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猪流行性腹泻病毒解旋酶Nsp13表达纯化及其RNA解旋活性鉴定
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作者 沈熹涓 姬晶晶 +3 位作者 金慧琴 李宇哲 刘斐 单衍可 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期33-38,共6页
旨在可溶性表达并纯化猪流行性腹泻病毒(PEDV)解旋酶Nsp13,并验证表达纯化得到的PEDV Nsp13蛋白具有RNA解旋活性。将pET28a(+)-PEDV Nsp13重组质粒转化到大肠杆菌Transetta(DE3)感受态细胞中,利用终浓度0.5 mmol/L的IPTG在18℃条件下诱... 旨在可溶性表达并纯化猪流行性腹泻病毒(PEDV)解旋酶Nsp13,并验证表达纯化得到的PEDV Nsp13蛋白具有RNA解旋活性。将pET28a(+)-PEDV Nsp13重组质粒转化到大肠杆菌Transetta(DE3)感受态细胞中,利用终浓度0.5 mmol/L的IPTG在18℃条件下诱导16 h,收集诱导后的菌体,超声破碎并收集其上清液,通过镍亲和层析技术获得纯化后的PEDV Nsp13;设计RNA底物,并建立体外解旋反应体系,验证蛋白的RNA解旋活性,并在相同时间内探究不同温度条件下PEDV Nsp13蛋白对RNA的解旋情况,进一步验证其活性。结果表明,在大肠杆菌系统中可溶性表达了PEDV Nsp13蛋白,纯化后蛋白浓度可达0.9 mg/mL;通过体外解旋试验,验证了PEDV Nsp13蛋白具有ATP依赖的RNA解旋酶活性,并发现PEDV Nsp13蛋白的RNA解旋酶活性在一定范围内随解旋温度的升高而提高。本研究结果为进一步深入研究PEDV Nsp13的RNA解旋作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 PEDV nsp13 可溶性表达 蛋白纯化 RNA解旋活性
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新型冠状病毒非结构蛋白NSP13通过调控IκBα蛋白降解抑制NF-κB信号通路
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作者 闫聪睿 安华英 +10 位作者 马骏 巩家媛 高锋华 宁畅文 张猛 李宝义 苏允琦 魏汉琪 刘鹏宇 蒋兴伟 于群 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第4期256-262,共7页
目的研究新型冠状病毒非结构蛋白13(NSP13)调控NF-κB信号通路的作用机制。方法利用GV367-NSP13-FLAG慢病毒感染的方法制备高表达NSP13的A549细胞(A549-NSP13)和A549对照组,用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和ELISA检测NF-κB下游细胞因子白... 目的研究新型冠状病毒非结构蛋白13(NSP13)调控NF-κB信号通路的作用机制。方法利用GV367-NSP13-FLAG慢病毒感染的方法制备高表达NSP13的A549细胞(A549-NSP13)和A549对照组,用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和ELISA检测NF-κB下游细胞因子白细胞介素6(IL-6)和趋化因子5(CCL-5)表达水平;Western印迹法检测NF-κB信号通路P65、磷酸化P65和NF-κB抑制因子α(IκBα)蛋白表达。放线菌酮10 mg·L^(-1)处理细胞0,15,30,45,90和120 min,Western印迹法检测IκBα蛋白半衰期。结果与A549对照组相比,A549-NSP13细胞检测到FLAG标签蛋白条带,且NSP13 mRNA表达显著上调(P<0.01),表明A549-NSP13细胞系构建成功。与A549对照组相比,A549-NSP13细胞IL-6 mRNA和蛋白表达水平(P<0.01)及CCL-5 mRNA和蛋白表达水平(P<0.05,P<0.01)均显著降低;磷酸化P65蛋白表达下降(P<0.01),而IκBα蛋白表达上调(P<0.01);且IκBα蛋白半衰期增加(P<0.01)。结论NSP13蛋白可通过抑制IκBα降解进而抑制NF-κB信号通路的活化并降低其下游IL-6和CCL-5等炎症相关分子产生和分泌。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 非结构蛋白13 NF-ΚB信号通路 NF-κB抑制因子α蛋白
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SARS-Coronavirus-2 Nsp13 Possesses NTPase and RNA Helicase Activities That Can Be Inhibited by Bismuth Salts 被引量:12
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作者 Ting Shu Muhan Huang +8 位作者 Di Wu Yujie Ren Xueyi Zhang Yang Han Jingfang Mu Ruibing Wang Yang Qiu Ding-Yu Zhang Xi Zhou 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期321-329,共9页
The ongoing outbreak of Coronavirus Disease 2019(COVID-19)has become a global public health emergency.SARScoronavirus-2(SARS-CoV-2),the causative pathogen of COVID-19,is a positive-sense single-stranded RNA virus belo... The ongoing outbreak of Coronavirus Disease 2019(COVID-19)has become a global public health emergency.SARScoronavirus-2(SARS-CoV-2),the causative pathogen of COVID-19,is a positive-sense single-stranded RNA virus belonging to the family Coronaviridae.For RNA viruses,virus-encoded RNA helicases have long been recognized to play pivotal roles during viral life cycles by facilitating the correct folding and replication of viral RNAs.Here,our studies show that SARS-CoV-2-encoded nonstructural protein 13(nsp13)possesses the nucleoside triphosphate hydrolase(NTPase)and RNA helicase activities that can hydrolyze all types of NTPs and unwind RNA helices dependently of the presence of NTP,and further characterize the biochemical characteristics of these two enzymatic activities associated with SARS-CoV-2 nsp13.Moreover,we found that some bismuth salts could effectively inhibit both the NTPase and RNA helicase activities of SARS-CoV-2 nsp13 in a dose-dependent manner.Thus,our findings demonstrate the NTPase and helicase activities of SARS-CoV-2 nsp13,which may play an important role in SARS-CoV-2 replication and serve as a target for antivirals. 展开更多
关键词 SARS-coronavirus-2(SARS-CoV-2) nsp13 NTPASE HELICASE Antiviral target
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SARS-CoV-2 helicase NSP13 hijacks the host protein EWSR1 to promote viral replication by enhancing RNA unwinding activity
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作者 Hongxiang Zeng Xiang Gao +5 位作者 Gang Xu Shengyuan Zhang Lin Cheng Tongyang Xiao Wenhong Zu Zheng Zhang 《Infectious Medicine》 2022年第1期7-16,共10页
Background:Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)emerged in December 2019 and has led to a global coronavirus disease 2019(COVID-19)pandemic.Currently,incomplete understanding of how SARS-CoV-2 ar... Background:Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)emerged in December 2019 and has led to a global coronavirus disease 2019(COVID-19)pandemic.Currently,incomplete understanding of how SARS-CoV-2 arrogates the host cell to establish its life cycle has led to slow progress in the development of effective drugs.Results:In this study,we found that SARS-CoV-2 hijacks the host protein EWSR1(Ewing Sarcoma breakpoint region 1/EWS RNA binding protein 1)to promote the activity of its helicase NSP13 to facilitate viral propagation.NSP13 is highly conserved among coronaviruses and is crucial for virus replication,providing chemical energy to unwind viral RNA replication intermediates.Treatment with different SARS-CoV-2 NSP13 inhibitors in multi-ple cell lines infected with SARS-CoV-2 effectively suppressed SARS-CoV-2 infection.Using affinity-purification mass spectrometry,the RNA binding protein EWSR1 was then identified as a potent host factor that physically associated with NSP13.Furthermore,silencing EWSR1 dramatically reduced virus replication at both viral RNA and protein levels.Mechanistically,EWSR1 was found to bind to the NTPase domain of NSP13 and potentially enhance its dsRNA unwinding ability.Conclusions:Our results pinpoint EWSR1 as a novel host factor for NSP13 that could potentially be used for drug repurposing as a therapeutic target for COVID-19. 展开更多
关键词 nsp13 Ewsr1 UNWINDING
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易通过冷冻食品传播的新冠病毒解旋酶的表达纯化及酶活研究 被引量:3
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作者 李海红 郑亚婷 +3 位作者 高博 韩晓睿 何怡宁 侯锡苗 《农产品加工》 2021年第24期68-71,74,共5页
通过原核表达方式纯化得到新冠病毒解旋酶(SARS-CoV-2-Nsp13),并利用荧光各向异性和凝胶阻滞试验探究了其体外结合DNA、RNA底物的亲和力及解旋双链DNA的最佳解旋条件。结果表明,SARS-CoV-2-Nsp13解旋酶具有结合单链DNA(ssDNA)、带有5&#... 通过原核表达方式纯化得到新冠病毒解旋酶(SARS-CoV-2-Nsp13),并利用荧光各向异性和凝胶阻滞试验探究了其体外结合DNA、RNA底物的亲和力及解旋双链DNA的最佳解旋条件。结果表明,SARS-CoV-2-Nsp13解旋酶具有结合单链DNA(ssDNA)、带有5'尾链的双链DNA(5'Oh-dsDNA)及RNA发卡结构(RNA-HP)的活力,亲和性依次为5'Oh-dsDNA≈RNA-HP>ssDNA,结合曲线呈S型。SARS-CoV-2-Nsp13解旋酶与DNA、RNA底物的结合具有协同性。SARS-CoV-2-Nsp13解旋酶可以解旋带有5'尾链的双链DNA,解旋的方向为5'-3',发挥完全解旋活性的酶浓度为3μmol/L;而该解旋酶解旋DNA双链的活性相对较弱,解旋活性在NaCl浓度达到80 mmol/L时受到明显的抑制。研究结论可为深入理解冠状病毒解旋酶的生化活性及工作机理提供参考和帮助。 展开更多
关键词 冠状病毒 nsp13解旋酶 蛋白表达纯化 DNA结合活性 DNA解旋活性
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冠状病毒非结构蛋白13的研究进展 被引量:1
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作者 吴诚诚 张帆帆 +2 位作者 汪娟 李娜 林翠 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期419-433,共15页
冠状病毒能够引发多种传染性疾病,给动物和人类的健康带来严重危害。研发有效的疫苗和抗病毒药物成为防治疾病的重要手段。冠状病毒基因组能够编码多种蛋白质,包括结构蛋白、非结构蛋白和辅助蛋白。解旋酶非结构蛋白13(nonstructural pr... 冠状病毒能够引发多种传染性疾病,给动物和人类的健康带来严重危害。研发有效的疫苗和抗病毒药物成为防治疾病的重要手段。冠状病毒基因组能够编码多种蛋白质,包括结构蛋白、非结构蛋白和辅助蛋白。解旋酶非结构蛋白13(nonstructural protein 13, NSP13)是冠状病毒编码的一种关键非结构蛋白,能够调控病毒复制和宿主先天免疫反应。因此,NSP13被认为是研发抗冠状病毒药物的重要靶点。本文结合国内外现有NSP13相关研究成果,对冠状病毒解旋酶NSP13的来源与结构、序列保守性、解旋机制、酶抑制剂、蛋白互作以及免疫调控等方面进行综述,并且分析了NSP13研究目前面临的问题,为研发靶向NSP13的广谱抗冠状病毒药物提供了理论依据。 展开更多
关键词 冠状病毒 非结构蛋白13 解旋机制 酶抑制剂 抗病毒药物
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