美国红鱼虹彩病毒ATP酶基因ORF核心序列克隆与分析

根据真鲷虹彩病毒ATP酶基因设计引物，从患暴发性流行病的美国红鱼(Sciaenop ocellatus)脾脏组织中扩增到一条约560bp的特征带。将PCR产物克隆入pGEM-T Easy载体，序列分析表明，PCR产物长563bp，与报道的从真鲷虹彩病毒ATPase基因ORF中扩增出的片段长度一致。PCR产物序列与几种脊椎动物虹彩病毒ATPase基因的ORF序列比较发现，克隆序列与所报道的鱼类虹彩病毒ATPase基因OPF的核心序列的同源性达95．6％以上；与蛙病毒3(FV3)的ATPase基因同源性为40％左右。据此认为引起美国红鱼暴发性流行病的病原为虹彩病毒，暂定名为美国红鱼虹彩病毒(Sciaenop Ocellatus lridovirus，简称SOI)。序列比较和系统树分析表明，我们比较的几种引起鱼类系统性疾病的虹彩病毒很可能是同一类群的病毒，但他们既不属于蛙病毒属，也不属于淋巴囊肿病毒属，可能是虹彩病毒科的一个新类群。