Line-geneK-FQ-PCR仪在检测结核菌中的质控问题

目的:探讨FQ-PCR技术在检测临床标本中结核分枝杆菌的应用价值。方法:通过FQ-PCR技术鉴定561株临床分离株,进行结核分枝杆菌的菌种鉴定和定量分析,同时进行抗酸染色和培养法。结果:FQ-PCR、染色和培养法阳性检出率分别为38.8%(128/330),21.8%(72/330),29.7%(98/330),提高阳性检出率(涂阴)16.97% (56/330),菌种鉴定特异性实验符合率为100%。结论:FQ-PGR技术是一种快速、敏感、特异性强的结核分枝杆菌辅助诊断方法。

多重荧光定量PCR快速鉴定转基因玉米品系

采用多重实时荧光PCR技术的高通量特征,对转基因玉米MIR604、GA21、DAS-40278-9和98140的特异性靶标序列设计TaqMan-MGB荧光探针,通过退火温度和引物探针浓度梯度优化建立了四重实时荧光PCR检测方法,经特异性,重复性和灵敏性等方法学验证确认了方法的可靠性。MIR604、GA21、DAS-40278-9、981404个特异性基因的标准曲线回归方程分别为y=-3.263 x+36.632,y=-3.422 x+36.384,y=-3.294 x+38.978和y=-3.278 x+37.514;Ct值变化范围分别在23.556~37.524、22.893~37.412、25.304~39.110和24.501~37.618之间;标准偏差分别在0.078~0.476,0.085~0.463,0.120~0.487和0.148~0.353之间;相关系数R 2分别为0.997,0.996,0.995和0.993;检出限可达10个拷贝,扩增效率满足欧盟等国际要求。

转基因番木瓜55-1的多重PCR鉴定方法研究

目的:建立对转基因番木瓜55-1进行品系鉴定的多重PCR检测方法。方法:根据番木瓜管家Papain基因和转基因番木瓜55-1品系的外源结构基因(35S-GUS)和调控基因(NOS)序列设计合成特异性检测引物。采用多重PCR技术对转基因番木瓜55-1进行品系鉴定。结果:本研究建立的多重PCR反应体系、反应参数能特异性地同时扩增转基因番木瓜55-1的管家基因Papain、外源结构基因35S-GUS和调控基因NOS序列。其中针对管家基因和外源结构基因的双重PCR检测方法的绝对检测低限为0.14 ng,其相对检测低限为0.14%;三重PCR检测方法的绝对检测低限为1.56 ng,其相对检测低限为1.56%。结论:本检测方法有较高稳定性,能快速准确地对转基因番木瓜55-1进行品系鉴定,该方法的检测灵敏度可基本上满足转基因食品标识管理定性检测的需要。

SYBR~ GreenI实时PCR鉴定检测转基因油菜RT73品系

利用特殊性引物,应用SYBR Green I实时PCR技术鉴定检测了商业化种植的转基因油菜RT73品系。结果表明,应用实时PCR技术,利用SYBR Green I染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到RT73品系特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,且通过溶解曲线确定其熔点值为(80.2±0.5)℃,而对其他油菜品系则检测不到荧光信号。SYBR Green I实时PCR能通过溶解曲线有效地区分了特异性产物、非特异性产物以及引物二聚体,是基因鉴定检测的新方法。

SYBR~ Green I实时荧光PCR鉴定检测转基因油菜RT73品系

根据转基因油菜RT73品系转入的外源基因质粒图谱,设计品系鉴定的特异性引物,进行SYBR!Green I实时PCR检测,建立转基因油菜品系鉴定的SYBR Green I实时PCR方法。同时针对油菜FatA基因设计出内源基因。结果表明:应用实时PCR技术,利用SYBR Green I染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到RT73品系特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,且通过溶解曲线确定其熔点值为80.2(±0.5)。SYBR Green I实时PCR能通过溶解曲线有效地区分特异性产物、非特异性产物以及引物二聚体,是鉴定转基因油菜RT73品系的新方法。

旋转式荧光定量PCR在临床应用中的价值

目的:探讨旋转式荧光定量PCR仪在检测临床标本中的应用价值。方法:通过旋转荧光定量-PCR技术鉴定1132株临床分离株,进行结核分枝杆菌的菌种鉴定和定量分析,同时进行抗酸染色和培养法。结果:总阳性检出率为48.64%,其中菌阳检出率为96.56%(253/262),阴性符合率为77.85%(369/474),菌种鉴定特异性实验符合率为100%。结论:旋转氏荧光定量PCR仪改进后更加快速、敏感,与其配套使用的试剂特异性强,是在检测结核分枝杆菌复合群的同时,又能进行非结核分枝杆菌鉴定辅助诊断的好方法。

银染法检测短串联重复序列(STR)位点PCR产物鉴别MRC-5细胞

通过采用银染法鉴别短串联重复序列聚合酶链式反应(STR)位点的PCR产物来鉴别人二倍体细胞MRC-5株主细胞库、工作细胞库及限制代细胞。运用PCR方法对细胞库的9个STR位点(CSF1PO、TPOX、TH01、F13A01、FESFPS、vWA、D16S539、D7S820、D13S317)和性别鉴别位点Am elogen in进行扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染法显影技术,检测MRC-5主细胞库、工作细胞库及限制代细胞的遗传标记。与ATCC公布的MRC-5的荧光STR图谱的8个STR位点和Am elogen in位点相比,MRC-5主细胞库、工作细胞库、限制代细胞的银染STR图谱的9个STR位点和Am elogen in位点,荧光法和银染法重叠的8个位点(CSF1PO、TPOX、TH01、FESFPS、vWA、D16S539、D7S820、D13S317和Am elogen in)数据完全吻合,说明细胞鉴别试验成立。STR图谱作为细胞鉴别的方法简单、易行、准确。

商业化种植的六种基因改良玉米品系的鉴定检测方法

以PCR方法鉴定检测六种商业化种植的基因改良玉米 (geneticallymodifiedmaize,简称GM 玉米 )。针对Mon810 (Monsanto公司 )、Bt11(Novartis公司 )、Event176 (Novartis公司 )、CBH 35 1(AgrEvo公司 )、T14/T2 5Liberty (AgrEvo公司 )及GA2 1(Monsanto公司 )GM 玉米转入的外源基因质粒图谱 ,设计具有品系特异性的引物进行PCR检测 ,建立了GM 玉米品系鉴定检测的方法。

水貂源犬瘟热病毒的分离及鉴定

为了研究当前犬瘟热的流行毒株,试验选取来自辽宁省大连市疑似犬瘟热发病死亡水貂的肺脏、脾脏、肾脏等组织,将研磨匀浆后的上清液接种于稳定表达犬瘟热SLAM受体的非洲猕猴肾细胞系-Vero/DogSLAM(VDS),通过病料的处理、VDS细胞的复苏与培养、病毒的分离与培养、病毒TCID50的测定、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)的方法检测感染细胞中的病毒核酸,用序列比对的方法与已发表的犬瘟热病毒H蛋白(CDV-H)和SLAM受体结合区(RBS)序列进行比对分析,用CDV-H蛋白间接免疫荧光(IFA)的方法检测荧光蛋白表达。结果表明:在Vero/DogSLAM(VDS)细胞上接种病毒培养24h后,80%~90%的VDS细胞出现合胞体病变(CPE),分离到的病毒TCID50达到1×10^5.23/(100μL),同时检测的CDV-H和SLAM受体结合区(RBS)序列比对分析一致,同源性为98%以上,在细胞质中可观察到抗CDV-H蛋白的特异性绿色荧光,RT-PCR成功扩增出H基。因部分片段。说明本试验成功分离并鉴定出1株犬瘟热毒株,将其命名为LNDL(17)M4株。