和1条带,并对待检鸽子性别进行解剖印证,结果显示,2条带为雌鸽,1条带为雄鸽... 为了能够快速并准确地鉴定鸽子性别,试验利用CHD基因鉴定引物,通过PCR技术对鸽子CHD基因进行特异性扩增,经琼脂糖凝胶电泳,分别从待检鸽子PCR产物中检测到2条带和1条带,并对待检鸽子性别进行解剖印证,结果显示,2条带为雌鸽,1条带为雄鸽;对获取的雌、雄鸽子PCR产物回收纯化后,与pMD19-T载体连接并转入K12感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序分析,发现所检序列确为CHD-Z、CHD-W基因;此外,在优化退火温度时发现,雌性鸽子扩增序列600 bp处,扩增效果易受退火温度影响,且与雄鸽该处的扩增效果存在差异,利用雌雄鸽子PCR扩增效率的不同也能达到鉴别鸽子性别的目的。结果表明:本研究验证了利用CHD基因来鉴别鸽子雌雄的方法,其准确率为100%。发现CHD基因特定位点的PCR扩增效率受性别影响,由此发展出基于PCR扩增效率的性别鉴定方法。本研究为鸽子的性别早期鉴定和准确鉴定提供了参考。 展开更多
关键词 鸽子 chd基因 性别鉴定 退火温度
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鸵鸟性别鉴定的分子标记方法 被引量:2
15
作者 付晶 白秀娟 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期82-87,共6页
鸵鸟(Struthiocamelus)属于平胸总目鸟类,雌雄鸵鸟在性成熟前外部形态相同,很难通过外观和形态来鉴定性别,给早期分群饲养造成了很大的困难。实验利用鸵鸟羽毛提取基因组DNA,之后利用EE0.6和CHD基因中2个引物组合对3对已知性别和9只未... 鸵鸟(Struthiocamelus)属于平胸总目鸟类,雌雄鸵鸟在性成熟前外部形态相同,很难通过外观和形态来鉴定性别,给早期分群饲养造成了很大的困难。实验利用鸵鸟羽毛提取基因组DNA,之后利用EE0.6和CHD基因中2个引物组合对3对已知性别和9只未知性别鸵鸟的性别基因片段进行特异性扩增。结果显示,这对引物组合在雄性鸵鸟的DNA中未扩增出片段,在雌性鸵鸟DNA中扩增出1条片段,可以对鸵鸟的性别作出准确鉴定,从而解决幼雏期鸵鸟难以从外貌上区分其性别的问题。 展开更多
关键词 平胸鸟类 鸵鸟 性别鉴定 EE0.6 chd
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