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水稻OsGRF6基因的克隆及调控初生根发育功能初步分析
1
作者
余青青
单玉爽
+2 位作者
尚汇鑫
曾川
张泽勇
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期22-33,共12页
【目的】OsGRF6隶属于GRF家族,参与调控植物的生长发育和植物对非生物胁迫的耐受性。试验旨在探究OsGRF6参与调控水稻初生根发育的分子机制,为深入研究OsGRF6参与调控水稻根的发育提供新线索。【方法】通过PCR从水稻品种‘ZH11’中克隆...
【目的】OsGRF6隶属于GRF家族,参与调控植物的生长发育和植物对非生物胁迫的耐受性。试验旨在探究OsGRF6参与调控水稻初生根发育的分子机制,为深入研究OsGRF6参与调控水稻根的发育提供新线索。【方法】通过PCR从水稻品种‘ZH11’中克隆得到转录因子基因OsGRF6,对其进行进化树构建、启动子分析;同时对OsGRF6-OE(过表达材料)和osgrf6(突变体)进行基因型分析、qRT-PCR鉴定和水稻表型观察,采用酵母单杂交技术对OsGRF6的结合基序进行检测,并通过ChIP-seq和RNA-seq数据对OsGRF6下游的直接靶基因进行分析。【结果】(1)OsGRF6含有1个QLQ和1个WRC保守的功能结构域,与拟南芥AtGRF1和AtGRF2以及水稻OsGRF7亲缘关系较近,且OsGRF6启动子区域含有多个非生物胁迫和激素响应顺式作用元件;(2)OsGRF6在水稻种子、幼穗和根中表达量较高,而在叶中表达量较低;OsGRF6定位于细胞核,并且具有转录激活活性;(3)与野生型相比,OsGRF6-OE转基因材料初生根长度较长,而osgrf6突变体材料表现出初生根变短的表型;(4)OsGRF6能与CGGCA基序结合;(5)ChIP-seqs和RNA-seqs分析发现,OsGRF6靶基因中包含OsARF7、OsARF4等多个参与调控水稻根发育的基因。【结论】OsGRF6除了参与调控水稻株型和种子发育外,还能通过直接调控生长素途径中基因(如OsARF7、OsARF4等)的表达调控水稻根的发育。
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关键词
水稻
osgrf6
初生根发育
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职称材料
题名
水稻OsGRF6基因的克隆及调控初生根发育功能初步分析
1
作者
余青青
单玉爽
尚汇鑫
曾川
张泽勇
机构
厅市共建甘薯及特色豆科作物种质创新与利用四川省重点实验室
细胞活动与逆境适应教育部重点实验室
重庆三峡农业科学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期22-33,共12页
基金
甘肃省科技厅自然科学基金面上项目(21JR7RA484)
厅市共建甘薯及特色豆科作物种质创新与利用四川省重点实验室开放课题基金资助项目(2021CGIHL04)
河南大学作物逆境适应与改良国家重点实验室开放课题项目(2022KF04)。
文摘
【目的】OsGRF6隶属于GRF家族,参与调控植物的生长发育和植物对非生物胁迫的耐受性。试验旨在探究OsGRF6参与调控水稻初生根发育的分子机制,为深入研究OsGRF6参与调控水稻根的发育提供新线索。【方法】通过PCR从水稻品种‘ZH11’中克隆得到转录因子基因OsGRF6,对其进行进化树构建、启动子分析;同时对OsGRF6-OE(过表达材料)和osgrf6(突变体)进行基因型分析、qRT-PCR鉴定和水稻表型观察,采用酵母单杂交技术对OsGRF6的结合基序进行检测,并通过ChIP-seq和RNA-seq数据对OsGRF6下游的直接靶基因进行分析。【结果】(1)OsGRF6含有1个QLQ和1个WRC保守的功能结构域,与拟南芥AtGRF1和AtGRF2以及水稻OsGRF7亲缘关系较近,且OsGRF6启动子区域含有多个非生物胁迫和激素响应顺式作用元件;(2)OsGRF6在水稻种子、幼穗和根中表达量较高,而在叶中表达量较低;OsGRF6定位于细胞核,并且具有转录激活活性;(3)与野生型相比,OsGRF6-OE转基因材料初生根长度较长,而osgrf6突变体材料表现出初生根变短的表型;(4)OsGRF6能与CGGCA基序结合;(5)ChIP-seqs和RNA-seqs分析发现,OsGRF6靶基因中包含OsARF7、OsARF4等多个参与调控水稻根发育的基因。【结论】OsGRF6除了参与调控水稻株型和种子发育外,还能通过直接调控生长素途径中基因(如OsARF7、OsARF4等)的表达调控水稻根的发育。
关键词
水稻
osgrf6
初生根发育
Keywords
Oryza sativa L.
osgrf6
primary root development
分类号
Q946 [生物学—植物学]
Q754 [生物学—分子生物学]
Q785 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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1
水稻OsGRF6基因的克隆及调控初生根发育功能初步分析
余青青
单玉爽
尚汇鑫
曾川
张泽勇
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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0
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