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水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析
1
作者
马银花
刘桃梅
+7 位作者
万天雪
肖新波
胡琼
李萍芳
段仁燕
张斌
金晨钟
杜波
《山东农业科学》
北大核心
2023年第5期8-14,共7页
类受体胞质激酶(receptor-like cytoplasmic kinases,RLCKs)家族是一类特殊蛋白激酶,在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能。在对水稻RLCKⅥ家族成员OsRRK1基因的研究中发现水稻4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因,...
类受体胞质激酶(receptor-like cytoplasmic kinases,RLCKs)家族是一类特殊蛋白激酶,在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能。在对水稻RLCKⅥ家族成员OsRRK1基因的研究中发现水稻4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因,即OsRLCK167(LOC_Os04g56060)。为了丰富类受体胞质激酶家族并探究水稻胞质受体激酶基因的作用,本研究利用ExPASy-Protparam、Protscale、CD-search等在线工具和DNAMAN软件对OsRLCK167基因进行生物信息学分析;采用qRT-PCR技术对OsRLCK167基因做组织表达模式分析。结果显示:OsRLCK167蛋白的分子量为43.77776 kD,为疏水性、不稳定的酸性蛋白;对该蛋白的二级结构进行预测,显示其主要由无规则卷曲(41.94%)、α-螺旋(35.29%)、延伸链(15.35%)和β-转角(7.42%)组成;该基因在水稻不同组织均有表达,且在叶鞘中的表达量最高。结果表明,OsRLCK167基因在进化过程中具有高度的保守性,在水稻中具有功能多样性。
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关键词
水稻
osrlck167
基因
组织表达模式
生物信息学分析
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职称材料
题名
水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析
1
作者
马银花
刘桃梅
万天雪
肖新波
胡琼
李萍芳
段仁燕
张斌
金晨钟
杜波
机构
湖南人文科技学院农业与生物技术学院
武汉大学生命科学学院/杂交水稻国家重点实验室
出处
《山东农业科学》
北大核心
2023年第5期8-14,共7页
基金
湖南省重点研发计划项目(2021NK2030)
湖南省科技创新人才计划大学生科技创新创业项目(2021RC1016)
+3 种基金
湖南省自然科学基金面上项目(2021JJ30376)
湖南省教育厅重点项目(21A0552)
湖南省区域联合基金项目(2023JJ50084)
杂交水稻国家重点实验室(武汉大学)开放基金项目(KF202207)。
文摘
类受体胞质激酶(receptor-like cytoplasmic kinases,RLCKs)家族是一类特殊蛋白激酶,在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能。在对水稻RLCKⅥ家族成员OsRRK1基因的研究中发现水稻4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因,即OsRLCK167(LOC_Os04g56060)。为了丰富类受体胞质激酶家族并探究水稻胞质受体激酶基因的作用,本研究利用ExPASy-Protparam、Protscale、CD-search等在线工具和DNAMAN软件对OsRLCK167基因进行生物信息学分析;采用qRT-PCR技术对OsRLCK167基因做组织表达模式分析。结果显示:OsRLCK167蛋白的分子量为43.77776 kD,为疏水性、不稳定的酸性蛋白;对该蛋白的二级结构进行预测,显示其主要由无规则卷曲(41.94%)、α-螺旋(35.29%)、延伸链(15.35%)和β-转角(7.42%)组成;该基因在水稻不同组织均有表达,且在叶鞘中的表达量最高。结果表明,OsRLCK167基因在进化过程中具有高度的保守性,在水稻中具有功能多样性。
关键词
水稻
osrlck167
基因
组织表达模式
生物信息学分析
Keywords
Rice(Oryza sativa L.)
osrlck167 gene
Tissue expression pattern
Bioinformatics analysis
分类号
S511.01 [农业科学—作物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析
马银花
刘桃梅
万天雪
肖新波
胡琼
李萍芳
段仁燕
张斌
金晨钟
杜波
《山东农业科学》
北大核心
2023
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