中国对虾微卫星DNA多态性分析

根据建立的中国对虾部分基因组文库,对筛选的含微卫星序列的克隆设计了引物,并选择了8对多态性引物对中国对虾进行了分析。实验材料为中国对虾黄渤海群体(HB)、朝鲜半岛西海岸群体(KX)和朝鲜半岛南海岸群体(KN)3个野生群共计60个个体。结果表明:经8对引物对60尾中国对虾进行PCR扩增后,共获得了61个等位基因。对3个野生群体的8个基因位点共计24个群体位点进行了杂合度观测值(HD)和杂和度期望值(He)计算,通过Hardy-Weinberg平衡偏离指数(D)检验,发现有5个群体位点处于杂合子缺失状态,其中HB群体有3个群体位点杂合子缺失。KC和KN群体各有1个群体位点杂合子缺失。其次,对中国对虾3个野生群体遗传分化指数F_(st)值进行了计算,两两群体之间的F_(st)值均小于0.05,说明中国对虾3个野生群体的遗传分化较弱。P检验也说明了这个结果,即3个群体的中国对虾遗传分化不显著,有99.27％的遗传变异是来自个体之间,只有0.73％的遗传变异是来自群体之间。最后,经过聚类分析,发现HB群体和KX群体的亲缘关系较近,而KN群体与前两者亲缘关系较远。实验还对8对微卫星引物的多态性信息含量(PIC)进行了评估,PIC值介于0.5984～0.9178之间,揭示了这8个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量。

草菇栽培菌株DNA多态性的PCR-RFLP和RAPD分析

12个草菇栽培菌株的核糖体DNA(rDNA)、线粒体DNA(mtDNA)和基因组总DNA的多态性被研究了。应用PCR-RFLP技术,扩增了rDNA5.8s+ITS区段及mtDNA小区段,并进行限制性酶切分析,结果表明菌株间的rDNA在5.8s+ITS区段的遗传差异小,据此只能将测试的12个菌株分为两类;而对mtDNA小区段的检测未能显示出菌株间的差异,表明测试的菌株在所研究的区段具有很高的遗传相似性。在此基础上,对基因组总DNA的RAPD分析表明,菌株两两间的遗传相似系数在0.554到0.898之间,而平均相似系数为0.707。通过平均链锁聚类方式(UPGMA)聚类,发现在相似系数0.710水平上,供试菌株可分为四大类。这些研究结果为草菇的育种提供了科学依据。

法医DNA序列多态性分析技术的研究进展

自上世纪80年代DNA分析技术应用于法医学实践以来,法医物证学技术从以往只能检测基因编码产物水平（如蛋白质）飞跃到直接检测基因多态性的分子水平,这是法医物证检验分析史上的一场重大革新.法医DNA分析技术对犯罪现场遗留的指纹、毛发、唾液、血迹,甚至一些微量、腐败、污染的生物检材,均能做到快速的法医DNA分析,以进行个人识别和亲子鉴定,使现场生物物证的利用率大大提高,成为认定犯罪的有力证据.目前,法医DNA分析技术已成为法医生物物证检验的常规技术,广泛应用于伤害、性侵犯、交通肇事、亲子鉴定等刑事和民事案件中,为刑事侦查提供线索,为司法审判提供有力地科学证据.

DNA多态性分析技术及其在蚕业上的应用

现代分子生物学的迅猛发展,使整个生命科学研究发生了深刻的革命.由之而孕育出的以基因组DNA多态性分析为核心的分子标记(molecular marker)技术,使人们对于生物遗传差异的认识,由表型(产物)特征深入到了分子水平,产生了由现象到本质的飞跃.DNA多态性是指基因组DNA在漫长的生命繁演历程中所发生的自然突变(DNA片断的插入、缺失、重排或碱基置换)状况的差异性.这种差异反映了基因组的本质特征。

利用微卫星血液DNA标记分析延边圈养黑熊遗传多态性

为了掌握圈养黑熊的相关遗传信息，试验采用微卫星血液DNA标记法研究圈养黑熊的遗传多态性，试验选择延边地区3个熊场175头圈养黑熊，对其进行遗传多态性检测，计算其等位基因频率、多态信息含量（PIC）等。结果表明：圈养黑熊的6个微卫星座位总共检测到39个等位基因，每个位点的等位基因数量为4．000～8．000个，每个微卫星的平均位点为6．500个，基因频率分布在0—1之间；6个微卫星基因座的平均PIC为0．5717，且PIC值在0．4534—0．7422之间，廷边3个黑熊养殖群体的平均PIC均高于0．5，表明6个微卫星标记均具有高度多态性，因此可以分析圈养黑熊的遗传多态性。

随机人群与精神分裂症患者微卫星DNA vWA多态性的关联性分析(英文)

背景:精神分裂症的发病与遗传关系密切,但对相关基因定位相当困难,因此有必要先寻找有关遗传标志。目的:通过对微卫星DNA vW A 多态性的分析,了解精神分裂症与vW A有关等位基因的关联情况。设计:以精神分裂症患者和随机人群为观察对象的病例-对照研究。单位:大连市第七人民医院病房和大连医科大学分子生物学实验室。对象:精神分裂症病例为2002-03/07大连市第七人民医院(精神病专科医院)住院患者32例,诊断符合《美国精神疾病诊断统计手册》第3版精神分裂症诊断标准,临床表现以阴性症状为主。随机人群样本为在大连市红十字血液中心随机选取的正常人血液样本123份,无精神疾病和严重躯体疾病,无明确亲缘关系。方法:采取抗凝全血标本,用PE Profilerplus 系统进行聚合酶链反应复合扩增,然后用ABI310型基因分析系统对扩增产物进行电泳和基因检测。计算出各等位基因的基因频率,并按H ardy-W einberg平衡定律计算出各等位基因的理论频率与实际观测值,作吻合度检验和连锁分析;将精神分裂症患者与随机人群进行比较,按RR =Pd ×(1-Pc)/Pc ×(1-Pd)公式进行相对危险度分析并作统计学显著性检验(RR:相对危险度;Pd:精神分裂症患者基因频率;Pc:随机人群基因频率),RR >1为有易感倾向,RR <1为有抗性倾向。找出vW A 与精神分裂症相关基因的易感连锁或抗性连锁的等位基因。主要观察指标:主要结局:精神分裂症患者与随机人群vW A 等位基因关联性分析。次要结局:精神分裂症患者和随机人群vW A 等位基因频率与H ardy-W einberg定律的吻合度。结果:两组受试对象的测试样本均纳入结果分析。①精神分裂症患者和随机人群vW A 等位基因频率符合H ardy-W einberg平衡定律(P >0.05)。②精神分裂症患者vW A-14的检出率(17.2%)低于随机人群(33.3%),差异有显著性(RR=0.415,P=0.014);精神分裂症患者vW A-17的检出率(31.3%)高于随机人群(19.5%),差异有显著性(RR =1.866,P =0.043);其他各等位基因检出率差异无显著性(P >0.05)。结论:精神分裂症患者vW A-14的检出率显著低于随机人群,提示vW A-14在精神分裂症时可能会因某种原因而被负选择,其附近可能存在抵抗精神分裂症发病的基因。精神分裂症患者vW A-17的检出率显著高于随机人群,表明vW A-17与精神分裂症相关联,其附近可能存在精神分裂症易感基因。

DNA芯片分析单核苷酸多态性及其法医学应用

DNA芯片技术作为一门新兴的高科技生物技术,显示了它旺盛的生命力和迅猛的发展势头。单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms,SNPs)是最常见的人类基因组变异类型。它作为一种有效的人类遗传标记,在疾病相关性研究、药物基因组学、法医学、人类进化和迁移等研究中发挥了重要作用。它同DNA芯片技术结合运用也将在法医检验,尤其是亲子鉴定和个人识别中发挥重要作用。本文主要讨论了DNA芯片和SNPs的特点,以及二者联合运用于法医学的价值。

杜氏利什曼原虫:PCR分析技术和DNA测序显示苏丹分离株的种内多态性

作者采用单链非特异性引物的PCR指印技术、核糖体操纵子内转录间隔区扩增产物的限制性片段长度多态性分析(ITS-RELP)、单链构象多态性(SSCP)和ITS测序等法研究26个杜氏利什曼原虫分离株间的多态性,其中23个为东部苏丹分离株,另外3个虫株分别来自肯尼亚、印度和中国。

应用RAPD技术分析绒山羊DNA的多态性

中国是世界上最大的山羊绒生产国，具有绒质好、价格高的特点。原绒产量和贸易占全世界的50%。20世纪80年代以来，国内外有关绒山羊的研究进展很大，分析和了解绒山羊群体间的遗传亲缘关系是获得杂种优势的重要途径之一，本实验研究应用RAPD技术，对辽宁绒山羊、辽宁多绒山羊、内蒙古阿尔巴斯白绒羊和杂种多绒山羊（辽宁多绒山羊与库布齐阿尔巴斯绒山羊杂交选育的高代杂交群体）进行基因多态性比较分析，为今后探测控制绒山羊性状的主效基因提供理论基础和科学依据。

肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析

利用6个微卫星位点分析了8个肉牛杂交亲本群体的遗传结构和遗传变异,结果表明:8个肉牛群体平均多态信息含量和平均杂合度较高.其范围分别为0.57～0.71和0.59～0.73。以海伏特牛和利木赞牛与三个母牛种群(FN,ZH,FU)间遗传距离为最大。由邻结法绘制的系统聚类图能清晰、客观地反映8个肉牛群体的地理分布、遗传分化特点,以及亲缘关系远近程度。这些研究为肉牛的杂交改良奠定了基础。

中国栗AC/GT微卫星的提取和多态性及对安徽省板栗品种的分析

运用富集技术构建富集中国栗微卫星的基因组文库,从富集(AC)n微卫星的基因组文库中筛选出的10个微卫星中设计出5对引物.使用安徽省的14个板栗品种分析5个SSR位点的多态性,从5个微卫星位点得到29个等位基因,每个位点的等位基因数量在4～7个之间,微卫星位点的平均PIC为0.63.利用微卫星数据进行聚类分析,14个品种分为2个类群,聚类结果与品种来源基本一致.(AC)n微卫星的高多态性表明其在板栗遗传图构建和品种指纹分析方面具有优越性.

用M13噬菌体作探针进行人的DNA限制性片段长度多态性分析

用M13噬菌体作为探针,可以检测人和动物基因组DNA中高度可变的小卫星区域,其有效顺序是该噬菌体基因Ⅲ中的两组15bp的串联重复。本文介绍的是采用随机引物与PCR过程相结合的方法标记M13噬菌体,得到高比活性的探针,与经HinfⅠ消化的人DNA杂交,产生具有高度多态性的DNA图谱,并与33.15探针杂交的DNA图谱进行了比较,证明M13噬菌体是进行DNA多态性分析的一种非常有用的探针。

中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)黄、渤海3个野生地理群遗传多样性的微卫星DNA分析

运用微卫星DNA技术 ,以中国对虾渤海湾群体 (BH)、辽东湾群体 (LD)和海州湾群体(HZ)的 3个野生群共计 60个个体为实验材料 ,进行了 7个基因位点的遗传参数分析。同时对7对微卫星引物的多态性信息含量 (PIC)进行了评估 ,EN0 0 2 1位点提供的信息含量低于 0 5 ,其他 6对微卫星引物的PIC值均在 0 5以上 ,适于应用于中国对虾的群体分析。结果表明 ,这7个微卫星位点在中国对虾 3个地理群 60个样品的分析中共获得了 5 6个等位基因 ,对 3个野生群体的 7个基因位点共计 2 1个群体位点进行了杂合度观测值 (Ho)和杂合度期望值 (He)计算 ;在Hardy Weinberg平衡条件下 ,进行了P检验 ,发现BH和HZ各有 1个群体位点发生平衡偏离 ,而LD有 1个群体位点发生平衡偏离 ,还有 2个群体位点已发生显著平衡偏离。但除此之外 ,对 3个地理群间的遗传分化指数Fst值进行的计算结果表明 ,BH和LD之间遗传分化较弱 ,HZ与另 2个地理群间则产生了中等程度的分化。从变异贡献率来看 ,有 92 83%的遗传变异来自个体之间 ,只有 7 1 7%的遗传变异来自群体之间。经过UPGMA聚类 ,发现BH群体和LD群体的亲缘关系较近 ,而HZ群体与前两者亲缘关系较远。

DNA分析技术在法医昆虫学中的应用

在利用尸食性昆虫进行法医学案件分析时,昆虫种类的鉴定是首要的一步[1].在尸体上及其附近发现的昆虫,用形态学方法鉴定常感困难[2].

龙须菜微卫星DNA标记筛查及系统分析

利用生物信息学方法,从龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)公共核苷酸数据库中筛查到8条含有微卫星DNA的序列,并根据筛查出的微卫星DNA序列设计合成了5对引物,此外还使用了细江蓠的4对已知微卫星DNA引物共9对引物在采集自青岛的26株野生龙须菜个体中进行扩增,结果筛选到2对引物可扩增出具有多态性的产物。然后利用5对龙须菜的微卫星引物对6个龙须菜品系和另外2个种外物种细基江蓠和菊花心江蓠进行系统学分析。根据计算得到的不同样品之间Nei氏遗传相似系数进行聚类分析,显示青岛野生龙须菜QD与栽培品系981、石岛的龙须菜样品SD与龙须岛的龙须菜样品LD之间的遗传相似系数最高,而来自委内瑞拉的龙须菜样品LV与青岛野生龙须菜之间的差异远远高于种内水平的差异。