河北猪繁殖与呼吸综合征病毒地方株HB-4(hs)株ORF5-7基因变异分析

为了给河北地区预防和控制猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）提供理论数据，根据GenBank公布的PRRSV CH-1a株和JXA1株的核苷酸序列，设计并合成三对特异性引物。应用RT-PCR方法分别扩增PRRSV HB-4（hs）株的ORF5，ORF6，ORF7基因片段。分别将片段克隆入pGmT载体后进行测序，并与多株GenBank中发表的PRRSV毒株ORF5—7基因的核苷酸序列进行比较和变异分析。结果表明，PRRSV HB-4（hs）株属于美洲型，其与近两年流行的毒株群相似性高达98．8％～99．5％；与早些年流行毒株群相似性较低，为91．9％～92．6％。系统进化树表明：HB-4（hs）株及近两年流衍的毒株可能均由早期分离的河北HB-1（sh）株进化而来。

中国华东地区猪生殖-呼吸道综合征病毒(S_1株)ORF_(5～7)基因特征研究

本研究对我国华东地区猪生殖和呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）分离株Ｓ１主要结构蛋白基因（ＯＲＦ５～７）进行了ＰＣＲ扩增和ＤＮＡ测序分析。结果表明，长度为１５２０ｂｐＤＮＡ序列含有３个阅读框ＯＲＦｓ，即ＯＲＦ５、ＯＲＦ６和ＯＲＦ７，ＯＲＦ５和ＯＲＦ６及ＯＲＦ６和ＯＲＦ７间有部分碱基重叠，且与欧洲型和美洲型ＰＲＲＳＶ相似。ＯＲＦｓ推导的氨基酸序列与美国ＶＲ２３３２和欧洲ＬＶ毒株同源性分析为９９％～１００％和５９％～７８％。ＯＲＦｓ预测的蛋白质分子量、等电点、糖基化位点、亲水性分布图及跨膜螺旋区与ＶＲ２３３２毒株相似。

2006年-2008年河南省PRRSV分子流行病学调查

根据GenBank公布的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332株的NSP2,ORF5-7基因的核苷酸序列,设计合成5对特异性引物,用RT-PCR方法扩增出10株PRRSV河南地方株的NSP2和ORF5-7片段,将扩增片段克隆到pMD-18T载体并进行测序。应用DNAStar序列分析软件对分离株的NSP2和ORF5-7基因和其推导的氨基酸序列与不同来源的PRRS毒株进行了同源性比较,结果表明PRRSV河南分离株的NSP2和ORF5-7基因与不同来源美洲型毒株之间的同源性分别为89.1%-98.1%和81.4%-96.1%,而与欧洲型毒株之间的同源性仅为46.7%-61.7%和44.7%-45.9%;同时将PRRSV河南分离株NSP2和ORF5-7基因的推导氨基酸序列与其他美洲型PRRSV毒株进行变异分析比较,证实了PRRSV河南分离株NSP2和ORF5-7基因发生了变异。