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SEQUENCE VARIABILITY OF HUMAN CYTOMEGALOVIRUS UL144 OPEN READING FRAME IN LOW-PASSAGE CLINICAL ISOLATES 被引量:6
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作者 RongHe QiangRuan ChangXia Lan-qingLiu Sheng-minLǔ YingLu YingQi Yan-pingMa QingLiu Yao-huaJi 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2004年第4期293-297,共5页
Objective To explore the relationship between human cytomegalovirus (HCMV) UL144 sequence variability and clinical disease. Methods HCMV UL144 open reading frame (ORF) was amplified by PCR assay in 72 lowpassage isola... Objective To explore the relationship between human cytomegalovirus (HCMV) UL144 sequence variability and clinical disease. Methods HCMV UL144 open reading frame (ORF) was amplified by PCR assay in 72 lowpassage isolates [65 con-genitally infective children and 7 healthy children who were HCMV-DNA positive by quantitative PCR (qPCR)]. All positive PCR products were analyzed by heteroduplex mobility assay and single-stranded conformation polymorphism (HMA-SSCP) and 32 of them were sequenced. Results Fifty-five patient isolates and five healthy children isolates were HCMV-UL144 positive by PCR. Sequencing and HMA-SSCP analysis showed that significant strain-specific variability was present in the UL144 ORF. Phylogenetic analysis indicated that the nucleotide sequences could be separated into 3 major genotypes. Comparing between UL144 se-quences and the corresponding symptoms showed that genotype 2 did not exist in megacolon isolates. And genotype 1 and 3 were the major types among microcephaly and jaundice isolates respectively. Conclusions HCMV-UL144 existed in most of low passage isolates and sequences were hypervariable. The UL144 ORF and its predicted product with the high level of sequence variability in different kinds of isolates suggest that UL144 ORF might play a role in HCMV infectivity and subsequent diseases. 展开更多
关键词 human cytomegalovirus UL144 open reading frame VARIABILITY
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C12ORF66对MYCN扩增的高危神经母细胞瘤细胞的活性调控
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作者 贾安娜 战世佳 +4 位作者 张璇 郭金鑫 于永波 郭永丽 常艳 《基础医学与临床》 2024年第3期288-294,共7页
目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-... 目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-qRCR检测正常组织永生化细胞系、MYCN扩增及MYCN非扩增细胞系中C12ORF66 mRNA表达差异。构建瞬时敲低和稳定敲低C12ORF66的MYCN扩增细胞株,对照组和敲低组细胞进行实时无标记动态细胞分析(RTCA)、集落形成能力检测及Ki67免疫荧光染色。结果R2数据库分析显示MYCN扩增NB患儿样本中C12ORF66表达显著高于MYCN非扩增NB患儿样本,并且C12ORF66表达与患儿预后负相关(P<0.05)。细胞实验表明,与MYCN非扩增细胞系CHLA-255和SH-SY5Y相比,C12ORF66在MYCN扩增细胞系BE(2)-C和SK-N-BE(2)中表达显著升高(P<0.001)。瞬时或稳定敲低C12ORF66,MYCN扩增NB细胞增殖显著减缓(P<0.001),集落形成能力显著降低(P<0.001),Ki67阳性细胞比例显著减少(P<0.05)。结论C12ORF66在MYCN扩增NB患儿样本和细胞系中高表达,且与患儿预后负相关,敲低C12ORF66显著抑制NB细胞活性。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框66 SK-N-BE(2)细胞 MYCN扩增 细胞增殖
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基于生物信息数据分析C12ORF49在乳腺癌中的表达及其意义
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作者 马强 李慧娟 吕运成 《华夏医学》 CAS 2024年第2期103-110,共8页
目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同... 目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性,然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性,最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图,并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织,乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短,差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01,Corrected-P<0.01),促进乳腺癌进展。结论C12ORF49在乳腺癌组织中表达上调,其高表达水平对预测乳腺癌患者不良预后有重要意义,需进一步深入研究。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框49 乳腺癌 生物信息学
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棉花CMS-D2和CMS-D8不育系线粒体全基因组比较分析
4
作者 葛李爽 冯娟娟 +8 位作者 张梦 郭立平 戚廷香 张学贤 李永旗 唐会妮 乔秀琴 邢朝柱 吴建勇 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期28-38,共11页
【目的】探究哈克尼西棉不育胞质(CMS-D2)和三裂棉不育胞质(CMS-D8)的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异,为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果,使用Synteny and Rearrangem... 【目的】探究哈克尼西棉不育胞质(CMS-D2)和三裂棉不育胞质(CMS-D8)的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异,为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果,使用Synteny and Rearrangement Identifier(Sy RI)软件鉴定结构变异,用Plotsr可视化分析包含共线性及非共线性区域的重组变异位点。以D8A线粒体基因组注释结果为参考,用D2A线粒体基因组注释的开放阅读框(open reading frame,ORF)编码的氨基酸序列进行tblastn比对,筛选出D2A线粒体基因组中特有的ORF,并进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证、相对表达量分析和生物信息学分析。【结果】D2A和D8A这2个不育系线粒体基因组之间存在2个部分重叠且相邻的倒易位区域。在D2A中发现17个特异的ORF,PCR验证了D2A中存在的6个特异ORF(orf114e、orf121b-1、orf121b-2、orf138b-2、orf186a-2和orf317a-2)。3~4 mm花蕾中orf121b-1和orf121b-2的相对表达量较高。orf114e、orf186a-2和orf317a-2具有典型的跨膜结构域和嵌合基因结构,符合不育基因的部分特征。【结论】D2A和D8A线粒体基因组间存在2个相邻的倒易位区域。D2A中存在6个特异的ORF,其中orf114e、orf186a-2和orf317a-2可能与棉花CMS-D2孢子体败育有关。 展开更多
关键词 棉花 细胞质雄性不育 线粒体基因组 孢子体不育 配子体不育 开放阅读框
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三角梅品种‘绿叶樱花’4,5-多巴双加氧酶开放阅读框克隆与分析
5
作者 李建运 姚国琼 +4 位作者 王飞 朱文 李子涵 孙正海 辛培尧 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期153-164,共12页
【目的】多巴双加氧酶(4,5-DOPA dioxygenase extradiol)是甜菜色素生物合成途径的关键酶之一,能催化多巴分解形成甜菜醛氨酸,也是最可能与三角梅最终的花色形成相关的酶蛋白。克隆三角梅多巴双加氧酶基因的开放阅读框(ORF),对其编码的... 【目的】多巴双加氧酶(4,5-DOPA dioxygenase extradiol)是甜菜色素生物合成途径的关键酶之一,能催化多巴分解形成甜菜醛氨酸,也是最可能与三角梅最终的花色形成相关的酶蛋白。克隆三角梅多巴双加氧酶基因的开放阅读框(ORF),对其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析,探讨三角梅花色变化机理和甜菜色素代谢途径。【方法】以三角梅品种‘绿叶樱花’的苞片为材料,提取其RNA,并进行逆转录,之后快速转化完成基因的克隆和基因PCR扩增,最后对其编码的氨基酸序列进行保守区预测、信号肽分析、磷酸化位点预测、跨膜信号预测、同源性比对、构建系统进化树以及二、三级结构预测,研究其氨基酸序列的结构和功能。【结果】‘绿叶樱花’的多巴双加氧酶基因ORF序列长801 bp,编码266个氨基酸。ORF序列所编码的氨基酸序列具有cd07363保守结构域,其编码蛋白是一种稳定的酸性亲水蛋白,分子量为29 734.76 kD,等电点为6.26,二级结构包含了11个α螺旋、7个β转角、20个β折叠结构,具有4个磷酸化位点,没有跨膜结构,可能只在细胞质内发挥作用。该序列还与66个序列高度同源,与同科的‘金心双色’、胶果木和梭房叶子花有着相同的进化分支,符合自然进化规律。【结论】‘绿叶樱花’多巴双加氧酶开放阅读框ORF的氨基酸序列属于第三类雌二醇双加氧基因家族,具有该基因家族具有的保守氨基酸序列,表明多巴双加氧酶基因在生成甜菜色素植物中具有独特的保守性,且属于稳定、酸性的亲水蛋白,没有跨膜结构,可能只在细胞质内发挥作用。三角梅中控制花色变化的主要是甜菜色素,研究三角梅甜菜色素合成途径中的关键酶,解析其甜菜色素的合成代谢机制,可为三角梅花色形成机制提供理论参考,有望在今后的工作中,利用转基因手段丰富三角梅花色。 展开更多
关键词 三角梅 多巴双加氧酶 开放阅读框 氨基酸序列 克隆
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戊型肝炎病毒结构区ORF2蛋白在巴氏毕赤酵母中的胞内表达与纯化的初步研究 被引量:11
6
作者 佟玉品 毕胜利 +1 位作者 江永珍 詹美云 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期34-37,共4页
为寻求新型表达系统来研制戊型肝炎基因工程疫苗 ,利用甲醇营养型酵母 pichiapastoris表达系统表达戊型肝炎病毒 (HEV)结构区ORF2蛋白。采用PCR方法从HEVcDNA中扩增得到的ORF2基因克隆到酵母表达载体pPIC3.5K上 ,构建成重组质粒 pPIC3.5... 为寻求新型表达系统来研制戊型肝炎基因工程疫苗 ,利用甲醇营养型酵母 pichiapastoris表达系统表达戊型肝炎病毒 (HEV)结构区ORF2蛋白。采用PCR方法从HEVcDNA中扩增得到的ORF2基因克隆到酵母表达载体pPIC3.5K上 ,构建成重组质粒 pPIC3.5KORF2。该质粒转化酵母菌GS115 ,经G418筛选得到高拷贝转化子。转化菌株经Mut表型鉴定后 ,用含甲醇的培养基诱导表达 ,SDS PAGE及ELISA筛选高表达活性菌株 ,放大培养后进行亲合层析纯化。在该系统中成功地表达了高生物活性的HEVORF2蛋白 ,经亲和层析纯化后扫描分析重组蛋白分子量约为 5 9kD ,纯度可达 96 %。Westernblotting证实 ,它与HEVORF2单克隆抗体有特异性反应。HEV结构区ORF2蛋白在甲醇营养型酵母中的成功表达 ,以及初步纯化得到的具有强免疫学活性的重组蛋白 。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 开放读码框架 异源基因表达 蛋白纯化 巴氏毕赤酵母 胞内表达
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基因表达式编程ORF过滤算子的设计和实现 被引量:4
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作者 段磊 唐常杰 +2 位作者 刘胤田 左劼 吴江 《四川大学学报(工程科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期102-106,共5页
基因表达式编程(GEP)的个体代表了问题的候选解。在缺乏先验知识的情况下,个体长度的设定是个"两难"问题,过长或过短都会降低GEP的效率。对此,分析了个体长度对GEP求解效率的影响;设计了开放阅读框(ORF)过滤算子根据最优个体... 基因表达式编程(GEP)的个体代表了问题的候选解。在缺乏先验知识的情况下,个体长度的设定是个"两难"问题,过长或过短都会降低GEP的效率。对此,分析了个体长度对GEP求解效率的影响;设计了开放阅读框(ORF)过滤算子根据最优个体的进化历程动态调节个体的有效编码区域;验证了ORF过滤算子的有效性,实验结果表明,在同样的进化代数内,引入ORF过滤算子,GEP能进化出更高适应度的最优解且减少平均运行时间17.0%。 展开更多
关键词 基因表达式编程 开放阅读框 个体
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LINE-1 ORF-1p过表达对肝癌细胞株SMMC7721增殖和锚定非依赖性生长的影响 被引量:5
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作者 高旭东 陆荫英 +4 位作者 冯帆 王春平 王鈜 常秀娟 杨永平 《实用肝脏病杂志》 CAS 2011年第5期323-326,共4页
目的研究逆转座子L1编码蛋白ORF-1p的表达对肝癌细胞株SMMC7721细胞增殖的影响。方法利用带Flag标签的L1 ORF1表达载体,转染SMMC7721细胞;采用Western blot法检测反转座子L1 ORF1编码蛋白ORF-1p的表达;采用软琼脂成集落实验和相关报告... 目的研究逆转座子L1编码蛋白ORF-1p的表达对肝癌细胞株SMMC7721细胞增殖的影响。方法利用带Flag标签的L1 ORF1表达载体,转染SMMC7721细胞;采用Western blot法检测反转座子L1 ORF1编码蛋白ORF-1p的表达;采用软琼脂成集落实验和相关报告基因检测ORF-1p表达对肝癌细胞p53、p15和p21活性的影响。结果在SMMC7721细胞中,Flag-ORF-1p表达能够显著促进该细胞的增殖(P<0.05),增强该细胞的锚定非依赖性生长(P<0.05),降低p53、p15和p21报告基因的活性。结论 L1基因编码蛋白ORF-1p能够促进肝癌细胞的生长、浸润以及肿瘤的形成。 展开更多
关键词 肝癌细胞株SMMC7721 逆转座子L1 开放读码框-1p 蛋白质转移吸印技术
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HHV-8 ORF50启动子区序列分离、鉴定及在293细胞中启动活性分析 被引量:3
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作者 卢春 黄丽 +1 位作者 曾怡 徐亚林 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期523-526,共4页
目的:分离和鉴定人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF50基因上游启动子区序列,评价其在293细胞中启动活性。方法:以佛波酯(TPA)刺激的BCBL-1细胞总DNA为模板,PCR扩增HHV-8 ORF50启动子区序列,克隆进pGL-3基本载体中虫荧光素酶(Luciferase)报告基... 目的:分离和鉴定人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF50基因上游启动子区序列,评价其在293细胞中启动活性。方法:以佛波酯(TPA)刺激的BCBL-1细胞总DNA为模板,PCR扩增HHV-8 ORF50启动子区序列,克隆进pGL-3基本载体中虫荧光素酶(Luciferase)报告基因上游多克隆位点,分别构建含正反双向ORF50启动子重组报告质粒,并分别转染293细胞,作Lu-ciferase活性检测,计算相对Luciferase活性单位(RLU)。结果:①克隆的HHV-8 ORF50启动子区序列长655碱基(bp),含多个潜在推测AP1、SP1和ERE等转录因子结合序列;②ORF50启动子与正常pGL-3基本载体相比,其RLU增加了26.3倍;③TPA刺激后ORF50启动子与刺激前相比启动活性增加了4.1倍。结论:HHV-8 ORF50启动子区序列在293细胞中具有较强的启动活性;TPA可以作为一有效的阳性对照刺激物用于进一步鉴定ORF50启动子特性。 展开更多
关键词 人类疱疹病毒8型 orf50启动子 启动子活性
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FMDV全ORF编码基因的克隆及其腺病毒穿梭质粒的构建 被引量:1
10
作者 张兴旺 王勤 +4 位作者 柳纪省 李志勇 王辉 殷相平 谢庆阁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期93-97,共5页
为研制FMD复制缺陷型腺病毒活载体疫苗,通过RT-PCR方法获得了O型口蹄疫病毒(FMDV)全开放阅读框(ORF)基因片段,将其克隆到pMD18-T载体后测序,再将ORF编码基因定向克隆入腺病毒穿梭载体pAdTrack-CMV中,构建了重组腺病毒穿梭质粒。经PCR、... 为研制FMD复制缺陷型腺病毒活载体疫苗,通过RT-PCR方法获得了O型口蹄疫病毒(FMDV)全开放阅读框(ORF)基因片段,将其克隆到pMD18-T载体后测序,再将ORF编码基因定向克隆入腺病毒穿梭载体pAdTrack-CMV中,构建了重组腺病毒穿梭质粒。经PCR、酶切及测序鉴定,所克隆的ORF编码基因序列与原始强毒株Akesu/58的ORF编码基因比较,L、P1、P2、P3基因的核苷酸同源性分别为98.8%、97.9%、99.0%和97.6%,PCR、酶切鉴定重组腺病毒穿梭质粒均获得了长约6.9 kb的目的基因片段。表明,成功获得了含有O型FMDV全ORF编码基因的阳性克隆,并成功构建了含有完整FMDV开放阅读框架的编码基因表达盒的重组腺病毒穿梭质粒。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 全开放阅读框 克隆 穿梭栽体
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长链非编码RNA及其编码的微蛋白在乳腺癌中的功能及其研究进展
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作者 温子靖 杜俊 +1 位作者 陈雪 刘文 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期799-812,共14页
[背景]乳腺癌发生发展过程相关药物靶点的发现及其分子机制研究一直是乳腺癌防治领域的前沿问题.近年来,长链非编码RNA(lncRNA)作为表观遗传调控的关键参与者受到广泛关注.部分lncRNA存在开放阅读框(ORF)并可编码功能性蛋白.越来越多研... [背景]乳腺癌发生发展过程相关药物靶点的发现及其分子机制研究一直是乳腺癌防治领域的前沿问题.近年来,长链非编码RNA(lncRNA)作为表观遗传调控的关键参与者受到广泛关注.部分lncRNA存在开放阅读框(ORF)并可编码功能性蛋白.越来越多研究表明,lncRNA及其编码的微蛋白在细胞分裂、钙及线粒体代谢等生物学过程中发挥重要作用,且在多种疾病尤其是肿瘤的发生发展过程中发挥关键调控作用,可参与多种癌症信号通路并调控肿瘤进程,调控肿瘤的生长增殖、侵袭转移与耐药,并与患者的预后相关,暗示其可能应用于癌症的诊断与治疗中.[进展]本文系统综述了lncRNA及其编码的微蛋白在乳腺癌中的功能和分子机制.作为lncRNA分子,lncRNA可以在转录或转录后水平调控基因表达、mRNA稳定性、蛋白翻译和蛋白稳定性,从而调控乳腺癌细胞增殖、分化、侵袭和转移及免疫应答等恶性进程.lncRNA的表达特征和存在形式也赋予其作为临床诊断标志物与治疗靶点的可能性.作为编码微蛋白的载体,lncRNA可以进一步翻译产生长度小于100个氨基酸的微蛋白,并在细胞的正常生理活动及癌症的发生发展中发挥关键调控作用.在乳腺癌中也发现lncRNA来源的微蛋白可以参与乳腺癌细胞的生长、转移和侵袭及耐药等恶性病变进程,并可能应用于癌症的诊断与治疗中.[展望]lncRNA及其编码的微蛋白被证明具有作为新治疗靶点和抗肿瘤药物的巨大潜力.然而,验证lncRNA的编码潜力是后续微蛋白功能研究的前提.如何从真核生物基因组数以万计的ORF中准确识别可编码的ORF,区分其与真正的转录或翻译“噪声”面临挑战;同时,这些微蛋白的具体结构、定位、表达水平仍待进一步研究,其作为新药靶点或肿瘤标志物的临床实用性也需更深入的探索和评估. 展开更多
关键词 乳腺癌 长链非编码RNA 短开放阅读框 微蛋白
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新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析 被引量:2
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作者 王佑春 张华远 +3 位作者 辜文杰 RogerLing 李河民 TimJHarrison 《中国病毒学》 CSCD 2001年第1期28-33,共6页
用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因... 用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%~ 82 % ;与II型的同源性为 80 %~ 81% ;和III型的同源性为 83%~ 85 % 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 基因型 同源性 开放读码框架 序列分析
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L1-ORF2对GES-1细胞衰老的影响及分子调控机制研究 被引量:1
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作者 李英男 王卫华 +1 位作者 王昌正 吴本俨 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期479-483,共5页
目的探讨长散在核元件1读码框2基因(L1-ORF2)对GES-1细胞衰老的影响及分子调控机制。方法采用高糖诱导法构建GES-1细胞衰老模型,构建L1-ORF2 si RNA载体,脂质体法将其瞬时转染正常及衰老的GES-1细胞,转染48h后用细胞计数法绘制细胞生长... 目的探讨长散在核元件1读码框2基因(L1-ORF2)对GES-1细胞衰老的影响及分子调控机制。方法采用高糖诱导法构建GES-1细胞衰老模型,构建L1-ORF2 si RNA载体,脂质体法将其瞬时转染正常及衰老的GES-1细胞,转染48h后用细胞计数法绘制细胞生长曲线,流式细胞仪分析细胞周期,β-半乳糖苷酶染色检测细胞衰老情况,Western blotting检测转染细胞中L1-ORF2、P53、P21蛋白表达水平。结果成功构建了稳定的GES-1细胞衰老模型及L1-ORF2si RNA载体。与转染了阴性对照载体的细胞相比,转染L1-ORF2 si RNA载体的正常及衰老GES-1细胞的L1-ORF2表达均下降(P<0.05)。与转染阴性对照载体的衰老GES-1细胞相比,转染L1-ORF2 si RNA载体的衰老GES-1细胞增殖速度变快(P<0.05),G0/G1期比例明显减少(34.2%vs 39.3%,P<0.05),β-半乳糖苷酶染色比例下降(56%vs 69%,P<0.05),而转染阴性对照载体和L1-ORF2 si RNA载体的正常GES-1细胞相比则无明显差异(P>0.05)。P53蛋白仅在衰老GES-1细胞中有表达,在正常GES-1细胞中无表达,而P21蛋白在正常和衰老的GES-1细胞中均有表达,且后者表达更高(P<0.05)。与转染阴性对照载体的细胞相比,转染L1-ORF2 si RNA载体的GES-1细胞P53、P21蛋白表达量明显下降(P<0.05)。结论L1-ORF2 si RNA载体可使正常及衰老的GES-1细胞中L1-ORF2表达下调,促进衰老GES-1细胞的生长和增殖,而对正常GES-1细胞无明显影响。P53、P21蛋白参与了L1-ORF2调控细胞衰老的过程。 展开更多
关键词 长核苷酸元件 开放读码框架 细胞衰老 RNA干扰
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猪源戊型肝炎病毒基因IV型ORF3编码蛋白的表达及鉴定 被引量:1
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作者 屈勇刚 贾鹏 +6 位作者 金宁一 陆民 孙中锋 朱光泽 于芳 刘玉生 夏志平 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期8-12,共5页
通过PCR从已构建的猪源戊型肝炎病毒全基因克隆扩增ORF3全基因,将扩增产物插入到pMD18-T载体中,亚克隆至原核表达载体pET28a(+),构建pET28a-ORF3表达载体,转入E.coliBL21(DE3),IPTG诱导表达。Ni-NTA层析柱纯化表达蛋白,用SDS-PAGE、免... 通过PCR从已构建的猪源戊型肝炎病毒全基因克隆扩增ORF3全基因,将扩增产物插入到pMD18-T载体中,亚克隆至原核表达载体pET28a(+),构建pET28a-ORF3表达载体,转入E.coliBL21(DE3),IPTG诱导表达。Ni-NTA层析柱纯化表达蛋白,用SDS-PAGE、免疫印迹、ELISA等方法分析鉴定表达产物。结果成功扩增到345bp的目的基因;构建了重组表达载体pET28a-ORF3;转化宿主菌E.coliBL21(DE3)后表达产物的相对分子质量在6.50~16.5kDa之间,与预期表达的目的蛋白相对分子质量相符;表达的目的蛋白能与阳性猪源和人源血清发生特异性反应,证实其具有较好的反应原性。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 结构蛋白 原核表达
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单纯疱疹病毒Ⅱ型潜伏相关转录体基因ORF真核表达载体的构建及表达 被引量:1
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作者 杨慧兰 齐维 +1 位作者 樊建勇 赵举峰 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第11期721-723,共3页
目的构建单纯疱疹病毒Ⅱ型潜伏相关转录体基因ORF片段真核表达载体,并在Vero细胞中进行表达。方法用PCR方法从已成功构建的pVAX-LAT重组质粒中扩增潜伏相关转录体基因ORF片段,克隆到pcDNA6/myc-his B质粒中,构建pcDNA-ORF重组质粒,双酶... 目的构建单纯疱疹病毒Ⅱ型潜伏相关转录体基因ORF片段真核表达载体,并在Vero细胞中进行表达。方法用PCR方法从已成功构建的pVAX-LAT重组质粒中扩增潜伏相关转录体基因ORF片段,克隆到pcDNA6/myc-his B质粒中,构建pcDNA-ORF重组质粒,双酶切及测序鉴定其正确性。以脂质体法瞬时转染Vero细胞,并用RT-PCR和Western blot检测其表达。结果双酶切及测序表明ORF片段大小及序列均正确,RT-PCR及Western blot显示重组质粒在Vero细胞中得到了表达。结论成功构建了pcDNA-ORF重组质粒,并可在Vero细胞内有效表达。 展开更多
关键词 单纯疱疹病毒Ⅱ型 潜伏相关转录体 蛋白读码框 真核表达
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HEV ORF3 cDNA序列分析及在HepG2细胞的表达
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作者 赵振宇 温雯静 +2 位作者 刘新胜 赵江波 刘晓东 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第23期3034-3036,共3页
目的对构建的HEV新疆株ORF3真核表达载体pcHEV3进行DNA序列分析,并转染HepG2细胞进行表达,为进一步探索ORF3蛋白功能提供基础。方法对HEV ORF3真核表达载体pcHEV3进行DNA测序,分析ORF3蛋白一级结构,脂质体介导法转染HepG2细胞,用免疫荧... 目的对构建的HEV新疆株ORF3真核表达载体pcHEV3进行DNA序列分析,并转染HepG2细胞进行表达,为进一步探索ORF3蛋白功能提供基础。方法对HEV ORF3真核表达载体pcHEV3进行DNA测序,分析ORF3蛋白一级结构,脂质体介导法转染HepG2细胞,用免疫荧光法鉴定ORF3蛋白的表达及细胞内定位。结果 HEV新疆株ORF3蛋白具有保守的PPLP基序,转染HepG2细胞后经免疫荧光鉴定能在细胞内表达。结论构建出HEV ORF3蛋白真核表达重组载体,并能在HepG2细胞表达,为进一步研究HEV ORF3蛋白的功能提供了实验基础。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 开放读码框架 表达载体
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口蹄疫病毒WFL株ORF基因真核表达质粒的构建及病毒的拯救
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作者 任林柱 王兴龙 +2 位作者 崔丽瑾 张辉 孟柯音 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期27-31,共5页
构建了FMDVWFL株ORF(open reading frame)基因真核表达质粒pEGFP-C1-A3I3,并进行了表达研究和共转染研究。结果发现,该质粒可以在BHK-21细胞中表达。将其与体外转录获得的FMDV RNA共转染BHK-21细胞后,用夹心ELISA、RT-PCR法以及电镜观... 构建了FMDVWFL株ORF(open reading frame)基因真核表达质粒pEGFP-C1-A3I3,并进行了表达研究和共转染研究。结果发现,该质粒可以在BHK-21细胞中表达。将其与体外转录获得的FMDV RNA共转染BHK-21细胞后,用夹心ELISA、RT-PCR法以及电镜观察证明共转染后的细胞培养液中有病毒粒子,且病毒量高于单独转染RNA所得病毒量。证明用FMDV基因组真核表达质粒与其基因组体外转录RNA共转染敏感细胞可提高拯救病毒的数量。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 开放性阅读框 真核表达 反向遗传技术 拯救
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2株微孢子虫热激蛋白Hsp70的ORF研究
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作者 马兰 李灿 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第8期139-143,147,共6页
为探讨微孢子虫的起源、分类地位及亲缘关系,在系统发育分析的基础上,对家蚕微孢子虫(Nosema.bombycis)和柞蚕微孢子虫(N.antheraeae)Hsp70基因的ORF序列进行克隆、测序,同时将2种微孢子虫的Hsp70基因的ORF序列翻译成氨基酸序列,利用Exp... 为探讨微孢子虫的起源、分类地位及亲缘关系,在系统发育分析的基础上,对家蚕微孢子虫(Nosema.bombycis)和柞蚕微孢子虫(N.antheraeae)Hsp70基因的ORF序列进行克隆、测序,同时将2种微孢子虫的Hsp70基因的ORF序列翻译成氨基酸序列,利用Expasy蛋白质数据库的分析工具和DNAstar软件对其功能进行理论分析和预测。结果表明:家蚕微孢子虫和柞蚕微孢子虫的Hsp70氨基酸序列在N端均有一个高度保守的基序GIDLGTT,另外还有被作为线粒体Hsp70标志的2个保守的基序;氨基酸序列相似性比较结果发现,家蚕微孢子虫广东株Hsp70的蛋白氨基酸序列和家蚕微孢子虫日本株的相似性最近,约为96%。系统发育分析发现,微粒子属和变形虫属有较近的亲缘关系。功能预测表明,2种微孢子虫在信号肽剪切位点、跨膜结构域及糖基化位点、二级结构、亲水性、柔韧性等方面均存在异同。 展开更多
关键词 微孢子虫 热激蛋白70 开放读码框
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Pathogenesis and clinical features of severe hepatitis E virus infection
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作者 László Orosz Károly Péter Sárvári +2 位作者 Áron Dernovics András Rosztóczy Klára Megyeri 《World Journal of Virology》 2024年第2期19-33,共15页
The hepatitis E virus(HEV),a member of the Hepeviridae family,is a small,non-enveloped icosahedral virus divided into eight distinct genotypes(HEV-1 to HEV-8).Only genotypes 1 to 4 are known to cause diseases in human... The hepatitis E virus(HEV),a member of the Hepeviridae family,is a small,non-enveloped icosahedral virus divided into eight distinct genotypes(HEV-1 to HEV-8).Only genotypes 1 to 4 are known to cause diseases in humans.Genotypes 1 and 2 commonly spread via fecal-oral transmission,often through the consum-ption of contaminated water.Genotypes 3 and 4 are known to infect pigs,deer,and wild boars,often transferring to humans through inadequately cooked meat.Acute hepatitis caused by HEV in healthy individuals is mostly asymptomatic or associated with minor symptoms,such as jaundice.However,in immunosup-pressed individuals,the disease can progress to chronic hepatitis and even escalate to cirrhosis.For pregnant women,an HEV infection can cause fulminant liver failure,with a potential mortality rate of 25%.Mortality rates also rise amongst cirrhotic patients when they contract an acute HEV infection,which can even trigger acute-on-chronic liver failure if layered onto pre-existing chronic liver disease.As the prevalence of HEV infection continues to rise worldwide,highlighting the particular risks associated with severe HEV infection is of major medical interest.This text offers a brief summary of the characteristics of hepatitis developed by patient groups at an elevated risk of severe HEV infection. 展开更多
关键词 Hepatitis E virus CIRRHOSIS Acute-on-chronic liver failure PREGNANCY Immune dysfunction open reading frames 1-4
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戊型肝炎病毒ORF_2基因在人胚肾293细胞中的表达
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作者 张强 高正琴 +2 位作者 周育森 贺争鸣 吴昊 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期188-190,共3页
目的探讨戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)ORF2基因在人胚肾293细胞的表达。方法利用聚合酶链反应(PCR)技术,以HEV ORF2为模板扩增其部分基因片段,克隆入真核表达载体pcDNA 3.1中,构建真核表达载体质粒,转染人胚肾293细胞,用G418(G... 目的探讨戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)ORF2基因在人胚肾293细胞的表达。方法利用聚合酶链反应(PCR)技术,以HEV ORF2为模板扩增其部分基因片段,克隆入真核表达载体pcDNA 3.1中,构建真核表达载体质粒,转染人胚肾293细胞,用G418(Geneticin,遗传霉素)加压筛选得到稳定表达株。用western-blot方法对表达产物进行免疫学特性初步研究。结果含ORF2结构基因部分片段的重组质粒在人胚肾293细胞中得到表达。结论表达的ORF2重组蛋白具有抗HEV抗体识别的抗原表位和一定的抗原性,为进一步研制HEV的诊断试剂奠定了基础。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 orf2基因 表达
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