水稻OsNAD-ME1的克隆、预测及逆境下的表达分析

植物中的苹果酸酶能够参与光合作用、呼吸作用和脂类生成等多种重要的代谢途径,而且与植物的逆境防御有着密切的关系。为研究水稻中一个苹果酸酶基因(OsNAD-ME1,GeneID:4343294)的基本特征及其与逆境间的响应关系,克隆得到该基因的cDNA片段,应用生物信息学对其序列进行分析及预测,并运用Northern检测的方法,对该基因在多种非生物逆境下的表达情况做出研究。由序列分析结果可知,OsNAD-ME1的ORF为1869bp,编码622个氨基酸,OsNAD-ME1属于植物NAD-ME的α亚组,其理论分子量为68.9kD,理论等电点为6.03。预测结果表明该蛋白属于苹果酸酶家族,无跨膜结构域,定位于线粒体上。并利用GFP定位的方法,在拟南芥悬浮细胞中对亚细胞定位的预测结果进行了验证。Northern检测结果显示,OsNAD-ME1能够响应多种非生物逆境,在NaCl和NaHCO3胁迫下其表达水平在24h时达到最大,在PEG和H2O2胁迫下其表达水平在12h时达到最大。该结果表明OsNAD-ME1可能与植物对非生物胁迫的响应有关。