北京市新型冠状病毒核酸检测混检策略应用

目的通过收集北京市新型冠状病毒样本混采核酸检测结果,评价混采检出能力,总结规律,为新型冠状病毒及其它传染病病原体混采策略提供参考。方法收集北京市2022年11月3日至17日10合1混采阳性样本,对其中核酸阳性感染者进行流行病学调查和实验室检测,汇总分析。结果累计收集942管10合1混采阳性样本,每管检出(0.98±0.05)例感染者。混采开放读码框1ab(open reading frame,ORF1ab)基因、核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,N)基因Ct值≥30占单采检出感染者812管混管的百分比分别为59.7%、67.9%。单采ORF1ab基因、N基因Ct值<30占检出923例感染者的百分比分别为72.2%、64.6%。混采与单采的O、N基因差值均值分别为(4.44±6.85)、(4.40±6.93)。空间分布显示,混管及单采阳性感染者分布存在明显空间聚集性。结论混检策略在实际应用过程中能有效发现阳性感染者。今后开展人群感染情况检测时,应用混采筛查也能有效判断空间聚集性,实现预警作用。

SARS-CoV-2混合稀释样本核酸检测效能分析

目的评价混合稀释样本在新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸检测的效能,为大规模人群的SARS-CoV-2核酸检测提供参考方案。方法于2021年3月至2021年11月分别采用有固定Ct值靶值的国家卫健委SARS-CoV-2阳性质控和第三方试剂公司的SARS-CoV-2弱阳性质控样本,用阴性样本分别以1∶5、1∶10、1∶15、1∶20进行稀释。以实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)检测原始及各稀释度样本SARS-CoV-2双靶标ORF1ab基因和N基因,通过统计学分析混合样本检测效能。结果阳性与弱阳性质控样本ORF1ab基因和N基因检测Ct值随样本稀释倍数增大而不断增大,各组检测Ct值均值一致性差异有统计学意义,阳性与弱阳性质控样本ORF1ab和N基因P值分别为0.015、0.013、0.021、0.023,均P<0.05。阳性与弱阳性质控样本ORF1ab基因和N基因阳性检出率随样本稀释倍数增加而下降。阳性质控样本在1∶20稀释时出现阴性检测结果;弱阳性质控样本超出1∶10稀释时出现阴性检测结果,且随着稀释倍数的增大超出试剂检测限,出现Ct值检测不出现象。阳性与弱阳性质控样本两靶标基因检测Ct值与稀释倍数之间相关系数均在0.9以上,呈高度正相关。结论进行大范围人群SARS-CoV-2核酸检测筛查时,混合稀释样本应尽可能选择低倍稀释,不应超过10倍稀释,低于试剂检测限可造成假阴性结果。