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RT-PCR/CRISPR-Cas12a快速检测和区分SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5变异株 被引量:2
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作者 马玉楠 邹丽容 +6 位作者 梁源浩 刘泉汛 孙倩 庞玉莲 林洪青 邓小玲 唐时幸 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期516-526,共11页
目的建立一种基于CRISPPR-Cas12a基因编辑技术对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.4/5变异株快速检测与鉴别的方法。方法结合逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)与CRISPR基因编辑技术,基于次优原间隔区相邻基序(suboptimal-PAM)设计奥密克... 目的建立一种基于CRISPPR-Cas12a基因编辑技术对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.4/5变异株快速检测与鉴别的方法。方法结合逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)与CRISPR基因编辑技术,基于次优原间隔区相邻基序(suboptimal-PAM)设计奥密克戎BA.4/5变异株特异性的CRISPRRNA(crRNA),从而建立RT-PCR/CRISPR-Cas12a快速检测新冠病毒BA.4/5变异株的方法。本研究检测了43例新冠病毒阳性的临床样本(包括新冠病毒野生株以及变异株Alpha、Beta、Delta、奥密克戎BA.1和BA.4/5)以及20例新冠病毒阴性的临床样本(包括11种常见呼吸道病原体),并以测序结果为金标准计算PCR/CRISPR-Cas12a检测方法的ROC曲线下面积(AUC)以及灵敏度(SEN)、特异性(SPE)、一致性(Kappa)评价检测方法的性能。结果本研究筛选到两条特异性crRNA-1和crRNA-2,所建立的方法可在30min内快速特异地检测出SARS-CoV-2奥密克戎BA.4/5变异株,最低检测限为10copies/μL。此外,在检测感染11种常见呼吸道病原体的临床样本时均未观察到非特异性交叉反应。基于crRNA-1和crRNA-2的检测结果的灵敏度分别为97.83%、100%;特异性均为100%;ROC曲线下面积分别为0.9989和1.0;与Sanger测序方法的一致性分别为92.83%、96.41%。结论本研究采用CRISPPR-Cas12a基因编辑技术与逆转录聚合酶链式反应相结合,成功建立了一种快速检测与鉴别SARS-CoV-2奥密克戎BA.4/5变异株的新方法。其特异性强、灵敏度高、稳定性好,可用于新冠病毒奥密克戎BA.4/5变异株的批量检测与分型,可用于常规监测和跟踪SARS-CoV-2变异的传播。 展开更多
关键词 聚合酶链式反应 CRISPR基因编辑 新冠核酸检测 奥密克戎 ba.4/5变异
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新型冠状病毒Omicron变异株亚型BA.4与BA.5的流行病学特征及防控研究 被引量:10
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作者 吴俣 刘珏 +1 位作者 刘民 梁万年 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2022年第30期3721-3725,共5页
全球新型冠状病毒肺炎疫情仍处于大流行状态,Omicron仍是全球优势株,约占全球基因序列的99%。全球多个地区正在经历第7波疫情,主要由Omicron变异株亚型BA.4和BA.5引起,目前对于Omicron变异株亚型BA.4和BA.5的流行病学特征尚不明确,给各... 全球新型冠状病毒肺炎疫情仍处于大流行状态,Omicron仍是全球优势株,约占全球基因序列的99%。全球多个地区正在经历第7波疫情,主要由Omicron变异株亚型BA.4和BA.5引起,目前对于Omicron变异株亚型BA.4和BA.5的流行病学特征尚不明确,给各国家和/或地区的疫情防控带来很大挑战。本文就Omicron变异株亚型BA.4和BA.5的发现与流行现状、潜伏期、传播力、临床症状、病死率、疫苗对其保护效果等方面的研究进展进行综述,以期为科学防控Omicron变异株亚型BA.4和BA.5所致疫情提供参考。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 omicron变异 ba.4亚型 ba.5亚型 流行病学 疾病传播 传染性 疫苗 体征和症状
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奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本核酸阴转时间及影响因素分析 被引量:1
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作者 葛玲玲 董旭 +6 位作者 王歆妤 许明晓 郭洪雷 刘亚允 徐爱静 范文瀚 梁雪松 《海军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1240-1246,共7页
目的分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本的核酸阴转时间及其影响因素。方法采用实时荧光PCR序贯检测海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院217例确诊为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)且... 目的分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本的核酸阴转时间及其影响因素。方法采用实时荧光PCR序贯检测海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院217例确诊为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)且基因测序确认病毒株为奥密克戎BA.2变异株患者的鼻咽拭子、痰液和肛拭子SARS-CoV-2核酸,比较不同部位样本核酸阴转时间。采用分层分析及多元线性回归分析法探讨不同部位样本核酸阴转时间的影响因素。结果217例COVID-19确诊患者的年龄为32.0(24.0,50.5)岁,男128例(59.0%)、女89例(41.0%);无症状感染者8例(3.7%)、轻型184例(84.8%)、普通型21例(9.7%)、重型3例(1.4%)、危重型1例(0.5%);接受莫努匹韦抗病毒治疗者70例(32.3%)。鼻咽拭子、痰液和肛拭子的SARS-CoV-2核酸阴转时间分别是13.0(11.0,17.0)、16.5(13.0,21.0)、10.0(5.3,11.0)d,两两比较差异均有统计学意义(P均<0.001)。年龄≥60岁、合并基础疾病尤其是高血压、冠状动脉疾病或神经系统疾病、临床分型为普通型是鼻咽拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性、合并基础疾病是痰液标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性是肛拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素。多元线性回归分析显示,临床分型为危重型是鼻咽拭子SARS-CoV-2核酸阴转时间延长的独立危险因素(P<0.05),男性和合并基础疾病是痰液核酸阴转时间延长的独立危险因素(P均<0.05)。结论在奥密克戎BA.2变异株感染患者中,痰液标本核酸阳性持续时间最长、肛拭子最短;男性、合并基础疾病患者痰液标本核酸阴转时间较长。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 奥密克戎ba.2变异 阴转时间 鼻咽拭子 痰液 肛拭子
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奥密克戎BA.2.38变异株感染儿童证候特点及中医疗效分析 被引量:1
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作者 杨京华 李玉霞 +7 位作者 郭建文 陈芯莹 任耀全 韩娟 李冬梅 丁霞 洪俊彬 张忠德 《广州中医药大学学报》 CAS 2023年第5期1053-1059,共7页
【目的】总结儿童新型冠状病毒奥密克戎(Omicron)BA.2.38变异株感染的中医证候特征,客观评价中医药疗效。【方法】对2022年7月8日~2022年8月4日期间甘肃省兰州市第二人民医院雁滩分院收治的251例新型冠状病毒Omicron BA.2.38变异株感染... 【目的】总结儿童新型冠状病毒奥密克戎(Omicron)BA.2.38变异株感染的中医证候特征,客观评价中医药疗效。【方法】对2022年7月8日~2022年8月4日期间甘肃省兰州市第二人民医院雁滩分院收治的251例新型冠状病毒Omicron BA.2.38变异株感染患儿进行调查,内容主要包括患儿基本信息、发病情况、入院时临床症状以及舌象、临床分型等,同时总结中医证候特点及证型分布规律,并以热程、治疗后退热时间、核酸转阴时间、病情由轻转重等为指标,评价中医药疗效。【结果】(1)症状、体征方面,251例患儿中,主要症状表现为发热者120例(占47.8%),且以中、高热为主,体温≥38.1℃者94例[占78.3%(94/120)],平均热程为(2.0±1.1)d;出现咳嗽者112例(占44.6%);部分患儿还出现咽痛、鼻塞、流涕、纳差、眠差、乏力、便秘等症状。舌象方面,舌质多红[占70.9%(178/251)],舌苔多腻[占72.5%(182/251)]。(2)治疗上以清热透邪、化湿解毒为法,结合儿童生理病理特点,兼以健脾消食以顾护脾胃。全程使用中药治疗的患儿有248例(占98.8%),其中,单纯中药治疗245例(占97.6%),中西医结合治疗3例(占1.2%)。(3)治疗后,所有患儿预后良好,无患儿出现病情加重。平均住院时间为(10.8±3.9)d,核酸转阴时间为(12.0±3.4)d;症状缓解最快的是“发热”,服药后热退时间为(1.4±0.7)d;其次为咳嗽,平均咳嗽缓解时间为(2.1±1.0)d;重复测量方差分析结果表明,治疗3 d和7 d后的中医证候积分均较治疗前降低,且治疗7 d后又较治疗3 d后降低,差异均有统计学意义(P<0.001)。(4)所有服用中药的患儿均未出现消化道不适、胸闷心悸、皮疹、肝肾功能损害等不良反应或不良事件。【结论】本轮疫情的Omicron BA.2.38变异株感染患儿的核心病机为疫毒侵肺、夹以暑湿,治疗上以清热透邪、化湿解毒为法;应用中药治疗能够明显改善患儿发热、咳嗽等症状,阻止病情进一步加重,且总体安全性良好。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 omicron ba.2.38变异 中医证候 清热透邪 化湿解毒 中医药疗效 儿童
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大黄素抗奥密克戎毒株BA.2.2药理活性的研究 被引量:3
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作者 常红 刘倩 +7 位作者 李方龙 孙永 袁媛 王绛辉 许寅聪 段绪红 苏彦雷 孙殿兴 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第9期17-19,I0015,共4页
目的探索大黄素抗新型冠状病毒(奥密克戎毒株BA.2.2)的药理活性。方法利用Autodock Vina软件将大黄素对接到新型冠状病毒RNA聚合酶晶体结构7VB2的底物结合位点处,研究二者分子间的相互作用;而后利用奥密克戎毒株BA.2.2转染的Vero细胞模... 目的探索大黄素抗新型冠状病毒(奥密克戎毒株BA.2.2)的药理活性。方法利用Autodock Vina软件将大黄素对接到新型冠状病毒RNA聚合酶晶体结构7VB2的底物结合位点处,研究二者分子间的相互作用;而后利用奥密克戎毒株BA.2.2转染的Vero细胞模型测试大黄素的抗病毒活性。结果大黄素可较好的结合于靶酶晶体结构7VB2的底物结合位点从而可阻碍正常核苷酸类底物的进入,对靶酶执行的病毒核酸复制的生物学功能起到抑制作用;细胞水平的药理活性测试发现大黄素具有明显的抑制奥密克戎毒株核酸复制的药理作用。结论大黄素具有抗新型冠状病毒及其变异株的药理活性,可为临床治疗提供基础实验的支持。 展开更多
关键词 大黄素 新型冠状病毒 奥密克戎毒{0.2.2 RNA聚合酶 分子对接 药理活性测试
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新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒的构建
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作者 杨静远 李永鑫 +3 位作者 史茜 刘春燕 梁梦洁 张新 《检验医学与临床》 CAS 2024年第8期1030-1034,共5页
目的构建新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒。方法选取并合成带有6×His标签的MS2噬菌体的衣壳蛋白(CP)、成熟蛋白(A蛋白)及Omicron I1566V突变基因序列,插入pACYCDuet-1质粒构建重组载体,通过原核系统诱导表... 目的构建新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒。方法选取并合成带有6×His标签的MS2噬菌体的衣壳蛋白(CP)、成熟蛋白(A蛋白)及Omicron I1566V突变基因序列,插入pACYCDuet-1质粒构建重组载体,通过原核系统诱导表达目的蛋白,纯化重组蛋白后利用透射电镜对蛋白质进行物理表征,最后通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测病毒样颗粒的热稳定性及耐核酸酶水解能力。结果成功构建包含有6×His标签的CP、A蛋白和Omicron I1566V突变基因序列的重组载体,经限制性内切酶BamHⅠ和KpnⅠ酶切鉴定和测序验证,结果均与预期相符。经诱导并纯化后,通过电镜观察到了大小均匀、直径为23~28 nm的病毒样颗粒,该病毒样颗粒经核酸酶消化后可在37℃条件下稳定储存20 d以上。结论该研究成功利用MS2噬菌体的CP和A蛋白构建了Omicron I1566V突变位点病毒样颗粒,为该突变位点的RT-PCR检测体系提供了可靠的质量保障。 展开更多
关键词 新型冠状病毒变异 omicron I1566V突变位点 反转录聚合酶链反应 MS2噬菌体 病毒样颗粒
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新冠病毒“奥密克戎亚型变异毒株BA.2”的最新研究进展 被引量:26
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作者 解有成 康殷楠 +4 位作者 高春 刘珊山 郑立婷 于晓辉 张久聪 《海南医学院学报》 CAS 2022年第8期561-565,共5页
自新型冠状病毒肺炎(COVID-19)暴发以来,随着一系列不同类型的新冠病毒变异株的出现,新冠肺炎疫情在全球持续蔓延,给世界各国人民生命安全和身体健康带来巨大威胁,也给全球公共卫生安全带来严峻挑战。近日,世界卫生组织(WHO)公布已在57... 自新型冠状病毒肺炎(COVID-19)暴发以来,随着一系列不同类型的新冠病毒变异株的出现,新冠肺炎疫情在全球持续蔓延,给世界各国人民生命安全和身体健康带来巨大威胁,也给全球公共卫生安全带来严峻挑战。近日,世界卫生组织(WHO)公布已在57个国家和地区发现新冠病毒变异株“奥密克戎”的亚型变异毒株BA.2,其具备较高的疫苗耐受性与抗体耐受性,具有比“奥密克戎”(Omicron,B.1.1.529)更高的传染性,本文就“奥密克戎亚型变异毒株BA.2”的最新研究作一简要综述。 展开更多
关键词 新冠肺炎 SARS-CoV-2 变异 omicron ba.2 进展
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针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2变异株Omicron的疫苗研究进展 被引量:1
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作者 刘明娅 戚菲菲 鲍琳琳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第5期867-873,共7页
2021年底,严重急性呼吸综合征冠状病毒2 Omicron变异株迅速取代Delta突变株在世界范围内广泛流行,其S蛋白具有36个位点突变,导致致病力和传播力发生明显变化,并且具备了免疫逃逸的能力。疫苗接种是目前疫情防控最普适的手段,研究发现,... 2021年底,严重急性呼吸综合征冠状病毒2 Omicron变异株迅速取代Delta突变株在世界范围内广泛流行,其S蛋白具有36个位点突变,导致致病力和传播力发生明显变化,并且具备了免疫逃逸的能力。疫苗接种是目前疫情防控最普适的手段,研究发现,现有疫苗针对Omicron突变株的保护效果明显下降。新的免疫策略或特异性疫苗/多价疫苗针对Omicron有效性的评估均需要动物模型的支撑。在实验室条件下,利用动物模型进行活病毒攻击实验,是在体内验证保护性中和抗体、疫苗有效性的关键技术手段,本文将从动物模型方向综述国内外针对Omicron变异株的疫苗研究进展。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 omicron变异 动物模型 加强免疫 omicron特异性疫苗 多价疫苗 体内有效性评价
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Neutralizing Antibody Responses against Five SARS-CoV-2 Variants and T Lymphocyte Change after Vaccine Breakthrough Infections from the SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Variant in Tianjin, China: A Prospective Study
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作者 ZHANG Ying QU Jiang Wen +13 位作者 ZHENG Min Na DING Ya Xing CHEN Wei YE Shao Dong LI Xiao Yan LI Yan Kun LIU Ying ZHU Di JIN Can Rui WANG LIN YANG Jin Ye ZHAI Yu WANG Er Qiang MENG Xing 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2023年第7期614-624,共11页
Objective To investigate whether Omicron BA.1 breakthrough infection after receiving the SARS-CoV-2 vaccine could create a strong immunity barrier.Methods Blood samples were collected at two different time points from... Objective To investigate whether Omicron BA.1 breakthrough infection after receiving the SARS-CoV-2 vaccine could create a strong immunity barrier.Methods Blood samples were collected at two different time points from 124 Omicron BA.1 breakthrough infected patients and 124 controls matched for age,gender,and vaccination profile.Live virus-neutralizing antibodies against five SARS-CoV-2 variants,including WT,Gamma,Beta,Delta,and Omicron BA.1,and T-lymphocyte lymphocyte counts in both groups were measured and statistically analyzed.Results The neutralizing antibody titers against five different variants of SARS-CoV-2 were significantly increased in the vaccinated population infected with the Omicron BA.1 variant at 3 months after infection,but mainly increased the antibody level against the WT strain,and the antibody against the Omicron strain was the lowest.The neutralizing antibody level decreased rapidly 6 months after infection.The T-lymphocyte cell counts of patients with mild and moderate disease recovered at 3 months and completely returned to the normal state at 6 months.Conclusion Omicron BA.1 breakthrough infection mainly evoked humoral immune memory in the original strain after vaccination and hardly produced neutralizing antibodies specific to Omicron BA.1.Neutralizing antibodies against the different strains declined rapidly and showed features similar to those of influenza.Thus,T-lymphocytes may play an important role in recovery. 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 COVID-19 omicron ba.1 T cells Neutralizing antibodies
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Novel coronavirus"Omicron subtype variant strain BA.2":The latest research progress
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作者 You-Cheng Xie Yin-Nan Kang +4 位作者 Chun Gao Shan-Shan Liu Li-Ting Zheng Xiao-Hui Yu Jiu-Cong Zhang 《Journal of Hainan Medical University》 2022年第8期1-4,共4页
Since the outbreak of COVID-19,with the emergence of a series of novel coronavirus variants of different types,COVID-19 has continued to spread across the globe,posing a huge threat to the lives and health of people a... Since the outbreak of COVID-19,with the emergence of a series of novel coronavirus variants of different types,COVID-19 has continued to spread across the globe,posing a huge threat to the lives and health of people around the world and posing a severe challenge to global public health security.Recently,the World Health Organization(WHO)announced that novel coronavirus variant strain"Omicron"subtype variant strain BA.2 has been found in 57 countries and regions.It has higher vaccine and antibody tolerance and is more infectious than omicron(B.1.1.529).In this paper,we briefly review the recent studies on the omicron subtype variant strain BA.2. 展开更多
关键词 Novel coronavirus pneumonia SARS-CoV-2 VARIANTS omicron ba.2 Progress
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Virological Characteristics and Prevention and Control of Omicron Sub-lineage BA.2
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作者 Xiao-Wen Yao Rong Wang +3 位作者 Cai-Hong Wang Yu-Xia Zhou Xiao-Hui Yu Jiu-Cong Zhang 《Journal of Hainan Medical University》 2022年第12期1-6,共6页
The Omicron sub-lineage BA.2 has caused a new round of infection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2),leading to a surge in the number of COVID-19 cases in many countries,including China.Beca... The Omicron sub-lineage BA.2 has caused a new round of infection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2),leading to a surge in the number of COVID-19 cases in many countries,including China.Because the subvariant BA.2 shows strong infectivity,fast transmission,strong immune escape ability,relatively mild symptoms,strong concealment,difficult to find and so on,it has gradually become a new challenge during the COVID-19 pandemic.Understanding the virological characteristics of Omicron sub-lineage BA.2 is of great significance for epidemic prevention and control.This paper briefly summarizes the virological characteristics and prevention and control strategies of Omicron sub-lineage BA.2. 展开更多
关键词 omicron ba.2 CHARACTERISTICS Vaccine effectiveness Monoclonal antibodies
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Global challenge with the SARS-CoV-2 omicron BA.2(B.1.1.529.2)subvariant:Should we be concerned?
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作者 Jalil Roohani Masoud Keikha 《World Journal of Virology》 2022年第6期496-501,共6页
BA.2 is a novel omicron offshoot of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)that has gone viral.There is limited knowledge regarding this variant of concern.Current evidence suggests that this varia... BA.2 is a novel omicron offshoot of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)that has gone viral.There is limited knowledge regarding this variant of concern.Current evidence suggests that this variant is more contagious but less severe than previous SARS-CoV-2 variants.However,there is concern regarding the virus mutations that could influence pathogenicity,transmissibility,and immune evasion. 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 omicron ba.2 B.1.1..29.2 Subvariant
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SARS-CoV-2 Omicron变异株的研究进展
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作者 王康泓 《微生物前沿》 2022年第2期49-60,共12页
拥有较强变异能力的严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2, SARS-CoV-2)在新型冠状病毒肺炎疫情长期流行的过程中不断发生变异进化。2021年11月,一种刺突蛋白携带大量突变的SARS-CoV-2变异株... 拥有较强变异能力的严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2, SARS-CoV-2)在新型冠状病毒肺炎疫情长期流行的过程中不断发生变异进化。2021年11月,一种刺突蛋白携带大量突变的SARS-CoV-2变异株在南非博茨瓦纳出现并被命名为“Omicron”,随后该毒株迅速取代Delta变异株成为现阶段全球流行毒株。与此前流行毒株相比,Omicron变异株具有更高的传染性和较强的免疫逃逸能力,其蔓延是当下全球2019冠状病毒病(Corona Virus Disease 2019, COVID-19)日新增确诊病例居高不下的关键因素。本文就Omicron变异株的起源、免疫逃逸机制及毒株致病性等方面进行综述。在总结Omicron变异株特点的同时分析该变异毒株对疫苗接种策略的潜在影响,以期为该变异毒株及将来可能出现的新发毒株的防控提供参考。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 2019冠状病毒病 omicron变异 免疫逃逸
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新型冠状病毒Omicron BA.5亚型变异株流行病学特征分析及防控建议
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作者 张瑾 韩辉 +1 位作者 伍波 贾娇娇 《口岸卫生控制》 2022年第4期1-5,共5页
目的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron变异株自2021年11月在南非首次发现以来迅速在全球传播,并且传播力和免疫逃逸能力增强的新亚型变异株不断涌现,对疫情防控提出更大的挑战。2022年6月以来,Omicron BA.5亚型变异株成为全球流行的优... 目的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron变异株自2021年11月在南非首次发现以来迅速在全球传播,并且传播力和免疫逃逸能力增强的新亚型变异株不断涌现,对疫情防控提出更大的挑战。2022年6月以来,Omicron BA.5亚型变异株成为全球流行的优势变异株,并导致多国疫情反弹。我国大陆地区由Omicron BA.5亚型变异株输入并引发本土疫情的频率逐渐增加,疫情波及范围广,防控难度极大。本文对Omicron BA.5亚型变异株流行现状、流行病学特征和输入我国大陆地区的情况进行分析,为口岸防控Omicron BA.5亚型变异株输入提供科学依据。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 omicron ba.5亚型变异 流行病学特征 疫苗接种 病例输入
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奥密克戎变异株感染儿童中医证候分布的观察分析
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作者 洪仲思 董文晓 +8 位作者 段思雨 李珂楠 林敏怡 陈洁花 赵国桢 李颖 胡晶 李博 刘清泉 《北京中医药》 2024年第12期1437-1440,共4页
目的观察分析珠海市感染奥密克戎(Omicron)变异株BA.2亚型、BA.5亚型儿童的临床症状及中医证候分布特点。方法选择2022年1—7月珠海市中山大学附属第五医院收治的Omicron变异株感染患儿70例,根据毒株亚型分为BA.2亚型组19例、BA.5亚型... 目的观察分析珠海市感染奥密克戎(Omicron)变异株BA.2亚型、BA.5亚型儿童的临床症状及中医证候分布特点。方法选择2022年1—7月珠海市中山大学附属第五医院收治的Omicron变异株感染患儿70例,根据毒株亚型分为BA.2亚型组19例、BA.5亚型组51例,统计并分析其临床特点和中医证候规律。结果BA.5亚型组的基线病毒载量均高于BA.2亚型组。BA.2亚型组入院时症状主要是咳嗽(78.9%)、流涕(63.2%)、鼻塞(52.6%)、发热(26.3%)、咽痛(15.8%)和咳黄痰(15.7%),中医证候以风寒束肺(31.6%)和风热犯肺(21.1%)最为多见,有部分患者邪入气分,病变在肺,因此辨证亦有湿毒郁肺证或寒湿阻肺;BA.5亚型组入院时的症状主要是发热(70.5%)、咳嗽(41.1%)、流涕(21.5%)、鼻塞(17.6%)、乏力(11.7%)和咳白痰(11.7%),中医证候以风邪挟湿、挟热、挟寒为主。结论Omicron变异株亚型感染患儿多见BA.5亚型,肺部症状和影像学改变较轻,治则当以疏风解表、宣肺止咳为主。 展开更多
关键词 omicron变异 ba.5亚型 ba.2亚型 中医证候
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新冠病毒Omicron变异毒株的研究进展与展望 被引量:5
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作者 蔡雨豪 张婷婷 程扬健 《生命科学研究》 CAS 2023年第3期210-216,共7页
引发新型冠状病毒感染(corona virus disease 2019,COVID-19)的严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)已经在全世界大规模传播了3年,并衍生出许多变异毒株。目前,在全球造成大规模... 引发新型冠状病毒感染(corona virus disease 2019,COVID-19)的严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)已经在全世界大规模传播了3年,并衍生出许多变异毒株。目前,在全球造成大规模传播的Omicron变异毒株具有极高传染性和较低毒性的特点,并已经演变出BA.4、BA.5、XBB等亚型,其对疫苗引发的免疫具有逃逸性,但疫苗加强针的施打可恢复一定程度的中和能力。针对Omicron变异毒株的新代疫苗和治疗药物正陆续问世,为人类提供了新的抵御措施和治疗方法。本文对Omicron变异毒株的特征、人体的免疫机制、现今疫苗和药物的研发以及感染后遗症问题进行了总结和浅析,并对未来应对SARS-CoV-2的方式提出了建议。 展开更多
关键词 omicron变异毒 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2) 免疫系统 疫苗和药物 后遗症
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奥密克戎亚变体BA.2的病毒学特点及防控 被引量:9
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作者 姚晓文 王蓉 +3 位作者 王彩红 周玉霞 于晓辉 张久聪 《海南医学院学报》 CAS 2022年第12期881-886,共6页
奥密克戎(Omicron)亚变体BA.2引起严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的新一轮感染,导致包括中国在内的很多国家新型冠状病毒肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)病例数激增。由于亚变体BA.2表现出传染性强,传播速度快、免... 奥密克戎(Omicron)亚变体BA.2引起严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的新一轮感染,导致包括中国在内的很多国家新型冠状病毒肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)病例数激增。由于亚变体BA.2表现出传染性强,传播速度快、免疫逃避能力强,具有症状相对较轻、隐匿性强、发现难等特点,逐渐成为COVID-19大流行期间的新挑战。了解Omicron亚变体BA.2的病毒学特点对疫情防控有着重要的意义。本文就Omicron亚变体BA.2的病毒学特点及防控对策进行简要综述。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 奥密克戎 ba.2 特点 疫苗有效性 单克隆抗体
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17例新型冠状病毒Omicron变异株境外输入感染者的流行病学特征 被引量:17
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作者 刘晓芳 陈美平 +3 位作者 周志国 陈东 莫娟 刘激扬 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期344-351,共8页
目的:严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)又称新型冠状病毒,其新变异株不断产生,中国疫情防控压力持续增加。具有更强传染性、免疫逃逸能力和重复感染能力的Omicron变异株在短... 目的:严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)又称新型冠状病毒,其新变异株不断产生,中国疫情防控压力持续增加。具有更强传染性、免疫逃逸能力和重复感染能力的Omicron变异株在短时间内传播至全球多个国家和地区,中国也陆续报道境外输入的Omicron变异株感染病例。本研究旨在通过分析湖南省Omicron变异株境外输入感染者的流行病学特征,更好地了解Omicron变异株的流行特点,为有效预防、控制境外输入疫情提供科学依据。方法:回顾性收集2021年12月16日至31日湖南省长沙市收治的新型冠状病毒肺炎境外输入病例的临床资料,分析病例的流行病学史、一般情况、临床分型、临床症状、SARS-CoV-2疫苗接种情况及肺部CT影像等资料。采集鼻咽拭子及血液标本,利用SARS-CoV-2检测试剂盒通过磁珠法进行病毒核酸检测,比较无症状感染者和确诊患者ORF1ab基因和N基因的Ct值差异;特异性IgM、IgG抗体分别采用SARS-CoV-2 IgM检测试剂盒和SARS-CoV-2 IgG检测试剂盒通过化学发光法检测,比较无症状感染者和确诊患者特异性抗体IgM抗体和IgG抗体的差异。结果:共收治17例Omicron变异株境外输入感染者,其中确诊15例(普通型5例、轻型10例)、无症状感染者2例。17例Omicron变异株感染者均为中国籍,年龄总体偏年轻,男性16例。9例患者有基础疾病,其中3例患者为呼吸系统疾病。17例感染者均已完成SARS-CoV-2疫苗全流程接种,但仅有1人接种了SARS-CoV-2疫苗加强针。患者临床表现较轻,主要表现为咽喉干/痛/痒、咳嗽、乏力。Omicron变异株感染的无症状感染者和确诊患者的总蛋白质和肌酸均在正常参考值范围内,但其他生化指标均出现异常,无症状感染者与确诊患者间仅C反应蛋白和纤维蛋白原差异具有统计学意义(均P<0.05),确诊患者中C反应蛋白升高者较多。入院时特异性IgM、IgG抗体检出率为100%,无症状感染者与确诊患者间特异性抗体水平差异无统计学意义(P>0.05)。无症状感染者和确诊患者ORF1ab基因的Ct值分别为21.35和18.39,N基因的Ct值分别为19.22和15.67,核酸Ct值差异无统计学意义(P>0.05)。仅3例患者肺部CT存在异常,表现为少量斑片状、条索状影,其中1例入院时未见异常,入院后出现肺部病变并呈现游走性现象。结论:Omicron变异株感染者有年轻化趋势且临床症状较轻,但病毒载量高、传染性强,因此对无症状感染者和表现轻微症状感染者的及时识别和有效隔离、管控极其重要;在疫情防控上,政府仍需加强境外输入的风险管控,坚持常态化疫情防控措施,以有效控制传染源、切断传播途径、保护易感人群。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 omicron变异 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 境外输入 流行病学特征
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Omicron变异株感染的轻型/普通型新型冠状病毒肺炎学龄前儿童出院后短期相关持续症状的随访 被引量:3
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作者 胡纯纯 许普 +6 位作者 徐柳 张莹 周建国 王立波 周文浩 叶岚 陆春梅 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1289-1294,共6页
目的探讨学龄前儿童感染严重急性呼吸综合征冠状病毒-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)Omicron变异株后的相关持续症状,为制订感染后的随访计划,减少和预防患儿感染后的相关症状提供依据。方法以2022年4... 目的探讨学龄前儿童感染严重急性呼吸综合征冠状病毒-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)Omicron变异株后的相关持续症状,为制订感染后的随访计划,减少和预防患儿感染后的相关症状提供依据。方法以2022年4月13日—5月8日由上海市仁济医院南院儿科病房出院的0~5岁Omicron BA.2感染的患儿为研究对象,收集人口学及临床资料,并以连续2次、间隔时间超过24 h的SARS-CoV-2核酸转阴时间为随访起点,其转阴后的4~5周为随访截点,对主要带养人进行电话随访,了解患儿出院后相关持续症状。结果符合纳入条件的103例患儿中,男孩61例,女孩42例,中位年龄为18个月。主要带养家长已接种2针及以上新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫苗的比例为64.1%(66/103)。患儿最常见的症状为发热(98.1%,101/103),其次是咳嗽/咳痰(63.1%,65/103)、胃肠道问题(37.9%,39/103)、食欲下降(30.1%,31/103)、乏力(27.2%,28/103)、鼻塞/流涕(16.5%,17/103)等。出院1个月时随访报告44例(42.7%)至少有1种持续症状,包括呼吸道相关症状(14例,13.6%)、胃肠道问题(19例,18.4%)等。主要带养人接种2针及以上COVID-19疫苗的患儿SARS-CoV-2核酸转阴时间较家长未接种或接种1针的患儿核酸转阴时间缩短(P<0.05),但2组患儿存在至少1种持续症状的比例差异无统计学意义(P>0.05)。结论近半数SARSCoV-2 Omicron变异株感染学龄前儿童出院后存在持续相关症状,多为胃肠道症状和呼吸道症状,但大部分症状轻微,需持续随访关注其转归情况。主要带养人COVID-19疫苗接种对儿童可起到一定的保护作用。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 严重急性呼吸综合征冠状病毒-2 omicron变异 症状 随访 疫苗接种 学龄前儿童
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新型冠状病毒Omicron变异株密码子偏爱性及其进化分析 被引量:2
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作者 李亚飞 罗春雨 +1 位作者 石哲芳 刘奇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期559-565,576,共8页
目的分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron变异株各蛋白密码子偏爱性的变化,探索Omicron与其他关切变异株(Variant of Concern,VOC)密码子偏爱性的差异及进化关系。方法从NCBI SARS-CoV-2数据库中收集标准株Wuhan-Hu-1及5种VOC全基因组... 目的分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron变异株各蛋白密码子偏爱性的变化,探索Omicron与其他关切变异株(Variant of Concern,VOC)密码子偏爱性的差异及进化关系。方法从NCBI SARS-CoV-2数据库中收集标准株Wuhan-Hu-1及5种VOC全基因组编码序列,使用EMBOSS子程序CUSP、MEGA 11.0、Codon W等分析软件进行相关密码子偏爱性数据的计算,通过SigmaPlot 14.0、SPSS 22.0等软件进行数据统计分析并绘图。结果Omicron变异株ENC均值为46.05±7.80,其S、E、ORF1ab、ORF1a蛋白编码基因密码子较其他VOC使用偏性减弱。相比Wuhan-Hu-1,Omicron关键蛋白RSCU与人类基因密码子更接近。基于密码子使用偏性的聚类分析结果显示,Omicron毒株S、ORF1a蛋白密码子与其他VOC毒株变异最大。结论新现Omicron变异株S、ORF1ab等关键蛋白的密码子偏爱性减弱,密码子使用模式较Wuhan-Hu-1更接近人类基因,可能是其感染效率增加的原因。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 omicron变异 聚类分析 系统发育 密码子偏爱性
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