基于PARMS技术的稻瘟病抗性基因分子标记研究及其在江苏太湖稻区的应用

以江苏太湖稻区的206份水稻育种高代稳定材料为研究对象,基于PARMS技术开发并应用了针对抗稻瘟病基因(Pi2、Pib、Pita、Pik)的分子标记,通过对水稻材料的基因型进行鉴定,分析了稻瘟病抗性基因在太湖稻区的分布情况,并进一步探讨了抗性基因与田间诱发穗颈瘟抗病性表现的关系。结果表明,抗性基因Pib、Pita和Pik在供试材料中分布广泛,检出率分别为98.06%、85.44%和40.29%,而Pi2基因的检出率则较低,仅为26.70%。在抗性基因组合中,以“Pib+Pita”组合材料最多,占比84.47%;3个基因组合中以“Pib+Pita+Pik”的材料最多,占比34.47%。由田间抗病性鉴定结果可知,多基因聚合对稻瘟病的抵抗力明显增强,同时存在2个基因“Pib+Pita”的中抗级别以上材料48份,存在3个基因“Pi2+Pita+Pik”的中抗级别以上材料47份。相关性分析表明,Pib和Pik基因与穗颈瘟的抗性呈(极)显著正相关,而Pi2和Pita基因的相关性不显著。本研究结果对于制定江苏太湖地区更有效的稻瘟病防治策略,以及进一步研究抗病品种选育具有重要的理论意义和较大的应用价值。

基于PARMS技术的绿豆抗叶斑病基因 VrTAF5 分子标记的开发

叶斑病是绿豆生产上主要的真菌性病害,利用抗性品种是防治该病害最经济、安全、有效的途径。为筛选抗病资源,根据抗性基因VrTAF5的突变位点,利用五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)开发分子标记。并利用抗病性具有差异的164份绿豆资源对所开发的分子标记的可靠性进行检验和评价。结果表明,VrTAF5-1517分子标记在7个分子标记中的检出率最高,基因分型为AA、AC、CC,可以有效区分基因碱基序列的SNP差异。根据叶斑病抗性评价结果,该标记对抗病材料的选择效率为75.00%、感病材料的选择效率为93.42%。VrTAF5-1517分子标记对抗病资源中检出抗病基因型的比例、对高感和感病资源中检出感病基因型比例均为100%,说明本研究开发的分子标记可用于绿豆抗叶斑病分子标记辅助育种。

基于PARMS技术的结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB分子标记的开发

文中旨在建立结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB的荧光分子标记,为分子药物敏感性试验提供简便、可靠的基因分型检测方法。对比分析利福平耐药菌株rpoB基因531、526、516、511、513等氨基酸位点的基因突变与敏感菌株中等位基因的序列差异,结合PARMS技术(Penta-primer amplification refractory mutation system),建立rpoB基因的荧光分子标记。利用其对104例结核分枝杆菌临床分离株进行检测,经Sanger测序验证,正确率100%。并采用比例法药敏试验对这104份样本进行了利福平耐药性鉴定,与分子标记结果相符率为94.23%。结果表明,分子标记有较强可靠性,能检出表型药敏无法测出的低浓度耐药样本(511/533单位点突变)。建立的11组荧光分子标记能覆盖92%–96%的利福平耐药菌株rpoB基因突变类型,为快速检测结核分枝杆菌利福平耐药提供新思路。

应用PARM技术对陕甘宁盆地中部气田中区奥陶系古风化壳储层进行横向预测

应用ＰＡＲＭ技术对陕甘宁盆地中部气田中区奥陶系古风化壳储层进行横向预测陈永波（中国石油天然气总公司西北石油地质勘探研究所）陕甘宁盆地中部气田中区奥陶系古风化壳储层下奥陶统马家沟组（Ｏ１ｍ５）主要分布在Ｏ１ｍ５１～Ｏ１ｍ５１３～Ｏ１ｍ５４。主力气层在Ｏ...

应用PARM技术对L构造石炭系Ⅰ油组进行储层横向预测

PARM高分辨率反演技术综合利用地震、测井等资料，完成对储集层进行横向预测的地质任务。该技术纵、横向分辨率高，相关系数高，工作方法独特。利用此技术对L构造石炭系I油组进行研究，在岩性标定、储层孔隙度预测、储层特征与综合评价诸方面都获得良好效果。

江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性基因(Pi2、Pita、Pib)的分布及抗病效应

为分析稻瘟病抗性基因Pi2、Pita、Pib在江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性育种中的作用,利用五引物扩增受阻突变体系(PARMS)检测技术,检测水稻稻瘟病抗性基因Pi2、Pita、Pib在江苏太湖地区农业科学研究所筛选培育的799份高世代稳定试验材料中的分布情况,并结合穗颈瘟人工接种鉴定结果分析基因型与抗性的关系。结果表明,在799份供试水稻品种中,以抗性基因Pib的分布频率最高,抗性基因Pita的分布频率也相对较高,抗性基因Pi2分布频率较低,多数材料携带2个抗性基因;在抗性基因组合中,Pita+Pib组合检出率较高,为44.81%(358/799)。田间抗病性鉴定结果表明,当供试材料中只存在单一抗病基因时,中抗级别以上材料占比为33.60%(86/256),当供试材料中存在复合基因型时,中抗级别以上材料占比为61.02%(299/490),表明抗性基因共存可以有效增强植株对稻瘟病的抗性。本研究结果为江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性基因聚合育种的选择提供了理论支持。

水稻油脂组分含量主效基因qPAL6分子标记的开发

水稻油脂组分含量是影响水稻食味品质的重要因素之一。开发水稻油脂组分含量主效基因qPAL6的分型检测方法并开展分子标记辅助选择,是改良水稻油脂组分含量及培育优良食味品质品种的有效途径。本研究利用qPAL6位点的序列差异,开发了qPAL6基因的功能性InDel(Insertion/Deletion)标记PAL6M2;同时基于PARMS技术(Penta-primer amplification refractory mutation system,五引物扩增受阻突变体),开发了qPAL6基因内的荧光分子标记PM-PAL6。利用分子标记PAL6M2和PM-PAL6对96份水稻材料进行分析,结果表明,2个分子标记均可用于水稻qPAL6位点基因型检测。该研究为水稻油脂组分含量分子标记辅助育种提供了实用可靠的基因分型技术。