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高密度Oligo基因芯片筛选小鼠嗅球发育相关基因的研究
被引量:
2
1
作者
宋业纯
杨辉
+4 位作者
刘仕勇
何家全
黄其林
邱克军
张治元
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期841-843,共3页
目的 研究小鼠嗅球发育相关基因表达谱,探讨嗅球(olfactorybulb ,OB)在室管膜前下区(anteriorsubventricularzone ,SVZa)神经干细胞的迁移及分化中的作用。方法 采用165 0 0点的小鼠高密度Oligo基因芯片对胚胎16d(embryonicday16,E16...
目的 研究小鼠嗅球发育相关基因表达谱,探讨嗅球(olfactorybulb ,OB)在室管膜前下区(anteriorsubventricularzone ,SVZa)神经干细胞的迁移及分化中的作用。方法 采用165 0 0点的小鼠高密度Oligo基因芯片对胚胎16d(embryonicday16,E16)、生后1d(postnatalday 1,P1)、7d(P7)、2 1d(P2 1)OB的基因表达情况进行检测,以4个时相点全脑等量混合样品作为对照。结果 通过筛选基因表达谱,得到5 2 77条在E16、P1、P7及P2 1OB中均有表达的基因,然后采用两两对比组合,得到6组数据,从中筛选出了5 81个差异在3倍以上的基因,分层聚类分析将其分为6大类,进一步分析了与SVZa区神经干细胞的迁移相关基因Slit2聚类同组的2 8个基因及与多巴胺神经元分化相关基因TH聚类同组的17个基因。结论 在小鼠嗅球发育中发现了5 81条表达差异≥3倍的基因,进一步通过对与Slit2相关的2 8个基因及与TH相关的17个基因的分析有助于揭示SVZa神经干细胞迁移及向多巴胺神经元分化的作用机制。
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关键词
嗅球
神经干细胞
oligo基因芯片
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职称材料
Oligo基因芯片分析黄芪多糖对脑缺血再灌注大鼠DND的保护作用
被引量:
6
2
作者
郑一
高玉红
+1 位作者
吴士文
于生元
《山东中医杂志》
2013年第8期579-582,共4页
目的:用基因芯片分析黄芪多糖(APs)对脑缺血再灌注损伤大鼠海马组织迟发性神经元死亡(DND)相关基因表达的影响,探讨其保护作用机制。方法:以博奥公司定制的包含5 705条大鼠的Oligo基因表达谱芯片,研究脑缺血再灌注4 d的大鼠海马组织基...
目的:用基因芯片分析黄芪多糖(APs)对脑缺血再灌注损伤大鼠海马组织迟发性神经元死亡(DND)相关基因表达的影响,探讨其保护作用机制。方法:以博奥公司定制的包含5 705条大鼠的Oligo基因表达谱芯片,研究脑缺血再灌注4 d的大鼠海马组织基因表达谱,观察黄芪多糖对大鼠脑缺血再灌注损伤基因表达的影响。结果:脑缺血再灌注4 d的大鼠海马组织共筛选出差异表达基因9条,而这9条基因全部表达下调。结论:黄芪多糖可引起9条基因下调,其中cyp21、Ifi27、S100a9、Hipk3是参与自由基、钙超载、免疫炎症反应和凋亡的基因。Slc2a13参与葡萄糖代谢,Irp94、Fgf21、Akap5、Admr的功能还不明确。黄芪多糖通过减轻免疫介导炎症反应,来保护CA1区锥体细胞的迟发性死亡。
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关键词
oligo基因芯片
基因
表达
脑缺血再灌注
DND
黄芪多糖
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职称材料
大鼠慢性高眼压视网膜损害相关基因表达谱的研究
3
作者
崔馨
贺翔鸽
+1 位作者
曹佳
熊仁平
《重庆医学》
CAS
CSCD
2006年第6期503-506,共4页
目的研究大鼠激光慢性高眼压视网膜损害相关基因表达谱的改变。方法采用5705点的大鼠高密度Oligo基因芯片,对运用532-二极管激光建立大鼠高眼压模型视网膜的基因表达情况进行检测,以对侧眼作为对照。结果通过筛选基因表达谱,得到5 277...
目的研究大鼠激光慢性高眼压视网膜损害相关基因表达谱的改变。方法采用5705点的大鼠高密度Oligo基因芯片,对运用532-二极管激光建立大鼠高眼压模型视网膜的基因表达情况进行检测,以对侧眼作为对照。结果通过筛选基因表达谱,得到5 277条在大鼠视网膜中有表达的基因,然后采用两两对比组合,从中筛选出了11条差异在2倍以上的基因,其中3条上调,8条下调。结论在大鼠高眼压模型视网膜中筛选到了11条表达差异>2倍的基因,可望为青光眼的神经损伤机制及治疗提供新的思路。
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关键词
视网膜
高眼压
oligo基因芯片
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职称材料
槲皮素对缺血缺氧损伤星形胶质细胞基因表达的影响
被引量:
2
4
作者
姚芳
胡子有
+2 位作者
颜晓慧
韩慧
吴炳义
《中华神经医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第12期1197-1201,共5页
目的应用高密度寡核苷酸(Oligo)基因芯片技术研究槲皮素对缺血缺氧损伤的星形胶质细胞基因表达的影响。方法体外原代培养星形胶质细胞分为缺血缺氧组和缺血缺氧+槲皮素处理组。2组细胞厌氧培养4h后缺血缺氧+槲皮素处理组加入含50μ...
目的应用高密度寡核苷酸(Oligo)基因芯片技术研究槲皮素对缺血缺氧损伤的星形胶质细胞基因表达的影响。方法体外原代培养星形胶质细胞分为缺血缺氧组和缺血缺氧+槲皮素处理组。2组细胞厌氧培养4h后缺血缺氧+槲皮素处理组加入含50μmol/L槲皮素的培养液,缺血缺氧组加入等量培养液,培养24h后应用基因表达谱芯片筛选2组细胞表达差异的基因并用实时荧光定量PCR检测进行验证。结果基因表达谱芯片分析显示缺血缺氧+槲皮素处理组与缺血缺氧组比较表达差异的基因共180个,其中上调基因49个,下调基因131个:实时荧光定量PCR结果显示缺血缺氧+槲皮素处理组细胞与缺血缺氧组比较148个基因的表达发生变化.差异均有统计学意义(P〈0.05),其中上调基因34个,下调基因114个。实时荧光定量PCR与基因表达谱芯片结果的符合率为82.2%(148/180)。结论基因表达谱芯片分析有助于从分子水平全面了解槲皮素对缺血缺氧的星形胶质细胞的作用机制,也为进一步研究槲皮素和星形胶质细胞在缺血缺氧脑损伤中的作用奠定了基础。
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关键词
槲皮素
星形胶质细胞
高密度
oligo基因芯片
RT—PCR
原文传递
题名
高密度Oligo基因芯片筛选小鼠嗅球发育相关基因的研究
被引量:
2
1
作者
宋业纯
杨辉
刘仕勇
何家全
黄其林
邱克军
张治元
机构
第三军医大学新桥医院神经外科
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期841-843,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目 ( 30 130 110 )~~
文摘
目的 研究小鼠嗅球发育相关基因表达谱,探讨嗅球(olfactorybulb ,OB)在室管膜前下区(anteriorsubventricularzone ,SVZa)神经干细胞的迁移及分化中的作用。方法 采用165 0 0点的小鼠高密度Oligo基因芯片对胚胎16d(embryonicday16,E16)、生后1d(postnatalday 1,P1)、7d(P7)、2 1d(P2 1)OB的基因表达情况进行检测,以4个时相点全脑等量混合样品作为对照。结果 通过筛选基因表达谱,得到5 2 77条在E16、P1、P7及P2 1OB中均有表达的基因,然后采用两两对比组合,得到6组数据,从中筛选出了5 81个差异在3倍以上的基因,分层聚类分析将其分为6大类,进一步分析了与SVZa区神经干细胞的迁移相关基因Slit2聚类同组的2 8个基因及与多巴胺神经元分化相关基因TH聚类同组的17个基因。结论 在小鼠嗅球发育中发现了5 81条表达差异≥3倍的基因,进一步通过对与Slit2相关的2 8个基因及与TH相关的17个基因的分析有助于揭示SVZa神经干细胞迁移及向多巴胺神经元分化的作用机制。
关键词
嗅球
神经干细胞
oligo基因芯片
Keywords
olfactory bulb
neural stem cells
oligo
microarray
分类号
R322.85 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
R394-33 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
Oligo基因芯片分析黄芪多糖对脑缺血再灌注大鼠DND的保护作用
被引量:
6
2
作者
郑一
高玉红
吴士文
于生元
机构
东营市胜利医院神经内科
武警总医院神经内科
解放军总医院神经内科
出处
《山东中医杂志》
2013年第8期579-582,共4页
文摘
目的:用基因芯片分析黄芪多糖(APs)对脑缺血再灌注损伤大鼠海马组织迟发性神经元死亡(DND)相关基因表达的影响,探讨其保护作用机制。方法:以博奥公司定制的包含5 705条大鼠的Oligo基因表达谱芯片,研究脑缺血再灌注4 d的大鼠海马组织基因表达谱,观察黄芪多糖对大鼠脑缺血再灌注损伤基因表达的影响。结果:脑缺血再灌注4 d的大鼠海马组织共筛选出差异表达基因9条,而这9条基因全部表达下调。结论:黄芪多糖可引起9条基因下调,其中cyp21、Ifi27、S100a9、Hipk3是参与自由基、钙超载、免疫炎症反应和凋亡的基因。Slc2a13参与葡萄糖代谢,Irp94、Fgf21、Akap5、Admr的功能还不明确。黄芪多糖通过减轻免疫介导炎症反应,来保护CA1区锥体细胞的迟发性死亡。
关键词
oligo基因芯片
基因
表达
脑缺血再灌注
DND
黄芪多糖
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
大鼠慢性高眼压视网膜损害相关基因表达谱的研究
3
作者
崔馨
贺翔鸽
曹佳
熊仁平
机构
第三军医大学大坪医院眼科
第三军医大学野战外科研究所第七研究室
第三军医大学军事预防医学院
出处
《重庆医学》
CAS
CSCD
2006年第6期503-506,共4页
基金
国家杰出青年基金资助项目(30125037)者
文摘
目的研究大鼠激光慢性高眼压视网膜损害相关基因表达谱的改变。方法采用5705点的大鼠高密度Oligo基因芯片,对运用532-二极管激光建立大鼠高眼压模型视网膜的基因表达情况进行检测,以对侧眼作为对照。结果通过筛选基因表达谱,得到5 277条在大鼠视网膜中有表达的基因,然后采用两两对比组合,从中筛选出了11条差异在2倍以上的基因,其中3条上调,8条下调。结论在大鼠高眼压模型视网膜中筛选到了11条表达差异>2倍的基因,可望为青光眼的神经损伤机制及治疗提供新的思路。
关键词
视网膜
高眼压
oligo基因芯片
Keywords
retina
high IOP
oligo
gene chip
分类号
R775 [医药卫生—眼科]
下载PDF
职称材料
题名
槲皮素对缺血缺氧损伤星形胶质细胞基因表达的影响
被引量:
2
4
作者
姚芳
胡子有
颜晓慧
韩慧
吴炳义
机构
南方医科大学南方医院临床医学实验研究中心
出处
《中华神经医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第12期1197-1201,共5页
基金
国家自然科学基金(30628018、3010047)
广东省211工程多器官衰竭项目
文摘
目的应用高密度寡核苷酸(Oligo)基因芯片技术研究槲皮素对缺血缺氧损伤的星形胶质细胞基因表达的影响。方法体外原代培养星形胶质细胞分为缺血缺氧组和缺血缺氧+槲皮素处理组。2组细胞厌氧培养4h后缺血缺氧+槲皮素处理组加入含50μmol/L槲皮素的培养液,缺血缺氧组加入等量培养液,培养24h后应用基因表达谱芯片筛选2组细胞表达差异的基因并用实时荧光定量PCR检测进行验证。结果基因表达谱芯片分析显示缺血缺氧+槲皮素处理组与缺血缺氧组比较表达差异的基因共180个,其中上调基因49个,下调基因131个:实时荧光定量PCR结果显示缺血缺氧+槲皮素处理组细胞与缺血缺氧组比较148个基因的表达发生变化.差异均有统计学意义(P〈0.05),其中上调基因34个,下调基因114个。实时荧光定量PCR与基因表达谱芯片结果的符合率为82.2%(148/180)。结论基因表达谱芯片分析有助于从分子水平全面了解槲皮素对缺血缺氧的星形胶质细胞的作用机制,也为进一步研究槲皮素和星形胶质细胞在缺血缺氧脑损伤中的作用奠定了基础。
关键词
槲皮素
星形胶质细胞
高密度
oligo基因芯片
RT—PCR
Keywords
Quercetin
Astrocyte
Large-scale
oligo
microarray
RT-PCR
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高密度Oligo基因芯片筛选小鼠嗅球发育相关基因的研究
宋业纯
杨辉
刘仕勇
何家全
黄其林
邱克军
张治元
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
2
下载PDF
职称材料
2
Oligo基因芯片分析黄芪多糖对脑缺血再灌注大鼠DND的保护作用
郑一
高玉红
吴士文
于生元
《山东中医杂志》
2013
6
下载PDF
职称材料
3
大鼠慢性高眼压视网膜损害相关基因表达谱的研究
崔馨
贺翔鸽
曹佳
熊仁平
《重庆医学》
CAS
CSCD
2006
0
下载PDF
职称材料
4
槲皮素对缺血缺氧损伤星形胶质细胞基因表达的影响
姚芳
胡子有
颜晓慧
韩慧
吴炳义
《中华神经医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
原文传递
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