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焦化废水活性污泥PAH双加氧酶基因多样性分析 被引量:6
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作者 蒙小俊 李海波 +1 位作者 盛宇星 曹宏斌 《中国环境科学》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 2017年第1期367-372,共6页
为分析焦化废水活性污泥中降解PAH双加氧酶的多样性,利用16Sr DNA-PCR-DGGE方法,以实际焦化废水好氧单元活性污泥总DNA为模板,通过引物对污泥中的双加氧酶基因进行了克隆表达和多样性分析.结果表明,以活性污泥总DNA为模板,利用引物RHD-G... 为分析焦化废水活性污泥中降解PAH双加氧酶的多样性,利用16Sr DNA-PCR-DGGE方法,以实际焦化废水好氧单元活性污泥总DNA为模板,通过引物对污泥中的双加氧酶基因进行了克隆表达和多样性分析.结果表明,以活性污泥总DNA为模板,利用引物RHD-GN-610F和RHD-GN-916R扩增后有明显的产物,产物大小约为300bp;DGGE指纹图谱显示PCR产物有8条分离条带,丰度分别为2.99%、8.16%、20.75%、28.50%、8.62%、7.26%、10.62%和13.10%;条带经切胶回收PCR扩增后出现明显的扩增产物,TA克隆后成功测试出4条序列,长度分别为305bp,298bp,334bp和294bp,表明焦化废水活性污泥中存在不同降解PAH的RHD酶.这些结果为焦化废水中PAHs的风险评估及其潛在生物降解提供理论基础. 展开更多
关键词 焦化废水 pahS 活性污泥 双加氧酶基因
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污泥好氧堆肥对PAHs的处理效果和抗生素及抗性基因消解效果 被引量:9
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作者 孙伟 匡科 +4 位作者 严兴 李碧清 雷芳 王双 肖先念 《环境科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1757-1763,共7页
为探讨污泥共堆肥对PAHs的处理效果以及堆肥过程中抗生素及抗性基因的变化情况,试验设置添加辅料木屑、蘑菇渣、微生物发酵菌和酸化生物质炭进行好氧共堆肥处理.结果表明:污泥堆肥对PAHs的去除率基本都在50%以上,特别是芴、菲和蒽的去... 为探讨污泥共堆肥对PAHs的处理效果以及堆肥过程中抗生素及抗性基因的变化情况,试验设置添加辅料木屑、蘑菇渣、微生物发酵菌和酸化生物质炭进行好氧共堆肥处理.结果表明:污泥堆肥对PAHs的去除率基本都在50%以上,特别是芴、菲和蒽的去除率超过了80%.∑_(16) PAHs(16种PAHs总量)的去除率达到78.7%,∑PAHs-cancer(具有致癌活性的4~6环PAHs总量)去除率达到74.1%,∑PAHs-ppc(被我国列入环境“优先污染物”的PAHs总量)去除率达到68.6%.136种抗性基因在堆肥过程中出现了不同程度的消减,其中,BL2a_1(青霉素)、catB5(氯霉素)和tetPA(四环素)等11种抗性基因在堆肥过程中完全消减,消减率达到100%,BL1_asba(头孢霉菌素)、EreA(红霉素)、QnrB(氟喹诺酮)和cmL_e8(氯霉素)等19种抗性基因在堆肥过程中消减率均超过85%,堆肥过程能有效消减该类抗性基因.研究显示,抗生素及其降解产物影响了微生物群落属水平,分枝杆菌属和鞘氨醇杆菌属变化明显,污泥堆肥产品施用过程中抗性基因出现水平迁移,不宜直接农业施用. 展开更多
关键词 污泥堆肥 微生物发酵菌 pahS 抗性基因 消减率
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不同污染强度下PAHs降解基因在土壤-根表-植物系统中的分布
3
作者 薛佳婧 杨洁 +3 位作者 宋瑶 孙凤飞 刘娟 高彦征 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期877-886,共10页
[目的]本文旨在解析植物-微生物联合修复多环芳烃(PAHs)污染土壤的分子机制,并为在PAHs污染区生产安全的农产品提供技术支持和理论依据。[方法]以紫花苜蓿为供试植物,以菲和芘作为供试PAHs,以PAHs降解菌株Sphingobium sp.RS2为供试菌株... [目的]本文旨在解析植物-微生物联合修复多环芳烃(PAHs)污染土壤的分子机制,并为在PAHs污染区生产安全的农产品提供技术支持和理论依据。[方法]以紫花苜蓿为供试植物,以菲和芘作为供试PAHs,以PAHs降解菌株Sphingobium sp.RS2为供试菌株,在根箱装置中进行温室盆栽试验,通过高效液相色谱技术和实时荧光定量PCR技术,研究不同PAHs污染浓度对种植紫花苜蓿的土壤-根表-植物系统中PAHs降解基因丰度和分布的影响。[结果]高浓度PAHs污染对紫花苜蓿的生长有抑制作用,而接种功能菌株RS2可以促进紫花苜蓿的生长。与未接种RS2的对照组相比,接种RS2的处理组紫花苜蓿生物量平均增加约22.4%。根际土壤中PAHs残留量显著低于非根际土壤。随PAHs污染浓度增加,降解基因丰度也增加。根表部位降解基因丰度最高,各层室土壤次之,植物根部和茎叶部丰度最低;在同一采样区域中,phe基因丰度显著高于nahAc和nidA基因。菲、芘残留量与nahAc基因丰度呈显著正相关。[结论]在土壤-根表-植物系统中,PAHs降解基因的丰度受PAHs浓度的影响,且根表环境中PAHs降解基因丰度最高,是PAHs代谢最为旺盛的区域。根表的PAHs代谢在去除土壤PAHs污染以及减低植物PAHs污染风险中起着不可替代的作用。 展开更多
关键词 多环芳烃 根箱 紫花苜蓿 根际土壤 pahs降解基因
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<i>PAH</i>mutational spectrum: still expanding
4
作者 Laura Vilarinho Sofia Esteves +2 位作者 Elisabete Ramos António Amorim Luisa Azevedo 《Open Journal of Genetics》 2011年第2期9-12,共4页
Phenylketonuria (PKU, MIM 261600) is the most common inborn error of amino acid metabolism. To date, a total of more than 500 mutations have been associated with the disease. In this report, the novel p.Glu182Lys muta... Phenylketonuria (PKU, MIM 261600) is the most common inborn error of amino acid metabolism. To date, a total of more than 500 mutations have been associated with the disease. In this report, the novel p.Glu182Lys mutation, found in a Portuguese family in combination with the previously reported p.Leu 348Val, is presented and its putative deleterious impact discussed. 展开更多
关键词 PHENYLKETONURIA (PKU) PHENYLALANINE HYDROXYLASE pah gene Novel Mutation
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PAH基因深度内含子杂合突变致苯丙酮尿症2家系基因检测和产前诊断
5
作者 白洁 代鹏 孔祥东 《中华实用诊断与治疗杂志》 2024年第5期454-458,共5页
目的 对2个携带单一杂合致病突变的苯丙酮尿症(PKU)家系进行全外显子组测序,探讨PAH基因突变情况,并进行产前诊断。方法 2023年3月郑州大学第一附属医院行基因检测与产前诊断的2个PKU家系。家系1先证者,男,7岁,出生后发育迟缓,新生儿期... 目的 对2个携带单一杂合致病突变的苯丙酮尿症(PKU)家系进行全外显子组测序,探讨PAH基因突变情况,并进行产前诊断。方法 2023年3月郑州大学第一附属医院行基因检测与产前诊断的2个PKU家系。家系1先证者,男,7岁,出生后发育迟缓,新生儿期严重黄疸,脑部CT检查示脑白质脱髓鞘,血清苯丙氨酸水平增高,外院基因检测发现PAH基因c.1068C>A(p.Y356X)单杂合突变。家系2先证者,女,8岁,出生后新生儿筛查为PKU,外院基因检测发现PAH基因c.611A>G(p.Y204C)单杂合突变。采集2个家系先证者及其父母外周静脉血,母亲再次妊娠后于18周行羊膜腔穿刺术抽取羊水,提取DNA行全外显子组测序。在PubMed数据库检索相关文献,将新发现的致病突变位点区域纳入目标区域,采用叠瓦式多层探针设计方案进行探针设计和捕获测序。选择人类基因组参考序列GRCh37,对全外显子组测序结果注释分析,筛选得到候选致病突变位点。利用dbSNP数据库检索候选位点突变的数据库收录和致病性,通过基因组整合数据库gnomAD查询该突变的人群频率。依据美国医学遗传学与基因组学学会遗传突变分类标准与指南,对突变进行致病性分级和判定。采用PCR扩增和Sanger测序方法验证先证者父母候选突变位点携带情况,并对胎儿进行产前诊断。结果 (1)家系1先证者为PAH基因c.1068C>A(p.Y356X)和c.1065+241C>A复合杂合突变,家系2先证者为PAH基因c.611A>G(p.Y204C)和c.1065+241C>A复合杂合突变。(2)PAH基因c.611A>G(p.Y204C)和c.1068C>A(p.Y356X)均是PKU的致病热点突变。PAH基因c.1065+241C>A位点在dbSNP数据库中无记录,不属于多态性位点,人群发生频率极低,gnomAD数据库未查询到该突变在人群中的发生频率。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传突变分类标准与指南,PAH基因c.1065+241C>A判定为致病性突变(Pathogenic, PM3_Very Strong, PP4_Moderate, PM2_Supporting)。(3)2个家系先证者Sanger验证结果与全外显子组测序结果一致,其父母均为相关致病突变基因的携带者;家系1胎儿为PAH基因c.1065+241C>A杂合突变携带者,家系2胎儿为PAH基因c.611A>G(p.Y204C)杂合突变携带者。结论 针对目标区域进行多层探针设计,根据文献及时更新全外显子组测序的目的区域,有助于全外显子组测序检出PAH基因深度内含子区致病突变。 展开更多
关键词 苯丙酮尿症 pah基因 深度内含子区 基因检测 产前诊断
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张家口地区不良孕产史产妇多环芳烃代谢相关酶类基因多态性的研究
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作者 李燕 岳婷 +2 位作者 宋瑶 刘璇 陈立霞 《河北医药》 CAS 2023年第14期2129-2132,共4页
目的分析张家口地区不良孕产史产妇多环芳烃(PAHs)CYP2E1、GSTM1基因多态性。方法选定2018年1月至2020年1月张家口地区妇幼保健院生产的987例孕产妇,结合孕产妇有无不良孕产史分组,将有不良孕产史的401例患者作为观察组,将无不良孕产史... 目的分析张家口地区不良孕产史产妇多环芳烃(PAHs)CYP2E1、GSTM1基因多态性。方法选定2018年1月至2020年1月张家口地区妇幼保健院生产的987例孕产妇,结合孕产妇有无不良孕产史分组,将有不良孕产史的401例患者作为观察组,将无不良孕产史的586例患者作为对比组,比较2组临床资料、母体血液、胎盘中PAHs含量,Logistic回归分析不良孕产史传统影响因素与PAHs相关代谢酶基因多态性的关系。结果观察组CYP2E1基因*1/*1、CYP2E1等位基因频率*1、GSTM1基因*1/*1、CYP2E1等位基因频率*1高于对比组,差异均有统计学意义(P<0.05)。孕前BMI、不良孕产史次数与CYP2E1、GSTM1基因多态性无相关性(P>0.05),母体血液PAHs含量、胎盘中PAHs含量与CYP2E1、GSTM1基因多态性呈正相关性(P<0.05)。结论PAHsCYP2E1、GSTM1基因多态性是不良孕产史的遗传易感因素,携带PAHs突变等位基因,会增加不良孕产史发生风险。 展开更多
关键词 不良孕产史 多环芳烃 基因多态性
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苯丙酮尿症分子遗传学研究进展 被引量:21
7
作者 张誌 何蕴韶 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期729-734,共6页
苯丙酮尿症是由于苯丙氨酸羟化酶基因突变引起的常染色体隐性遗传病。文章综述了苯丙酮尿症中的苯丙氨酸羟化酶基因的定位、结构、突变、调控以及突变基因的体外表达和苯丙氨酸羟化酶的三维结构特点等分子遗传学进展,阐述了苯丙氨酸羟... 苯丙酮尿症是由于苯丙氨酸羟化酶基因突变引起的常染色体隐性遗传病。文章综述了苯丙酮尿症中的苯丙氨酸羟化酶基因的定位、结构、突变、调控以及突变基因的体外表达和苯丙氨酸羟化酶的三维结构特点等分子遗传学进展,阐述了苯丙氨酸羟化酶基因的突变对苯丙氨酸羟化酶的体外表达及其三维结构的影响,以及部分基因型与表型相关的分子机制。 展开更多
关键词 苯丙酮尿症 苯丙氨酸羟化酶 基因 分子遗传
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吉林和辽宁地区80例苯丙酮尿症患儿苯丙氨酸羟化酶基因突变分析 被引量:5
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作者 李锦 李晶 +6 位作者 李娜娜 陈宁 孟岩 潘亭亭 张蔓丽 朱军 田亚平 《解放军医学院学报》 CAS 北大核心 2021年第8期843-848,889,共7页
背景苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)是一种常染色体隐性遗传的氨基酸代谢病,由苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)活性的部分或完全缺失引起,会使苯丙氨酸在体内蓄积,导致患儿出现神经系统等损害。PAH基因突变种类和频率... 背景苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)是一种常染色体隐性遗传的氨基酸代谢病,由苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)活性的部分或完全缺失引起,会使苯丙氨酸在体内蓄积,导致患儿出现神经系统等损害。PAH基因突变种类和频率存在明显的地域和种族差异。目的分析吉林和辽宁地区苯丙酮尿症80例患儿苯丙氨酸羟化酶PAH基因的突变特征。方法对2016-2018年吉林辽宁两省医院80例PKU患儿PAH基因的13个外显子及其侧翼序列,包含5’和3’端非编码区,进行一代测序点突变分析。结果80例患儿共检出161个突变位点,占292个突变等位基因的55.14%。其中,R243Q占比最高(15.75%),IVS11-3 A>T、R413P、IVS4-1 G>A和EX6-96A>G次之,占比依次为4.11%、3.42%、3.08%和3.08%。另外5个低频突变位点Y356^(*)、R111^(*)、R241C、R53H a和IVS2+19 T>C突变频率为1%~3%。此次,我们发现PAH基因1个新的突变点F294S,位于8号外显子。结论依据此次吉林辽宁地区80例PKU患儿PAH基因的突变特点,为该地区预防PKU出生缺陷提供理论依据。 展开更多
关键词 pah基因突变 苯丙氨酸羟化酶 苯丙酮尿症 苯丙氨酸羟化酶缺乏症 一代测序
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好氧细菌对多环芳烃降解机制的研究进展 被引量:10
9
作者 赵百锁 王慧 +1 位作者 李瑞瑞 毛心慰 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期414-420,共7页
多环芳烃(PAHs)是指两个或两个以上的苯环以线性排列、弯接或簇聚方式构成的一类碳氢化合物。这类化合物广泛分布于环境中,具有潜在的致畸性、致癌性和遗传毒性。在自然环境中,好氧细菌对PAHs的生物降解是一种很重要的方式,凸显其在清... 多环芳烃(PAHs)是指两个或两个以上的苯环以线性排列、弯接或簇聚方式构成的一类碳氢化合物。这类化合物广泛分布于环境中,具有潜在的致畸性、致癌性和遗传毒性。在自然环境中,好氧细菌对PAHs的生物降解是一种很重要的方式,凸显其在清除环境PAHs污染物中具有广阔的应用前景。在过去二十多年中,科学家们已经从基因水平上对好氧细菌降解PAHs的机制进行了深入的研究,其中包括PAHs降解基因的多样性、与PAHs降解有关的基因以及细菌群体PAHs遗传适应机制等。在此,就好氧细菌对多环芳烃降解机制的研究进展进行了综述和讨论。 展开更多
关键词 多环芳烃 生物降解 pahs降解基因
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多环芳烃微生物降解基因的研究进展 被引量:28
10
作者 郑乐 刘宛 李培军 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期449-454,共6页
多环芳烃(PAHs)是环境中普遍存在的一类有机污染物,微生物的降解是PAHs去除的主要途径。近年来,有关PAHs微生物降解途径和代谢产物的研究已有很多报道。小分子PAHs一般可以直接被微生物降解,而大分子PAHs则需要微生物以共代谢的方式降... 多环芳烃(PAHs)是环境中普遍存在的一类有机污染物,微生物的降解是PAHs去除的主要途径。近年来,有关PAHs微生物降解途径和代谢产物的研究已有很多报道。小分子PAHs一般可以直接被微生物降解,而大分子PAHs则需要微生物以共代谢的方式降解。在过去20年中,微生物降解PAHs的基因相继被发现,各种基因在调控PAHs降解过程中的功能也越来越清晰。本文概述了PAHs微生物降解基因方面的研究进展,详细介绍了微生物对萘、菲的降解基因,最后对PAHs微生物降解基因的应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 多环芳烃 微生物降解 降解基因
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焦化厂污染土壤中多环芳烃降解菌群解析 被引量:16
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作者 李晓斌 孙寓姣 +1 位作者 王红旗 丁爱中 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第2期477-483,共7页
以苯并[a]芘、苯并[a]蒽、苯并[b]荧蒽、苯并[k]荧蒽、茚并[1,2,3-cd]芘5种较难降解的多环芳烃为碳源和能源,采用富集培养的方法从焦化厂污染的土壤中筛选分离得到50株PAHs降解菌。通过对其16S rRNA基因序列分析,将这些PAHs降解菌分为1... 以苯并[a]芘、苯并[a]蒽、苯并[b]荧蒽、苯并[k]荧蒽、茚并[1,2,3-cd]芘5种较难降解的多环芳烃为碳源和能源,采用富集培养的方法从焦化厂污染的土壤中筛选分离得到50株PAHs降解菌。通过对其16S rRNA基因序列分析,将这些PAHs降解菌分为15个种群,分别属于Sphingomonas(鞘氨醇单胞菌属)、Methylobacterium(甲基杆菌属)、Burkholderia(伯克霍尔德氏菌属)、Rhodococcus(红球菌属)、Bradyrhizobium(慢生根瘤菌属)、Phyllobacterium(叶杆菌属)、Chryseobacterium(金黄杆菌属)、Microbaterium(微杆菌属)8个属,其中优势菌为鞘氨醇单胞菌属。纯菌株降解能力测试表明,培养12 d后,菌株3-6-12降解效果要优于其他菌株,对苯并[a]蒽、苯并[a]芘、苯并[b]荧蒽、苯并[k]荧蒽、茚并[1,2,3-cd]芘的降解率分别可达39.64%、33.52%、38.57%、25.37%、31.17%。实验结果可为多环芳烃污染土壤的生物修复提供高效的降解菌源。 展开更多
关键词 多环芳烃 菌株筛选 16S RRNA基因 生物降解
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微生物降解多环芳烃有机污染物分子遗传学研究进展 被引量:8
12
作者 崔玉霞 金洪钧 《环境污染治理技术与设备》 CSCD 北大核心 2001年第6期16-23,共8页
多环芳烃是环境中广泛存在的一类难降解危险性致癌污染物 ,微生物酶在降解转化多环芳烃的过程及其归趋中起着重要作用。
关键词 多环芳烃 微生物降解 降解性基因 分子遗传学 有机污染物
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根系分泌物对土壤中多环芳烃降解及相关微生物的影响 被引量:1
13
作者 武文涛 陈希元 王晓杰 《山东农业科学》 北大核心 2022年第6期82-92,共11页
根系分泌物可有效降解有机污染物,目前尚不清楚根系分泌物对土壤中多环芳烃(PAH)降解效果、降解基因及相关功能菌丰度的影响。本研究采用盆栽试验,探索不同浓度(10、20、40、80 mg/kg)人工根系分泌物、水稻根系分泌物对PAH(NAP、PHE、P... 根系分泌物可有效降解有机污染物,目前尚不清楚根系分泌物对土壤中多环芳烃(PAH)降解效果、降解基因及相关功能菌丰度的影响。本研究采用盆栽试验,探索不同浓度(10、20、40、80 mg/kg)人工根系分泌物、水稻根系分泌物对PAH(NAP、PHE、PYR)降解率、降解基因(nidA、nahAc、phe)丰度和细菌群落结构的影响。结果表明,添加10~80 mg/kg的人工和水稻根系分泌物处理皆可在一定程度提高土壤中NAP、PHE、PYR的降解率,且降解率随着根系分泌物浓度的增加呈先增加后降低趋势,整体以40 mg/kg效果较佳。qRT-PCR和16S rRNA高通量测序表明,与CK处理相比,根系分泌物处理下微生物群落丰度发生明显变化,且不同时间、不同浓度皆可影响群落结构特征。相关性分析结果表明,PAH降解效率、降解基因丰度、PAH功能菌三者间皆具有很强的相关性;人工根系分泌物处理下PAH降解率与nidA基因、诺卡氏菌属(Nocardioides)和分枝杆菌属(Mycobacterium)呈极显著正相关(P<0.01),水稻根系分泌物处理下PAH降解率与nahAc基因、假单胞菌属(Pseudomonas)呈极显著正相关。综上,人工根系分泌物及水稻根系分泌物皆可促进土壤中PAH的生物降解。 展开更多
关键词 根系分泌物 多环芳烃(pah) 16S rRNA基因 pah降解基因 细菌群落结构
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九个苯丙氨酸羟化酶基因单点突变重组质粒的构建和鉴定
14
作者 白晋丽 瞿宇晋 +2 位作者 金煜炜 王红 宋昉 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期527-530,共4页
目的构建Y154H、R157I、Y206C、G247R、D282G、G346R、S349A、A389G、R400K9个PAH基因突变型重组质粒,为下一步研究这些PAH突变体在哺乳动物细胞中表达蛋白功能奠定基础。方法①选择错义突变位点。结合突变位点所在酶蛋白的结构域(如催... 目的构建Y154H、R157I、Y206C、G247R、D282G、G346R、S349A、A389G、R400K9个PAH基因突变型重组质粒,为下一步研究这些PAH突变体在哺乳动物细胞中表达蛋白功能奠定基础。方法①选择错义突变位点。结合突变位点所在酶蛋白的结构域(如催化结构域或与辅因子BH4结合位点)及患儿相关临床表型进行了9个突变位点的选择。②构建PAH基因突变型重组质粒。以野生型PAH真核表达载体pcDNA3.0-PAH-wt为模板,应用PrimerPremier5.0软件自行设计了9对突变引物,并在Platin-iumTaqDNA高保真聚合酶的作用下直接利用体外PCR定点突变法构建PAH基因突变型重组质粒。③初筛PAH基因突变型重组质粒。氨苄抗性初步筛选:利用重组基因含氨苄青霉素抗性基因的特点,可筛选出阳性克隆;PCR及酶切技术筛选:根据野生型与突变型靶序列酶切片段的差异进行筛选,其中S349A、D282G、G247R、Y206C、Y154H这5种突变存在MvaⅠ、MvaⅠ、HindⅢ、RsaⅠ、RsaⅠ的天然酶切位点,而R157I、G346R、A389G、R400K与其相应的野生型所在位点周围并不存在天然的酶切位点,需要在目的位点的上/下游设计引物,即人工构建DdeⅠ、HindⅢ、PstⅠ、MvaⅠ酶切位点,然后利用上述限制性内切酶进行突变体的酶切鉴定。④验证PAH基因突变型重组质粒,突变体最终由DNA测序加以验证。结果这9个突变型PAHcDNA序列除特定碱基位点被突变的碱基替换外,其他序列和野生型的完全保持一致。结论成功构建了9个PAH基因突变型重组质粒。体外定点突变技术准确、实用。 展开更多
关键词 pah基因 点突变 质粒
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大鼠4S多环芳香烃结合蛋白对细胞色素P450IAl基因体外转录的激活作用
15
作者 何开玲 Houser WH Bresnick E 《上海医科大学学报》 CSCD 1991年第6期465-470,共6页
作者以Hela细胞液体系,研究大鼠细胞色素P450IA-1(P 450 C)基因在4S多环芳香烃(PAH)结合蛋白存在下的体外转录作用。用含大鼠细胞色素P 450 IA1的-880至外显子的第1000碱基对((bp)的质粒pA9[长约1.94千碱基对(kb)],经内切酶切割成不同... 作者以Hela细胞液体系,研究大鼠细胞色素P450IA-1(P 450 C)基因在4S多环芳香烃(PAH)结合蛋白存在下的体外转录作用。用含大鼠细胞色素P 450 IA1的-880至外显子的第1000碱基对((bp)的质粒pA9[长约1.94千碱基对(kb)],经内切酶切割成不同大小的片段为模板。以插有腺病毒-2大部晚期启动子(Ad-2)的质粒PHML-1作为阳性对照。所得结果显示Hela细胞体系能按模板准确地转录出预期的产物。加入4S PAH-结合蛋白使pA9模板的转录增加2~3倍,而对PHML-1的转录无增强作用,说明4S PAH-结合蛋白是专一加强细胞色素P450IA1基因转录的正调节因素。推测4S PAH-结合蛋白也可能诱导大鼠体内细胞色素P 450 IA1基因的表达。 展开更多
关键词 pah 结合蛋白 细胞色素
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内蒙古地区汉族PKU患儿苯丙氨酸羟化酶基因突变分析 被引量:3
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作者 侯丽青 冀云鹏 +3 位作者 朱博 侯东霞 武丽琼 王晓华 《中国妇幼健康研究》 2020年第4期464-469,共6页
目的分析内蒙古地区汉族苯丙酮尿症(PKU)患儿苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因的突变频率和特征。方法收集2015年1月至2018年10月在内蒙古自治区妇幼保健院经新生儿疾病筛查及遗传咨询门诊确诊的26例PKU患儿为研究对象,采用PCR直接测序法对26例... 目的分析内蒙古地区汉族苯丙酮尿症(PKU)患儿苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因的突变频率和特征。方法收集2015年1月至2018年10月在内蒙古自治区妇幼保健院经新生儿疾病筛查及遗传咨询门诊确诊的26例PKU患儿为研究对象,采用PCR直接测序法对26例患儿及其父母的PAH基因第1~13外显子区域进行突变分析。结果共检出24种突变类型,主要以错义突变(66.7%)、剪接突变(20.8%)和无义突变(8.3%)为主,大部分突变集中在第7、11、6、12、3外显子及第12、4内含子区域,最常见的错义突变为R243Q(13.5%)、R241C(5.8%)、Y204C(5.8%)和R413P(5.8%);最常见的剪接突变为IVS12+6T>A(5.8%);最常见的无义突变为Y356X(9.6%);Q355H和c.1316-286A>C是国际上未见报道的新突变。内蒙古地区汉族PKU患儿PAH基因突变构成不同于西北五省,Y204C和IVS12+6T>A在西北五省中均未检出,而在西北五省中突变频率较高的EX6-96A>G在内蒙古地区汉族中未检出。结论内蒙古地区汉族PKU患儿PAH基因突变具有独特的多样性和复杂性。 展开更多
关键词 苯丙氨酸羟化酶 基因突变 苯丙酮尿症 汉族
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下一代测序法对新生儿进行苯丙酮尿症致病突变的筛查
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作者 王辉芳 叶倩平 +2 位作者 杨旭 梁志坤 胡妮娅 《分子诊断与治疗杂志》 2016年第6期380-384,共5页
目的运用基于半导体芯片技术的下一代测序方法对苯丙酮尿症相关基因进行基因测序,筛查出常见的致病突变位,探讨半导体测序技术在遗传病检测方面的应用价值。方法采用AmpliSeq方法通过多重PCR捕获目的片段,然后构建文库,用Ion Torrent PG... 目的运用基于半导体芯片技术的下一代测序方法对苯丙酮尿症相关基因进行基因测序,筛查出常见的致病突变位,探讨半导体测序技术在遗传病检测方面的应用价值。方法采用AmpliSeq方法通过多重PCR捕获目的片段,然后构建文库,用Ion Torrent PGM^(TM)测序仪进行测序反应,与Sanger一代测序法进行结果比较验证。结果 75个临床检测为苯丙酮尿症样本中有57例含致病突变位点,包括有杂合突变、纯合突变以及复合杂合突变。下一代测序结果与Sanger一代测序结果完全一致。结论半导体测序能准确检测苯丙酮尿症常见致病突变,对遗传病发病机制的研究及筛查具有一定的应用价值。 展开更多
关键词 苯丙酮尿症 半导体测序 ION Torrent PGMTM 基因突变 pah基因
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Consequences of primer binding-sites polymorphisms on genotyping practice
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作者 Estefania M. Martins Laura Vilarinho +3 位作者 Sofia Esteves Mónica Lopes-Marques António Amorim Luísa Azevedo 《Open Journal of Genetics》 2011年第2期15-17,共3页
Herein we investigated the effect of primer binding site polymorphisms in achieving correct genotyping when a mismatch occurs in distinct positions of the primer sequence. For that purpose primer sequences were design... Herein we investigated the effect of primer binding site polymorphisms in achieving correct genotyping when a mismatch occurs in distinct positions of the primer sequence. For that purpose primer sequences were designed in order to carry either allelic form at the 3’ end and at 3 bp, 5 bp and 7 bp apart from the 3’ end of an intronic polymorphism (rs2247836) observed in phenylalanine hydroxylase (PAH) gene. For one of the alleles annealing failure was obtained when the mismatch occurs at all the four primer-site locations. Primer sequences carrying the alternative SNP allele resulted to be less specific as the distance to the primer-3’ end was increased. Altogether, these results revealthat effects in the extension of the annealing failure is allele and mismatch-position dependent. 展开更多
关键词 PRIMER BINDING-SITE SNP pah gene Molecular geneTICS
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苯丙氨酸羟化酶基因c.158G>A变异的致病性及基因型-表型相关性分析
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作者 杨佩颖 孙云 +4 位作者 王欣 马定远 王彦云 张志蕾 蒋涛 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第3期278-283,共6页
目的探讨苯丙氨酸羟化酶(PAH)缺乏症相关的PAH基因c.158G>A变异的致病性以及与表型的相关性。方法回顾分析2016年7月至2021年6月南京医科大学附属妇产医院确诊的37例PAH缺乏症患儿的临床资料和基因检测结果。结果在37例患儿中,轻度... 目的探讨苯丙氨酸羟化酶(PAH)缺乏症相关的PAH基因c.158G>A变异的致病性以及与表型的相关性。方法回顾分析2016年7月至2021年6月南京医科大学附属妇产医院确诊的37例PAH缺乏症患儿的临床资料和基因检测结果。结果在37例患儿中,轻度高苯丙氨酸血症(HPA)共34例,其中33例检测到2处PAH变异(包括c.158G>A)且均为复合杂合子,1例检测到3处PAH变异,包括c.158G>A纯合变异及c.842+2T>A杂合变异。3人为经典型苯丙酮尿症(PKU),并携带3处PAH变异,在其中2例中c.158G>A与c.842+2T>A呈顺式排列,基因型为c.[158G>A,842+2T>A]/c.728G>A和c.[158G>A,842+2T>A]/c.611A>G,在另1例中158G>A与c.722G>A呈顺式排列,基因型为c.[158G>A,c.722G>A]/c.728G>A。其中,c.158G>A变异对PAH的活性影响较小,与轻度HPA表型相关,可归类为"可能良性"变异,但患者的临床表型还与另一等位基因的变异类型有关。结论37例PAH缺乏症患儿遗传学研究提示,c.158G>A变异与其他致病变异呈顺式排列时,患者的临床表型主要取决于其余2个变异的致病性。 展开更多
关键词 苯丙氨酸羟化酶 pah基因 c.158G>A变异
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应用高分辨熔解曲线技术检测经典型苯丙酮尿症患者PAH基因第7外显子基因突变
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作者 周永安 高伟华 +6 位作者 杨建平 张全斌 张改秀 刘建萍 马云霞 张晓刚 郁梁 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期683-685,共3页
目的建立操作简便、快速,使用成本低,结果准确的鉴定PAH基因第7外显子c.728G〉A突变热点的基因诊断方法。方法应用高分辨熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术,对山西省临床确诊的88例经典型苯丙酮尿症患儿第7外显子c.728... 目的建立操作简便、快速,使用成本低,结果准确的鉴定PAH基因第7外显子c.728G〉A突变热点的基因诊断方法。方法应用高分辨熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术,对山西省临床确诊的88例经典型苯丙酮尿症患儿第7外显子c.728G〉A突变热点进行检测,并将检测结果进行测序验证。结果受检患儿PAH基因第7外显子c.728G〉A突变位点HRM技术检测结果和测序结果完全相符。结论高分辨熔解曲线技术操作简便、快速,使用成本低,结果准确,可作为PAH基因第7外显子热点突变的快速、灵敏检测方法。 展开更多
关键词 苯丙酮尿症 pah基因 高分辨熔解曲线技术 突变热点 基因诊断
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