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短蛸(Octopus ocellatus)四个地理群体遗传特性的AFLP分析 被引量:8
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作者 张龙岗 杨建敏 +4 位作者 刘相全 王卫军 孙国华 刘丽娟 郑小东 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期803-807,共5页
应用AFLP标记技术对我国北方近海短蛸的遗传多样性进行分析。采用6对AFLP引物组合对4个群体(大连、烟台、青岛、连云港)120个个体进行扩增,其中每对引物扩增位点数在42—66之间,共得到303个扩增位点。4个群体内的多态位点比例为62.03%—... 应用AFLP标记技术对我国北方近海短蛸的遗传多样性进行分析。采用6对AFLP引物组合对4个群体(大连、烟台、青岛、连云港)120个个体进行扩增,其中每对引物扩增位点数在42—66之间,共得到303个扩增位点。4个群体内的多态位点比例为62.03%—67.93%。群体的Nei’s基因多样性指数(H)为0.2353—0.2617,Shannon多样性指数(I)为0.3497—0.3863,群体间的遗传距离为0.0497—0.085;大连群体的多态位点比例、Shannon多样性指数和群体Nei’s基因多样性指数均高于其它三个群体。用UPGMA方法构建的群体系统进化树显示,大连群体与烟台群体聚到一起,青岛群体与连云港群体聚到一起,显示群体间具有典型的地理特征,但群体间存在遗传渗透。分子变异分析(AMOVA)结果表明,短蛸群体88.28%的变异来源于群体内,群体间的变异占11.72%,显示短蛸的遗传变异主要来源于群体内个体间,但群体间已经有了一定程度的遗传分化。 展开更多
关键词 短蛸 aflp分析 遗传多样性
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Analysis of genetic diversity in banana cultivars(Musa cvs.) from the South of Oman using AFLP markers and classification by phylogenetic,hierarchical clustering and principal component analyses 被引量:2
2
作者 Umezuruike Linus OPARA Dan JACOBSON Nadiya Abubakar AL-SAADY 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2010年第5期332-341,共10页
Banana is an important crop grown in Oman and there is a dearth of information on its genetic diversity to assist in crop breeding and improvement programs.This study employed amplified fragment length polymorphism(AF... Banana is an important crop grown in Oman and there is a dearth of information on its genetic diversity to assist in crop breeding and improvement programs.This study employed amplified fragment length polymorphism(AFLP) to investigate the genetic variation in local banana cultivars from the southern region of Oman.Using 12 primer combinations,a total of 1094 bands were scored,of which 1012 were polymorphic.Eighty-two unique markers were identified,which revealed the distinct separation of the seven cultivars.The results obtained show that AFLP can be used to differentiate the banana cultivars.Further classification by phylogenetic,hierarchical clustering and principal component analyses showed significant differences between the clusters found with molecular markers and those clusters created by previous studies using morphological analysis.Based on the analytical results,a consensus dendrogram of the banana cultivars is presented. 展开更多
关键词 MUSA genetic diversity Amplified fragment length polymorphism(aflp) PHYLOgeneticS Principal component analysis(PCA) Hierarchical clustering analysis(HCA) Oman
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黄瓜种质资源遗传多样性及其亲缘关系的AFLP分析 被引量:67
3
作者 李锡香 朱德蔚 +3 位作者 杜永臣 沈镝 孔秋生 宋江萍 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期309-314,共6页
采用AFLP分子标记技术 ,对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析 ,结果表明 8对AFLP引物在 70份黄瓜种质中共扩增出 4 2 5条带 ,多态性带的比例为 6 6 %。供试黄瓜种质的平均期望杂合度为 0 376 ,中国种质的平均... 采用AFLP分子标记技术 ,对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析 ,结果表明 8对AFLP引物在 70份黄瓜种质中共扩增出 4 2 5条带 ,多态性带的比例为 6 6 %。供试黄瓜种质的平均期望杂合度为 0 376 ,中国种质的平均期望杂合度为 0 387,明显高于国外种质的 0 2 91。西双版纳黄瓜和印度野生黄瓜具有一些栽培种质没有的特异位点 ,中国栽培种质的特异位点多于外来栽培种质 ,后者也有一些中国栽培种质没有的特异位点。聚类分析将 70份种质分为三大组群 ,即西双版纳黄瓜 (CucumissativusL .var.xishuangbannanesisQietYuan)组群 ,C .sativusvar.hardwickii野生黄瓜组群和栽培黄瓜组群。西双版纳黄瓜与栽培黄瓜的距离最远 ,与野生黄瓜次之。按一定的遗传距离可以将中国和外来栽培种质分开。大多数华南型和华北型种质归属于不同的亚组。 展开更多
关键词 黄瓜 种质资源 遗传多样性 aflp分子标记 聚类分析
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中国境内不同地理型东方蜜蜂遗传多样性的AFLP分析 被引量:24
4
作者 姜玉锁 刘文忠 +4 位作者 张春香 乔利英 朱文进 张桂贤 郭传甲 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期144-152,共9页
利用22对AFLP引物组合对我国9个省市的11个东方蜜蜂种群和1个西方蜜蜂种群的39个个体基因组DNA的遗传变异进行了研究;根据AFLP分析结果,采用GeneScan3.0软件、群体遗传数据分析包(Hickoryv1.0.4)和群体遗传变异分析程序(AFLP-SURV1.0),... 利用22对AFLP引物组合对我国9个省市的11个东方蜜蜂种群和1个西方蜜蜂种群的39个个体基因组DNA的遗传变异进行了研究;根据AFLP分析结果,采用GeneScan3.0软件、群体遗传数据分析包(Hickoryv1.0.4)和群体遗传变异分析程序(AFLP-SURV1.0),分别计算了39个个体间的遗传相似系数和各蜜蜂种群的Nei’s遗传距离、Reynolds遗传距离和成对的固定指数Fst,并构建了各自的UPGMA聚类关系图。结果表明:AFLP标记具有很高的多态检测效率,适合于蜜蜂种群遗传多样性分析和品种鉴定。蜜蜂种间的遗传分化明显,亲缘关系较远。中国境内不同地理型东方蜜蜂群体间存在着广泛的遗传变异。UPMGA聚类关系图显示,海南东方蜜蜂由于长期的海岛隔离,已经形成了一个独特的类群,支持了通过形态学认定的海南东方蜜蜂为东方蜜蜂的一个新亚种。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 西方蜜蜂 生态型 aflp分析 遗传多样性 中国
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AFLP标记在玉米种质资源鉴定中的应用 被引量:12
5
作者 杜金友 靳占忠 +3 位作者 徐兴友 耿立英 王天宇 黎裕 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期927-932,共6页
利用AFLP分子标记技术对55份玉米(Z ea m ay s L.)种质材料进行了研究.结果表明,20对AFLP引物检测到清晰可见的带656条,其中多态性带487条.平均每个引物组合可以检测到24.4条多态性带.将55份玉米材料聚为6组,与材料来源基本一致.结果显... 利用AFLP分子标记技术对55份玉米(Z ea m ay s L.)种质材料进行了研究.结果表明,20对AFLP引物检测到清晰可见的带656条,其中多态性带487条.平均每个引物组合可以检测到24.4条多态性带.将55份玉米材料聚为6组,与材料来源基本一致.结果显示AFLP有利于玉米遗传多样性分析.对来源美国先锋的P ioneer系列与瑞得种群和BSSS种群的关系进行了初步探讨,认为P ioneer系列中有很多材料与瑞得种群有亲缘关系. 展开更多
关键词 玉米 aflp 遗传多样性 聚类分析
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西瓜二倍体及同源多倍体遗传差异的AFLP分析 被引量:50
6
作者 刘文革 王鸣 阎志红 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期46-49,共4页
试验以蜜枚和JM西瓜品种的纯合二倍体及其人工诱导的同源四倍体、三倍体为材料,对不同倍性西瓜AFLP标记的分子遗传变异进行了比较。结果表明:共筛选48对引物组合,获得4800~5000条位于50~600bp的片段,大部分引物组合扩增出的不同倍性... 试验以蜜枚和JM西瓜品种的纯合二倍体及其人工诱导的同源四倍体、三倍体为材料,对不同倍性西瓜AFLP标记的分子遗传变异进行了比较。结果表明:共筛选48对引物组合,获得4800~5000条位于50~600bp的片段,大部分引物组合扩增出的不同倍性之间的AFLP条带没有明显差异;蜜枚品种西瓜具有多态性的条带有3条,其中1条为四倍体特有带,1条为三倍体特有带,1条为二倍体特有带;JM西瓜具有多态性的条带有7条,3条为JM4x特有带,2条为JM3x特有带,2条为JM2x特有带,不同倍性西瓜之间多态性较低。同源四倍体和相应的二倍体相比,有特异性片段的消失或增加,也有扩增出双亲皆有或皆无而三倍体F1消失或增加的DNA片段。 展开更多
关键词 西瓜 同源多倍体 遗传差异 aflp分析
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部分牡丹品种遗传多样性的AFLP分析 被引量:40
7
作者 侯小改 尹伟伦 +1 位作者 李嘉珏 王华芳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期1709-1715,共7页
目的研究牡丹遗传多样性为合理利用牡丹种质资源、培育观赏价值高的牡丹新品种提供依据。方法利用荧光标记AFLP技术,采用8对M+3和P+3引物组合对30份牡丹栽培品种进行了总基因组DNA水平上的多态性检测。结果检测结果共获得1123条可统计... 目的研究牡丹遗传多样性为合理利用牡丹种质资源、培育观赏价值高的牡丹新品种提供依据。方法利用荧光标记AFLP技术,采用8对M+3和P+3引物组合对30份牡丹栽培品种进行了总基因组DNA水平上的多态性检测。结果检测结果共获得1123条可统计的条带,其中965条呈多态性,多态性带百分率达86%。揭示了牡丹栽培种质丰富的遗传多样性。8组引物在30个品种中检测到数目不等的品种特异带型,这些品种的特异带型对供试牡丹品种具有一定的鉴别价值。结论8对引物能将30个牡丹品种完全区分开。聚类分析结果表明多数来源地相同的牡丹种质表现出较为密切的亲缘关系。 展开更多
关键词 牡丹 遗传多样性 aflp分析
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云南芋种质资源遗传多样性的AFLP分析 被引量:18
8
作者 沈镝 朱德蔚 +1 位作者 李锡香 宋江萍 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期449-453,共5页
采用荧光标记引物的AFLP分子标记技术,用筛选出的“3+2”引物组合,对48份云南芋种质进行遗传多样性分析,3对引物共扩增出184个DNA位点,平均每对引物可检测出56.3个多态性位点,多态性位点高达91.8%,云南芋种质资源在DNA分子水平上表现出... 采用荧光标记引物的AFLP分子标记技术,用筛选出的“3+2”引物组合,对48份云南芋种质进行遗传多样性分析,3对引物共扩增出184个DNA位点,平均每对引物可检测出56.3个多态性位点,多态性位点高达91.8%,云南芋种质资源在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。聚类分析表明:野生种质和栽培种质的亲缘关系较远,栽培种质基于AFLP标记的分类结果与形态性状基本一致,少数材料差异较大。 展开更多
关键词 种质资源 遗传多样性 aflp 聚类分析
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云南省核桃品种遗传多样性的FISH-AFLP分析 被引量:17
9
作者 宁德鲁 马庆国 +3 位作者 张雨 王滑 陆斌 裴东 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2011年第2期189-193,共5页
采用FISH-AFLP技术,选取8对E+3和M+3引物组合,对云南省林木品种审定委员会审(认)定的17个核桃品种(无性系)进行了基因组DNA分子水平上的检测,实验结果共获得987条可统计的条带,其中942条呈多态性,多态性带百分率达95.44%;17份供试核桃... 采用FISH-AFLP技术,选取8对E+3和M+3引物组合,对云南省林木品种审定委员会审(认)定的17个核桃品种(无性系)进行了基因组DNA分子水平上的检测,实验结果共获得987条可统计的条带,其中942条呈多态性,多态性带百分率达95.44%;17份供试核桃样品的遗传相似系数范围为0.606 9 0.796 4,平均为0.734 9。本研究分析了云南省审(认)定核桃品种(无性系)的遗传多样性和亲缘关系,建立了它们的指纹图谱,为下一步的核桃新品种选育、构建核桃优良种质库提供了理论指导。 展开更多
关键词 核桃 品种 遗传多样性 FISH-aflp 聚类分析
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药用灵芝遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
10
作者 郑林用 贾定洪 +1 位作者 罗霞 杨志荣 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第17期1733-1736,共4页
目的:分析不同药用灵芝栽培菌株的遗传差异,为灵芝道地性研究、种质资源鉴定、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供分子生物学依据。方法:以24个来源不同的灵芝及紫芝栽培菌株和野生菌株为材料,采用扩增酶切片断多态性AFLP方法,用NTSY... 目的:分析不同药用灵芝栽培菌株的遗传差异,为灵芝道地性研究、种质资源鉴定、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供分子生物学依据。方法:以24个来源不同的灵芝及紫芝栽培菌株和野生菌株为材料,采用扩增酶切片断多态性AFLP方法,用NTSYSpc 2.1软件进行UPGMA法聚类分析,构建遗传系统树。结果:筛选14对引物,共扩增出177条多态性谱带。聚类结果表明利用AFLP技术可将全部供试材料区分开。结论:药用灵芝栽培菌株在分子水平上存在较大差异,并在相似系数0.676水平上聚为赤芝群和紫芝群。 展开更多
关键词 aflp 灵芝 遗传多样性 聚类分析
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辽宁沿海海蜇与沙海蜇遗传多样性的AFLP分析 被引量:10
11
作者 高祥刚 曹洁 +2 位作者 董婧 刘星 赫崇波 《水产科学》 CAS 北大核心 2009年第2期75-78,共4页
海蜇和沙海蛰均为腔肠动物门的大型食用水母,采用AFLP分子标记技术对辽宁沿海的海蜇野生群体、养殖群体和沙海蜇野生群体共90个个体进行了遗传多样性分析。10对引物共得到560个稳定扩增位点。3个群体的多态性位点比例为海蜇野生群体82.0... 海蜇和沙海蛰均为腔肠动物门的大型食用水母,采用AFLP分子标记技术对辽宁沿海的海蜇野生群体、养殖群体和沙海蜇野生群体共90个个体进行了遗传多样性分析。10对引物共得到560个稳定扩增位点。3个群体的多态性位点比例为海蜇野生群体82.05%,海蜇养殖群体78.46%,沙海蜇野生群体74.10%;平均杂合度分别为0.2072、0.1850和0.2116,Shannon多样性指数分别为0.3248、0.2954和0.3262,海蜇野生群体与海蜇养殖群体和沙海蜇野生群体的遗传距离分别为0.0300和0.2702。分析结果表明,3个群体的遗传多样性均保持了相对较高的水平。 展开更多
关键词 海蜇 沙海蜇 遗传多样性 aflp分析
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野生哲罗鱼种质资源遗传多样性的AFLP分析 被引量:25
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作者 佟广香 匡友谊 尹家胜 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期833-841,共9页
目前哲罗鱼(Hucho taimen)处于濒危状态,野生样品采集较困难,因此对其种群遗传结构了解甚少。本研究应用7对AFLP引物对5个野生哲罗鱼群体(104个体)进行了扩增和遗传结构分析。结果显示7对引物共扩增出193个多态位点,多态位点比率为70.1... 目前哲罗鱼(Hucho taimen)处于濒危状态,野生样品采集较困难,因此对其种群遗传结构了解甚少。本研究应用7对AFLP引物对5个野生哲罗鱼群体(104个体)进行了扩增和遗传结构分析。结果显示7对引物共扩增出193个多态位点,多态位点比率为70.18%;多态性位点数(AP)、多态性位点比率(P)、观测等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)和遗传距离(D)揭示的规律一致,在5个群体中上述指标从大到小依次均为虎头江段2002、抓吉江段、海青江段、虎头江段2006、呼玛河,H在0.148~0.1953之间,I在0.2215~0.2913之间,5个群体的遗传多样性均偏低;且遗传距离(D)、遗传相似度(S)、遗传分化度(Gst)、基因流(Nm)和聚类结果显示5个群体间的基因交流少,遗传分化程度均很大,并在一定程度上存在近亲交配的现象。以上结果表明,哲罗鱼资源量的减少已经影响了其种群遗传多样性,保护野生哲罗鱼资源已迫在眉睫,应采取及时有效的措施对野生哲罗鱼资源进行保护以期恢复哲罗鱼资源。 展开更多
关键词 哲罗鱼 种质资源 遗传多样性 aflp 聚类分析
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基于AFLP的燕麦遗传多样性研究 被引量:26
13
作者 刘欢 慕平 赵桂琴 《草业学报》 CSCD 2008年第6期121-127,共7页
采用AFLP分子标记技术对来自中国、加拿大、澳大利亚和欧洲等国家的34个有代表性的饲用燕麦品种及8个裸燕麦品种进行遗传多样性分析,从30对EcoRI/MseI引物组合中筛选出5对多态性和清晰度较高的引物组合,共获得268条带,其中多态带18... 采用AFLP分子标记技术对来自中国、加拿大、澳大利亚和欧洲等国家的34个有代表性的饲用燕麦品种及8个裸燕麦品种进行遗传多样性分析,从30对EcoRI/MseI引物组合中筛选出5对多态性和清晰度较高的引物组合,共获得268条带,其中多态带185条,平均多态性检出率为69.0%,E-AGG/M-CTA的扩增效率最高达78.6%。由Nei’s指数(h)估测,供试品种平均变异为0.1664,平均Shannon’s信息指数估计值为0.2206;42个燕麦品种间遗传相似系数为0.4881~0.9880,遗传距离的变化范围是0.0120~0.7172。通过AFLP数据构建燕麦的UPGMA系统树,在遗传相似系数0.748水平,所有供试品种可聚为6类。皮燕麦与裸燕麦在遗传相似度0.59处被明显分为2类,与形态学分类结果一致。由AFLP揭示的品种间遗传关系与品种实际来源基本一致,品种的遗传距离与其地理分布关系密切。 展开更多
关键词 燕麦 遗传多样性 aflp 聚类分析
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木豆种质资源AFLP标记遗传多样性分析 被引量:20
14
作者 闫龙 关建平 宗绪晓 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期790-798,共9页
利用AFLP分子标记技术,以木豆野生种(Cajanus scarabaeiodes)为对照,对来自印度、中国、非洲和美洲的139份栽培木豆(Cajanus cajan)种质遗传多样性进行研究。17对引物共扩增出502条清晰可辨的带,其中多态性带494条。遗传相似性系数UPGM... 利用AFLP分子标记技术,以木豆野生种(Cajanus scarabaeiodes)为对照,对来自印度、中国、非洲和美洲的139份栽培木豆(Cajanus cajan)种质遗传多样性进行研究。17对引物共扩增出502条清晰可辨的带,其中多态性带494条。遗传相似性系数UPGMA聚类图,揭示木豆种内存在足够的遗传多样性,可用于种质资源的准确鉴别与分类。借助遗传距离的ME进化树又将参试种质分成8个组群。分析结果表明,印度地方资源遗传多样性广泛,育成品种遗传基础广阔;非洲、美洲资源遗传多样性较丰富,且与印度资源的亲缘关系较密切。中国地方资源遗传多样性独特,且与印度、非洲、美洲栽培木豆资源亲缘关系不明显。研究结果基本支持印度木豆起源和多样性中心、非洲次生多样性中心的观点,并提出中国次生起源中心和遗传多样性中心假说。研究还发现,木豆核质互作雄性不育系(A)和保持系(B)间存在独特的AFLP谱带差异,可能有助于分子标记辅助的木豆杂种优势利用和杂交种培育。 展开更多
关键词 木豆 aflp 聚类分析 遗传多样性 起源中心
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西瓜种质资源的遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析 被引量:18
15
作者 李艳梅 段会军 马峙英 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第B08期177-180,共4页
利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析。结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0... 利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析。结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0.24-0.99之间,平均相似系数为0.70,说明西瓜品种间遗传基础狭窄。用NTSYS软件进行聚类分析,57个西瓜品种被划分为2个类群。其中类群1包括1个野生西瓜,类群2均为栽培种。在类群2中引进的资源聚在一起,杂交种和双亲或其一聚在一起。此外,本研究表明,AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,能够揭示西瓜品种间的差异,是鉴定西瓜品种的有力工具。 展开更多
关键词 西瓜 品种 遗传多样性 亲缘关系 aflp分析
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黑龙江省水稻纹枯病菌的致病力分化与AFLP分析 被引量:7
16
作者 范文艳 文景芝 +2 位作者 金丽娜 马建 陈瑾 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期57-61,共5页
为了明确黑龙江省水稻纹枯病菌遗传多样性,为水稻抗病育种和水稻纹枯病的综合防治提供依据。本文对采自13个水稻种植地区的29个水稻纹枯病菌菌株进行了致病力测定和AFLP分析。结果表明9对AFLP引物对供试菌株扩增出396条带,其中多态性带... 为了明确黑龙江省水稻纹枯病菌遗传多样性,为水稻抗病育种和水稻纹枯病的综合防治提供依据。本文对采自13个水稻种植地区的29个水稻纹枯病菌菌株进行了致病力测定和AFLP分析。结果表明9对AFLP引物对供试菌株扩增出396条带,其中多态性带187条,占总扩增带数的47.22%。黑龙江省水稻纹枯病菌的遗传距离变化在0.50~0.92之间,平均为0.71,群体遗传多样性较为丰富。UPGMA法可以将供试菌株分成4个AFLP聚类组群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ),相同地理来源的菌株基本上聚集在同一组群内,表明AFLP类群划分与菌株的地理来源有较强的相关性。黑龙江省水稻纹枯病菌致病性分化较为明显,并且AFLP类群划分与菌株的致病性鉴定之间存在一定相关性。 展开更多
关键词 水稻纹枯病菌 aflp 致病力 遗传多样性
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桑树二倍体及人工诱导的同源四倍体遗传差异的AFLP分析 被引量:35
17
作者 王卓伟 余茂德 鲁成 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2002年第2期194-200,共7页
利用AFLP(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism)分子标记技术 ,即扩增片段长度多态性 ,从DNA分子水平探讨二倍体桑 (2n =2X =2 8)与经秋水仙素诱变得到的同源四倍体桑 (2n =4X =5 6 )在遗传结构上的差异。根据对供试材料DNA多态性及遗... 利用AFLP(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism)分子标记技术 ,即扩增片段长度多态性 ,从DNA分子水平探讨二倍体桑 (2n =2X =2 8)与经秋水仙素诱变得到的同源四倍体桑 (2n =4X =5 6 )在遗传结构上的差异。根据对供试材料DNA多态性及遗传距离分析 ,认为经秋水仙素诱变得到的同源 4X与 2X相比在DNA分子遗传结构上产生一定程度的改变 ,在种内变异水平上 ,2X与同源 4X桑间的遗传差异小于种间差异。 展开更多
关键词 桑树 二倍体 人工诱导 同源四倍体 遗传差异 aflp分析
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38株维氏气单胞菌分离株的AFLP基因分型研究 被引量:9
18
作者 汪开毓 牟巧凤 +4 位作者 黄锦炉 陈德芳 黄凌远 王均 连海 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期905-911,共7页
试验通过人工设计合成的通用接头以及与接头序列相匹配的专用引物,对38株维氏气单胞菌分离株和1株维氏气单胞菌标准菌株进行AFLP基因分型研究。结果显示,采用5对引物使39株维氏气单胞菌扩增出1080条可见条带,片段长度在50—1000 bp之间... 试验通过人工设计合成的通用接头以及与接头序列相匹配的专用引物,对38株维氏气单胞菌分离株和1株维氏气单胞菌标准菌株进行AFLP基因分型研究。结果显示,采用5对引物使39株维氏气单胞菌扩增出1080条可见条带,片段长度在50—1000 bp之间,其中多态性条带727条,平均每对引物组合产生154条多态性条带,平均多态性检出率为66.7%。按UPGMA方法对条带进行聚类分析,建立聚类分支树状图,将39株维氏气单胞菌分为9个基因型,其中第四类群基因Ⅳ型包含了14株菌株,约占总菌数的35.9%,分布在5个不同的地区,推测其可能是引起斑点叉尾发病的主要流行性基因型。不同地区分离的维氏气单胞菌具有地域性差异,而同一地区分离株既存在相同基因型现象,也存在基因型多样性现象。 展开更多
关键词 维氏气单胞菌 DNA扩增片段长度多态性(aflp 基因分型 指纹图谱 聚类分析
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滇杨优树遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
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作者 纵丹 员涛 +4 位作者 周安佩 刘东玉 郑元 段安安 何承忠 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期103-108,213,共7页
以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条... 以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。 展开更多
关键词 滇杨优树 aflp 遗传多态性 遗传相似系数 UPGMA聚类分析
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楸树优良种质资源的AFLP遗传多样性分析 被引量:6
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作者 李永涛 董玉峰 +5 位作者 王振猛 张鹏远 王卫东 荀守华 秦光华 姜岳忠 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期37-43,共7页
为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对PstI/MseI引物组合从44份楸树种质中共扩增出1087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1043条,多态... 为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对PstI/MseI引物组合从44份楸树种质中共扩增出1087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(Ⅰ)分别为1.3210、0.2003和0.3204,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.5022~0.7919间,平均为0.6527。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。 展开更多
关键词 楸树 种质资源 aflp标记 遗传多样性 聚类分析
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