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利用种特异性PCR快速鉴定新疆酸马奶优势菌群 被引量:5
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作者 赵潞 张列兵 +1 位作者 张世湘 郝彦玲 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2010年第1期12-14,22,共4页
建立了一种快速准确鉴定酸马奶中乳酸菌优势菌群的种特异性PCR技术。据资料报道,酸马奶中已知的6种优势菌主要集中在植物乳杆菌、干酪乳杆菌和嗜酸乳杆菌3大类群。首先,针对属于同一类群内的两种优势菌设计2对种特异性引物,采用3组PCR... 建立了一种快速准确鉴定酸马奶中乳酸菌优势菌群的种特异性PCR技术。据资料报道,酸马奶中已知的6种优势菌主要集中在植物乳杆菌、干酪乳杆菌和嗜酸乳杆菌3大类群。首先,针对属于同一类群内的两种优势菌设计2对种特异性引物,采用3组PCR实验验证引物的特异性。然后以酸马奶中提取的总DNA为模板,利用经验证的6对种特异性引物鉴定2份新疆酸马奶样品中的优势菌群。结果表明,新疆酸马奶中含有Lactobacillus(L.)helveticus,L.pentosus,L.plantarum,L.acidophilus和L.paracasei,与前人报道结果一致。本研究建立的种特异性PCR技术不仅能够快速鉴定酸马奶中乳酸菌优势菌群组成,同时可为其它发酵制品中3大类群乳酸菌鉴定提供有效的方法。 展开更多
关键词 种特异性pcr 酸马奶 乳酸菌 优势菌群
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一种集成PCR与CE的生物芯片的设计研究 被引量:5
2
作者 季旭 刘理天 《半导体技术》 CAS CSCD 北大核心 2003年第8期42-45,共4页
阐述了一种集成PCR反应室与CE管道的生物芯片的研究和设计工作,实现了样品扩增、电泳分离和紫外光检测3个生物分析检测过程的单片集成。为这种DNA生物芯片设计了PCR反应池及其加热控制系统、毛细管电泳管道和配备即时测温功能的辅助电... 阐述了一种集成PCR反应室与CE管道的生物芯片的研究和设计工作,实现了样品扩增、电泳分离和紫外光检测3个生物分析检测过程的单片集成。为这种DNA生物芯片设计了PCR反应池及其加热控制系统、毛细管电泳管道和配备即时测温功能的辅助电路系统(PCB板),并且完成了芯片的版图设计以及工艺方案及具体工艺参数设计。整个系统可以基本实现一个小型DNA检测实验室的功能。 展开更多
关键词 pcr CE 生物芯片 毛细管电泳 聚合酶链式反应 微电子机械系统 微缩芯片实验室
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PCR芯片及其应用研究进展 被引量:3
3
作者 徐一冉 程肖蕊 +1 位作者 周文霞 张永祥 《生物技术通讯》 CAS 2012年第6期904-908,共5页
PCR芯片实质上就是固定有与研究对象有关的许多已知基因的引物阵列并可用于PCR检测的固相载体,其制作时最关键的是目的基因的引物设计。与基于杂交的芯片技术不同,PCR芯片技术是一种高通量的,准确、灵敏的定量检测基因表达的技术,它将... PCR芯片实质上就是固定有与研究对象有关的许多已知基因的引物阵列并可用于PCR检测的固相载体,其制作时最关键的是目的基因的引物设计。与基于杂交的芯片技术不同,PCR芯片技术是一种高通量的,准确、灵敏的定量检测基因表达的技术,它将待测基因的引物固定于固相载体上,通过简单的、经过优化的定量PCR体系和荧光定量PCR仪,实现待检样品中已知基因的扩增,用于定量检测待检样品中已知基因的表达情况。PCR芯片由于其操作简单、结果准确、数据产出快而多等特点,已应用于疾病发病机制、药物作用机理和细菌分型等研究领域,并将在生命科学研究领域得到更为广泛的应用。 展开更多
关键词 基因表达 pcr芯片 pcr芯片实验室
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实时荧光PCR芯片及其检测平台的设计
4
作者 罗磊 阳小勇 于军 《仪表技术与传感器》 CSCD 北大核心 2009年第11期105-107,共3页
研制了一款实时荧光PCR芯片及其检测平台。其中PCR芯片实现样品的预处理及实时荧光反应等功能;检测平台实现实时荧光检测、分析及处理等功能。该检测平台由注射泵系统、实时荧光信号采集系统和PCR温度控制系统等组成。并成功地实现了从... 研制了一款实时荧光PCR芯片及其检测平台。其中PCR芯片实现样品的预处理及实时荧光反应等功能;检测平台实现实时荧光检测、分析及处理等功能。该检测平台由注射泵系统、实时荧光信号采集系统和PCR温度控制系统等组成。并成功地实现了从血液中提取白细胞及同一腔体中PCR反应、检测以及分析等。实验结果表明,该系统能满足实时荧光PCR芯片的控制与检测实验结果,达到了设计各项指标。 展开更多
关键词 芯片实验室 实时荧光pcr 生物芯片检测
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一种集成PCR反应室与CE的生物芯片的研究 被引量:4
5
作者 季旭 刘理天 《仪器仪表学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第z2期201-202,共2页
生物芯片是便携式生物化学分析器的核心技术。主要研究内容是研制一种集成了聚合酶链式反应PCR(PolymeraseChain Reaction)反应室与毛细管电泳CE(Capillary Electrophoresis)的生物芯片,它的用途有DNA测序,DNA突变检测等,另外还可以改... 生物芯片是便携式生物化学分析器的核心技术。主要研究内容是研制一种集成了聚合酶链式反应PCR(PolymeraseChain Reaction)反应室与毛细管电泳CE(Capillary Electrophoresis)的生物芯片,它的用途有DNA测序,DNA突变检测等,另外还可以改制成便携生物传感器,通过与现有的实验数据的对照分析可以快速检测并识别不明微生物,便于及时采取针对措施。 展开更多
关键词 毛细管电泳 聚合酶链式反应 生物芯片 微电子机械系统 微缩芯片实验室
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啤酒污染乳酸菌PCR引物的设计与验证 被引量:4
6
作者 陈利娜 王德良 田瑞华 《酿酒》 CAS 2008年第1期57-59,共3页
根据细菌16SrDNA序列的特点,对啤酒中常见污染乳酸菌16SrDNA序列进行分析,设计合成了针对啤酒污染乳酸菌的特征引物。并用该引物对从啤酒厂分离到的7种乳酸菌进行了检测,PCR结果表明该引物能够准确检测到啤酒中常见的乳酸菌。
关键词 啤酒 乳酸菌 16SrDNA pcr 引物
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啤酒有害乳酸菌PCR引物的设计与验证 被引量:4
7
作者 杨波 潘丽晶 《中国酿造》 CAS 北大核心 2006年第10期42-45,共4页
根据乳酸菌16SrDNA序列的特征,设计合成了针对啤酒有害乳酸菌的通用引物,在16SrDNA基因水平上采用聚合酶链式反应(PCR)技术鉴定了啤酒中59株有害乳酸菌的种类。同时根据鉴定结果设计了8种乳酸菌的特异引物,PCR技术验证结果表明该8种特... 根据乳酸菌16SrDNA序列的特征,设计合成了针对啤酒有害乳酸菌的通用引物,在16SrDNA基因水平上采用聚合酶链式反应(PCR)技术鉴定了啤酒中59株有害乳酸菌的种类。同时根据鉴定结果设计了8种乳酸菌的特异引物,PCR技术验证结果表明该8种特异引物能够准确鉴定乳酸菌。 展开更多
关键词 乳酸菌 16S RDNA 聚合酶链式反应(pcr) 引物
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PCR实验室工程设计要点分析 被引量:10
8
作者 宋杨 赵梦竹 《化工与医药工程》 2019年第6期23-27,共5页
在PCR实验室的设计和建造越来越受到建设单位重视的情况下,从PCR实验室平面布局、通风空调系统两个方面进行设计要点分析,提出了PCR实验室按照四个区域设计为宜,实验室设备的布置不仅考虑实用同时要兼顾疏散,气流组织和压力控制保证气... 在PCR实验室的设计和建造越来越受到建设单位重视的情况下,从PCR实验室平面布局、通风空调系统两个方面进行设计要点分析,提出了PCR实验室按照四个区域设计为宜,实验室设备的布置不仅考虑实用同时要兼顾疏散,气流组织和压力控制保证气流单向流动防止气溶胶污染,同时在房间内设定、变风量阀应对生物安全柜开启和关闭时房间的压差扰动,供PCR实验室的建设单位和设计同行的相关人员参考。 展开更多
关键词 pcr实验室 平面布局 空调通风
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7种食源性致病菌GeXP多重PCR检测方法的建立及其应用 被引量:2
9
作者 张艳芳 谢芝勋 +7 位作者 曾婷婷 刘加波 谢丽基 邓显文 谢志勤 罗思思 黄娇玲 王盛 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期2536-2546,共11页
本研究旨在建立一种能够同时鉴别包括大肠杆菌O157:H7、沙门菌、空肠弯曲菌、单核细胞增生李斯特菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌和金黄色葡萄球菌7种常见食源性致病菌的GeXP多重PCR检测方法。根据这些致病菌在GenBank上公布的保守基因序列,... 本研究旨在建立一种能够同时鉴别包括大肠杆菌O157:H7、沙门菌、空肠弯曲菌、单核细胞增生李斯特菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌和金黄色葡萄球菌7种常见食源性致病菌的GeXP多重PCR检测方法。根据这些致病菌在GenBank上公布的保守基因序列,设计合成了7对特异性GeXP引物。用单一或混合细菌样品的DNA模板优化反应条件,设置对照组,构建重组质粒,随机组合不同浓度的样品,验证所建立的GeXP方法的特异性、敏感性和准确性。最后用该方法检测120份临床样品,进一步验证所建立的GeXP检测方法的准确性和可靠性。结果显示,单一或混合模板的GeXP检测均能特异性出现相应清晰峰值,可在10~3拷贝·μL^-1水平上同时特异地检测出7种细菌病原体,不同浓度模板混合时,本试验所建立的方法依然可检测出对应病原体。检测120份临床样品,GeXP多重PCR阳性率为2.50%(3/120)~15.83%(19/120),普通PCR阳性率为2.50%(3/120)~15.00%(18/120),GeXP多重PCR多检出8份阳性,表明GeXP方法更为敏感与准确。本研究建立的同时鉴别7种食源性致病菌的GeXP多重PCR检测方法,具有高通量、特异性强和敏感性高的特点,为食源性常见致病菌感染或混合感染提供了快速分子诊断方法。 展开更多
关键词 食源性致病菌 GeXP 多重pcr 特异性嵌合引物
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9种鸭病毒病GeXP多重PCR检测方法的建立及其应用 被引量:7
10
作者 张艳芳 谢芝勋 +7 位作者 谢丽基 邓显文 谢志勤 罗思思 黄莉 黄娇玲 曾婷婷 王盛 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2457-2468,共12页
旨在建立一种能够同时鉴别H5、H7和H9亚型禽流感病毒、基因A型鸭甲肝病毒、鸭坦布苏病毒、鸭瘟病毒、减蛋综合征病毒、新城疫病毒、鸭圆环病毒、番鸭呼肠孤病毒和番鸭细小病毒9种常见鸭病毒病的GeXP多重PCR检测方法。根据这些病原体在Ge... 旨在建立一种能够同时鉴别H5、H7和H9亚型禽流感病毒、基因A型鸭甲肝病毒、鸭坦布苏病毒、鸭瘟病毒、减蛋综合征病毒、新城疫病毒、鸭圆环病毒、番鸭呼肠孤病毒和番鸭细小病毒9种常见鸭病毒病的GeXP多重PCR检测方法。根据这些病原体在GenBank上公布的保守基因序列,设计合成了12对特异性GeXP引物。用单一病毒或混合病毒样品的cDNA/DNA模板优化反应条件,同时以其他常见鸭病病原体及鸭组织器官核酸为对照,验证所建立的GeXP方法的特异性和准确性。以106至101拷贝·μL-1梯度稀释的克隆质粒或体外转录RNA来检测GeXP方法的敏感性。随机选取不同浓度的模板(103和107拷贝·μL-1)进行干扰性试验,并与单一病原体为模板的GeXP多重PCR的检测结果比较。最后用该方法检测150份临床样品,与普通PCR方法的结果作比较,所有阳性结果样品均进行测序,进一步验证所建立的GeXP检测方法的可靠性。结果显示,单重或多重模板的GeXP检测均能特异性扩增出相应片段,不能扩增其他常见鸭病病原体,并且可在103拷贝·μL-1水平上同时特异地检测出9种鸭病原体。GeXP干扰性试验结果显示,当3种不同浓度的模板组合时,本试验所建立的方法依然可同时检测出所有病原体,与单重检测比较,未影响其检出。比较GeXP多重PCR方法和普通PCR方法对150份临床样品的检测结果,结果显示GeXP方法更为敏感与准确。笔者建立的同时鉴别9种鸭病毒病的GeXP多重PCR检测方法,具有高通量、特异性强和灵敏度高的特点,为混合感染的鸭病毒病临床样品提供了快速分子诊断新方法。 展开更多
关键词 鸭病毒病 GeXP检测 多重pcr 特异性嵌合引物
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Micro Flow-Through Thermocycler with Simple Meandering Channel with Symmetric Temperature Zones for Disposable PCR-Devices in Microscope Slide Format
11
作者 Anett Reichert Jana Felbel +3 位作者 Mark Kielpinski Matthias Urban Benno Steinbrecht Thomas Henkel 《Journal of Bionic Engineering》 SCIE EI CSCD 2008年第4期291-298,共8页
Chip-based flow-through PCR implements the PCR as a continuous process for nucleic acid analytics. The sample is transported in a winding channel through temperature zones required for denaturation, annealing and exte... Chip-based flow-through PCR implements the PCR as a continuous process for nucleic acid analytics. The sample is transported in a winding channel through temperature zones required for denaturation, annealing and extension. Main fields of application are the monitoring of continuous processes for rapid identification of contaminants and quality control as well as high throughput screening of cells or microorganisms. A modular arrangement with five heating zones for flow-through PCR is discussed and evaluated. The special heater arrangement allows the implementation of up to 40 cycles on the footprint of a microscope slide, which is placed on top ofa 5 zones heating plate. Liquid/liquid two phase flow of PCR reaction mixture and mineral oil have been applied to create a segmented flow process scheme. In that way, the developed system may provide flow-through PCR as a unit operation for the droplet based microfluidics platform. The single use of disposable devices is commonly preferred due to the sensitivity of the PCR process to contaminations. All-glass microfluidic chips and disposable chip devices, made from polycarbonate as a replication with identically geometry, have been fabricated and tested. For the first time, microchannel geometries with nearly circular profile developed by all-glass technology have been transferred to mass fabrication by injection compression molding. Both devices have been successfully applied for the detection of the tumor suppressor gene p53. Although product yield and selectivity of the amplification process do not depend on the chip material, a well defined, reliable segmented flow regime could only be realized in the all-glass chip. 展开更多
关键词 lab-ON-A-CHIP pcr microfluidics two-phase-flow injection molding POINT-OF-CARE biomedical
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北京地区实验动物中猴痘病毒感染情况调查
12
作者 李晓波 王吉 +5 位作者 王淑菁 王莎莎 李威 秦骁 岳秉飞 付瑞 《实验动物科学》 2023年第2期17-21,共5页
目的对北京地区实验动物中猴痘病毒(MPXV)感染情况进行调查。方法参照世界卫生组织(WHO)MPXV实验室检测指导意见,采用荧光PCR法检测北京地区实验动物中MPXV,共642只动物,包括猴127只、小鼠215只、大鼠80只、豚鼠40只、地鼠10只、兔85只... 目的对北京地区实验动物中猴痘病毒(MPXV)感染情况进行调查。方法参照世界卫生组织(WHO)MPXV实验室检测指导意见,采用荧光PCR法检测北京地区实验动物中MPXV,共642只动物,包括猴127只、小鼠215只、大鼠80只、豚鼠40只、地鼠10只、兔85只、犬85只。其中猴采集咽拭子,大小鼠、豚鼠和地鼠等采集盲肠,兔和犬采集肛拭子,采集的样本加入适量灭菌PBS,盲肠样本充分匀浆,拭子样本涡旋振荡1 min,-70℃反复冻融3次,离心取上清提取核酸,荧光PCR检测MPXV DNA,最后对结果进行分析。结果经荧光PCR检测,127只猴、215只小鼠、80只大鼠、40只豚鼠、10只地鼠、85只兔、85只犬MPXV DNA均为阴性。结论目前未在北京地区实验动物中发现MPXV感染。 展开更多
关键词 实验动物 猴痘病毒 荧光pcr
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某核酸检测实验室空调通风系统的设计
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作者 马小金 《洁净与空调技术》 2023年第1期88-91,共4页
介绍了PCR实验室各区功能工艺的要求;通过实际案例,对加强型PCR核酸检测实验室的送、排风量展开了详细的分析,根据计算门缝渗透的风量来获得维持室内外压差所需的风量,结合换气次数要求、满足人员卫生要求计算出送、排风系统的最终风量... 介绍了PCR实验室各区功能工艺的要求;通过实际案例,对加强型PCR核酸检测实验室的送、排风量展开了详细的分析,根据计算门缝渗透的风量来获得维持室内外压差所需的风量,结合换气次数要求、满足人员卫生要求计算出送、排风系统的最终风量;最后分析了送风系统冷负荷的计算,获得最终设备参数;为PCR实验室空调通风系统的设计提供参考。 展开更多
关键词 pcr实验室 门缝渗透 冷负荷 室内外压差
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聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性和芯片生物分析技术用于台湾海峡常见石斑鱼和鲷鱼的品种鉴定 被引量:6
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作者 陈双雅 张津 +2 位作者 陈伟玲 徐敦明 周昱 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期677-680,共4页
应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)和芯片生物分析系统建立了台湾海峡常见石斑鱼和鲷鱼的分子生物学品种鉴定新方法。首先提取鱼的基因组脱氧核糖核酸(DNA)进行细胞色素b基因特定片段的PCR扩增,然后用DdeⅠ、HaeⅢ... 应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)和芯片生物分析系统建立了台湾海峡常见石斑鱼和鲷鱼的分子生物学品种鉴定新方法。首先提取鱼的基因组脱氧核糖核酸(DNA)进行细胞色素b基因特定片段的PCR扩增,然后用DdeⅠ、HaeⅢ和NlaⅢ3种限制性内切酶进行酶切,在Agilent DNA1000芯片上对酶切片段进行分离。该方法成功鉴定了台湾海峡常见的8种石斑鱼品种和5种鲷鱼品种,是一种快速、简便、有效的鱼类品种鉴定分析手段。 展开更多
关键词 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态分析 芯片实验室 物种鉴定 细胞色素B 石斑鱼 鲷鱼
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DMD基因及其产物检测的临床价值 被引量:1
15
作者 樊绮诗 潘瑞福 +5 位作者 崔杰峰 李建平 翁中芳 张宇舟 朱立红 杨伟宗 《中国实验诊断学》 1999年第6期268-270,共3页
目的针对DMD基因的突变特点以及由此而产生的编码产物的异常,探讨DMD基因及其编码产物──抗肌营养个良蛋白的检测对于诊断疾病的意义。方法用多重PCR技术和免疫印迹技术对DMD或BMD患者的DMD基因和抗肌营养不良蛋白... 目的针对DMD基因的突变特点以及由此而产生的编码产物的异常,探讨DMD基因及其编码产物──抗肌营养个良蛋白的检测对于诊断疾病的意义。方法用多重PCR技术和免疫印迹技术对DMD或BMD患者的DMD基因和抗肌营养不良蛋白进行了检测。结果33.3%的DMD患者虽然未被检测出基因的片段性缺失,但他们的抗肌营养不良蛋白却完全丧失。结论多重PCR技术是检测DMD基因片段性缺失的有效方法,但却无法检测出点突变等微小突变。兔疫印迹技术能反映由于各种类型的基因突变所造成的编码产物的缺陷,更有利于DMD和BMD的确实诊断,应将其作为主要的实验室检测指标之一。 展开更多
关键词 免疫印迹法 肌营养不良 DMD基因 聚合酶链反应
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16S rDNA序列分析法快速鉴定西藏地区传统乳制品中的乳酸菌 被引量:20
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作者 夏雪娟 陈芝兰 +2 位作者 陈宗道 阚建全 杨吉霞 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第14期245-249,共5页
对14株乳酸菌进行菌种鉴定。提取基因组DNA,采用属特异性聚合酶链式反应(PCR)、16S rDNA序列同源性分析、种特异性PCR与NEBcutter分析相结合的方法对乳酸菌进行鉴定。结果表明,14株菌中,除123-2和23-3外,其余12株菌均属于乳杆菌属;11-2... 对14株乳酸菌进行菌种鉴定。提取基因组DNA,采用属特异性聚合酶链式反应(PCR)、16S rDNA序列同源性分析、种特异性PCR与NEBcutter分析相结合的方法对乳酸菌进行鉴定。结果表明,14株菌中,除123-2和23-3外,其余12株菌均属于乳杆菌属;11-2、13-3、14-3、16-4、23-3、24-3、26-1、122-1、123-4为干酪乳杆菌或副干酪乳杆菌,17-5、20-2、28-1属于植物乳杆菌,123-2为肠膜状明串株菌,125-2为类布氏乳杆菌,除23-3外均与属特异性PCR结果相匹配;11-2、13-3、14-3、16-4、23-3、24-3、26-1、122-1、123-4均为副干酪乳杆菌。NEBcutter分析结果进一步验证了菌株划分的准确性。该方法快速可靠,且误差较小。 展开更多
关键词 乳酸菌 鉴定 属特异性聚合酶链式反应 16SrDNA 种特异性聚合酶链式反应 NEBcutter
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聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性和芯片生物分析技术用于渤海地区鱼种鉴定 被引量:5
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作者 李潇 曲焱焱 +4 位作者 张丕乔 张津 张丽华 黄大亮 张玉奎 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期673-676,共4页
以渤海湾具有重要商业价值的9种海鱼(小黄鱼、花鲈、蓝点马鲛、鲐、钝吻黄盖鲽、棘头梅童鱼、许氏平鲉、高眼鲽和长蛇鲻)为研究对象,利用聚合酶链式反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)和芯片生物分析技术对其进行鱼种鉴定。首先提取... 以渤海湾具有重要商业价值的9种海鱼(小黄鱼、花鲈、蓝点马鲛、鲐、钝吻黄盖鲽、棘头梅童鱼、许氏平鲉、高眼鲽和长蛇鲻)为研究对象,利用聚合酶链式反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)和芯片生物分析技术对其进行鱼种鉴定。首先提取其基因组脱氧核糖核酸(DNA),对其细胞色素b的特定片段(464bp)进行扩增,然后选择DdeⅠ、HaeⅢ和NlaⅢ3种限制性内切酶进行酶切,并利用芯片生物分析技术得到酶切产物的特异图谱和确切的片段大小,从而有效区分了9种海鱼。研究结果表明,PCR-RFLP和芯片生物分析技术在鱼种鉴定上具有精确、鉴别和快速三大优势,可为鱼类食品检测提供科学依据。 展开更多
关键词 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性 芯片实验室 物种鉴定 细胞色素B 鱼类
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8种猪呼吸道和繁殖障碍病病原体GeXP检测方法的建立 被引量:13
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作者 张民秀 谢芝勋 +4 位作者 邓显文 谢志勤 谢丽基 黄莉 黄娇玲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第24期4996-5006,共11页
【目的】建立了一种同时鉴别H1、H3亚型猪流感、猪繁殖与呼吸障碍综合征、猪瘟、猪日本乙型脑炎、猪圆环病毒病、猪细小病毒病和猪伪狂犬病8种病毒性呼吸道和繁殖障碍病病原体的GeXP高通量检测方法。【方法】根据这8种病原体的基因保守... 【目的】建立了一种同时鉴别H1、H3亚型猪流感、猪繁殖与呼吸障碍综合征、猪瘟、猪日本乙型脑炎、猪圆环病毒病、猪细小病毒病和猪伪狂犬病8种病毒性呼吸道和繁殖障碍病病原体的GeXP高通量检测方法。【方法】根据这8种病原体的基因保守序列,设计并合成了9对特异性引物,在每对特异性引物的5'端均加上一段通用引物,形成特异性嵌合引物。运用GeXP单重PCR方法,以单一病毒cDNA/DNA为模板验证引物的可行性;建立GeXP多重PCR方法,以单一病毒cDNA/DNA模板、阳性cDNA/DNA混合模板验证GeXP多重检测体系的特异性和准确性;将含猪圆环病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒靶基因的克隆质粒及体外转录的RNA(H1、H3亚型猪流感、猪繁殖与呼吸障碍综合征、猪瘟、猪日本乙型脑炎)分别梯度稀释为10^3,10^2,10^1拷贝/μl,运用GeXP多重PCR方法进行单一病原体灵敏度分析;根据单一病原体的灵敏度分析结果,优化各对特异性嵌合引物的工作浓度,将含有体外转录好的6种RNA模板和3种克隆质粒等量混合,将混合物梯度稀释为10^4,10^3,10^2,10^1拷贝/μl,运用GeXP多重PCR方法分析同时检测8种病原体的灵敏度。运用建立好的GeXP多重检测体系对23份临床样品进行检测,并与常规单重PCR进行比较,对该GeXP多重检测体系的临床应用进行评价。【结果】基于GeXP系统的单重PCR检测体系和GeXP多重PCR检测体系均能扩增出特异性片段,验证了引物的可行性、GeXP多重检测体系的特异性和准确性;GeXP多重检测体系的单一病原模板灵敏度分析结果显示,多重检测体系对单一病原体检测的下限均为10-1拷贝/μl;GeXP多重检测体系在8种病原体同时检测的灵敏度分析结果显示,多重检测体系可在10^3拷贝/μl水平可同时检测到8种病原体;比较GeXP多重PCR检测方法和常规PCR方法对临床样品的检测结果,两种检测方法的检测结果相符。【结论】成功建立了基于GeXP系统的多重PCR检测体系,可以同时检测8种猪呼吸道和繁殖障碍性疾病病原体;本研究建立的同时鉴别8种猪呼吸道和繁殖障碍性疾病病原体的GeXP检测方法具有高通量、特异性强和灵敏度高的特点,为猪病毒性呼吸道和繁殖障碍性疾病的分子诊断提供了新型的检测方法。 展开更多
关键词 猪呼吸道和繁殖障碍传染病 GENOME lab基因表达平台(GeXP) 多重pcr 通用引物 特异性嵌合引物
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新型冠状病毒核酸检测实验室设计要点分析
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作者 宋杨 郑佳 赵梦竹 《化工与医药工程》 2020年第5期43-46,共4页
一场突如其来的新型冠状病毒感染的肺炎疫情对传统的检测实验室挑战巨大,提出了新型冠状病毒核酸检测实验室与传统的核酸检测实验室的区别以及新型冠状病毒核酸检测实验室平面布局、通风空调、电气通信以及对废弃污物处理的设计要点,供... 一场突如其来的新型冠状病毒感染的肺炎疫情对传统的检测实验室挑战巨大,提出了新型冠状病毒核酸检测实验室与传统的核酸检测实验室的区别以及新型冠状病毒核酸检测实验室平面布局、通风空调、电气通信以及对废弃污物处理的设计要点,供相应建设单位和设计同行参考。 展开更多
关键词 新型冠状病毒核酸检测实验室 平面布局 空调通风 电气通信 废弃污物
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GeXP多重PCR法与新型Cervista酶切信号扩大法检测高危型HPV DNA的比较 被引量:2
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作者 刘文渊 卢文波 饶冬平 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第14期2061-2062,2093,共3页
目的比较基于GenomeLab^(TM)GeXP(GenomeLab eXpress Profiling)遗传分析系统的多重PCR法与新型Cervista酶切信号扩大法(Cervista HR-HPV),检测子宫颈脱落细胞高危型HPV DNA的差异。方法收集妇科门诊449例患者宫颈脱落细胞样本,分别采用... 目的比较基于GenomeLab^(TM)GeXP(GenomeLab eXpress Profiling)遗传分析系统的多重PCR法与新型Cervista酶切信号扩大法(Cervista HR-HPV),检测子宫颈脱落细胞高危型HPV DNA的差异。方法收集妇科门诊449例患者宫颈脱落细胞样本,分别采用Ge XP多重PCR法和Cervista HR-HPV法检测HPV DNA,分析2种方法检测的阳性率和一致率,对其不一致的结果进行基因测序验证。结果 Cervista HR-HPV和Ge XP多重PCR法检测阳性率分别为25.84%和32.07%,差异有统计学意义(P<0.05),2种方法在不同细胞学病变分组人群中的阳性率比较差异均无统计学意义(P>0.05);2种方法的总一致率为87.08%,具有高度的一致性(Kappa值为0.69);2种方法不一致的病例经测序验证后,Cervista HR-HPV、Ge XP多重PCR法结果与测序结果的吻合率分别为46.15%、53.84%。结论 Ge XP多重PCR法与Cervista HR-HPV法在检测宫颈脱落细胞高危型HPV DNA的结果具有高度的一致性。 展开更多
关键词 Ge XP 多重pcr 人乳头状瘤病毒 宫颈疾病
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