斑马鱼Z-OTU蛋白在卵子发生和胚胎发育早期的表达(英文)

斑马鱼z-otu基因编码的蛋白可能具有DUBs活性,它包含OTU和TUDOR结构域,属于OTU相关蛋白酶家族的成员。该研究将原核表达的融合蛋白(OTU结构域和GST)纯化后免疫新西兰兔,获得多克隆抗体anti-Z-OTU,并利用该抗体对Z-OTU蛋白质在斑马鱼卵子发生和早期胚胎发育过程中的表达进行了分析。根据原位和整体免疫组织化学检测结果并结合以前的研究结论,分析并比较了z-otu基因的mRNA和蛋白质的分布,发现在卵子发生和早期胚胎发育过程中,z-otu基因的mRNA和蛋白质表达模式存在明显差异:mRNA仅在卵子发生早期表达,卵母细胞受精后才重新开始表达,而其蛋白在卵子发生过程中均表达;在卵子发生过程中,mRNA分布于细胞质中,而蛋白质先分布于细胞核中,然后向细胞质迁移,接着又向卵母细胞生发泡(germinal vesicle,GV)集中。推测Z-OTU蛋白类似于其他具有去泛素化酶活性的OTU相关蛋白酶,对于卵母细胞减数分裂过程中生发泡破裂、生发泡迁移及维持胚胎的分裂是必需的。

不同OTUs划分阈值对湖泊浮游细菌α多样性的影响

微生物研究中,湖泊浮游细菌微生物群落的α多样性通过OTUs（operation taxonomy units）来分析评价。考察了现有手段下不同OTUs划分阈值或分类单元＂属＂水平对α多样性大小和趋势的影响,并推断了分类单元＂属＂所对应的OTUs划分阈值。通过454高通量测序技术研究了南京莫愁湖、前湖、玄武湖、紫霞湖4个湖泊的浮游细菌微生物群落,探讨了不同OTUs划分阈值对α多样性指数OTUs、Chao1、Invsimpson、Shannon的影响。结果发现,OTUs划分阈值不同,OTUs和Chao1指数变化一致,Invsimpson和Shannon指数变化一致;在不同的OTUs划分阈值下,4个湖泊的OTUs和Chao1指数在不同季节的排序基本保持不变,Invsimpson和Shannon指数在不同季节的排序发生改变。表明,分类单元＂属＂所对应的OTUs划分阈值在0.06~0.08范围内;原有的以0.03或0.1阈值划分OTUs来分析α多样性是合理的;所用的分析微生物群落α多样性方法是全面的、可靠的。

OTUB2表达下调对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭能力及PI3K/AKT信号通路的影响

目的探讨含OTU结构域的泛素醛结合蛋白2(OTUB2)表达下调对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭能力及磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路的影响。方法采用Lipofectmine 2000转染试剂向MGC-803细胞中转染OTUB2小干扰RNA(si-OTUB2)序列(si-OTUB2组)和si-NC序列(si-NC组),以不进行任何转染的胃癌MGC-803细胞作为空白对照组。分别采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测细胞中OTUB2 mRNA及蛋白的表达水平。采用CCK-8法检测细胞增殖能力,Transwell小室检测细胞迁移和侵袭能力,Western blot检测增殖细胞核抗原(PCNA)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)、AKT、磷酸化蛋白激酶B(p-AKT)蛋白表达水平。结果与空白对照组和si-NC组比较,si-OTUB2组细胞中OTUB2 mRNA及蛋白表达水平降低(P<0.05),细胞增殖能力减弱(P<0.05),细胞迁移数和侵袭数减少(P<0.05),细胞中PCNA、N-cadherin和p-AKT蛋白表达水平降低(P<0.05),E-cadherin蛋白表达水平升高(P<0.05)。结论下调OTUB2可以抑制胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭,其作用机制可能与抑制PI3K/AKT信号通路有关。

长耳鸮Asio otus消化系统形态组织学观察

采用解剖、测量、石蜡切片、HE染色等方法,对2只成年雄性长耳鸮的消化系统进行了形态组织学观察,结果表明:长耳鸮食管粗大,无嗉囊,黏膜褶发达,黏膜层为复层扁平上皮.胃内腺体发达,分布有大量的单管状腺和复管状腺.肌胃内未见明显的类角质膜.十二指肠绒毛长而密,空回肠绒毛稍短且粗.小肠肠腺发达,黏膜上皮为单层柱状上皮,肌肉层以环行肌为主.盲肠壁薄.直肠壁厚.肝脏和胰脏的小叶界限不清晰.

浅析IP Over OTN网络应用中OTU单板波分侧业务调度

本文拟对中兴传输骨干网南杭ZXM900波分系统上开放IP业务在OTN网的边界物理器件OTU波长转换单元波分侧出现收信端口硬件故障时,如何利用现有资源进行有效业务调度,并进一步实验论证了不同厂家的波分设备(国内两大设备供应商中兴、华为)在波分侧调度的可能性与否,运用理论进行分析及初步的探讨。

稀有OTU对海洋底栖纤毛虫群落异质性的影响研究

运用高通量测序技术分析微型生物多样性时,生物学重复间常表现出明显的异质性,这可能是高比例的稀有可操作分类单元(operated taxonomic unit,OTU)造成的“假象”。为明晰陆架海区站位间及同一站位重复间底栖纤毛虫群落的异质性水平,并探明稀有OTU与群落异质性的关系,给出去除稀有OTU阈值的科学建议。本研究在东海选取具有明显环境梯度的4个站位,每站位采集3个重复沉积物,采用高通量测序技术研究纤毛虫群落与分布。研究表明同一站位重复间群落不相似度在30%~34%,重复间群落的高差异性会掩盖地理距离较近的站位间差异(33%)。各个站位重复间共有OTU分别占该站位检获的总OTU数的34.4%,31.9%,39.5%和36.5%,而序列数基本占据94%以上。相对丰度小于0.1%的OTU占总OTU数的80%。依次去除相对丰度低于0.01%至0.1%的OTU,发现去除稀有OTU能够有效降低重复间差异,去除越稀有的OTU,降低效果越强;对站位之间的差异影响较小,且站位差异越大影响越小。稀有OTU的分布随机性极强,基本与站位无关。相对丰度低于0.015%的OTU是造成重复间群落异质性的主要原因,去除该部分OTU可更真实地展现底栖纤毛虫的群落异质性。

赛罕乌拉国家级自然保护区红角鸮(Otus scops)的繁殖生态观察

为了解红角鸮(Otus scops)的繁殖状态,2009年5～8月,在内蒙古赛罕乌拉国家级自然保护区,以直接观察法对红角鸮的繁殖生态进行了研究。结果表明,所观察的4个巢址全部是以柳树为主干的树洞巢,巢内铺垫物较少或无铺垫,巢距地面的平均高度为91.3cm,巢内径平均为13.5cm,巢外径平均为15.0cm,巢深平均32.0cm(n=4)。平均窝卵数为3.75,对其中一窝进行测量,4枚卵平均量度是28.9mm×24.6mm,重量9.5g。雏鸟孵出后,雌性亲鸟承担主要育雏任务,雄性亲鸟日间停歇于离巢不远的树上负责警戒工作,夜间与雌鸟共同哺育雏鸟。小型鼬科动物的捕食可能是干扰红角鸮繁殖成功率的主要因素。

棉花黄萎菌病毒VdCV1 OTU蛋白的表达及纯化

采用Gateway技术将棉花黄萎菌病毒Vd CV1的OTU蛋白基因克隆至原核表达载体p ET42-DEST中,并在大肠杆菌Escherichia coli BL21中诱导表达,然后通过镍柱亲和层析和分子筛纯化得到纯化的目的蛋白,并进行Western Blot检测。结果表明,BL21表达的OTU蛋白以包涵体形式存在,大小为97 ku。Western Blot检测表明,His标签抗体能与97 ku左右的OUT-His融合蛋白特异性结合。

OTU上定时再生电路中锁相环抑制抖动的研究

重点介绍了在抖动性能要求下确定定时再生器中锁相环参数的定性分析方法 ;讨论锁相环参数的变化对外接滤波器电阻和电容值的影响 ;以及提出了在抖动容限下要求的最低带宽的计算方法 ,对实际工程中的应用具有指导意义 ;

OTUB1在90例卵巢黏液性肿瘤中的表达分析

背景与目的:卵巢黏液性肿瘤是卵巢上皮性肿瘤的主要亚型之一,其恶变机制目前尚未明确。泛素化是人体主要的翻译后修饰机制,并与肿瘤密切相关。去泛素化酶可通过逆转泛素化过程从而影响肿瘤的发生、发展。该研究旨在分析编码人体最主要的去泛素化酶的癌基因泛素醛结合物1(OTU deubiquitinase,ubiquitin aldehyde binding 1,OTUB1)在卵巢黏液性肿瘤中的蛋白表达及临床应用。方法:收集2010—2015年复旦大学附属妇产科医院病理科诊断的卵巢良性黏液性囊腺瘤、卵巢交界性黏液性肿瘤及卵巢原发性黏液性癌病例共90例,收集临床病理资料,完成OTUB1的免疫组织化学法表达实验并作统计分析。结果:90例卵巢黏液性肿瘤中,卵巢良性黏液性囊腺瘤有14例,卵巢交界性黏液性肿瘤有17例,卵巢原发性黏液性癌有59例。OTUB1在卵巢原发性黏液性癌的蛋白表达率及阳性程度显著高于卵巢良性黏液性囊腺瘤(P<0.01);OTUB1在卵巢交界性黏液性肿瘤中上皮内癌的阳性率显著高于肠型交界性黏液性肿瘤(P<0.01);随着FIGO分期增高,OTUB1的阳性率及阳性程度增加(P<0.05);OTUB1在输卵管有累及的患者中表达率及阳性程度均高于未累及者(P<0.05);OTUB1在子宫和大网膜累及的患者中阳性率及阳性程度均高于未累及者(P<0.05);OTUB1在有淋巴结转移的患者中表达率及阳性程度均高于无转移者(P<0.05)。结论:OTUB1在卵巢原发性黏液性癌中的蛋白表达水平明显高于卵巢良性黏液性囊腺瘤,并且和FIGO分期及肿瘤侵袭转移性高度相关。在临床病理中可将OTUB1作为卵巢黏液性肿瘤恶变与否的评价指标及肿瘤进展的辅助判别指标。

DWDM系统中OTU中继功能的应用

对DWDM系统中OTU的中继功能做了简要阐述,将利用OTU中继功能进行光纤直连方案与采用点对点DWDM设备组网方案进行了比较,并结合漳州本地网DWDM扩波和优化工程说明其实际应用。

Avancon公司推出万向传输单元(OTU)

瑞士Avancon股份有限公司生产的万向传输单元(Omni-directional Transfer Unit,OTU),可应用在内部物流系统的输送装置上。OTU可用于进料装置、开关、转向器、交叉点、输送器、分拣机等,实现任意方向的输送;或组合成任意长度和宽度的OTU换向台,并以现场总线为接口,建立起一套完整的控制系统。每个OTU都由尺寸为75×75×133毫米的高科技聚合物材料构成,并配有一个能够向任意方向驱动滚轮的齿架。滚轮包覆聚氨酯,通过每个单元内部的锥齿轮系统驱动。

PCB高速信号设计及其在OTU设计中的应用

符合MSA协议的光器件由于管脚之间的不匹配,其电接口之间的互联一直是高速数字信号电路设计的难点。作者在此给出了一种新的解决思路,相对于传统的方法而言,它能够更好地提高系统稳定性,维护传输信号质量,降低成本。本文主要从理论上论述了这种方案的可行性,同时定性地给出了各参数对信号质量的影响。分析结果表明,精密的阻抗控制和合理的PCB布局可以满足高速电信号的印制线互连。

OTU在WDM中的使用

OTU在WDM系统中占据重要地位 ,对其进行研究有可能优化WDM和SDH系统。本文介绍了OTU的概念、特点及其运用。

朗讯OLS 1.6T DWDM系统OTU告警详解

朗讯公司OLS1.6TDWDM系统可在C波段和L波段上最多支持160路10Gbit/s信号,在国内电信运营商中得到广泛应用。其中在中国电信南沿海干线上应用的C波段80×10Gbit/s系统目前已接近满配置,部分段落已经满配置,这也成为我国迄今为止实际建成的最高速率的传输系统之一。本文对该系统的OTU告警将进行举例分析。

DWDM光网络中发送OTU输出口性能研究

本文以中国高速信息示范网(CAINONET)为对象,研究了在由OXC和OADM构成的光网络中,发送OTU输出口(光发射机)的主要性能参数,包括调制方式、中心频率偏移、发射功率、调制啁啾、光源谱线宽度、消光比等,对光网络性能的影响,并利用CAINONET仿真平台进行了仿真,得出了有益的结论,为CAINONET联网调试、扩充升级和光网络的标准化提供了参考和建议。

OTUD5在宫颈癌中的表达及对Hela细胞增殖的影响

目的:探讨OTUD5在宫颈癌组织的表达及OTUD5过表达对宫颈癌Hela细胞系增殖的影响。方法:采用免疫组化及RNA聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT PCR)技术检测宫颈癌组织及癌旁组织的OTUD5表达;Western blotting检测人宫颈癌Hela细胞中OTUD5蛋白的表达情况;构建过表达OTUD5的Hela细胞系,采用CCK-8法和平板克隆技术检测过表达组及对照组细胞增殖能力的变化。结果:OTUD5阳性表达主要着色于细胞浆,在宫颈癌组织中,高表达率为38.3%(23/60),在癌旁组织中高表达率为21.7%(13/60),两组之间行χ^2检验,差异有统计学意义(χ^2=3.968,P=0.046);在新鲜癌组织及癌旁组织之间,OTUD5 mRNA表达水平明显高于癌旁组织,差异均有统计学意义(P<0.05)。pcDNA3.1转染后细胞内OTUD5蛋白相对表达水平为0.435±0.048,pcDNA3.1-OTUD5转染后细胞内OTUD5蛋白相对表达水平为0.224±0.139,两组间差异有统计学意义(t=-3.162,P=0.012)。CCK-8法及平板克隆实验显示,过表达OTUD5组较对照组增殖及克隆能力均增强(P<0.05)。结论:OTUD5在宫颈癌中高表达,并能促进Hela细胞的克隆及增殖。

阿尔卡特朗讯Wave Star OLS 1.6T DWDM系统OTU告警案例详解

阿尔卡特朗讯WaveStarOLS1.6TDWDM系统可在C波段和L波段上最多支持160路10Gbit/s信号,在国内电信运营商中广泛应用。其中在中国电信南沿海干线上应用的C波段80×10Gbit/s系统,目前已接近满配置,部分段落已经满配置,是我国迄今为止实际建成的最高速率的传输系统之一。OLS1.6T的告警情况与其他设备有很大不同,尤其是与OTU有关的告警,因此熟练掌握OTU相关告警,对做好该系统的维护工作至关重要。

去泛素化酶OTUD3调控PTEN肿瘤相关突变体蛋白稳定性的研究

目的 探索去泛素化酶含OTU结构域蛋白3(OTUD3)在乳腺癌中对抑癌蛋白PTEN肿瘤相关突变体蛋白稳定性的调控。方法 收集50例乳腺癌患者样本,提取癌与癌旁组织的RNA后进行逆转录,对PTEN C2结构域进行PCR扩增后测序分析,鉴定乳腺癌PTEN C2结构域的肿瘤相关突变。结合现有数据库中PTEN基因的突变位点信息,将PTEN突变体的编码序列扩增后插入哺乳动物表达载体pCMV-Myc中,构建含有PTEN C2结构域肿瘤相关突变体基因的质粒载体。将上述含PTEN点突变体或截短体基因的质粒载体分别与含OTUD3基因的质粒载体共转染MCF-7细胞,通过免疫共沉淀实验、半衰期实验、泛素化实验及Western印迹实验分别检测PTEN所有突变体与OTUD3结合能力、OTUD3对部分PTEN突变体蛋白稳定性的维持能力及去泛素化修饰能力。结果 从50例乳腺癌病例中鉴定出PTEN C2结构域有3种突变,即I224M、E307K与F341V,其中F341V是本研究在乳腺癌病例中首次鉴定出的PTEN突变体。△M199、F341V以及1-319丧失了与OTUD3结合的能力,从而失去了OTUD3对其的稳定作用。结论 在乳腺癌中,PTEN的一些突变体丧失了与OTUD3结合的能力,不能对其去泛素化修饰,使得蛋白稳定性降低。

拟穴青蟹OTUB的分子克隆及其在性腺发育过程中的表达

OTUB1是哺乳动物雌激素信号通路中的一个关键因子,它可以使雌激素受体α(ERα)去泛素化并抑制其转录活性。本研究从实验室拟穴青蟹(Scylla paramamosain)转录组测序数据库中筛选出OTUB基因片段,利用SMART RACE技术克隆得到Sp-OTUB的cDNA全长。该序列全长1 261 bp,包括5'非编码区(5'-UTR)40 bp,开放阅读框(ORF)804 bp和3'非编码区(3'-UTR)417 bp。其ORF编码267个氨基酸,预测其分子量为31 ku。该蛋白序列中包含一个OTU样的半胱氨酸蛋白酶催化结构域和一个由半胱氨酸(C)、天冬氨酸(D)和组氨酸(H)组成的催化三联体。实时定量PCR结果显示,Sp-OTUB在成熟拟穴青蟹各组织器官中均有表达,其中在血淋巴中的表达量最大,精巢中表达量最低。在卵巢发育过程中,Sp-OTUB的表达量在卵巢增值期为最大,与其他各时期具有显著差异;在精巢发育各阶段,Sp-OTUB表达量在精子细胞期达到最大,显著高于精母细胞期和成熟精子期。同源系统进化分析Sp-OTUB与大多数物种的OTUB1聚为一支,与肩突硬蜱(Ixodes scapularis)和紫海胆(Strongylocentrotuspurpuratus)亲缘关系最近。实验结果初步显示Sp-OTUB在拟穴青蟹生殖调控方面可能发挥重要作用。