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单纯疱疹病毒II型PCR检测引物设计及其价值探讨
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作者 李福民 李燎 陈德宇 《中国麻风皮肤病杂志》 北大核心 2002年第3期241-242,共2页
关键词 单纯疱疹病毒Ⅱ型 pcr检测引物 生殖器疱疹 糖蛋白D HSV-2核酸疫苗
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人体蠕形螨的DNA提取与随机引物PCR检测 被引量:11
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作者 赵亚娥 成慧 +1 位作者 寻萌 吴李萍 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期929-933,共5页
【目的】探索人体毛囊蠕形螨和皮脂蠕形螨DNA的提取方法。【方法】采用液氮反复冻融研磨法破碎螨体细胞,选用改良小昆虫DNA提取法、碱裂解法和试剂盒提取法,分别提取冻存时间在5个月内和8~10个月的毛囊蠕形螨和皮脂蠕形螨基因组DNA,并... 【目的】探索人体毛囊蠕形螨和皮脂蠕形螨DNA的提取方法。【方法】采用液氮反复冻融研磨法破碎螨体细胞,选用改良小昆虫DNA提取法、碱裂解法和试剂盒提取法,分别提取冻存时间在5个月内和8~10个月的毛囊蠕形螨和皮脂蠕形螨基因组DNA,并用随机引物PCR方法进行检测。【结果】蛋白核酸测定仪检测结果显示,试剂盒法提取的DNA纯度较高、量较多,明显优于改良小昆虫法和碱裂解法。随机引物扩增结果显示清晰的DNA指纹图谱,两种人体蠕形螨DNA指纹具有明显差异。蠕形螨冻存时间影响DNA提取的量,但对DNA提取的纯度和RAPD指纹图谱影响较小。不同DNA提取方法提取的同一种蠕形螨DNA指纹图谱基本相似,试剂盒法和改良小昆虫法提取的DNA样本条带多而清晰,碱裂解法提取的样本条带少而模糊。【结论】液氮反复冻融研磨法破碎蠕形螨细胞是有效的,蠕形螨冻存时间不宜超过6个月,试剂盒提取法是提取蠕形螨DNA的好方法。RAPD技术可以用于这两种人体蠕形螨DNA分子水平上的检测和分类。 展开更多
关键词 毛囊蠕形螨 皮脂蠕形螨 DNA提取 随机引物pcr检测
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阿克苏地区枣树花叶伴随病毒A(JuMaVA)的分子检测 被引量:2
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作者 王权 刘保军 +2 位作者 张国新 宋单波 白剑宇 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期449-455,共7页
【目的】明确枣树花叶伴随病毒A的田间侵染动态,探索出病害防治的关键时间节点。【方法】以枣树花叶伴随病毒A全基因组序列为靶标设计序列特异性引物,建立枣树花叶伴随病毒A分子检测技术,并应用于枣树花叶伴随病毒A田间侵染动态的追踪... 【目的】明确枣树花叶伴随病毒A的田间侵染动态,探索出病害防治的关键时间节点。【方法】以枣树花叶伴随病毒A全基因组序列为靶标设计序列特异性引物,建立枣树花叶伴随病毒A分子检测技术,并应用于枣树花叶伴随病毒A田间侵染动态的追踪检测与分析。【结果】该检测技术对枣树花叶伴随病毒A检测的最低质量浓度为4.168 pg·μL^(-1),可在叶片显症之前检测到该病毒。通过田间侵染动态的追踪检测与分析,明确了5月中下旬是防治该枣树花叶病毒病的关键时间节点。【结论】建立的分子检测技术具有可操作性,能够快速准确对枣树花叶伴随病毒A田间侵染动态进行追踪检测。利用已建立的分子检测技术开展了枣树花叶伴随病毒A田间侵染动态的追踪检测,初步明确了枣树花叶伴随病毒A的田间侵染动态,明确了枣树叶片带毒率随着月份的增加而增加。其中5—6月份检出率较低,7—8月份的检出率明显高于5—6月份,这与病害前期隐症、7月份叶片显症、8月份进入显症高峰期的田间调查结果相一致,但枣树花叶病毒A与枣树花叶和果实畸形的关系还需进一步实验验证。 展开更多
关键词 枣树花叶伴随病毒 枣树DNA病毒 特异性pcr引物分子检测 侵染动态
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蕹菜溃疡病菌分子检测方法的建立及田间监测
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作者 陈思妍 薛洋 +8 位作者 韩海亚 林敏怡 黎旭宇 尹德明 陶杰 李世茂 彭李亚 席卓君 周佳暖 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期339-345,共7页
【目的】蕹菜是我国南方重要的经济作物,近年来随着蕹菜种植面积不断扩大,由穿孔黄单胞菌(Xanthomonas perforans)引起的蕹菜溃疡病日趋严重,对生产造成了巨大损失。建立高效快捷的蕹菜溃疡病菌检测技术,可为有效防控病害奠定基础。【... 【目的】蕹菜是我国南方重要的经济作物,近年来随着蕹菜种植面积不断扩大,由穿孔黄单胞菌(Xanthomonas perforans)引起的蕹菜溃疡病日趋严重,对生产造成了巨大损失。建立高效快捷的蕹菜溃疡病菌检测技术,可为有效防控病害奠定基础。【方法】采用普通PCR检测技术,针对蕹菜溃疡病菌X. perforans基因组中特有序列TC2-1_002562(编码噬菌体终止酶大亚基家族蛋白)和TC2-1_002580(编码噬菌体家族蛋白)设计两对特异性检测引物,在同一个PCR体系中达到了快速检测蕹菜溃疡病菌的目的。【结果】建立的PCR检测方法可操作性强,对蕹菜溃疡病菌具有良好的特异性。利用特异性引物对来自广东多个地区的蕹菜植株、土壤和水体进行病原菌分子检测,发现第一批样本仅在5份来自东莞的蕹菜叶片上检测到病原菌,第二批样本分别在土壤、水体和植株上检测到病原菌。【结论】所建立的PCR检测方法能快速检测穿孔黄单胞菌,可用于对蕹菜溃疡病的早期诊断。该病在东莞、深圳等地呈普遍发生态势,田间检测结果表明,病害发展迅速,留种蕹菜种苗或种子很可能是该病的初侵染源,种植环境的水、土壤也是病害循环的重要环节,这对于今后进一步研究病害循环规律、制定针对性防控策略具有重要意义。 展开更多
关键词 蕹菜 溃疡病 穿孔黄单胞菌 引物pcr检测
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Optimization of Quantitative Real-time PCR System on Amplification of Beta-glucosidase Gene Os1bglu4
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作者 Rouyi CHEN Jiang CHENG +2 位作者 Changxiang ZHENG Minna PAN Mariena KETUDAT-CAIRNS 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2014年第7期1105-1108,1218,共5页
[Objective] This study aimed to establish a quantitative real-time PCR (qRT-PCR) system for detecting the expression of rice beta-glucosidase gene Os1bglu4.[Method] The PCR was conducted with SYBR Green Ⅰ method,us... [Objective] This study aimed to establish a quantitative real-time PCR (qRT-PCR) system for detecting the expression of rice beta-glucosidase gene Os1bglu4.[Method] The PCR was conducted with SYBR Green Ⅰ method,using the primers of reference gene actin or ubiquitin.[Result] Actin was more suitable to be the reference gene than ubiquitin.More accurate results were obtained when the 100 ng cDNA template was added at a large volume and a lower concentration.The primer concentration in the range from 0.2 to 0.8 μmol/L we set had no significant influence on the results,so,0.4 μmol/L was selected as the optimal primer concentration in this study.The amplification efficiency was greatly reduced when the annealing temperature was set at 64 ℃,therefore,annealing temperature was set at 60 ℃.Compared with the reaction system of 25 μl,the fluorescence intensity was significantly lower but the CT value did not change greatly in 10 μl system.So,the 10 μl reaction system was selected,which significantly reduces the research costs for the detection of a large amount of samples in future study. 展开更多
关键词 RICE Β-GLUCOSIDASE Quantitative real-time pcr Os1bglu4
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Detecting Factor Ⅺ Deficiency in Holstein Cattle Using PCR Analysis
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作者 张科 王占彬 王清义 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第5期109-111,共3页
[Objective] This study established a method to detect Factor Ⅺ by polymerase chain reaction analysis.[Method]A pair of primers was designed and synthesized according to sequences of FⅪ gene in Holstein calves,publis... [Objective] This study established a method to detect Factor Ⅺ by polymerase chain reaction analysis.[Method]A pair of primers was designed and synthesized according to sequences of FⅪ gene in Holstein calves,published in Genbank. Polymerase chain reaction was used to analyze FⅪ deficiency of 576 Holstein calves in Henan,and the result was verified by DNA sequencing. [Result] We detect 576 cows,which include two carriers and one F Ⅺ deficiency,and the result was consistent with the DNA sequencing. The frequency of the FⅪ mutant allele was 0.3%,the carrier was 0.3%,the prevalence was 0.2%.[Conclusion]A method detecting FⅪ by polymerase chain reaction analysis was established. This method is not only simple and convenient,but also has a high accuracy and low cost,which is more suitable for large-scale FⅪ investigation. 展开更多
关键词 Holstein cattle Factor deficiency pcr detection
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