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奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌的PCR-16S rDNA鉴定及日粮的影响
被引量:
9
1
作者
巩庆亮
王振勇
+4 位作者
柴同杰
侯志高
贾玉东
王允田
马健
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1367-1372,共6页
设计9个精料梯度的日粮饲喂干乳期成年荷斯坦奶牛,并对其瘤胃液中的部分细菌进行了分离,PCR-16SrDNA鉴定和动态检测。结果显示,以瘤胃液为原料,采用人工培养基共分离到56株细菌,并对7株具代表性的细菌进行了PCR扩增,经序列同源性比较,...
设计9个精料梯度的日粮饲喂干乳期成年荷斯坦奶牛,并对其瘤胃液中的部分细菌进行了分离,PCR-16SrDNA鉴定和动态检测。结果显示,以瘤胃液为原料,采用人工培养基共分离到56株细菌,并对7株具代表性的细菌进行了PCR扩增,经序列同源性比较,最终把细菌鉴定为牛链球菌(A0625、A1212、0131)、蜡样芽孢杆菌(0113)、地衣芽孢杆菌(0091)、短小芽孢杆菌(0083)和嗜热链球菌(0123)。同时还发现随精料浓度的增加,牛链球菌、芽孢杆菌及嗜热链球菌的数量均呈不同程度的上升趋势。结果表明不同精料浓度的日粮对奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌有着不同程度的影响,其中对牛链球菌影响最大,从系统发育分析可知所分离细菌虽未形成新的细菌进化枝,但牛链球菌和嗜热链球菌的核苷酸序列仍发生了多处碱基突变。
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关键词
奶牛
瘤胃细菌
pcr-16s
rDNA鉴定
日粮影响
下载PDF
职称材料
草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析
被引量:
2
2
作者
段盛文
刘正初
+3 位作者
郭刚
冯湘沅
郑科
成莉凤
《湖北农业科学》
北大核心
2009年第9期2052-2054,2098,共4页
通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16~23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片...
通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16~23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析。结果表明,8株菌株分别属于地衣芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌;基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;AluⅠ、HinfⅠ、Sau3AⅠ、TaqⅠ4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0~4条100~440bp的酶切产物。
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关键词
草本纤维
产芽孢菌株
pcr-16s
RDNA
IT
s
-RFLP
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职称材料
题名
奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌的PCR-16S rDNA鉴定及日粮的影响
被引量:
9
1
作者
巩庆亮
王振勇
柴同杰
侯志高
贾玉东
王允田
马健
机构
山东农业大学动物医学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1367-1372,共6页
基金
山东农业大学2006年青年博士后基金项目(76211)
文摘
设计9个精料梯度的日粮饲喂干乳期成年荷斯坦奶牛,并对其瘤胃液中的部分细菌进行了分离,PCR-16SrDNA鉴定和动态检测。结果显示,以瘤胃液为原料,采用人工培养基共分离到56株细菌,并对7株具代表性的细菌进行了PCR扩增,经序列同源性比较,最终把细菌鉴定为牛链球菌(A0625、A1212、0131)、蜡样芽孢杆菌(0113)、地衣芽孢杆菌(0091)、短小芽孢杆菌(0083)和嗜热链球菌(0123)。同时还发现随精料浓度的增加,牛链球菌、芽孢杆菌及嗜热链球菌的数量均呈不同程度的上升趋势。结果表明不同精料浓度的日粮对奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌有着不同程度的影响,其中对牛链球菌影响最大,从系统发育分析可知所分离细菌虽未形成新的细菌进化枝,但牛链球菌和嗜热链球菌的核苷酸序列仍发生了多处碱基突变。
关键词
奶牛
瘤胃细菌
pcr-16s
rDNA鉴定
日粮影响
Keywords
cow
s
rumen bacteria
pcr-16s
rDNA identification
affected by the dietary
分类号
S811.6 [农业科学—畜牧学]
Q936 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析
被引量:
2
2
作者
段盛文
刘正初
郭刚
冯湘沅
郑科
成莉凤
机构
中国农业科学院麻类研究所
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2009年第9期2052-2054,2098,共4页
基金
国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21201-14)
文摘
通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16~23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析。结果表明,8株菌株分别属于地衣芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌;基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;AluⅠ、HinfⅠ、Sau3AⅠ、TaqⅠ4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0~4条100~440bp的酶切产物。
关键词
草本纤维
产芽孢菌株
pcr-16s
RDNA
IT
s
-RFLP
Keywords
herbaceou
s
s
poreformer
s
pcr-16s
rDNA
IT
s
-RFLP
分类号
Q939.124 [生物学—微生物学]
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌的PCR-16S rDNA鉴定及日粮的影响
巩庆亮
王振勇
柴同杰
侯志高
贾玉东
王允田
马健
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
9
下载PDF
职称材料
2
草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析
段盛文
刘正初
郭刚
冯湘沅
郑科
成莉凤
《湖北农业科学》
北大核心
2009
2
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职称材料
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