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Analysis of the effect of PCR testing and antigen testing on controlling the transmission for Omicron based on different scenarios
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作者 Wentao Song Buasiyamu Abudunaibi +3 位作者 Zeyu Zhao Weikang Liu Xiaolan Wang Tianmu Chen 《Infectious Disease Modelling》 CSCD 2023年第4期939-946,共8页
After the policy adjustment,China no longer carries out COVID-19 PCR testing for all people,and antigen testing has become the main way to detect and manage infectious sources.We developed a dynamic model to evaluate ... After the policy adjustment,China no longer carries out COVID-19 PCR testing for all people,and antigen testing has become the main way to detect and manage infectious sources.We developed a dynamic model to evaluate and compare the effects between PCR and antigen testing for controlling the pandemic.Due to the increase of contact degree,the peak reduction effect of PCR testing in population is lower than that of antigen testing.Even if it was only 20%of people isolated at home after antigen testing,the peak of the epidemic could be reduced by 9.46%.If the proportion of antigen testing is further increased to 80%,the peak of the pandemic can be reduced by 31.41%.Antigen testing performed better effects in school(reduction proportion 29.27%)and community(29.34%)than in workplace(27.75%).Therefore,we recommend that antigen testing in the popu-lation should be encouraged during the pandemic,and home isolation of infected persons should be advocated,especially in crowded places.To improve the availability of antigen,the testing proportion should be further enhanced. 展开更多
关键词 pcr testing Antigen testing COVID-19
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荧光定量PCR仪校准技术指标及结果分析
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作者 梁文 霍银波 +2 位作者 杨镇州 罗超 李妍 《上海计量测试》 2024年第2期2-5,共4页
根据不同荧光定量PCR仪器品牌的市场占有率挑选了不同型号、不同工作频率和使用年限的仪器进行校准和质量风险分析,重点针对温度示值误差、温度均匀度、样本重复性和样本线性四个技术指标作了检测和比较,探讨了这四个技术指标出现偏差... 根据不同荧光定量PCR仪器品牌的市场占有率挑选了不同型号、不同工作频率和使用年限的仪器进行校准和质量风险分析,重点针对温度示值误差、温度均匀度、样本重复性和样本线性四个技术指标作了检测和比较,探讨了这四个技术指标出现偏差可能造成的检测结果失准的风险,并对仪器生产厂商和仪器使用者提出了建议。通过分析评估得出了该类仪器应该重点关注的技术参数指标和技术难点,为仪器使用者了解该产品的质量状况及相关政策措施的制定提供了参考依据。 展开更多
关键词 荧光定量pcr 计量测试 风险评估
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基于SYBR Green的实时qPCR法定量检测动物脂肪中的RNA
3
作者 李德月 张玉梅 江磊 《食品安全导刊》 2024年第32期87-90,95,共5页
建立一种从食用动物脂肪中提取RNA,并采用基于SYBR Green的实时荧光定量PCR(Quantitative Real-Time PCR,RT-qPCR)测定不同动物脂肪中RNA表达水平的方法。结果表明,改进后的TRIzol^((R))提取方法能够从动物脂肪中有效提取出200~500 ng&#... 建立一种从食用动物脂肪中提取RNA,并采用基于SYBR Green的实时荧光定量PCR(Quantitative Real-Time PCR,RT-qPCR)测定不同动物脂肪中RNA表达水平的方法。结果表明,改进后的TRIzol^((R))提取方法能够从动物脂肪中有效提取出200~500 ng·μL^(-1)的高纯度RNA。经RT-qPCR反应后所有提取的RNA样本均展现出了优异的扩增性能。本研究开发的TRIzol^((R))提取法结合RT-qPCR的新方法,可为后续动物脂肪的鉴别和追溯提供数据支撑。 展开更多
关键词 动物脂肪 RNA提取 实时荧光定量pcr 定量检测
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诺如病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的设计与优化 被引量:1
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作者 陈波 李家奇 +1 位作者 付立申 吴文明 《五邑大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期1-6,共6页
为设计一种快速、高灵敏度检测诺如病毒(Norovirus,NV)的方法.本文通过检索参考NCBI数据库中收录的国内典型流行的NV毒株BJSMQ的基因序列NC_039476.1,合成了NV的标准重组质粒,根据NV的ORF1基因保守序列设计一组特异性引物和荧光探针;通... 为设计一种快速、高灵敏度检测诺如病毒(Norovirus,NV)的方法.本文通过检索参考NCBI数据库中收录的国内典型流行的NV毒株BJSMQ的基因序列NC_039476.1,合成了NV的标准重组质粒,根据NV的ORF1基因保守序列设计一组特异性引物和荧光探针;通过正交试验进行程序及试剂反应体系的优化,设计TaqMan荧光定量PCR检测方法.结果表明该检测方法具有高灵敏度,最低检测限可达1.2 copies/μL,且在标准重组质粒浓度1.2×10^(5)~1.2×10^(0) copies/μL范围内具有较好的线性关系,其R^(2)=0.9907;该方法特异性强,在病毒的混合重组质粒样液中仅与NV病毒反应;组内和组间的重复性良好,变异系数(CV)值均小于2%;在数字PCR试验中进一步验证了该方法的可行性.本文设计的TaqMan荧光定量PCR检测方法可用于NV毒株的快速准确检测,有望成为NV诊断的有效工具. 展开更多
关键词 诺如病毒 TaqMan荧光定量pcr 荧光探针 扩增试验 正交试验
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天麻PCR‑层析试纸条快速可视化检测方法的建立与评价
5
作者 马秋贺 马玉贺 +9 位作者 刘悦 李涛 刘昂 徐子强 柴金军 王艳茹 高丽君 夏薇 李明成 曲永梅 《上海中医药杂志》 CSCD 2024年第3期79-85,共7页
目的通过聚合酶链式反应(PCR)与层析试纸条结合的方法,实现天麻快速可视化真伪鉴别,并对其检测效果进行评价。方法采用一步法提取天麻及其伪品基因组DNA,应用NCBI数据库设计天麻特异性引物。采用DNA分子克隆技术制备天麻阳性质粒,作为... 目的通过聚合酶链式反应(PCR)与层析试纸条结合的方法,实现天麻快速可视化真伪鉴别,并对其检测效果进行评价。方法采用一步法提取天麻及其伪品基因组DNA,应用NCBI数据库设计天麻特异性引物。采用DNA分子克隆技术制备天麻阳性质粒,作为天麻阳性对照品。建立PCR-层析试纸条法鉴定天麻真伪,摸索最优实验条件,并进行方法学评价。结果①样品DNA提取的纯度符合要求,最优的PCR反应引物浓度为1μmol/L,循环为29次。②分子克隆的天麻阳性质粒序列与天麻DNA分子标记特异性指纹区片段序列同源性为98%,可作为天麻PCR-层析试纸条法的阳性对照品。③PCR-层析试纸条法的方法学评价结果显示:天麻对照药材在试纸条上出现两个条带,伪品和阴性对照品出现1个条带,与琼脂糖凝胶电泳法结果一致,特异性良好;PCR-层析试纸条法较琼脂糖凝胶电泳法的灵敏度高100倍,天麻DNA浓度为10-1 mg/L时,试纸条仍有模糊条带;在第3、6、9、12个月采用PCR-层析试纸条法进行检测,检测结果与预期一致,稳定性良好;混合样品验证显示,PCR-层析试纸条法的最低检测限为10%,而琼脂糖凝胶电泳法的最低检测限为50%。④采用PCR-层析试纸条法对15份市售天麻样品进行检测,鉴别出3个伪品,与琼脂糖凝胶电泳法结果一致。结论所构建的PCR-层析试纸条检测方法特异性强、灵敏度高、操作简便快速,可在短时间内实现鉴定结果的可视化,检测结果准确、稳定,为道地药材天麻的真伪鉴别提供了新方法。 展开更多
关键词 天麻 聚合酶链式反应 试纸条 分子克隆 可视化鉴定 中药研究
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柔嫩艾美耳球虫和肠致病性大肠杆菌双重PCR检测方法的建立及流行病学调查应用
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作者 罗小勇 杜鹏 +3 位作者 向万江 杨佳佳 陈影 王碧 《贵州农业科学》 CAS 2024年第6期78-84,共7页
【目的】建立可同时检测柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella,E.tenella)和肠致病性大肠杆菌(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)的双重PCR检测方法,为临床E.tenella继发EPEC病的检测提供技术支持。【方法】基于E.tenella和EPEC(escV... 【目的】建立可同时检测柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella,E.tenella)和肠致病性大肠杆菌(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)的双重PCR检测方法,为临床E.tenella继发EPEC病的检测提供技术支持。【方法】基于E.tenella和EPEC(escV)分别设计2条特异性引物,并通过退火温度、模板浓度和引物浓度等优化多重PCR的反应条件,建立2种病原体的双重PCR检测方法,并运用该方法检测贵州地区490份肉鸡、蛋鸡粪便样品,进行流行病学分析。【结果】该方法所需模板DNA的最低浓度组合为3.5ng/μL,最佳退火温度为62℃,最佳引物浓度组合为0.1 nmol/μL。流行病学调查显示,贵州毕节样本中E.tenella和EPEC的阳性率均为36.36%,混合感染阳性率9.09%;贵州黎平仅有EPEC感染,阳性率为23%;贵州习水样本中未检测出阳性,锦屏样本中E.tenella阳性率为11.11%,EPEC阳性率为22.22%,无混合感染。总样本中E.tenella、EPEC及2种混合感染的阳性率分别为10.20%、18.37%和2.04%。【结论】建立的柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella,E.tenella)和肠致病性大肠杆菌(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)双重PCR检测方法具有特异性强、敏感性高和重复性好的优点。 展开更多
关键词 柔嫩艾美耳球虫 肠致病性大肠杆菌 双重pcr 流行病学 快速检测
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快速PCR方法在食品检验中的应用研究
7
作者 黄齐湘 麦善建 《食品安全导刊》 2024年第29期122-124,共3页
食品安全关系公众的健康和生命安全,而快速准确的食品检测技术是保障食品安全的重要手段。本文通过阐述快速聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)方法的基本原理,分析其在食源性致病菌、转基因成分、过敏原和真菌毒素检测方... 食品安全关系公众的健康和生命安全,而快速准确的食品检测技术是保障食品安全的重要手段。本文通过阐述快速聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)方法的基本原理,分析其在食源性致病菌、转基因成分、过敏原和真菌毒素检测方面的具体应用。通过利用快速PCR方法,可使检测时间明显缩短,提高了检测灵敏度和特异性,为食品安全检测的发展提供了强有力的技术支撑。 展开更多
关键词 快速pcr方法 食品安全 检测技术
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实时荧光定量RT-PCR在麻疹和风疹病毒检测中的应用
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作者 张博奇 《智慧健康》 2024年第24期16-18,共3页
目的探讨实时荧光定量RT-PCR在麻疹和风疹病毒检测中的应用效果。方法选取2021年12月—2022年12月盘锦市疾病预防控制中心接收的麻疹与风疹患者76例为研究对象,入院后所有研究对象均接受酶联免疫吸附试验法和实时荧光定量RT-PCR法检测,... 目的探讨实时荧光定量RT-PCR在麻疹和风疹病毒检测中的应用效果。方法选取2021年12月—2022年12月盘锦市疾病预防控制中心接收的麻疹与风疹患者76例为研究对象,入院后所有研究对象均接受酶联免疫吸附试验法和实时荧光定量RT-PCR法检测,以检测患者恢复期血免疫球蛋白G(IgG)抗体水平(相对急性期是否4倍升高)为麻疹诊断金标准,对比两种检测方法的检测准确率、不同检测时间的阳性检出率。结果实时荧光定量RT-PCR法总诊断准确率为97.37%;酶联免疫吸附试验法中总诊断准确率为88.16%,比较两种方法的诊断准确率差异有统计学意义(P<0.05)。第1d,实时荧光定量RT-PCR法阳性检出率高于酶联免疫吸附试验法,差异有统计学意义(P<0.05)。第5d,实时荧光定量RT-PCR法阳性检出率低于酶联免疫吸附试验法,差异有统计学意义(P<0.05)。第2d、第3d、第4d实时荧光定量RT-PCR法和酶联免疫吸附试验法阳性检出率对比差异无统计学意义(P>0.05)。结论实时荧光定量RT-PCR对麻疹、风疹检测有一定诊断作用,可以有效提高检测准确率,同时操作简单,灵敏性较高,值得在麻疹与风疹病毒检测中推广。 展开更多
关键词 麻疹 实时荧光定量RT-pcr 风疹 检测价值 检测准确率
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山豆根ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选
9
作者 李金梅 关妙娟 +3 位作者 黄鼎 明如宏 李良波 谭勇 《安徽农业科学》 CAS 2024年第18期78-82,共5页
以山豆根为试验材料,采用正交试验考察DNA、引物、Mg^(2+)、dNTPs、Taq酶5个因素对ISSR-PCR反应体系的影响,建立并优化山豆根ISSR-PCR反应体系条件。结果表明:山豆根ISSR-PCR反应体系(20μL)最优条件为Mg^(2+)浓度3 mmol/L,dNTPs 0.2 mm... 以山豆根为试验材料,采用正交试验考察DNA、引物、Mg^(2+)、dNTPs、Taq酶5个因素对ISSR-PCR反应体系的影响,建立并优化山豆根ISSR-PCR反应体系条件。结果表明:山豆根ISSR-PCR反应体系(20μL)最优条件为Mg^(2+)浓度3 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq酶1 U,引物0.5μmol/L,模板DNA 100 ng,运用该体系从100条UBC引物中筛选到10条清晰、多态性好的引物。采用正交试验设计可有效建立山豆根ISSR-PCR反应的最优体系,为山豆根的亲缘关系,种质资源遗传多样性评价及品种鉴定和系统分类等研究提供科学依据。 展开更多
关键词 山豆根 ISSR-pcr体系优化 正交试验 引物筛选
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PCR技术在食品检测领域的国内标准使用现状及应用进展 被引量:3
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作者 白瑞 《工业微生物》 CAS 2024年第2期66-68,91,共4页
PCR技术作为一种高效、快速、高灵敏度和高特异性的检测方法,被广泛应用于食品检测的各个领域中。文章归纳了PCR技术在国内食品检测标准中的应用现状,总结了该技术在食品致病菌检测、转基因食品检测、动物检疫、物种鉴定、过敏原检测及... PCR技术作为一种高效、快速、高灵敏度和高特异性的检测方法,被广泛应用于食品检测的各个领域中。文章归纳了PCR技术在国内食品检测标准中的应用现状,总结了该技术在食品致病菌检测、转基因食品检测、动物检疫、物种鉴定、过敏原检测及食品工业化生产过程中的应用情况,并根据自身的工作经验,指出了PCR技术的发展难点并展望了其发展前景,以期为PCR技术在食品检测领域的广泛应用提供参考和帮助。 展开更多
关键词 pcr 致病菌 动物检疫 转基因食品检测 物种鉴定 过敏原检测
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TaqMan实时荧光PCR快速检测与鉴定单核细胞增生李斯特氏菌能力验证样品
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作者 王凤军 周叶熹 +5 位作者 陈丽敏 葛越 林洁洁 郑如福 陈显显 李可月 《保鲜与加工》 CAS 北大核心 2024年第7期84-90,共7页
利用TaqMan实时荧光PCR技术对单核细胞增生李斯特氏菌能力验证样品进行快速鉴定和验证。依据GB 4789系列标准的第一法对ACAS-PT526能力验证中的样品D15和样品D16进行检测,通过增菌、分离、初筛和鉴定等传统培养法检测。鉴定过程中还使... 利用TaqMan实时荧光PCR技术对单核细胞增生李斯特氏菌能力验证样品进行快速鉴定和验证。依据GB 4789系列标准的第一法对ACAS-PT526能力验证中的样品D15和样品D16进行检测,通过增菌、分离、初筛和鉴定等传统培养法检测。鉴定过程中还使用了鉴定试剂条API Listeria和全自动微生物鉴定系统。同时采用TaqMan实时荧光PCR技术对经过增菌的样品D15与样品D16的培养物和单核细胞增生李斯特氏菌标准菌株的培养物进行快速鉴定。结果表明,经API Listeria试剂条鉴定,样品D15为单核细胞增生李斯特氏菌,鉴定百分率为98.6%,T值为1;经全自动微生物鉴定系统检测,样品D15为单核细胞增生李斯特氏菌,99%可能性;样品D16为金黄色葡萄球菌,99%可能性;经实时荧光PCR鉴定,样品D15 LB1增菌液培养物及李斯特显色培养基平板上的单菌落都具有显著的S型扩增曲线。综上得出,实时荧光PCR与GB 4789.30—2016的第一法试验结果一致,样品D15为单核细胞增生李斯特氏菌检出,样品D16为单核细胞增生李斯特氏菌未检出,TaqMan实时荧光PCR方法可用于微生物的快速检验,尤其是对盲样检测的辅助验证。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特氏菌 能力验证 TaqMan实时荧光pcr 快速检测
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PC饮用水桶中粪链球菌快速定性检测实时荧光PCR方法的建立
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作者 赵彤彤 李娜 +6 位作者 王一村 郗丹 张宇鑫 高静静 周莉莉 王智 温展 《齐鲁工业大学学报》 CAS 2024年第4期55-59,共5页
开发了一种针对PC饮用水桶中粪链球菌快速定性检测的实时荧光PCR方法,该方法基于粪链球菌23S rDNA基因序列,使用特异性引物和探针进行扩增和检测。对其特异性和重复性进行评估,并分别应用该方法和国标方法对PC饮用水桶样品进行了检测。... 开发了一种针对PC饮用水桶中粪链球菌快速定性检测的实时荧光PCR方法,该方法基于粪链球菌23S rDNA基因序列,使用特异性引物和探针进行扩增和检测。对其特异性和重复性进行评估,并分别应用该方法和国标方法对PC饮用水桶样品进行了检测。结果表明,该方法能够对PC饮用水桶中粪链球菌进行快速定性检测,可有效缩短检测时间并减少实验操作,具有较高的特异性和重复性。 展开更多
关键词 PC饮用水桶 桶装饮用水 粪链球菌 快速定性检测 实时荧光pcr
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实时荧光定量PCR检查在献血者乙型肝炎病毒核酸检测中的应用
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作者 汤纯柳 《中国医药指南》 2024年第22期157-159,共3页
目的探究献血者乙型肝炎病毒(HBV)核酸检测中,实时荧光定量PCR检查的应用价值。方法选取2022年10月至2023年9月宁德市中心血站10403份献血者标本,对其进行乙型肝炎病毒检测。ELISA检测用A、B两种不同试剂进行初检、复检,对检测阴性的血... 目的探究献血者乙型肝炎病毒(HBV)核酸检测中,实时荧光定量PCR检查的应用价值。方法选取2022年10月至2023年9月宁德市中心血站10403份献血者标本,对其进行乙型肝炎病毒检测。ELISA检测用A、B两种不同试剂进行初检、复检,对检测阴性的血液标本进一步行核酸检测。结果经ELISA检测,A试剂初检乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)阳性率为0.57%(59/10403);B试剂复检HBsAg阳性率为0.65%(68/10403)。对阴性血液标本进一步核酸检测,A试剂初检HBsAg阴性标本的阳性率为0.261%(27/10344);B试剂复检HBsAg阴性标本的阳性率为0.174%(18/10335)。结论献血者HBV检测使用核酸检测有助于提高血液筛查的准确性,保障用血安全。 展开更多
关键词 献血 乙型肝炎病毒 核酸检测 实时荧光定量pcr
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薄壳山核桃SSR-PCR体系优化及引物筛选
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作者 罗晓蕾 黄丹 +4 位作者 彭兵阳 王磊彬 毕慧慧 何的明 吕佳斌 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期138-147,共10页
【目的】为建立薄壳山核桃SSR-PCR的最佳反应体系,筛选薄壳山核桃高多态性SSR引物,为薄壳山核桃构建指纹图谱、亲缘关系分析、品种鉴定等后续的相关研究提供有力工具。【方法】采用单因素试验与L_(16)(4^(5))正交试验设计相结合的方法,... 【目的】为建立薄壳山核桃SSR-PCR的最佳反应体系,筛选薄壳山核桃高多态性SSR引物,为薄壳山核桃构建指纹图谱、亲缘关系分析、品种鉴定等后续的相关研究提供有力工具。【方法】采用单因素试验与L_(16)(4^(5))正交试验设计相结合的方法,以薄壳山核桃DNA作为模板,对影响薄壳山核桃SSR-PCR反应体系中的6个影响因素(DNA、Mg^(2+)、10×PCR Buffer、引物、Taq酶、dNTPs)进行单因素试验,根据单因素试验的结果确定各影响因素的适宜用量范围,再据此设计正交试验。【结果】根据正交试验扩增结果,确立薄壳山核桃的最佳反应体系(10μL)为:Taq酶0.15 U,Mg^(2+)2.0 mmol/L,dNTPs 0.1 mmol/L,引物1.0μmol/L,50 ng模板DNA 1.0μL,10×PCR Buffer 1.0μL,ddH_(2)O5.8μL。5个因素影响薄壳山核桃SSR-PCR反应体系的扩增效果,其影响程度大小依次为Taq酶>引物=DNA>Mg^(2+)>dNTPs。以8种薄壳山核桃DNA为模板,4对薄壳山核桃引物对优化后的薄壳山核桃SSR-PCR反应体系进行验证,均扩增出明亮清晰的条带,证明优化后的反应体系稳定可靠。利用优化后的反应体系在283对核桃及山核桃引物中筛选出高多态性薄壳山核桃引物12对,其多态性位点信息数均高于0.5。【结论】优化后的反应体系及筛选出的12对薄壳山核桃引物可直接用于后续的SSR分子标记试验,为薄壳山核桃亲缘关系鉴定、交配系统分析等研究奠定理论基础。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 SSR-pcr反应体系 引物筛选 单因素试验 正交设计试验
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SAT-TB联合FQ-PCR检测在痰涂片阴性肺结核诊断中的效能
15
作者 刘延华 《中国民康医学》 2024年第7期136-138,共3页
目的:分析RNA恒温扩增实时检测技术(SAT-TB)联合荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测在痰涂片阴性肺结核患者诊断中的效能。方法:选取2020年7月至2022年7月该院收治的75例疑似痰涂片阴性肺结核患者进行前瞻性研究。采集所有患者肺泡灌洗... 目的:分析RNA恒温扩增实时检测技术(SAT-TB)联合荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测在痰涂片阴性肺结核患者诊断中的效能。方法:选取2020年7月至2022年7月该院收治的75例疑似痰涂片阴性肺结核患者进行前瞻性研究。采集所有患者肺泡灌洗液标本,采用SAT-TB、FQ-PCR法进行检测,以结核分枝杆菌痰培养结果为“金标准”,比较SAT-TB、FQ-PCR单项及联合检测在痰涂片阴性肺结核诊断中的效能。结果:金标准结果显示,75例疑似痰涂片阴性肺结核患者中,阳性48例,阴性27例;SAT-TB检测结果显示,阳性36例,阴性39例;FQ-PCR检测结果显示,阳性37例,阴性38例;SAT-TB联合FQ-PCR检测结果显示,阳性47例,阴性28例;SAT-TB联合FQ-PCR检测诊断痰涂片阴性肺结核的灵敏度、准确度均高于SAT-TB、FQ-PCR单项检测诊断,漏诊率低于SAT-TB、FQ-PCR单项检测诊断,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:SAT-TB联合FQ-PCR检测诊断痰涂片阴性肺结核的效能高于二者单项检测诊断效能。 展开更多
关键词 RNA恒温扩增实时检测技术 荧光定量pcr 痰涂片阴性 肺结核 准确度
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高危型HPV感染临床检验中实时荧光定量PCR检测法的作用
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作者 石诗雨 《实用妇科内分泌电子杂志》 2024年第19期104-106,共3页
目的分析高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染临床检验中实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测法的作用。方法选取80例疑似高危型HPV感染患者,均接受第二代杂交式捕获法(HCⅡ)、实时荧光定量PCR检测,以病理检查结果为金标准,分析实时荧光定量PC... 目的分析高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染临床检验中实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测法的作用。方法选取80例疑似高危型HPV感染患者,均接受第二代杂交式捕获法(HCⅡ)、实时荧光定量PCR检测,以病理检查结果为金标准,分析实时荧光定量PCR检测价值。结果实时荧光定量PCR检验准确率97.50%、敏感度98.51%、特异度92.31%,均显著高于HCⅡ的78.75%、88.06%、38.46%(P<0.05);实时荧光定量PCR诊断检出率CINⅠ100%、慢性宫颈炎92.31%,均显著高于HCⅡ的88.10%、46.15%(P<0.05)。结论应用实时荧光定量PCR检测法可明显提高高危型HPV感染患者的临床检验准确性,提高治疗方法的针对性。 展开更多
关键词 高危型人乳头瘤病毒感染 临床检验 实时荧光定量pcr检测法 准确性
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牛呼吸道合胞体病毒的恒温隔绝式荧光RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:5
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作者 常益铭 岳华 汤承 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期144-149,共6页
为建立检测牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)的恒温隔绝式RT-PCR(iiRT-PCR)方法,本研究根据BRSV N基因序列设计并合成一对引物和探针,通过反应体系和条件的优化,初步建立了检测BRSV的iiRT-PCR方法。利用该方法对BRSV、牛病毒性腹泻/粘膜病病毒(... 为建立检测牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)的恒温隔绝式RT-PCR(iiRT-PCR)方法,本研究根据BRSV N基因序列设计并合成一对引物和探针,通过反应体系和条件的优化,初步建立了检测BRSV的iiRT-PCR方法。利用该方法对BRSV、牛病毒性腹泻/粘膜病病毒(BVDV)、牛副流感病毒3型(BPIV-3)、牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛鼻病毒(BRV)、牛腺病毒3型(BAV-3)、多杀性巴氏杆菌(P.multocida)、溶血性曼氏杆菌(M.haemolytica)和牛支原体(M.Bovis)等临床可引起牛呼吸道疾病综合征的病原检测,结果显示,该方法仅特异性检测BRSV,对其它病原检测结果均为阴性,特异性强;将BRSV重组质粒标准品10倍倍比稀释(3.45×105拷贝/μL~3.45×10^(-1)拷贝/μL)后,利用该方法分别检测,结果显示,该方法对该重组质粒标准品的检测限为3.45拷贝/μL,敏感性高;重复性试验结果显示,批内重复性变异系数为1.92%~2.12%,批间重复性变异系数为1.67%~1.89%,重复性好。采用该iiRT-PCR方法和文献报道的3种方法同时对采自5个省146份肉牛呼吸道疾病患牛的鼻腔拭子和40份牦牛肺脏样品进行检测,结果显示,本实验建立的iiRT-PCR方法对146份鼻腔拭子中BRSV的平均检出率为36.30%,场阳性率为75.00%,5个省均有检出;牦牛肺脏样品中BRSV的检出率为45.00%,场阳性率为100%,该结果首次证实BRSV在牦牛中的存在和流行。另外本实验建立的方法对临床样品的检出率高于其他3种方法。本实验建立的iiRT-PCR方法配合使用PetNAD核酸萃取试剂盒和POCKITTM手持式核酸分析仪能够对BRSV现场检测,结果显示其与实验室检测结果一致。本研究为BRSV的快速检测提供了有利工具,丰富了国内BRSV的流行病学资料。 展开更多
关键词 牛呼吸道合胞体病毒 恒温隔绝式pcr 现场检测
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啮齿类实验动物唐菖蒲伯克霍尔德菌荧光定量PCR方法的建立及应用
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作者 申屠芬琴 刘敏 +7 位作者 王雪妹 王吉星 彭刚 吴石爱 李艳楠 周倩 张巧稚 韩雪 《实验动物科学》 2023年第4期69-72,共4页
目的建立用于检测实验动物小鼠中唐菖蒲伯克霍尔德菌的荧光定量PCR方法。方法参考团标公布的序列合成唐菖蒲伯克霍尔德氏菌引物、探针和质粒,建立荧光PCR方法,并对方法的线性、灵敏度、重复性和特异性等性能进行验证。同时应用建立的荧... 目的建立用于检测实验动物小鼠中唐菖蒲伯克霍尔德菌的荧光定量PCR方法。方法参考团标公布的序列合成唐菖蒲伯克霍尔德氏菌引物、探针和质粒,建立荧光PCR方法,并对方法的线性、灵敏度、重复性和特异性等性能进行验证。同时应用建立的荧光PCR方法和细菌培养法对110份小鼠送检样品进行比对检测。结果建立的唐菖蒲伯克霍尔德菌荧光PCR方法,相关系数R2可达0.998,线性良好;方法最低可检测至1×10^(2) copies/5μL,灵敏度高;方法检测培养的唐菖蒲伯克霍尔德菌为阳性,检测金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、产酸克雷伯杆菌、绿脓杆菌和嗜肺巴斯德杆菌均为阴性,特异性良好。采集110只安乐死小鼠样品,分别进行细菌培养和荧光PCR检测,结果均为阴性,2种方法结果完全符合。结论建立的荧光PCR方法性能良好,可用于实验动物小鼠唐菖蒲伯克霍尔德菌的检测。 展开更多
关键词 唐菖蒲伯克霍尔德菌 荧光pcr 检测 培养
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乳粉中克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)能力验证PCR技术的探索
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作者 仇平平 田梦 孙巧巧 《中国标准化》 2023年第16期146-150,共5页
为提高实验室检测克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)的能力,本文依据NIFDC-PT-384乳粉中克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验能力验证作业指导书、GB4789.40-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验》,探索传统生化方法... 为提高实验室检测克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)的能力,本文依据NIFDC-PT-384乳粉中克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验能力验证作业指导书、GB4789.40-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验》,探索传统生化方法和PCR技术相结合的检测克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)的方法。结果表明,样品CODE12未检出克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌),样品CODE19检出克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌),结果均为满意。本实验室具备检验克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)的能力,PCR技术很好地印证了传统生化实验的结果。 展开更多
关键词 乳粉 克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌) 能力验证 pcr技术
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实时荧光PCR法与国标法检测单增李斯特菌比较 被引量:3
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作者 黄翠 单宏 +3 位作者 李莉莉 朱秋明 孙娜 张瑞英 《黑龙江农业科学》 2023年第1期57-61,共5页
单增李斯特菌(Listeria monocytogenes)是食源性致病菌之一,可引起人和动物患病。对食品中单增李斯特菌进行检验,对保障食品安全至关重要。为明确实时荧光PCR法在食源性单增李斯特菌检测中的最低检出限以及在不同食品类型中的检出效率,... 单增李斯特菌(Listeria monocytogenes)是食源性致病菌之一,可引起人和动物患病。对食品中单增李斯特菌进行检验,对保障食品安全至关重要。为明确实时荧光PCR法在食源性单增李斯特菌检测中的最低检出限以及在不同食品类型中的检出效率,对实时荧光PCR法检测单增李斯特菌的最低检出浓度进行了摸索与验证,对人工污染单增李斯特菌的豆粉、饼干、生菜、猪肉4种食品,在不同培养时间点取样采用实时荧光PCR法检测,同时与国标法GB 4789.30-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验单核细胞增生李斯特氏菌检验》检测进行了比较。结果表明,实时荧光PCR法具有检测速度快、灵敏度高的优点,可在快速检测中应用,但因其死菌可以产生假阳性问题,而国标法检测可以分离得到污染菌株用于后续研究,因此,建议对于实时荧光PCR法检测阳性的样品用国标方法复检确认。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 快速检验 实时荧光pcr
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