Omicron病毒S蛋白序列特征分析

采用生信方法,从理化性质、亲疏水性、跨膜区域、信号肽特征、磷酸化位点以及最佳抗原表位,分析Omicron变异株蛋白序列特征并预测其抗体结合位点。结果表明,该变异株S蛋白理论等电点为7.14,亲水性总平均值为-0.080,为低亲水性分泌蛋白,存在128个磷酸化位点,主要的二级结构类型为无规卷曲,抗原表位区域在614~629、770~776范围,获得该病毒S蛋白关键抗体结合位点。

老年Omicron新冠病毒感染臨床特徵分析

目的分析新冠Omicron流行期間,成年新冠感染者的臨床特徵及預後,提高對老年人、特別是長壽老人感染Omicron病毒株的臨床認識,以提高臨床救治水準。方法收集2022年12月18日~2023年2月2日在澳門地區某醫院確診新冠感染住院患者的臨床資料,按年齡分為青年老年組、老老年組和長壽老年組,從合併基礎疾病、MEWS評分、體溫、血常規、診斷、治療、住院天數及預後等方面和中青年組進行對照分析。結果患者年齡18歲~109歲,平均年齡(76.18±18.14)歲,212例(22.6%)為≥90歲的長壽老年人,本組平均年齡(94.52±3.56)歲,重症及危重症佔94.5%,95.3%的患者至少合併1種基礎疾病。對照組好轉出院132例,佔95.7%,而90歲及以上組好轉出院160例,佔76.5%(χ2=33.9,P<0.05)。結論新冠Omicron感染者,老年人重症率高,好轉出院率低,特別是90歲及以上長壽老人,是新冠防疫和救治的重點人群。

新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染的临床特点及流行病学分析

目的分析新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染的临床特点及流行病学。方法回顾性选取2022年12月23日~2023年3月17日我院新生儿科收治的27例新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染病例。分析新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染的流行病学特征和临床表现特点。结果27例新型冠状病毒Omicron变异株感染患儿中,25例为社区获得性感染,2例由本院产科转入。社区获得性感染患儿均有明确接触史(患儿家属或保姆);产科转入2例,产前患儿母亲在孕晚期均有明确新型冠状病毒Omicron变异株感染史。临床表现:发热23例,鼻塞10例,流涕3例,咳嗽7例,喉中痰鸣10例,气促1例,纳差6例,腹泻8例。入院后血常规示:白细胞计数、C反应蛋白均正常。影像学检查:27例检查胸片,有肺部感染征象者13例,其中6例做胸部CT检查,均有磨玻璃、斑片状影。结论新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染,大多数经水平传播,孕后期可出现极少数的垂直传播;上、下呼吸道均可出现感染,感染后多数会出现发热;肺部感染者,大多数症状较轻,肺部体征少,持续时间短;而胸部影像学明显改变者,恢复时间长。

上海市220例新型冠状病毒Omicron变异株感染者中医体质类型分布与防控策略

目的初步探讨上海局部传播的新型冠状病毒Omicron变异株感染者中医体质类型的分布,为确立核酸筛查和常态化核酸检测的重点人群提供中医体质学说依据。方法设计中医体质量表,对上海市花博园安徽方舱医院新型冠状病毒Omicron变异株感染者进行中医体质调查,通过中医临床数据采集平台录入一般资料和体质调查数据,并进行统计学分析。结果220例新型冠状病毒Omicron变异株无症状感染者中,全程无症状感染病例163例,无症状感染者转化为轻型者57例。163例全程无症状感染者中,平和质141例(86.5%),偏颇质22例(13.5%),57例无症状感染者转化为轻型者中,平和质3例(5.3%),偏颇质54例(94.7%)。两组平和质、偏颇质分布率比较,差异均有统计学意义(P<0.05);全程无症状感染者的平和质分布率显著高于无症状感染者转化为轻型者(P<0.05)。全程无症状感染者出现频率超过10%的体质类型仅有平和质,而无症状感染者转化为轻型病例出现频率超过10%的体质类型有4种,分别是湿热质、气郁质、痰湿质、气虚质。全程无症状感染者的湿热质、气郁质、痰湿质、气虚质分布率显著低于无症状感染转化为轻型者(P<0.05)。结论上海市新型冠状病毒Omicron变异株感染者,由无症状感染者转化为轻型者的发病过程与体质偏颇、基础疾病密切相关;新型冠状病毒Omicron变异株感染平和质者的隐蔽性强,是优先进行核酸筛查和常态化核酸检测的重点人群。

针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2变异株Omicron的疫苗研究进展

2021年底,严重急性呼吸综合征冠状病毒2 Omicron变异株迅速取代Delta突变株在世界范围内广泛流行,其S蛋白具有36个位点突变,导致致病力和传播力发生明显变化,并且具备了免疫逃逸的能力。疫苗接种是目前疫情防控最普适的手段,研究发现,现有疫苗针对Omicron突变株的保护效果明显下降。新的免疫策略或特异性疫苗/多价疫苗针对Omicron有效性的评估均需要动物模型的支撑。在实验室条件下,利用动物模型进行活病毒攻击实验,是在体内验证保护性中和抗体、疫苗有效性的关键技术手段,本文将从动物模型方向综述国内外针对Omicron变异株的疫苗研究进展。

西安市重症新型冠状病毒Omicron变异株感染人群临床特征及预后风险因素分析

目的分析重症新型冠状病毒Omicron变异株感染人群免疫学、影像学临床特征及死亡预后风险因素。方法本研究为回顾性研究。采用非随机抽样法。选择2022年11月1日至2023年2月1日西安市第九医院确诊新型冠状病毒Omicron变异株感染重型及危重型患者为研究对象,以2023年2月1日为时间点,根据预后不同分为死亡组和生存组,收集患者人口学资料、免疫学特征[自然杀伤细胞、T淋巴细胞、B淋巴细胞、免疫球蛋白(Ig)M、IgG、IgA]及胸部定量CT,分析生存组与死亡组患者间数据的差异,利用二元logistic回归分析影响重型及危重型Omicron变异株感染人群死亡的独立危险因素。利用受试者工作特征曲线比较不同生物学标志物之间的预测价值。结果共纳入重症新型冠状病毒Omicron变异株感染患者138例,其中死亡组43例(男32例,女11例),生存组95例(男55例,女40例),2组性别构成比差异无统计学意义(χ^(2)=3.47,P=0.063)。死亡组高龄患者、危重型患者占比高于生存组(χ^(2)值分别为5.54、46.01,均P<0.05)。死亡组淋巴细胞(CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞及B淋巴细胞)、自然杀伤细胞计数低于生存组(均P<0.05);死亡组Ig水平与生存组相比差异无统计学意义(均P>0.05)。死亡组患者全肺病变容积和百分比高于生存组(均P<0.05),且不论在生存组还是死亡组,右肺病变容积均大于左肺病变容积(均P<0.05)。二元logistic回归分析显示:年龄≥65岁(OR=1.20,95%CI:1.05~1.37)、肺部病变范围≥552.00 ml(OR=28.18,95%CI:3.05~260.56)和合并糖尿病(OR=16.45,95%CI:1.37~198.15)是重症新型冠状病毒Omicron变异株感染人群死亡的独立危险因素。结论重症新型冠状病毒Omicron变异株感染人群存在免疫失调,其中年龄≥65岁、肺部病变范围≥552.00 ml、合并糖尿病可作为评估重症新型冠状病毒Omicron变异株感染患者死亡的独立危险因素。

新冠病毒演变中的卫气营血辨证施治

在新冠肺炎发展演变过程中,初期阶段是SARS-CoV-2病毒,其毒性强,犯及卫气营血,甚至逆传心包,治疗重在用安宫牛黄丸等开窍醒神,用麻杏石甘汤、达原饮等宣肺化湿解毒;德尔塔(Delta)变异株病毒毒性虽然更强,但主要引起上中焦卫气营分症状,病机特点为肺脾亏虚,气阴两伤,治疗选用清肺解毒汤;奥密克戎(Omicron)变异株病毒传染性虽强,但致病力弱,主要出现卫表症状,或者无症状,治疗需坚持“未病先防,既病防变”的治未病思路。

871例新型冠状病毒Omicron株感染患儿的临床特征与管理方法

目的:了解新型冠状病毒Omicron株感染患儿的临床特征和管理方法。方法:采用便利抽样法,选取2022年4月7日-6月2日经检测确诊感染新冠病毒Omicron株并收治于上海儿童新冠肺炎定点隔离病区(上海交通大学医学院附属仁济医院南部院区)的871例患儿为研究对象,回顾性分析患儿的临床及护理资料。结果:871例患儿中,低年龄段患儿(<3岁)有561例(64.4%)。按诊断标准评为轻型的患儿有572例(65.7%),普通型298例(34.2%),重症1例(0.1%);伴有基础疾病的患儿有86例(9.9%),以肿瘤、神经系统疾病为主。主要临床症状包括发热、咳嗽、腹泻和呕吐等消化系统症状。根据患儿年龄结构、疾病特征、临床表现给予相对应的护理策略,主要包括隔离病区管理、基础疾病护理、症状护理、重症病例早期识别评估等。结论:新型冠状病毒Omicron株感染患儿的重点人群包括低年龄段、伴有基础疾病的患儿,症状上以发热及呼吸道症状为主。开展针对性护理诊疗,对于提高患儿救治效率、降低疫情传播风险具有重要意义。

Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液特异性鉴别试验RT-PCR法的建立及验证

目的建立Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液特异性鉴别试验的RT-PCR法,并对该方法进行验证。方法根据GIAIDS数据库中新型冠状病毒Omicron株及其他突变株和原型株的S基因序列差异设计并合成引物OSTF1、OS1R,提取Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液病毒RNA,逆转录为cDNA,利用对Omicron株S蛋白基因序列中的特异性插入及缺失核苷酸序列设计的引物对进行PCR扩增,扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳鉴定。对建立的RT-PCR法进行重复性、中间精密度、专属性、耐用性及灵敏度验证,并用该方法鉴别6批Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗原液。结果Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液利用引物OSTF1/OS1R进行RT-PCR检测,可扩增出约460 bp的条带,而原型株、Beta株、Delta株新型冠状病毒灭活疫苗原液(Vero细胞)均无法扩增出条带;重复3次检测、2名实验人员分别在3 d重复3次检测、利用3种不同退火温度进行RT-PCR,Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液均可扩增出约460 bp的条带;原液蛋白浓度在0.04μg/mL以上、RNA浓度在0.128 ng/μL以上均可扩增出较亮的约460 bp的条带;6批Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液经RT-PCR检测,均可见约460 bp的条带。结论RT-PCR法专属性、重复性、中间精密度、耐用性和灵敏度均良好,可用于Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗(Vero细胞)原液鉴别。