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无苞芥NAC转录因子基因OpNAC026的克隆与分析
被引量:
4
1
作者
魏艳玲
黄先忠
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期37-43,共7页
在新疆耐逆植物无苞芥幼苗cDNA文库的随机克隆测序结果中,发现1条与拟南芥NAC转录因子基因AtNAC026高度相似的5′端EST序列(GenBank登录号为JZ151854),对该克隆进行3′端测序,拼接得到一条全长1 327bp的cDNA序列,该序列包含一个906bp的...
在新疆耐逆植物无苞芥幼苗cDNA文库的随机克隆测序结果中,发现1条与拟南芥NAC转录因子基因AtNAC026高度相似的5′端EST序列(GenBank登录号为JZ151854),对该克隆进行3′端测序,拼接得到一条全长1 327bp的cDNA序列,该序列包含一个906bp的最大开放阅读框(ORF),推测编码301个氨基酸。根据该ORF序列设计引物,利用RT-PCR技术对其进行克隆,将该基因命名为OpNAC026(GenBank登录号为KM457621)。理化性质分析表明,OpNAC026蛋白是一个无跨膜区域的亲水蛋白,在N端具有一段保守结构域;蛋白质二级结构预测显示,OpNAC026蛋白包含54个α-螺旋和12个β-转角。系统进化树分析表明,OpNAC026基因与拟南芥AtNAC026和AtNAM进化关系最近。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析显示,OpNAC026基因在无苞芥的各组织中都有表达,在叶中表达量最高;高盐胁迫处理24h、干旱12h、ABA 6h、4℃低温8h处理均可明显诱导OpNAC026基因的表达。研究表明,OpNAC026基因可能参与无苞芥抗逆机制的调控。
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关键词
无苞芥
opnac026
克隆
抗逆
基因表达
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职称材料
题名
无苞芥NAC转录因子基因OpNAC026的克隆与分析
被引量:
4
1
作者
魏艳玲
黄先忠
机构
石河子大学生命科学学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期37-43,共7页
基金
国家自然科学基金(U1303302
31060149)
石河子大学高层次人才启动项目(RCZX200902)
文摘
在新疆耐逆植物无苞芥幼苗cDNA文库的随机克隆测序结果中,发现1条与拟南芥NAC转录因子基因AtNAC026高度相似的5′端EST序列(GenBank登录号为JZ151854),对该克隆进行3′端测序,拼接得到一条全长1 327bp的cDNA序列,该序列包含一个906bp的最大开放阅读框(ORF),推测编码301个氨基酸。根据该ORF序列设计引物,利用RT-PCR技术对其进行克隆,将该基因命名为OpNAC026(GenBank登录号为KM457621)。理化性质分析表明,OpNAC026蛋白是一个无跨膜区域的亲水蛋白,在N端具有一段保守结构域;蛋白质二级结构预测显示,OpNAC026蛋白包含54个α-螺旋和12个β-转角。系统进化树分析表明,OpNAC026基因与拟南芥AtNAC026和AtNAM进化关系最近。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析显示,OpNAC026基因在无苞芥的各组织中都有表达,在叶中表达量最高;高盐胁迫处理24h、干旱12h、ABA 6h、4℃低温8h处理均可明显诱导OpNAC026基因的表达。研究表明,OpNAC026基因可能参与无苞芥抗逆机制的调控。
关键词
无苞芥
opnac026
克隆
抗逆
基因表达
Keywords
Olimarabidopsis pumila
opnac026
cloning
stress tolerance
gene expression
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
无苞芥NAC转录因子基因OpNAC026的克隆与分析
魏艳玲
黄先忠
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
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