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基于生物信息学分析NUSAP1在肺腺癌组织中的表达及临床意义
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作者 葛恒广 李新丽 《现代医药卫生》 2023年第8期1281-1287,共7页
目的探讨核仁和纺锤体相关蛋白1(NUSAP1)在肺腺癌组织中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine、GEPIA、UALCAN、TIMER、STRING等数据库,分析肺腺癌NUSAP1基因与蛋白表达情况、NUSAP1表达对患者预后的影响、NUSAP1基因与肿瘤免疫细胞... 目的探讨核仁和纺锤体相关蛋白1(NUSAP1)在肺腺癌组织中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine、GEPIA、UALCAN、TIMER、STRING等数据库,分析肺腺癌NUSAP1基因与蛋白表达情况、NUSAP1表达对患者预后的影响、NUSAP1基因与肿瘤免疫细胞浸润的关系,以及蛋白网络图富集参与的生理过程等。结果NUSAP1在肺腺癌组织中高表达,基因表达越高患者预后越差,差异有统计学意义(P<0.05);NUSAP1在肺腺癌组织中表达水平与肿瘤微环境中B淋巴细胞、CD4^(+)T淋巴细胞、树突细胞均呈负相关(P<0.05),与CD8^(+)T淋巴细胞、巨噬细胞、中性粒细胞均呈正相关(P<0.05);NUSAP1主要参与调节细胞周期、有丝分裂细胞周期的正调控、核分裂等生物学过程。结论NUSAP1在肺腺癌组织中高表达,并与肺腺癌的发生、发展相关,可能作为肺腺癌诊断及预后评估的生物标志物。 展开更多
关键词 计算生物学 肺肿瘤 腺癌 基因表达 数据库 核仁和纺锤体相关蛋白1
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NuSAP1、LDLR与局部晚期乳腺癌患者腋窝淋巴结转移的关系及其危险因素分析
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作者 陈新宽 杨海燕 梁伟 《肿瘤代谢与营养电子杂志》 2022年第6期747-752,共6页
目的探讨核仁纺锤体相关蛋白1(NuSAP1)、低密度脂蛋白受体(LDLR)与局部晚期乳腺癌患者腋窝淋巴结转移情况的关系,并分析患者腋窝淋巴结转移≥10枚的危险因素。方法选取2018年1月至2022年4月在江苏省连云港市第一人民医院诊治的局部晚期... 目的探讨核仁纺锤体相关蛋白1(NuSAP1)、低密度脂蛋白受体(LDLR)与局部晚期乳腺癌患者腋窝淋巴结转移情况的关系,并分析患者腋窝淋巴结转移≥10枚的危险因素。方法选取2018年1月至2022年4月在江苏省连云港市第一人民医院诊治的局部晚期乳腺癌患者125例为研究对象,均经手术病理确诊为乳腺癌且均发生腋窝淋巴结转移。术中取癌组织及癌旁组织,并检测NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达情况。对比不同腋窝淋巴结转移情况患者癌组织NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达,分析NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达与腋窝淋巴结转移情况的相关性。采用二元Logistic回归模型分析腋窝淋巴结转移≥10枚的危险因素。结果癌组织NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达高于癌旁组织(P<0.05);随着患者腋窝淋巴结转移数目增加,癌组织NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达呈升高趋势(P<0.05);癌组织NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达与腋窝淋巴结转移数目呈正相关(P<0.05);校正临床分期、肿瘤最大直径后,癌组织NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA高表达仍是乳腺癌患者腋窝淋巴结转移≥10枚的独立危险因素(P<0.05),建立Logistic回归模型:logit(P)=-6.004+1.298×LDLR mRNA+1.141×NuSAP1 mRNA。结论局部晚期乳腺癌患者癌组织NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA呈高表达,表达水平与患者腋窝淋巴结转移数目密切相关,且NuSAP1 mRNA、LDLR mRNA表达升高是患者腋窝淋巴结转移≥10枚的独立危险因素。 展开更多
关键词 核仁纺锤体相关蛋白1 低密度脂蛋白受体 局部晚期 乳腺癌 腋窝淋巴结转移 危险因素
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LSD1、NUSAP1和TEAD4在人乳头瘤病毒感染尖锐湿疣及宫颈癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 刘丽媛 冯晓阳 +2 位作者 牛艳东 齐海花 段昕所 《实用皮肤病学杂志》 2022年第3期139-142,共4页
目的观察组蛋白赖氨酸去甲基化酶1(histone lysines demethylase 1,LSD1)、核仁纺锤体相关蛋白1(nucleolar and spindle-associated protein 1,NUSAP1)和转录增强因子4(TEA domain transcription factor4,TEAD4)在低危型、高危型人乳头... 目的观察组蛋白赖氨酸去甲基化酶1(histone lysines demethylase 1,LSD1)、核仁纺锤体相关蛋白1(nucleolar and spindle-associated protein 1,NUSAP1)和转录增强因子4(TEA domain transcription factor4,TEAD4)在低危型、高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染尖锐湿疣组织及宫颈鳞状细胞癌(宫颈癌)组织中的表达变化及其临床意义。方法采用免疫组化法分别检测LSD1、NUSAP1和TEAD4在30例宫颈癌组织、30例高危型HPV感染尖锐湿疣组织、30例低危型HPV感染尖锐湿疣组织以及10例正常宫颈组织中的表达情况。结果宫颈癌组、高危型组、低危型组、正常对照组中LSD1阳性率分别为76.67%、53.33%、16.67%、0.00%,NUSAP1阳性率分别为90.00%、56.67%、20.00%、0.00%,TEAD4阳性率分别为86.67%、50.00%、13.33%、0.00%;组间多重比较结果显示,与正常对照组相比,宫颈癌组、高危型组LSD1、NUSAP1和TEAD4表达水平均显著升高:与低危型组相比,宫颈癌组、高危型组LSD1、NUSAP1和TEAD4表达水平均显著升高:与高危型组相比,宫颈癌组NUSAP1和TEAD4表达水平均显著升高:与高危型组相比,宫颈癌组LSD1的表达差异无显著性:与正常对照组相比,低危型组LSD1、NUSAP1和TEAD4的表达差异无显著性。结论LSD1、NUSAP1、TEAD4参与了高危型HPV感染向宫颈癌的发展,可能成为宫颈癌研究的新思路。 展开更多
关键词 宫颈 尖锐湿疣 人乳头瘤病毒 组蛋白赖氨酸去甲基化酶1 核仁纺锤体相关蛋白1 转录增强因子4
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Nucleolus-localized Def-CAPN3 protein degradation pathway and its role in cell cycle control and ribosome biogenesis 被引量:1
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作者 Shuyi Zhao Delai Huang Jinrong Peng 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2021年第11期955-960,共6页
The nucleolus,as the‘nucleus of the nucleus’,is a prominent subcellular organelle in a eukaryocyte.The nucleolus serves as the centre for ribosome biogenesis,as well as an important site for cell-cycle regulation,ce... The nucleolus,as the‘nucleus of the nucleus’,is a prominent subcellular organelle in a eukaryocyte.The nucleolus serves as the centre for ribosome biogenesis,as well as an important site for cell-cycle regulation,cellular senescence,and stress response.The protein composition of the nucleolus changes dynamically through protein turnover to meet the needs of cellular activities or stress responses.Recent studies have identified a nucleolus-localized protein degradation pathway in zebrafish and humans,namely the Def-CAPN3 pathway,which is essential to ribosome production and cell-cycle progression,by controlling the turnover of multiple substrates(e.g.,ribosomal small-subunit[SSU]processome component Mpp10,transcription factor p53,check-point proteins Chk1 and Wee1).This pathway relies on the Ca2þ-dependent cysteine proteinase CAPN3 and is independent of the ubiquitin-mediated proteasome pathway.CAPN3 is recruited by nucleolar protein Def from cytoplasm to nucleolus,where it proteolyzes its substrates which harbor a CAPN3 recognition-motif.Def depletion leads to the exclusion of CAPN3 and accumulation of p53,Wee1,Chk1,and Mpp10 in the nucleolus that result in cell-cycle arrest and rRNA processing abnormality.Here,we summarize the discovery of the Def-CAPN3 pathway and propose its biological role in cell-cycle control and ribosome biogenesis. 展开更多
关键词 nucleolus protein degradation Def CAPN3 P53 CHK1 Wee1 Mpp10 Sas10
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Structural components of the nuclear body in nuclei of Allium cepa cells
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作者 TAO WEI, CHANG HUI YAN, TAO CAI, SHUI HAO, ZHONG HE ZHAI (College of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, China) (Institute of Genetics and Cytology, Northeast Normal University, Changchun Jilin 130024, China) 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2001年第1期68-73,共6页
Nuclear bodies have long been noted in interphase nuclei of plant cells, but their structural component, origin and function are still unclear by now. The present work showed in onion cells the nuclear bodies appeared... Nuclear bodies have long been noted in interphase nuclei of plant cells, but their structural component, origin and function are still unclear by now. The present work showed in onion cells the nuclear bodies appeared as a spherical structure about 0.3 to 0.8 microm in diameter. They possibly were formed in nucleolus and subsequently released, and entered into nucleoplasm. Observation through cytochemical staining method at the ultrastructural level confirmed that nuclear bodies consisted of ribonucleoproteins (RNPs) and silver-stainable proteins. Immunocytochemical results revealed that nuclear bodies contained no DNA and ribosomal gene transcription factor (UBF). Based on these data, we suggested that nuclear bodies are not related to the ribosome or other gene transcription activities, instead they may act as subnuclear structures for RNPs transport from nucleolus to cytoplasm, and may also be involved in splicing of pre-mRNAs. 展开更多
关键词 Pol1 Transcription Initiation Complex proteins Cell nucleolus Cell Nucleus DNA DNA-Binding proteins INTERPHASE Microscopy Electron Onions Plant Components RNA Messenger Research Support Non-U.S. Gov't RIBONUCLEOproteinS Silver Staining Transcription Factors
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过表达核糖体装配调控蛋白NOG1对番茄果实大小的影响
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作者 赵一博 赵慧 +5 位作者 丁艳 曾博 马杰莹 王文茹 郭江波 辛翠花 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期39-44,共6页
作物果实大小是作物非常重要的农艺性状,直接影响经济效益。核仁G蛋白-1(NOG1)通过调控核糖体60S大亚基的装配影响细胞蛋白质的合成,而蛋白质的合成与作物果实大小有关。但目前尚不清楚NOG1是否参与调控植物果实大小的形成。为了研究NOG... 作物果实大小是作物非常重要的农艺性状,直接影响经济效益。核仁G蛋白-1(NOG1)通过调控核糖体60S大亚基的装配影响细胞蛋白质的合成,而蛋白质的合成与作物果实大小有关。但目前尚不清楚NOG1是否参与调控植物果实大小的形成。为了研究NOG1是否参与调控植物果实大小,本试验构建了NOG1过表达载体(OE)转化番茄品种Micro-Tom,得到23棵T1代过表达转基因阳性苗。对T2代阳性苗和对照果实大小和重量分析的结果表明:过表达NOG1可以增加转基因番茄果实的大小和重量。这些结果说明NOG1蛋白通过控制蛋白质合成,参与了植物调控果实大小。 展开更多
关键词 核仁G蛋白-1(NOG1) 过表达 果实大小 蛋白质合成
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乳腺癌组织中核仁纺缍体相关蛋白1表达与腋窝淋巴结转移的关系 被引量:4
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作者 张顺礼 王雅琪 +4 位作者 胡继卫 马杰 谷峥 王宇 张景华 《肿瘤学杂志》 CAS 2020年第11期957-961,共5页
[目的]探讨乳腺癌组织中核仁纺缍体相关蛋白1 (nucleolus spinosa-related protein 1,NuSAP1)的表达与腋窝淋巴结转移的关系。[方法]采用免疫组织化学染色法检测100例乳腺癌组织(浸润性导管癌)及其配对的癌旁组织(距离肿瘤边缘>3cm)... [目的]探讨乳腺癌组织中核仁纺缍体相关蛋白1 (nucleolus spinosa-related protein 1,NuSAP1)的表达与腋窝淋巴结转移的关系。[方法]采用免疫组织化学染色法检测100例乳腺癌组织(浸润性导管癌)及其配对的癌旁组织(距离肿瘤边缘>3cm)中NuSAP1、Hedgehog信号通路相关蛋白(Smo和Gli-1)表达水平。采用Logistic多因素分析影响乳腺癌腋窝淋巴结转移的影响因素。[结果]乳腺癌组织中NuSAP1高表达率为65%(65/100),明显高于癌旁组织的18%(18/100)(χ2=45.945,P<0.001)。NuSAP1高表达组中WHO分级Ⅲ级、TNMⅢ期、腋窝淋巴结转移率均高于低表达组(P<0.05)。WHO分级Ⅲ级(OR=1.689,95%CI:1.240~3.333)、TNMⅢ期(OR=1.543,95%CI:1.345~3.602)、三阴性乳腺癌(OR=2.786,95%CI:1.764~4.002)和NuSAP1高表达(OR=2.507,95%CI:1.684~3.971)是乳腺癌患者腋窝淋巴结转移的独立影响因素(P<0.05)。NuSAP1表达水平与腋窝淋巴结转移数目呈正相关(r=0.561,P<0.001)。NuSAP1表达与Smo、Gli-1表达水平呈正相关(r分别为0.748和0.528,P均<0.001)。[结论] NuSAP1可能通过激活Hedgehog信号通路参与腋窝淋巴结的转移。 展开更多
关键词 乳腺癌 核仁纺缍体相关蛋白1 淋巴结转移 免疫组织化学染色法
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