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日本蛇根草糖基转移酶基因Oj GT1的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
孙威
林建
+3 位作者
申欢
马玲
鞠志刚
乙引
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期452-457,共6页
糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要的修饰酶之一,其在花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整的cDNA序列,随后对OjGT1的功能结构域、...
糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要的修饰酶之一,其在花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整的cDNA序列,随后对OjGT1的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整的CDS长度为1 413 bp,翻译形成蛋白的分子量为52.087 kD,等电点为5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与三级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因的成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据。
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关键词
日本蛇根草
ojgt1
基因克隆
生物信息学分析
原文传递
题名
日本蛇根草糖基转移酶基因Oj GT1的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
孙威
林建
申欢
马玲
鞠志刚
乙引
机构
贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室
贵阳中医学院药学院
西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期452-457,共6页
基金
国家自然科学基金(31760076)
贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2017]122)
+4 种基金
贵州省重点实验室建设项目(黔科合计Z字[2011]4005)
贵州省联合基金项目(黔科合LH字[2016]7211号
[2017] 7358号)
贵州省中医药管理局中医药
民族医药科学技术研究课题(Q2YY-2016-064)共同资助
文摘
糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要的修饰酶之一,其在花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整的cDNA序列,随后对OjGT1的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整的CDS长度为1 413 bp,翻译形成蛋白的分子量为52.087 kD,等电点为5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与三级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因的成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据。
关键词
日本蛇根草
ojgt1
基因克隆
生物信息学分析
Keywords
Ophiorrhizajaponica
ojgt1
Gene cloning
Bioinformatics analysis
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
日本蛇根草糖基转移酶基因Oj GT1的克隆与生物信息学分析
孙威
林建
申欢
马玲
鞠志刚
乙引
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
原文传递
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参考文献
引证文献
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