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基于28S rDNA的南海刺长腹剑水蚤(Oithona setigera)种群遗传多样性研究
被引量:
1
1
作者
季莹莹
徐磊
+2 位作者
黎红
王亮根
杜飞雁
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期89-97,共9页
长腹剑水蚤属是海洋中小型浮游动物中最为丰富的类群之一,在生物地理学与海洋生态学研究中均具有重要地位。本研究基于 28S rDNA 分析了南海长腹剑水蚤属中较为常见的刺长腹剑水蚤 Oithona setigera 的单倍型多样性和种群遗传结构。结...
长腹剑水蚤属是海洋中小型浮游动物中最为丰富的类群之一,在生物地理学与海洋生态学研究中均具有重要地位。本研究基于 28S rDNA 分析了南海长腹剑水蚤属中较为常见的刺长腹剑水蚤 Oithona setigera 的单倍型多样性和种群遗传结构。结果显示, 792bp 长度的核苷酸片段中,碱基 G+C 的平均含量为 58.2%,高于 A+T 含量(41.8%)。种群平均遗传距离ΦST为 0.011。在 22 个种群共计 186 个个体中,发现了 28 个单倍型,其中单倍型 H10 在 21 个种群中均被发现,最远距离超过 1000km,说明刺长腹剑水蚤可以实现远距离的扩散且受到南海海流影响。Mantel 检验结果显示,刺长腹剑水蚤种群遗传距离和地理距离无线性相关性(R= 0.04615, P=0.678);RDA 变差分解结果显示,空间变量全模型对种群遗传结构的解释率为 53.3%,结合种群平均遗传距离ΦST 为 0.011,我们判断目前观测到的刺长腹剑水蚤的种群遗传结构可能由历史上种群扩展带来的拓殖隔离造成。
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关键词
刺长腹剑水蚤
28S
RDNA
南海
遗传分化
空间隔离
下载PDF
职称材料
题名
基于28S rDNA的南海刺长腹剑水蚤(Oithona setigera)种群遗传多样性研究
被引量:
1
1
作者
季莹莹
徐磊
黎红
王亮根
杜飞雁
机构
上海海洋大学海洋科学学院
中国水产科学研究院南海水产研究所
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期89-97,共9页
基金
国家自然科学基金(41406188)
中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2017YB26、2016TS24)~~
文摘
长腹剑水蚤属是海洋中小型浮游动物中最为丰富的类群之一,在生物地理学与海洋生态学研究中均具有重要地位。本研究基于 28S rDNA 分析了南海长腹剑水蚤属中较为常见的刺长腹剑水蚤 Oithona setigera 的单倍型多样性和种群遗传结构。结果显示, 792bp 长度的核苷酸片段中,碱基 G+C 的平均含量为 58.2%,高于 A+T 含量(41.8%)。种群平均遗传距离ΦST为 0.011。在 22 个种群共计 186 个个体中,发现了 28 个单倍型,其中单倍型 H10 在 21 个种群中均被发现,最远距离超过 1000km,说明刺长腹剑水蚤可以实现远距离的扩散且受到南海海流影响。Mantel 检验结果显示,刺长腹剑水蚤种群遗传距离和地理距离无线性相关性(R= 0.04615, P=0.678);RDA 变差分解结果显示,空间变量全模型对种群遗传结构的解释率为 53.3%,结合种群平均遗传距离ΦST 为 0.011,我们判断目前观测到的刺长腹剑水蚤的种群遗传结构可能由历史上种群扩展带来的拓殖隔离造成。
关键词
刺长腹剑水蚤
28S
RDNA
南海
遗传分化
空间隔离
Keywords
oithona setigera
28S rDNA
South China Sea
genetic differentiation
isolation-by-distance
分类号
Q179.1 [生物学—水生生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于28S rDNA的南海刺长腹剑水蚤(Oithona setigera)种群遗传多样性研究
季莹莹
徐磊
黎红
王亮根
杜飞雁
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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