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广州地区婴幼儿感染Noro病毒基因型的初步研究 被引量:2
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作者 钟家禹 周荣 +2 位作者 朱冰 区文玑 龚四堂 《中国循证儿科杂志》 CSCD 2006年第4期273-278,共6页
目的 探讨广州地区婴幼儿腹泻中感染Noro病毒的基因型。方法 用Clustal W比对GⅡ组Noro病毒后,设计处于ORF1与ORF2连接点两旁两对简并引物,进行巢式RT—PCR扩增出目标片段,克隆于T载体上,测定序列,对ORF1与ORF2连接点两旁序列和衣... 目的 探讨广州地区婴幼儿腹泻中感染Noro病毒的基因型。方法 用Clustal W比对GⅡ组Noro病毒后,设计处于ORF1与ORF2连接点两旁两对简并引物,进行巢式RT—PCR扩增出目标片段,克隆于T载体上,测定序列,对ORF1与ORF2连接点两旁序列和衣壳蛋白N/S区用Clustal W进行同源性分析,用phylip 3.65软件、邻接法构建进化树。结果 标本NVgz100、NVgz10成功扩增出ORF1与ORF2连接点两旁1208bp片段(相对于Hawaii virus,U07611位置为4476—5683),包含ORF1的3’端RdRp的大部分基因和ORF2基因的5’端的S区。对标本NVgz100、NVgz10与另一实验NVgz01(DQ369797)的1208bp进行同源性分析发现,3份标本与GⅠ组同源性为58%~61%,与GⅡ组同源性为74%~92%;将这3份标本与GⅠ、GⅡ组构建进化树,可发现NVgz100、NVgz10和NVgz01与GⅡ组Bristol等病毒密切相关,将NVgz100、NVgz10和NVgz01的衣壳蛋白N/S区与GⅡ组各基酬型进行同源性比较,发现3份标本与GⅡ4基因型Camberwell、Bristolt Grimsby同源性较高(92%~96%),与其他基因型同源性为70%~73%,以N/S区构建进化树可发现3份标本与Camberwell、Bristol、Grimsby、Lordsdale处于同一簇中。结论 本实验结果表明Noro病毒株以GⅡ组为主,病毒流行的基因型为与Camberwell、Bristol、Grimsby和Lordsdale等密切相关的GⅡ-4基因型。 展开更多
关键词 noro病毒 GⅡ-4基因型 同源性比较 进化树分析
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北京市某医院院内感染Noro病毒胃肠炎的调查 被引量:5
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作者 陈美芳 高燕 +7 位作者 贾立平 张又 钱渊 武迎宏 张正 解基严 苗懿德 魏来 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期141-143,共3页
目的了解Noro病毒感染引起医院内暴发集体腹泻的临床特点。方法分析一起18例医院内暴发腹泻患者的流行病学和临床资料,同时对每例患者粪便标本进行细菌培养,随机选择7例粪便标本用抗原检测和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行轮状病毒RNA检测;... 目的了解Noro病毒感染引起医院内暴发集体腹泻的临床特点。方法分析一起18例医院内暴发腹泻患者的流行病学和临床资料,同时对每例患者粪便标本进行细菌培养,随机选择7例粪便标本用抗原检测和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行轮状病毒RNA检测;用逆转录-聚合酶链反应检测Noro病毒核酸以确定感染的病原,分析感染患者的临床特点和易感因素。结果发病者多为老年合并多种基础疾病;腹泻主要为稀水便(12/18,66.67%),个别为黏液稀便(3/18,16.67%);大部分粪便常规检测正常(10/18,55.56%),个别见少量白细胞(3/18,16.67%)和潜血弱阳性(4/18,22.22%);全部粪便标本细菌学培养阴性;轮状病毒RNA检测阴性;3份标本中检出Noro病毒核酸,阳性率为42.86%(3/7)。结论Noro病毒是此次医院内集体暴发腹泻的重要病原之一,尤其多见于有基础疾病、体弱的老年患者。 展开更多
关键词 noro病毒 医院内感染 临床特征
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北京地区Noro病毒主要衣壳蛋白编码基因的序列分析 被引量:4
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作者 贾立平 钱渊 +3 位作者 张又 陈冬梅 赵林清 朱汝南 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期394-399,共6页
目的 确定从北京地区婴幼儿腹泻标本中检测到的3株Noro病毒的基因型别及主要衣壳蛋白(VP1)编码基因的特点。方法 从经酶免疫分析法筛选到的Noro病毒阳性的粪便标本中应用RT-PCR方法扩增Noro病毒VP1全基因,克隆到pBS-T载体中并测定核... 目的 确定从北京地区婴幼儿腹泻标本中检测到的3株Noro病毒的基因型别及主要衣壳蛋白(VP1)编码基因的特点。方法 从经酶免疫分析法筛选到的Noro病毒阳性的粪便标本中应用RT-PCR方法扩增Noro病毒VP1全基因,克隆到pBS-T载体中并测定核苷酸序列,与GenBank中的其他Noro病毒VP1基因序列进行比较和分析。结果 经过扩增和测序,标本CR2905、CR2932和CR2987的VP1基因全长分别为1620bp、1623bp和1647bp,编码不同大小的蛋白。CR2905和CR2932与GⅡ-4型的氨基酸同源性在80%以上,属于Noro病毒GⅡ基因组(Genogroup)的GⅡ-4型(Geno.type);CR2987与GⅡ-3型的氨基酸同源性在80%以上,属于Noro病毒GⅡ基因组的GⅡ-3型。CR2905、CR2932与其他GⅡ-4型的变异性在9.1%至12.5%之间,提示为新的变异株。结论 北京地区婴幼儿中存在不同基因型别的Noro病毒的感染,根据基因的同源性分析,CR2905、CR2932可能为GⅡ-4型的新的变异株。 展开更多
关键词 noro病毒 VP1基因 序列分析
原文传递
北京地区不同基因型Noro病毒的主要衣壳蛋白在大肠杆菌中的表达 被引量:1
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作者 贾立平 钱渊 +1 位作者 陈冬梅 张又 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期144-148,共5页
目的对北京地区的不同基因型Noro病毒的主要衣壳蛋白(VP1)进行表达,得到Noro病毒抗原,为对Noro病毒做进一步的深入研究打下基础。方法用PCR分别从先前研究得到的含北京Noro病毒主要衣壳蛋白VP1编码基因的重组质粒pBST-CR2987(GⅡ-... 目的对北京地区的不同基因型Noro病毒的主要衣壳蛋白(VP1)进行表达,得到Noro病毒抗原,为对Noro病毒做进一步的深入研究打下基础。方法用PCR分别从先前研究得到的含北京Noro病毒主要衣壳蛋白VP1编码基因的重组质粒pBST-CR2987(GⅡ-3)及pBST-CR2932(GⅡ4)中扩增得到VP1全基因,然后将目的基因亚克隆到表达载体pET-30a(+)中,得到重组质粒,转化BL21(DE3)感受态细胞,利用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导蛋白表达。通过SDS-PAGE和Western blot检测蛋白的表达和抗原性,并对表达产物进行了纯化。结果(1)双酶切和测序证明得到了VP1的重组表达载体。CR2987 VP1基因全长1647 bp,含编码549个氨基酸的单一的开放读码框架(ORF);CR2932 VP1基因全长1623 bp,含编码541个氨基酸的单一的ORF。(2)重组表达的VP1主要以包涵体的形式存在,在诱导后4—6h表达量最高。(3)重组表达的VP1能够被豚鼠抗Noro病毒VP1的特异性免疫血清及鼠抗His标签的抗体所识别。(4)纯化后的蛋白能够为人血清所识别。结论GⅡ-3型及GⅡ-4型Noro病毒北京地方株的VP1在原核体系中获得表达,表达的VP1可以被特异性免疫血清及人血清所识别,说明其具有抗原活性。 展开更多
关键词 noro病毒 VP1蛋白表达 原核表达 抗原性
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