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结肠小袋纤毛虫PCR-RFLP分型方法的建立
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作者 徐啊慧 冯彩彩 +6 位作者 丰山旺 赵立卓 齐闻新 张雯 胡苏辉 王天奇 闫文朝 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期829-833,840,共6页
目的建立高效、特异的结肠小袋纤毛虫遗传亚型分析方法。方法选择限制性内切酶ApoI和PflMI对结肠小袋纤毛虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的PCR扩增产物进行酶切分析,建立PCR-RFLP分型方法,利用建立的PCR-RFLP方法对猪源、羊源和豚鼠源临床粪便... 目的建立高效、特异的结肠小袋纤毛虫遗传亚型分析方法。方法选择限制性内切酶ApoI和PflMI对结肠小袋纤毛虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的PCR扩增产物进行酶切分析,建立PCR-RFLP分型方法,利用建立的PCR-RFLP方法对猪源、羊源和豚鼠源临床粪便样品进行遗传亚型分析。结果基于ApoI和PflMI的PCR-RFLP方法可以准确区分结肠小袋纤毛虫遗传变异型A和B,用PflMI可以进一步将遗传变异型B细分为B-c和B-t两个亚型。与镜检和测序结果比较,建立的PCR-RFLP方法具有良好的特异性和更高的灵敏性,不仅可以鉴定临床样品中结肠小袋纤毛虫单个亚型,而且可以鉴别单个样品中结肠小袋纤毛虫多个亚型的混合感染。结论本研究成功建立了结肠小袋纤毛虫PCR-RFLP方法,可用于结肠小袋纤毛虫遗传多态性鉴定和分子流行病学研究。 展开更多
关键词 结肠小袋纤毛虫 PCR-RFLP分析 豚鼠
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一种基于线粒体COI PCR-RFLP单酶切快速鉴定4种巨蛎属牡蛎的方法
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作者 崔中望 于诗奇 +1 位作者 缪雄平 阙华勇 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期68-73,共6页
本文报道了一种基于线粒体细胞色素氧化酶亚基I(mt COI)基因序列PCR-RFLP单酶切的牡蛎物种鉴定方法。本方法可快速鉴定福建牡蛎(Crassostrea angulata)、熊本牡蛎(Crassostrea sikamea)、香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)和近江牡蛎... 本文报道了一种基于线粒体细胞色素氧化酶亚基I(mt COI)基因序列PCR-RFLP单酶切的牡蛎物种鉴定方法。本方法可快速鉴定福建牡蛎(Crassostrea angulata)、熊本牡蛎(Crassostrea sikamea)、香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)和近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)等中国沿海常见的4种巨蛎属(Crassostrea)牡蛎。该方法以甲基转移酶(Msp I)作为限制性内切酶,对4种巨蛎属牡蛎的线粒体DNA COI扩增序列进行酶切,以得到的特异性条带为依据进行物种鉴定。本方法的鉴定结果与COI测序方法的鉴定结果一致,并且筛选出的单一的限制性内切酶Msp I在4种牡蛎的COI序列中不存在酶切位点的突变,准确率达到100%,能够为巨蛎属牡蛎的物种鉴别提供简便可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 巨蛎属(Crassostrea)牡蛎 线粒体COI PCR-RFLP
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Relationship between the rs2241766 ADIPOQ Polymorphism in a Black African Population and the Occurrence of Type 2 Diabetes
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作者 Aude Syntia Mbang Bengone Rosalie Nikiema-Ndong +6 位作者 Elisabeth Lendoye Alvine Sibylle Batou Edwige Nnegue Edzo Serge Bekale Daniela Nsame Frédéric Da Dari Félix Ovono Abessolo 《American Journal of Molecular Biology》 CAS 2024年第2期97-106,共10页
Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disease, characterized by chronic hyperglycemia. This pathology is linked to various genes whose interaction with the environment promotes its development. Th... Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disease, characterized by chronic hyperglycemia. This pathology is linked to various genes whose interaction with the environment promotes its development. The aim of this work was to determine the relationship between the rs2241766 (T/G) polymorphism of the ADIPOQ gene with type 2 diabetes in the black population. Material and Methods: This work was a case-control study, involving type 2 diabetics subjects (n = 94) and controls (n = 82). The study took place from September 2022 to September 2023. Patients were recruited in the Endocrinology Department of the Libreville University Hospital Center. Analysis was performed in the Biochemistry laboratory of the University of Health Sciences in Libreville and at the Research Institute of Health Sciences of Bobodioulasso. Genomic DNA was extracted using the protocol Qiagen kit and the PCR-RFLP method was used to determine the rs2241766 (T/G) polymorphism of the ADIPOQ gene. Results: Only 2 genotypes were found in this population, the TT genotype and the GT genotype. The proportions were not different between the two groups (p = 0.1095) neither the distribution of G and T alleles (p = 0.1095). On the other hand, the HDL hypocholesterolemia was frequent in subjects with the GT genotype compared to TT heterozygous (51.1% vs 48.9%, p = 0.0280;OR = 0.55 [0.30 - 1.01]). Conclusion: There was no association between the rs2241766 (T/G) variant of the ADIPOQ gene and the occurrence of type 2 diabetes in this population. On the other hand, a relationship between HDL hypocholesterolemia and the GT genotype has been established. 展开更多
关键词 Type 2 Diabetes Mellitus POLYMORPHISM rs2241766 ADIPOQ PCR-RFLP
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安徽省石台县日本血吸虫rDNA-ITS2和mtDNA-COX1遗传多态性研究
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作者 宇芙蓉 方佩斐 +1 位作者 施维 金郁 《安徽医专学报》 2023年第2期85-87,90,共4页
目的:研究安徽石台县日本血吸虫的核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因和线粒体细胞色素C氧化亚基1基因(mtDNA-COX1)的遗传变异。方法:收集两种不同来源的阳性钉螺(石台和南京),逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(20±2)尾蚴,3... 目的:研究安徽石台县日本血吸虫的核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因和线粒体细胞色素C氧化亚基1基因(mtDNA-COX1)的遗传变异。方法:收集两种不同来源的阳性钉螺(石台和南京),逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(20±2)尾蚴,35天后解剖小鼠,收集血吸虫成虫,PCR-RFLP扩增成虫的rDNA-ITS2和mtDNA-COX1基因,限制性核酸内切酶Taq I水解,观察结果;同时收集小鼠的肝脏和血液,HE染色观察肝脏肉芽肿的大小,ELISA检测小鼠血清中的谷丙转氨酶(ALT)。结果:石台组和南京组均获得500 bp的ITS2序列和1400 bp的mtDNA-COX1序列;两组的ITS2序列经Taq I酶切后,得到一样的片段;而mtDNA-COX1序列经Taq I酶切后,两组结果不同,石台组在1000 bp检测到1条清晰的条带,而南京组在此处无任何条带;两组小鼠的肝脏纤维化病理结果与谷氨酸转氨酶测定结果均无明显差异。结论:石台组和南京组的日本血吸虫虽然在致病性方面具有相似性,但在mtDNA-COX1基因序列存在差异,本研究为今后日本血吸虫的种群遗传结构研究提供科学依据。 展开更多
关键词 日本血吸虫 遗传多态性 PCR-RFLP ITS2 COX1
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鸡金银羽位点基因型PCR-RFLP鉴定方法的建立及其应用研究 被引量:1
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作者 崔梦笛 倪慧勇 +5 位作者 刘华格 褚素乔 王学静 许利军 王志永 樊宝良 《中国家禽》 北大核心 2023年第2期8-14,共7页
为了建立一个快速、简便、有效鉴定鸡金银羽位点基因型的方法,试验通过对金银羽等位基因位点核苷酸序列进行分析,设计合成一对引物,应用该对引物对海兰褐、伊莎褐和大午金凤等采用金银羽羽色自别雌雄的蛋鸡配套系商品代公鸡(金银羽等位... 为了建立一个快速、简便、有效鉴定鸡金银羽位点基因型的方法,试验通过对金银羽等位基因位点核苷酸序列进行分析,设计合成一对引物,应用该对引物对海兰褐、伊莎褐和大午金凤等采用金银羽羽色自别雌雄的蛋鸡配套系商品代公鸡(金银羽等位基因杂合,Ss)和母鸡(金羽等位基因半合子,s-)进行了PCR-RFLP基因型鉴定分析。结果显示,PCR-RFLP方法的鉴定结果与实际基因型一致;采用该方法从960只白羽太行鸡母鸡中鉴定得到3只不携带显性白羽等位基因的银羽母鸡(银羽等位基因半合子,S-);以海兰褐父母代父本公鸡(金羽等位基因纯合,ss)作为父本与用本方法鉴定得到的3只银羽太行鸡母鸡进行杂交,来模拟金银羽自别雌雄的海兰褐蛋鸡商品代鸡的生产,获得的后代雏鸡绒羽颜色表型和性别符合海兰褐商品代鸡金银羽羽色自别雌雄的规律。上述结果表明,建立的PCR-RFLP方法能够快速、简便、有效且低成本地鉴定鸡金银羽位点基因型,为银羽纯合品系的建立提供了一个有效的个体金银羽位点基因型鉴定的方法。 展开更多
关键词 金银羽 基因型 性别鉴定 分子标记 PCR-限制性片段长度的多态性(PCR-RFLP)
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石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲PCR-RFLP鉴别方法研究 被引量:3
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作者 杜晓伟 宋平顺 倪琳 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2023年第5期121-126,共6页
目的通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法建立快速鉴别石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲的方法。方法对石菖蒲和藏菖蒲的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列酶切位点进行比对分析,选择藏菖蒲的特异性酶切位点AluI,设计PCR-RFL... 目的通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法建立快速鉴别石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲的方法。方法对石菖蒲和藏菖蒲的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列酶切位点进行比对分析,选择藏菖蒲的特异性酶切位点AluI,设计PCR-RFLP反应引物,对影响PCR-RFLP反应的退火温度、引物浓度、循环数、酶切时间等条件进行优化,对该方法的准确性进行考察。利用建立的PCR-RFLP鉴别方法对不同产地的石菖蒲、藏菖蒲及掺混样品进行适用性考察。结果建立了石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲的PCR-RFLP鉴别方法,在退火温度60℃、循环数为30时,藏菖蒲或掺有藏菖蒲的石菖蒲样品经过特异性引物扩增后,能被AluI酶酶切,在100~300 bp检出2条单一DNA条带,石菖蒲样品则无此条带。该方法能对石菖蒲药材及饮片中掺混的藏菖蒲进行准确鉴别,并对石菖蒲中掺入藏菖蒲的检出限为3%。结论建立的PCR-RFLP鉴别方法稳定性好、灵敏度高,可用于石菖蒲与藏菖蒲鉴别及石菖蒲中掺混藏菖蒲的检测,为石菖蒲与藏菖蒲药材的质量控制提供参考。 展开更多
关键词 石菖蒲 藏菖蒲 掺混鉴别 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法
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基于ITS序列PCR-RFLP鉴别大蓟药材及饮片中掺伪飞廉、魁蓟的方法研究 被引量:1
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作者 张诗华 赖晶 +3 位作者 倪琳 宋平顺 李辰荃 郭朝晖 《天津中医药大学学报》 CAS 2023年第6期780-785,共6页
[目的]利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP),建立快速鉴别大蓟混伪品飞廉和魁蓟的方法。[方法]通过比对ITS基因序列,分别筛选飞廉、魁蓟的限制性内切酶位点并设计鉴别引物。考察PCR反应的退火温度、循环数及不同酶的适用... [目的]利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP),建立快速鉴别大蓟混伪品飞廉和魁蓟的方法。[方法]通过比对ITS基因序列,分别筛选飞廉、魁蓟的限制性内切酶位点并设计鉴别引物。考察PCR反应的退火温度、循环数及不同酶的适用性,对酶切反应时间和酶切底物量进行优化。同时对该方法适应性及掺伪比例的专属性、稳定性进行考察。[结果]当退火温度为58~60℃、循环数为30个时,样品均能扩增出一条379 bp的DNA条带。底物为8μL、酶切温度为37℃、酶切反应120 min时,ZraI酶将飞廉切割成120 bp和259 bp两条DNA条带;DNA底物为8μL、酶切温度为37℃、酶切反应60 min时,ApaLI酶将魁蓟切割成126 bp和253 bp两条DNA条带。[结论]试验建立的PCR-RFLP方法能够准确地鉴别大蓟混伪品飞廉、魁蓟,避免此类药材的混用,以保证临床用药安全。 展开更多
关键词 大蓟 飞廉 魁蓟 PCR-RFLP法 ITS序列
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梅花鹿鞭与马鹿鞭PCR-RFLP鉴别研究 被引量:1
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作者 周童 吴楠 +5 位作者 孟媛 姜菲菲 李佩瑶 张英 裴笑仙 艾金霞 《吉林医药学院学报》 2023年第2期81-86,共6页
目的建立一种应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)鉴别梅花鹿鞭与马鹿鞭的方法。方法根据梅花鹿与马鹿的细胞色素b基因序列的差异,设计并选取DNA限制性内切酶MseI来区分梅花鹿鞭和马鹿鞭。采用改良SDS法提取样本基因... 目的建立一种应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)鉴别梅花鹿鞭与马鹿鞭的方法。方法根据梅花鹿与马鹿的细胞色素b基因序列的差异,设计并选取DNA限制性内切酶MseI来区分梅花鹿鞭和马鹿鞭。采用改良SDS法提取样本基因组DNA,经PCR扩增后进行RFLP分析,并优化PCR-RFLP反应体系及反应条件,用优化的PCR-RFLP体系对市售鹿鞭样本进行鉴定。结果经PCR-RFLP分析,MseI可切割梅花鹿与马鹿Cyt b片段,前者被切成2个片段,后者被切成3个片段,从而将两者进行鉴别。结论本实验建立的PCR-RFLP方法可准确鉴别梅花鹿鞭与马鹿鞭。 展开更多
关键词 鹿鞭 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术 梅花鹿鞭 马鹿鞭
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Tumor Necrosis Factor-Alpha (TNF)-308G/A and Interleukin 8(IL-8)-251C/T Polymorphisms in Pulmonary Tuberculosis Patients from Congo
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作者 Faust René Okamba Prudence Spinelie Koumba Pambou +4 位作者 Mandingha Kosso Etoka-Beka Brave Nzoussi Regis Gothard Bopaka Cyr Jonas Morabandza Gabriel Ahombo 《Open Journal of Immunology》 CAS 2023年第1期1-13,共13页
Background: Tuberculosis (TB) is one of the world’s deadliest infectious diseases. Tumor necrosis factor-Alpha (TNF-α) and Interleukin 8 (IL-8) are involved in the pathogenesis of pulmonary TB (PTB). However, the co... Background: Tuberculosis (TB) is one of the world’s deadliest infectious diseases. Tumor necrosis factor-Alpha (TNF-α) and Interleukin 8 (IL-8) are involved in the pathogenesis of pulmonary TB (PTB). However, the contribution of polymorphisms of these cytokines to PTB susceptibility needed more investigation across geographic regions and ethnic groups. Purpose: The aim of this study was to investigate the association of the TNF-α-308 G/A and IL-8-251T/A polymorphisms with PTB risk in the Congolese population. Methods: This case-control study included 150 PTB patients and 160 control subjects. Blood samples were collected from all participants and were used for the TNF-α-308 G/A and IL-8-251T/A genotyping by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique. Odds ratios (OR) were calculated to estimate the potential polymorphism associations. A P level of Results: A significant difference was found between PTB patients and controls regarding the TNF-α-308AA genotype (P = 0.035) distribution. Moreover, this genotype was associated with risk to TB (OR = 7.19, 95% CI = 0.85 - 60.65, P = 0.035). The A allele was significantly more frequent in PTB patients than in controls, and was associated with risk to PTB (OR = 1.68, 95% CI = 1.05 - 2.68, P = 0.014). Regarding the IL-8-251T/A gene, TA and AA genotypes were significantly more frequent in PTB patients compared to controls, and were associated with increased risk to PTB (OR = 2.64, 95% CI = 0.97 - 7.18, P = 0.031 and OR = 3.0, 95% CI = 1.13 - 7.98, P = 0.014, respectively). However, the IL-8-251 A allele was not associated to PTB susceptibility (OR = 0.27, 95% CI = 0.15 - 0.44). Conclusion: TNF-α-308G/A and IL-8-251T/A polymorphisms may be associated to PTB susceptibility in the Congolese population, and the AA genotype of both cytokines could be a risk factor. 展开更多
关键词 Pulmonary Tuberculosis Cytokine Polymorphism Tumor Necrosis Factor-Alpha INTERLEUKIN-8 PCR-RFLP
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基于ITS序列PCR-RFLP鉴别北柴胡混伪品藏柴胡
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作者 赖晶 倪琳 +5 位作者 蔺瑞丽 靳婉君 刘富强 宋平顺 马萧 滕宝霞 《现代中医药》 CAS 2023年第5期105-112,共8页
目的基于ITS序列用PCR-RFLP方法鉴别北柴胡药材掺伪藏柴胡的方法。方法分析并筛选出藏柴胡特有的限制性内切酶AseⅠ,用Primer Premier 5.0设计特异性引物,对引物PCR扩增条件和酶切试验进行优化,并对该方法的准确性进行了考察。结果PCR... 目的基于ITS序列用PCR-RFLP方法鉴别北柴胡药材掺伪藏柴胡的方法。方法分析并筛选出藏柴胡特有的限制性内切酶AseⅠ,用Primer Premier 5.0设计特异性引物,对引物PCR扩增条件和酶切试验进行优化,并对该方法的准确性进行了考察。结果PCR扩增的目的片段为331 bp,且建立的PCR反应方法对不同的酶均具有适应性。限制性内切酶AseⅠ将藏柴胡切成79 bp和252 bp两个片段,而北柴胡及其他柴胡均不能被酶切,且掺伪检出限为1%。结论PCR-RFLP方法实现了准确鉴别北柴胡中的混伪品藏柴胡。 展开更多
关键词 藏柴胡 北柴胡 ITS PCR-RFLP 分子鉴定
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9个猪种H-FABP基因5’-上游区和第二内含子的遗传变异 被引量:51
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作者 张桂香 曹红鹤 +2 位作者 王立贤 李宏滨 郑友民 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期340-343,共4页
以 8个中国地方猪种和引进品种大白猪共 40 9头猪为实验动物 ,利用PCR RFLP技术研究了H FABP基因的 5’ 上游区和第二内含子内的遗传变异。结果在 9个品种的 5’ 上游区中都验证了一个HinfⅠ RFLP ,变异的酶切位点在 132 2位 ,等位基因... 以 8个中国地方猪种和引进品种大白猪共 40 9头猪为实验动物 ,利用PCR RFLP技术研究了H FABP基因的 5’ 上游区和第二内含子内的遗传变异。结果在 9个品种的 5’ 上游区中都验证了一个HinfⅠ RFLP ,变异的酶切位点在 132 2位 ,等位基因H ,在皖南花猪 ,二花脸猪 ,金华猪 ,小梅山猪 ,滇南小耳猪 ,香猪 ,荣昌猪 ,北京黑猪和大白猪中的频率分别为 0 36 ,0 34 ,0 6 0 ,0 6 6 ,0 80 ,0 73,0 76 ,0 70和 0 90。大白猪和滇南小耳猪的HinfⅠ RFLP的基因型分布相似 ,二者分别与其它 7个猪种之间存在着极显著的差异 ;皖南花猪和二花脸猪相近 ,二者与另外 7个品种之间的差异也达到极显著水平。在第二内含子中 ,验证了一个HaeⅢ RFLP ,该多态性只出现在皖南花猪和大白猪中 ,等位基因D的频率分别为 0 99和 0 6 1。另外 ,发现一个新的多态HinfⅠ 酶切位点 ,测序结果表明 ,该多态位点的产生是由于 1970位碱基C突变为T造成的。该多态位点只在皖南花猪和大白猪中出现 ,等位基因B的频率在两品种中分别为 0 86和 0 5 8。在所有测定的猪种中 ,都没有发现MspⅠ RFLP。 展开更多
关键词 5′-上游区 遗传变异 H-FABP基因 PCR-RFLP 第二内含子
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中外11个猪种H-FABP基因PCR-RFLP的研究 被引量:35
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作者 李桢 曹红鹤 +4 位作者 储明星 李宏滨 马月辉 郑友民 周忠孝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期313-317,共5页
本文利用PCR RFLP技术对五指山猪、沂蒙黑猪、汉江黑猪、莱芜猪、香猪、民猪、成华猪、内江猪、二花脸猪、巴马香猪和大白猪11个猪种共420头猪的心脏脂肪酸结合蛋白基因5′ 端上游区(HinfI RFLP)和第二内含子内(HinfI RFLP、HaeⅢ RFLP... 本文利用PCR RFLP技术对五指山猪、沂蒙黑猪、汉江黑猪、莱芜猪、香猪、民猪、成华猪、内江猪、二花脸猪、巴马香猪和大白猪11个猪种共420头猪的心脏脂肪酸结合蛋白基因5′ 端上游区(HinfI RFLP)和第二内含子内(HinfI RFLP、HaeⅢ RFLP)的遗传变异进行了研究。研究表明:(1)在5′ 端上游区的HinfI RFLP位点上,所有的品种都有变异,但沂蒙黑猪和大白猪只有两种基因型(HH、Hh);(2)在第二内含子内的HinfI RFLP位点上,二花脸只有BB基因型,而其它品种都表现出多态性;(3)在第二内含子内的HaeⅢ RFLP位点上,只在五指山猪、香猪和大白猪中发现有多态性存在,等位基因D的频率分别为0 86,0 98和0 68,其余8个猪种均表现为DD型。 展开更多
关键词 中国 外国 品种 H—FABP基因 PCR—RFLP 心脏脂肪酸 蛋白基因
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猪雌激素受体(ESR)基因对产仔数性状的影响 被引量:105
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作者 陈克飞 黄路生 +3 位作者 李宁 张勤 罗明 吴常信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第10期853-857,共5页
猪产仔数是重要的经济性状,产仔数的提高将会大大地增加商品肉猪的产量,给现代养猪生产带来巨大的经济效益。ESR基因是影响猪产仔数的主效基因,而且与猪的生长发育性状及酮体性状之间不存在负的基因多效性影响。采用PCR-RF... 猪产仔数是重要的经济性状,产仔数的提高将会大大地增加商品肉猪的产量,给现代养猪生产带来巨大的经济效益。ESR基因是影响猪产仔数的主效基因,而且与猪的生长发育性状及酮体性状之间不存在负的基因多效性影响。采用PCR-RFLPs的方法,通过对5个不同品种的、特别是我国地方品种的262头母猪进行了基因多态性分析,研究表明ESR基因在这些种群对产仔数均有极显著影响,ESR位点BB基因型母猪平均比AA基因型母猪多1.40~3.37头总产仔数/胎,0.63~3.58头产活仔数/胎,这些发现对育种改良猪繁殖性能有重要意义。 展开更多
关键词 ESR基因 PCR-RFLPS 产仔数 激素受体基因
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不同猪种E .coli F1 8受体基因的多态性 被引量:39
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作者 施启顺 黄生强 +2 位作者 柳小春 贺长青 蒋隽 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第3期221-224,共4页
采用PCR RFLP技术检测了大约克、长白、杜洛克、宁乡、沙子岭和大围子 6个品种共 86 7头猪的E .coliF18受体 (ECF18R)基因座的遗传变异。结果表明 :Hin6Ⅰ RFLP位点上 ,大约克、长白、杜洛克 3个外来猪种均存在多态 ,且以敏感型 (GG型... 采用PCR RFLP技术检测了大约克、长白、杜洛克、宁乡、沙子岭和大围子 6个品种共 86 7头猪的E .coliF18受体 (ECF18R)基因座的遗传变异。结果表明 :Hin6Ⅰ RFLP位点上 ,大约克、长白、杜洛克 3个外来猪种均存在多态 ,且以敏感型 (GG型和AG型 )居多 ,平均占 94%,3个外来猪种的G等位基因频率平均为 0 76 ,AA抗性型个体占少数 ,平均为 6 %,猪群中M30 7处G→A的突变频率并不高。宁乡、沙子岭和大围子 3个本地猪种的所有检测样品都表现为GG型 ,在该位点上均不存在G→A的突变。各猪种ECF18受体基因座的PCR RFLP基因型分布 χ2 检验结果表明 ,每个外来猪种ECF18受体基因座的PCR RFLP基因型分布与 3个本地猪种的相比均差异显著或极显著 ,3个本地猪种间的ECF18受体基因座的PCR RFLP基因型分布完全一致。外来猪种间只有长白与杜洛克各基因型的分布差异显著 ,其余均不显著。 展开更多
关键词 品种 F18受体基因 PCR—RFLP 多态性 肠毒素大肠杆菌病 抗性基因
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小梅山、中梅山及大约克猪的SLA-DQB基因外显子2 PCR-RFLP多态性分析 被引量:46
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作者 方美英 胡晓湘 +1 位作者 李宁 吴常信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第8期685-687,共3页
采用限制性内切核酸酶RsaⅠ对中国地方猪种小梅山、中梅山及国外猪种大约克SLA DQB基因外显子 2的2 73bp扩增产物进行多态性分析。小梅山猪酶切后出现两种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB) ;中梅山猪中出现 4种基... 采用限制性内切核酸酶RsaⅠ对中国地方猪种小梅山、中梅山及国外猪种大约克SLA DQB基因外显子 2的2 73bp扩增产物进行多态性分析。小梅山猪酶切后出现两种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB) ;中梅山猪中出现 4种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB)、132bp 114bp 2 7bp(CC)、2 4 6bp 132bp 84bp 30bp 2 7bp(AB) ;大约克猪中出现 5种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB)、132bp 114bp 2 7bp(CC)、2 4 6bp 132bp 84bp 30bp 2 7bp(AB)、2 73bp 2 4 6bp 2 7bp(AD)。分析发现 ,SLA DQB基因外显子 2的 11、94和 12 4位碱基表现出多态性并在 3个猪种中检测到A、B、C和D 4个等位基因 ;χ2 适合性检验结果表明 ,小梅山、中梅山及大约克SLA DQB基因外显子 2在RsaⅠ酶切位点已经达到了Hardy 展开更多
关键词 小梅山 中梅山 大约克猪 SLA-DQB基因 外显子2 PCR-RFLP多态性分析 中国地方猪种
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北京油鸡和矮脚鸡心脏型、脂肪型脂肪酸结合蛋白基因多态性的研究 被引量:30
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作者 叶满红 曹红鹤 +3 位作者 文杰 李宏滨 陈继兰 赵桂萍 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期422-426,共5页
根据不同物种间同一基因核苷酸序列的保守性及相似性,设计特异性引物,利用聚合酶链式反应技术(PCR),扩增鸡心脏型脂肪酸结合蛋白(H FABP)基因第二内含子序列;根据已经发表的鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A FABP)基因mRNA序列,设计特异性引物... 根据不同物种间同一基因核苷酸序列的保守性及相似性,设计特异性引物,利用聚合酶链式反应技术(PCR),扩增鸡心脏型脂肪酸结合蛋白(H FABP)基因第二内含子序列;根据已经发表的鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A FABP)基因mRNA序列,设计特异性引物,扩增鸡A FABP基因第三内含子序列。选用HhaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ、BamHⅠ、EcoRⅠ、PstⅠ、XmnⅠ和HindⅢ8种限制性内切酶对扩增产物分别进行单酶切,发现H FABP基因第二内含子HhaⅠPCR RFLP及A FABP基因第三内含子HinfⅠPCR RFLP。 展开更多
关键词 北京油鸡 矮脚鸡 心脏型 脂肪型 脂肪酸 蛋白基因 多态性 聚合酶链式反应 特异性引物 内切酶
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猪资源家系MC4R基因扫描及其与脂肪性状的相关分析 被引量:41
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作者 刘桂兰 蒋思文 +2 位作者 熊远著 郑嵘 屈彦纯 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第6期497-501,共5页
黑素皮质激素受体 4 (Melanocortin 4Receptor,MC4R)是在人类肥胖研究中发现的重要调节因子 ,它可以与瘦蛋白 (Leptin)、神经肽Y(NeuropeptideY ,NPY)、α 黑素细胞刺激激素 (Alpha melanocyte stimulatinghormone ,α MSH)等一起调节... 黑素皮质激素受体 4 (Melanocortin 4Receptor,MC4R)是在人类肥胖研究中发现的重要调节因子 ,它可以与瘦蛋白 (Leptin)、神经肽Y(NeuropeptideY ,NPY)、α 黑素细胞刺激激素 (Alpha melanocyte stimulatinghormone ,α MSH)等一起调节动物体重和采食量。采用PCR RFLP技术 ,分析了MC4R基因部分片段在猪资源家系群体中的TaqⅠ酶切片段多态性分布。MC4R基因多态性与生长肥育性状、肉质性状、胴体性状的相关性分析的结果表明 ,MC4R基因型频率在不同品种群体中的分布不同 ;MC4R基因与猪胸腰椎间膘厚、臀部膘厚、平均背膘、眼肌宽度、眼肌面积、皮率呈显著性相关。MC4R基因主要以显性作用方式发挥作用 。 展开更多
关键词 猪资源家系MC4R 基因扫描 脂肪性状 相关分析 背膘厚
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鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与其体重的关系 被引量:25
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作者 欧阳建华 孙汉 +5 位作者 李海华 邱峰芳 柳小春 施启顺 王文君 林树茂 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期525-529,共5页
对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这... 对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这3种基因型的分布呈现显著差异(P<0 05)。分析这3种基因型与其体重的关系发现,这3种基因型对初生重、30日龄体重、60日龄体重、90日龄体重及120日龄体重影响差异均不显著(P>0 05),但体现出AA型有较高体重的趋势,公母表现出一致的规律。在万载康乐黄鸡中,均呈现出杂合优势,在8周龄及18周龄时差异不显著(P>0 05),而在12周龄表现为差异显著(P<0 05)。宁都三黄鸡公母基因型分布均符合哈代 温格伯定律,而万载康乐黄鸡基因型分布不符合哈代 温格伯定律。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子-1 IGF-1 基因 遗传多态性 体重 宁都三黄鸡 万载康乐黄鸡 PCR—RFLP 调控区 遗传 变异 基因型 哈代-温格伯定律 AA型
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IGF2基因PCR-RFLP多态性与脂肪沉积相关性状的关联分析 被引量:52
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作者 刘桂兰 蒋思文 +2 位作者 熊远著 郑嵘 屈彦纯 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第12期1107-1112,共6页
胰岛素样生长因子 2在胎儿生长发育、肿瘤细胞增殖、肌肉生长等方面具有重要的调控作用 ,是影响猪瘦肉量的主要候选基因。采用PCR RFLP技术 ,分析了IGF2基因第 8内含子部分片段在猪资源家系群体中的NciⅠ酶切片段多态性分布。IGF2基因... 胰岛素样生长因子 2在胎儿生长发育、肿瘤细胞增殖、肌肉生长等方面具有重要的调控作用 ,是影响猪瘦肉量的主要候选基因。采用PCR RFLP技术 ,分析了IGF2基因第 8内含子部分片段在猪资源家系群体中的NciⅠ酶切片段多态性分布。IGF2基因该片段具有两个NciⅠ酶切位点 (切点位于第 8内含子 ,分别记录为位点A和位点B) ,两位点在资源家系中均具有多态性。IGF2基因B位点酶切未突变个体均比酶切突变的个体背膘薄 18 2 8% (P<0 0 1) ,肥肉率低 2 2 4 3% (P <0 0 1) ,瘦肉率高 8 71% (P <0 0 1) ,位点A具有相同的影响趋势。在该研究群体中 ,IGF2基因发挥作用的方式主要为加性效应 。 展开更多
关键词 IGF2基因 PCR-RFLP 背膘厚
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牛TLR4基因的遗传多态性与乳房炎的关联分析 被引量:36
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作者 王兴平 许尚忠 +3 位作者 马腾壑 高雪 任红艳 陈金宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期120-124,共5页
TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共397头为研究对象,利用创造酶切位点PCR法扩增243 bp的目的片段,通过限制性内切酶HinfⅠ酶切来检测TLR4第3外... TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共397头为研究对象,利用创造酶切位点PCR法扩增243 bp的目的片段,通过限制性内切酶HinfⅠ酶切来检测TLR4第3外显子的多态性,结果发现扩增产物的27 bp处C到T的突变使得多态位点产生,编码的氨基酸由苏氨酸变为异亮氨酸。A、B 2个等位基因在3个群体中均有分布,A等位基因占优势(大于78%),经χ2适合性检验,三河牛在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。运用SAS 8.2软件采用最小二乘法拟合线性模型,将该基因座不同基因型与奶牛乳房炎进行了关联分析,结果表明:AA基因型为乳房炎抗性基因型(P<0.05),A等位基因为乳房炎抗性的有利基因。 展开更多
关键词 TLR4基因 CRS-PCR PCR-RFLP 乳房炎 体细胞数 体细胞评分
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