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海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析
被引量:
6
1
作者
王晓玲
郭安平
+4 位作者
彭于发
刘恩平
孔华
林海妹
贺立卡
《热带作物学报》
CSCD
2008年第4期478-484,共7页
以转bar基因粳稻(O. sativa ssp. japonica)YOO3为外类群,采用PAUP4.0等软件,对海南7个主要普通野生稻(O. rufipogon)核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)全序列信息进行比较分析。结果表明,ITS全长为586~589 bp,其中ITS1为193~195 ...
以转bar基因粳稻(O. sativa ssp. japonica)YOO3为外类群,采用PAUP4.0等软件,对海南7个主要普通野生稻(O. rufipogon)核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)全序列信息进行比较分析。结果表明,ITS全长为586~589 bp,其中ITS1为193~195 bp,共有20个变异位点数,G/C含量为72.02%~74.74%;ITS2为229~231 bp,共有12个变异位点数,G/C含量为75.55%~76.08%;离栽培稻越近的类群G/C含量越高。所有材料5.8S rDNA序列完全一致,全长164 bp,G/C占97 bp,含量为59.15%。各类群间ITS序列信息较丰富,且显示ITS1比ITS2进化速度要快。利用ITS差异信息序列进行聚类分析为鉴别不同居群的普通野生稻提供了分子依据。
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关键词
普通野生稻
核糖体
dna
its
区
序列分析
下载PDF
职称材料
题名
海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析
被引量:
6
1
作者
王晓玲
郭安平
彭于发
刘恩平
孔华
林海妹
贺立卡
机构
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《热带作物学报》
CSCD
2008年第4期478-484,共7页
基金
农业部农业结构调整重大技术研究专项(06-11-03B)
华南热带农业大学创新基金(RBCX-0505)
中央级公益性科研院所基本科研业务费、热区转基因植物生物安全及生物多样性研究项目资助
文摘
以转bar基因粳稻(O. sativa ssp. japonica)YOO3为外类群,采用PAUP4.0等软件,对海南7个主要普通野生稻(O. rufipogon)核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)全序列信息进行比较分析。结果表明,ITS全长为586~589 bp,其中ITS1为193~195 bp,共有20个变异位点数,G/C含量为72.02%~74.74%;ITS2为229~231 bp,共有12个变异位点数,G/C含量为75.55%~76.08%;离栽培稻越近的类群G/C含量越高。所有材料5.8S rDNA序列完全一致,全长164 bp,G/C占97 bp,含量为59.15%。各类群间ITS序列信息较丰富,且显示ITS1比ITS2进化速度要快。利用ITS差异信息序列进行聚类分析为鉴别不同居群的普通野生稻提供了分子依据。
关键词
普通野生稻
核糖体
dna
its
区
序列分析
Keywords
oryza rufipogon nuclear ribosomal dna its region sequence analysis
分类号
S511.901 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析
王晓玲
郭安平
彭于发
刘恩平
孔华
林海妹
贺立卡
《热带作物学报》
CSCD
2008
6
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