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糯玉米opaque2基因近等基因系的创制 被引量:9
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作者 张晓星 朱慧 +5 位作者 张东民 宋丽雅 张德贵 翁建峰 郝转芳 李明顺 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1760-1766,共7页
opaque2基因能够提高糯玉米赖氨酸、色氨酸等必需氨基酸的含量。用2种优质蛋白玉米(QPM)CA339和鲁2548自交系作为opaque2基因供体,25个品质较好的糯玉米自交系作为受体,利用回交技术和SSR分子标记辅助选择育种,创制糯玉米opaque2近等基... opaque2基因能够提高糯玉米赖氨酸、色氨酸等必需氨基酸的含量。用2种优质蛋白玉米(QPM)CA339和鲁2548自交系作为opaque2基因供体,25个品质较好的糯玉米自交系作为受体,利用回交技术和SSR分子标记辅助选择育种,创制糯玉米opaque2近等基因系。分子标记结果表明,不同受体以及两种供体间都存在多态性。5套创制成功的opaque2近等基因系的赖氨酸含量比其轮回亲本分别提高了59.0%、52.7%、48.5%、46.3%和61.9%,分别由0.308%、0.313%、0.309%、0.341%、0.323%提高到0.489%、0.478%、0.458%、0.498%、0.522%。本研究表明,可以利用此方法通过向不同遗传背景的多种受体导入opaque2,选取赖氨酸含量提高较大、透明表型的近等基因系,提高糯玉米的营养价值和经济价值。 展开更多
关键词 糯玉米 opaque2基因 WAXY基因 近等基因系 赖氨酸
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两个玉米回交一代群体中opaque2基因单侧连锁累赘的SSR分析 被引量:8
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作者 方明镜 丁冬 +2 位作者 杨文鹏 徐尚忠 郑用琏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1359-1364,共6页
为了在回交一代既能较好地消除靶基因的遗传连锁累赘,又能在进行背景选择的基础上选择到轮回亲本遗传背景回复率较高的单株,本研究构建了单株数分别为1 416和1 627的SCBC1F1和HCBC1F1两个不同遗传背景的回交群体。结合玉米叶片DNA大量... 为了在回交一代既能较好地消除靶基因的遗传连锁累赘,又能在进行背景选择的基础上选择到轮回亲本遗传背景回复率较高的单株,本研究构建了单株数分别为1 416和1 627的SCBC1F1和HCBC1F1两个不同遗传背景的回交群体。结合玉米叶片DNA大量、快速提取法,使用5个与opaque2(o2)基因连锁并已定位的SSR标记,在SCBC1F1与HCBC1F1群体中,对o2基因单侧的连锁累赘进行SSR分析,并与Ribaut(2002)的计算机模拟结果进行比较,结果表明,本研究获得的结果优于相应的计算机模拟结果。并对分子标记辅助选择体系在玉米回交育种中应用的若干理论问题进行了讨论,认为在实际应用MAS程序中,不仅要重点考虑最终决选的单株数(Ni),而且还应该考虑到实际有足够后代的中选单株数(Nj)。另外,结合预期要消除连锁累赘的图距,制备足够大的BC1F1群体是十分必要的。 展开更多
关键词 玉米 分子标记辅助选择 o2基因 连锁累赘
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RNAi靶向沉默opaque2基因对高粱醇溶蛋白含量的影响
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作者 蔡欣月 李志江 +4 位作者 牛江帅 包丹 苏晨 孙艺墨 戴凌燕 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期72-78,共7页
为研究opaque2基因沉默对高粱醇溶蛋白含量的影响,采用RNAi技术构建opaque2基因抑制表达载体,利用农杆菌介导转化高粱幼胚,测定转基因植株籽粒中醇溶蛋白含量,SDS-PAGE电泳检测醇溶蛋白带型,并使用透射电镜观察胚乳细胞中蛋白质体变化... 为研究opaque2基因沉默对高粱醇溶蛋白含量的影响,采用RNAi技术构建opaque2基因抑制表达载体,利用农杆菌介导转化高粱幼胚,测定转基因植株籽粒中醇溶蛋白含量,SDS-PAGE电泳检测醇溶蛋白带型,并使用透射电镜观察胚乳细胞中蛋白质体变化。结果表明,与野生型相比,5株转基因植株中4株籽粒的醇溶蛋白含量显著降低(P<0.05);野生型和各转基因植株的醇溶蛋白SDS-PAGE电泳带型相同;野生型胚乳细胞中淀粉粒排列紧密,部分大淀粉粒融合成大块状,蛋白质体数量较多且有一些体积较大;而转基因植株淀粉粒排列疏松,细胞中存在多处孔隙,蛋白质体数量较少,体积较小。opaque2基因沉默引起胚乳细胞蛋白质体数量变少,体积变小,进而影响胚乳细胞内部结构和籽粒醇溶蛋白含量。 展开更多
关键词 高粱 RNA i opaque2基因 醇溶蛋白 含量
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通过荧光标记的凝胶阻滞技术分析Opaque2蛋白与ZmGRAS11启动子的结合位点
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作者 朱佳梦 江海洋 +1 位作者 陈茹梅 周晓今 《生物技术进展》 2022年第6期880-887,共8页
凝胶阻滞实验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是研究蛋白质与核酸结合的一种关键实验技术。EMSA技术兴起以来,使用放射性同位素、生物素标记核酸探针的手段已经非常成熟,但这两种传统的标记技术分别具有放射性探针稳定性... 凝胶阻滞实验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是研究蛋白质与核酸结合的一种关键实验技术。EMSA技术兴起以来,使用放射性同位素、生物素标记核酸探针的手段已经非常成熟,但这两种传统的标记技术分别具有放射性探针稳定性差和生物素检测步骤复杂等缺点。近年来,尽管荧光标记探针逐渐被应用于EMSA中,但是对于利用荧光标记探针的EMSA仍缺乏系统的报道。对荧光标记的EMSA技术流程进行了优化和系统总结;利用6-羧基荧光素(6-carboxy-fluoroscine,FAM)标记ZmGRAS11启动子探针,通过EMSA检测其与Opaque2蛋白的结合,明确了蛋白和探针的适宜比例为8∶1。对GCN4 motif序列碱基进行突变并利用EMSA分析Opaque2与ZmGRAS11启动子之间的结合位点,结果表明GCN4 motif的“TGAC”核心基序在ZmGRAS11启动子与Opaque2蛋白的结合中可能起到了关键作用。研究结果为进一步探究Opaque2-ZmGRAS11转录调控模块在玉米籽粒发育中的作用机理提供了数据支撑。 展开更多
关键词 凝胶阻滞实验 荧光标记探针 ZmGRAS11启动子 opaque2蛋白
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Sucrose-associated SnRK1a1-mediated phosphorylation of Opaque2 modulates endosperm filling in maize
5
作者 Tao Yang Yunqin Huang +9 位作者 Longyu Liao Shanshan Wang Haoyu Zhang Jingying Pan Yongcai Huang Xiaoling Li Di Chen Tao Liu Xiaoduo Lu Yongrui Wu 《Molecular Plant》 SCIE CSCD 2024年第5期788-806,共19页
During maize endosperm filling,sucrose not only serves as a source of carbon skeletons for storage-reserve synthesis but also acts as a stimulus to promote this process.However,the molecular mechanisms underlying sucr... During maize endosperm filling,sucrose not only serves as a source of carbon skeletons for storage-reserve synthesis but also acts as a stimulus to promote this process.However,the molecular mechanisms underlying sucrose and endosperm filling are poorly understood.In this study,we found that sucrose promotes the expression of endosperm-filling hub gene Opaque2(O2),coordinating with storage-reserve accumulation.We showed that the protein kinase SnRK1a1 can attenuate O2-mediated transactivation,but sucrose can release this suppression.Biochemical assays revealed that SnRK1a1 phosphorylates O2 at serine 41(S41),negatively affecting its protein stability and transactivation ability.We observed that mutation of SnRK1a1 results in larger seeds with increased kernel weight and storage reserves,while overexpression of SnRK1a1 causes the opposite effect.Overexpression of the native O2(O2-OE),phospho-dead(O2-SA),and phospho-mimetic(O2-SD)variants all increased 100-kernel weight.Although O2-SA seeds exhibit smaller kernel size,they have higher accumulation of starch and proteins,resulting in larger vitreous endosperm and increased test weight.O2-SD seeds display larger kernel size but unchanged levels of storage reserves and test weight.O2-OE seeds show elevated kernel dimensions and nutrient storage,like a mixture of O2-SA and O2-SD seeds.Collectively,our study discovers a novel regulatory mechanism of maize endosperm filling.Identification of S41 as a SnRK1-mediated phosphorylation site in O2 offers a potential engineering target for enhancing storage-reserve accumulation and yield in maize. 展开更多
关键词 MAIZE opaque2 SnRK1 ENDOSPERM PHOSPHORYLATION SUCROSE
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opaque2对糯玉米子粒食味和营养品质的影响分析 被引量:2
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作者 刘晓丽 韩洁楠 +3 位作者 李冉 郭增辉 张德贵 李明顺 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期52-58,共7页
玉米opaque2(o2)是胚乳发育的核心调控基因,对子粒发育至关重要。基于9组糯玉米o2近等基因系(o2-NILs)及对应轮回亲本,对鲜食期和成熟期子粒的种皮厚度、总淀粉含量、可溶性糖含量等性状进行分析。结果表明,黄糯2/o2o2和中63-2/o2o2鲜... 玉米opaque2(o2)是胚乳发育的核心调控基因,对子粒发育至关重要。基于9组糯玉米o2近等基因系(o2-NILs)及对应轮回亲本,对鲜食期和成熟期子粒的种皮厚度、总淀粉含量、可溶性糖含量等性状进行分析。结果表明,黄糯2/o2o2和中63-2/o2o2鲜食期子粒的食味品质性状均有提高,其他o2-NILs子粒品质变化不一。鲜食期o2突变对种皮厚度影响较大,但与成熟期无直接相关性。o2突变使玉米子粒赖氨酸含量增加,营养价值提高,但多数近等基因系成熟期淀粉含量和百粒重降低,仅糯2/o2o2、淀粉含量和百粒重均不受影响。糯2/o2o2、SY1-2/o2o2、赵OP-6/o2o2中27 KDγ-zein表达量显著增加、子粒饱满度与轮回亲本相近,但均表现为粉质胚乳,因此认为,优质蛋白糯玉米硬质胚乳的恢复需多个o2胚乳修饰基因协同作用。 展开更多
关键词 糯玉米 opaque2 食味品质 营养品质
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郑58/opaque2近等基因系中opaque2基因突变位点分析与高效分子标记开发 被引量:1
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作者 韩小花 鲁晓民 +10 位作者 周波 魏良明 王延召 张前进 朱卫红 魏昕 郭书磊 刘康 郭金生 王振华 张新 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期61-68,共8页
opaque2突变体材料是最常用的高赖氨酸玉米供体。对已获得的郑58/o2近等基因系研究表明,胚乳发育不同时期22-kDα-醇溶蛋白的积累均明显低于郑58。荧光定量PCR结果表明,α-醇溶蛋白家族基因Z1A、Z1B、Z1C和Z1D的表达均显著低于郑58。郑5... opaque2突变体材料是最常用的高赖氨酸玉米供体。对已获得的郑58/o2近等基因系研究表明,胚乳发育不同时期22-kDα-醇溶蛋白的积累均明显低于郑58。荧光定量PCR结果表明,α-醇溶蛋白家族基因Z1A、Z1B、Z1C和Z1D的表达均显著低于郑58。郑58/o2胚乳发育不同时期Opaque2基因均正常表达。测序分析发现,郑58/o2中o2基因ATG后713 bp处缺失10个碱基,ORF预测Opaque2蛋白翻译提前终止。针对突变缺失位点开发基因内分子标记o2-indel-1,利用该标记进行回交转育,结果表明,o2-indel-1与o2突变表型完全连锁,错选率为0。opaque2基因突变位点的解析有助于高效分子标记的开发,有效降低错选率,提高优质蛋白鲜食玉米多基因聚合育种的选择效率。 展开更多
关键词 玉米 醇溶蛋白 opaque2 基因突变
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玉米opaque2近等基因系中相关基因的表达量分析
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作者 颜娜 宋丽雅 +8 位作者 夏仁培 周志强 张世煌 李新海 郝转芳 翁建峰 张德贵 雍洪军 李明顺 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期26-32,共7页
Opaque2(O2)基因编码产生OPAQUE2蛋白,该蛋白为碱性亮氨酸拉链家族的一种转录因子,可作用于基因的启动区,调控基因的转录。辽2345/o2为本实验室构建的辽2345的opaque2(o2)基因回交导入系,蛋白组学分析表明,辽2345与辽2345/o2在授粉后18 ... Opaque2(O2)基因编码产生OPAQUE2蛋白,该蛋白为碱性亮氨酸拉链家族的一种转录因子,可作用于基因的启动区,调控基因的转录。辽2345/o2为本实验室构建的辽2345的opaque2(o2)基因回交导入系,蛋白组学分析表明,辽2345与辽2345/o2在授粉后18 d的胚乳细胞中表达蛋白的种类和数量存在很大差异,从中筛选出差异较明显的9种蛋白质。为了进一步验证O2与9种蛋白间的作用关系,应用相对荧光定量PCR的方法对9种蛋白进行了RNA水平表达量的检测。结果表明,在胚乳发育过程中Chfi很可能受到O2的抑制作用,O2很可能对Ubc、Lgl、Sdh、LOC541920、Shmt、Ppdk等基因存在某种促进或激活作用。 展开更多
关键词 玉米 近等基因系 opaque2 相对表达量
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ZmGRAS11,transactivated by Opaque2,positively regulates kernel size in maize 被引量:4
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作者 Ye Li Shuai Ma +10 位作者 Qianqian Zhao Di Lv Baobao Wang Ke Xiao Jiameng Zhu Suzhen Li Wenzhu Yang Xiaoqing Liu Haiyang Wang Xiaojin Zhou Rumei Chen 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2021年第12期2031-2037,共7页
Although the genetic basis for endosperm development in maize(Zea mays)has been well studied,the mechanism for coordinating grain filling with increasing kernel size remains elusive.Here,we report that increased kerne... Although the genetic basis for endosperm development in maize(Zea mays)has been well studied,the mechanism for coordinating grain filling with increasing kernel size remains elusive.Here,we report that increased kernel size was selected during modern breeding and identify a novel DELLA-like transcriptional regulator,ZmGRAS11,which positively regulates kernel size and kernel weight in maize.We find that Opaque2,a core transcription factor for zein protein and starch accumulation,transactivates the expression of Zm GRAS11.Our data suggest that the Opaque2-Zm GRAS11 module mediates synergistic endosperm enlargement with grain filling. 展开更多
关键词 DELLA-like ENDOSPERM kernel size MAIZE opaque2 seed weight
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Revealing the process of storage protein rebalancing in high quality protein maize by proteomic and transcriptomic
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作者 ZHAO Hai-liang QIN Yao +3 位作者 XIAO Zi-yi SUN Qin GONG Dian-ming QIU Fa-zhan 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第5期1308-1323,共16页
Quality protein maize(QPM)(Zea mays L.) varieties contain enhanced levels of tryptophan and lysine, exhibiting improved nutritive value for humans and livestock. However, breeding QPM varieties remains challenging due... Quality protein maize(QPM)(Zea mays L.) varieties contain enhanced levels of tryptophan and lysine, exhibiting improved nutritive value for humans and livestock. However, breeding QPM varieties remains challenging due to the complex process of rebalancing storage protein. This study conducted transcriptome and proteome analyses to investigate the process of storage proteins rebalancing in opaque2(o2) and QPM. We found a weak correlation between the transcriptome and proteome, suggesting a significant modulating effect of post-transcriptional events on non-zein protein abundances in Mo17o2 and QPM. These results highlight the advantages of proteomics. Compared with Mo17, 672 differentially expressed proteins(DEPs) were identified both in Mo17o2 and QPM, and several of them were associated with storage protein, starch, and amino acid synthesis. We identified 178 non-zeins as DEPs in Mo17o2 and QPM kernels. The up-regulated non-zein DEPs were enriched in lysine, tryptophan, and methionine, which affected the protein quality. Co-expression network analysis identified regulators of storage protein synthesis in QPM, including O2,PBF1, and several transcription factors. Our results revealed how storage protein rebalancing occurs and identified nonzein DEPs that may facilitate superior-quality QPM breeding. 展开更多
关键词 quality PROTEIN MAIZE opaque2 qy27 PROTEIN body storage PROTEIN ITRAQ
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玉米O2/o2近等基因系胚乳中基因表达差异分析 被引量:2
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作者 陈旋 皮远江 +3 位作者 方明镜 杨文鹏 郑用琏 张方东 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期817-822,共6页
对玉米Hz85(O2/O2)和Hz85(o2/o2)以及S7913(O2/O2)和S7913(o2/o2)两种不同核背景下的近等基因系(NIL),采用cDNA芯片杂交技术研究玉米o2突变基因及赖氨酸形成和胚乳发生相关基因在RNA水平上的表达差异.在两套NILs中检测到共同的表达差异... 对玉米Hz85(O2/O2)和Hz85(o2/o2)以及S7913(O2/O2)和S7913(o2/o2)两种不同核背景下的近等基因系(NIL),采用cDNA芯片杂交技术研究玉米o2突变基因及赖氨酸形成和胚乳发生相关基因在RNA水平上的表达差异.在两套NILs中检测到共同的表达差异克隆87个,对其序列分析得到26个TUGs(tentativeuniquegenes)、11个未命名蛋白和6个新序列.这些TUGs分别参与了生长发育、胁迫响应、物质运输、信号转导、电子传递链、细胞防御、代谢等细胞过程,以及作为细胞组分和贮存蛋白.基于O2/o2NILs间胚乳发育中基因表达的差异,讨论了o2籽粒中的不透明粉质胚乳形成的分子机制. 展开更多
关键词 opaque2(O2) 玉米(Ze amay sL.) 近等基因系 芯片 基因表达
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玉米高赖氨酸和糯性基因聚合材料主要农艺性状配合力分析 被引量:1
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作者 陈汁雯 杨文鹏 +5 位作者 王明春 柏光晓 任洪 张开武 柯付文 王伟 《山地农业生物学报》 2020年第2期33-39,共7页
为研究玉米高赖氨酸和糯性基因聚合材料主要农艺性状的配合力效应,以9个玉米骨干自交系为母本,9个玉米基因聚合材料及其6个亲本为父本,按9×15不完全双列杂交模式配制杂交组合并进行田间鉴定,对产量等农艺性状进行配合力分析。结果... 为研究玉米高赖氨酸和糯性基因聚合材料主要农艺性状的配合力效应,以9个玉米骨干自交系为母本,9个玉米基因聚合材料及其6个亲本为父本,按9×15不完全双列杂交模式配制杂交组合并进行田间鉴定,对产量等农艺性状进行配合力分析。结果表明:小区产量、千粒重、穗长、穗行数、秃尖、株高和穗位高性状的一般配合力和特殊配合力均呈显著差异,且一般配合力方差均大于特殊配合力方差,一般配合力方差占基因型方差的比例大小是穗上叶片数>穗行数>穗粗>穗位高>株高>千粒重>小区产量>出籽率>穗长>秃尖;综合各性状表现,三基因聚合材料QCL8002-11(o2o16wx)、两基因聚合材料QCL8003-2(o2o16)和QCL8009-5(o16wx)具有较好的利用潜力,组合掖478×QCL8002-11产量杂种优势潜势较强。研究结果为玉米优质基因聚合材料的有效利用和改良提供参考。 展开更多
关键词 玉米 opaque2 Opaque16 WAXY 配合力
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玉米奥帕克-16和奥帕克-2突变的BC_2F_(2∶3)近等基因材料的SDS-PAGE分析
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作者 杨文鹏 杨留启 +1 位作者 王明春 王伟 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2011年第3期14-17,共4页
为了探知玉米opaque-16(o16)、opaque-2(o2)高赖氨酸突变和普通玉米的蛋白质表达差异,构建了BC2F2∶3世代o16和o2的近等基因材料。结果表明,突变o16、o2近等基因材料与其普通玉米之间,其植株形态相近,但籽粒胚乳质地相异,o16o、2近... 为了探知玉米opaque-16(o16)、opaque-2(o2)高赖氨酸突变和普通玉米的蛋白质表达差异,构建了BC2F2∶3世代o16和o2的近等基因材料。结果表明,突变o16、o2近等基因材料与其普通玉米之间,其植株形态相近,但籽粒胚乳质地相异,o16o、2近等基因材料的胚乳不透明,而其普通玉米的胚乳透明。经蛋白质SDS-PAGE分析,苗期叶片的总蛋白质表达相同,而乳熟期籽粒的总蛋白质表达却不同。在籽粒乳熟期,o16、o2近等基因材料的47 kDa蛋白质组分的表达比其普通玉米强,而o16近等基因材料的44kDa蛋白质组分的表达又比o2近等基因材料强。经DBL法测定赖氨酸含量,o16o、2近等基因材料比其普通玉米的籽粒赖氨酸含量提高70%~80%。表明,这2种蛋白质组分表达的增强可能与玉米籽粒赖氨酸含量的提高有关。这对于了解o16突变对赖氨酸含量的调控有重要意义。 展开更多
关键词 玉米 奥帕克-16 奥帕克-2 近等基因材料 SDS-PAGE
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玉米o2,o16和wx基因不同聚合类型近等基因系的选育 被引量:3
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作者 王伟 王明春 +3 位作者 张开武 任洪 赵德刚 杨文鹏 《种子》 北大核心 2019年第2期1-6,共6页
为研究玉米高赖氨酸奥帕克-2(opaque-2,o2),奥帕克-16(opaque-16,o16)和糯性(waxy1,wx1)突变基因聚合提高营养品质的分子机理,以玉米o2,o16和wx三隐性基因聚合系QCL 8002-11(o2o2o16o16wxwx)为供体亲本,以普通玉米自交系CML 539为受体亲... 为研究玉米高赖氨酸奥帕克-2(opaque-2,o2),奥帕克-16(opaque-16,o16)和糯性(waxy1,wx1)突变基因聚合提高营养品质的分子机理,以玉米o2,o16和wx三隐性基因聚合系QCL 8002-11(o2o2o16o16wxwx)为供体亲本,以普通玉米自交系CML 539为受体亲本,构建玉米o2、o16和wx基因不同聚合类型的近等基因系,经过多代回交和自交,利用分子标记辅助选择技术,选育出一批含有o2o16wx三隐性基因,o2o16、o2wx和o16wx双隐性基因,o2、o16和wx单隐性基因的近等基因系材料,为玉米品质的快速改良和阐明优异基因聚合提高玉米营养品质的机理提供材料基础。 展开更多
关键词 玉米 OPAQUE-2 opaque-16 近等基因系 分子标记辅助选择
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opaque—2基因对玉米胚乳中蛋白质片断聚积的影响
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作者 J.Landry S.Delhaye 邱敦莲 《国外作物育种》 2003年第1期39-40,共2页
关键词 opaque—2基因 玉米 胚乳 蛋白质 片断聚积
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基于DAP-Seq方法鉴定玉米胚乳特异表达转录因子O2在全基因组水平上的结合位点 被引量:1
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作者 宁丽华 王建晖 +3 位作者 时丕彪 伍楚善 董志诚 赵涵 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第24期2537-2548,共12页
Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq数据,本研究DAP-Seq共检测到317个O2直接结合并调控的靶基因,... Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq数据,本研究DAP-Seq共检测到317个O2直接结合并调控的靶基因,其中包括97个已报道ChIP-Seq检测靶基因以及220个DAP-Seq特异检测的靶基因.而基序(motif)富集分析显示, DAP-Seq检测O2结合317靶标基因与220个特异结合靶标基因所富集的基序均与已报道O2结合motif相同.另外, GO富集分析显示,与ChIP-Seq一致的O2靶基因主要参与zein蛋白合成及氨基酸代谢途径,而特异检测的O2靶标基因,除参与上述途径外,还主要参与糖代谢途径以及多个胁迫响应相关途径.本研究利用DAP-Seq技术进一步揭示了O2在胚乳发育过程发挥调控作用,该结果是对前人研究结果的验证和补充. 展开更多
关键词 opaque2 转录因子 DAP-Seq 转录因子结合位点 调控网络
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玉米子粒粉质突变体3901l的图位克隆 被引量:1
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作者 冯帆 姚东升 宋任涛 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期21-26,共6页
粉质胚乳突变体3901l来源于美国种质中心,该突变体胚乳呈现完全不透明表型。生化分析发现,该突变体α-和β-醇溶蛋白剧烈下降,同时伴随着非醇溶蛋白的大幅度升高。通过玉米SNP3072芯片进行基因分型分析发现,3901l基因定位于7号染色体约3... 粉质胚乳突变体3901l来源于美国种质中心,该突变体胚乳呈现完全不透明表型。生化分析发现,该突变体α-和β-醇溶蛋白剧烈下降,同时伴随着非醇溶蛋白的大幅度升高。通过玉米SNP3072芯片进行基因分型分析发现,3901l基因定位于7号染色体约33 M的区间。通过与o2突变体进行等位测试,确认3901l是o2的等位突变体。进一步研究表明,该突变体的O2转录本缺失了一个61-bp的外显子,造成开放阅读框移码和翻译提前终止。利用O2特异抗体检测子粒总蛋白,发现突变体中O2蛋白完全缺失,不能检测到提前终止的O2蛋白,说明错误翻译的O2蛋白被机体快速识别并降解。 展开更多
关键词 玉米 粉质胚乳 opaque2 醇溶蛋白
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