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题名OATP1B1蛋白结构与功能的生物信息学分析
被引量:2
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作者
刘嘉伟
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机构
南昌大学药学院
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第7期2230-2235,共6页
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基金
江西省自然科学基金项目(20161BAB205281)资助。
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文摘
有机阴离子转运多肽1B1(OATP1B1)是有机阴离子转运多肽OATP超家族的膜转运蛋白,在药物的吸收、分布、代谢、排泄过程中发挥着重要的作用。本研究从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中检索OATP1B1膜蛋白的氨基酸序列,运用生物信息学在线分析软件对OATP1B1蛋白的理化性质、保守结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点及相互作用蛋白拓扑网络进行了预测分析。结果表明,OATP1B1为疏水性蛋白,分子中存在12个跨膜结构域,无信号肽序列,有多个磷酸化位点和糖基化位点,是高度磷酸化的糖蛋白。蛋白质二级结构软件在线预测显示,无规则卷曲占46.16%,α-螺旋占34.15%,延伸链占17.66%,β-转角占2.03%。对其相互作用蛋白的拓扑网络预测发现,OATP1B1主要参与胆汁酸,胆汁盐,甲状腺激素等的转运,与药物转运进肝细胞密切相关,另外还参与胆汁分泌。本研究可为研究OATP1B1的药物转运、代谢、排泄机制和联合用药提供理论基础。
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关键词
oatp1b1蛋白
生物信息学
理化性质
蛋白质修饰位点
蛋白相互作用
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Keywords
oatp1b1
bioinformatics
Physicochemical properties
Protein modification sites
Protein interaction
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分类号
Q51
[生物学—生物化学]
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