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小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析
1
作者
吴珂妍
千慧敏
+5 位作者
赵俊溢
李闯
路亚南
邢国珍
刘娜
郑文明
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期113-127,共15页
为挖掘小麦锈菌侵染过程中发挥关键作用的植物细胞壁降解酶(Plant cell wall-degrading enzymes,PCWDEs)基因,通过生物信息学方法对小麦3种锈菌(叶锈菌、条锈菌和秆锈菌)基因组中的碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes, CAZym...
为挖掘小麦锈菌侵染过程中发挥关键作用的植物细胞壁降解酶(Plant cell wall-degrading enzymes,PCWDEs)基因,通过生物信息学方法对小麦3种锈菌(叶锈菌、条锈菌和秆锈菌)基因组中的碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes, CAZymes)进行预测分析,在此基础上对其中的PCWDEs基因家族进行全基因组范围的筛选鉴定,并利用qRT-PCR方法对叶锈菌PCWDEs家族成员在侵染过程中的转录水平进行了检测分析。结果表明:1)小麦叶锈菌、条锈菌和秆锈菌基因组分别编码355、322和345个CAZymes家族成员基因以及160、153和158个PCWDEs基因;小麦3种锈菌共含75个保守CAZymes基因亚家族和94个PCWDEs直系同源基因簇。2)16个叶锈菌特异性PCWDEs基因在亲和(Pt15-‘中国春’)/非亲和(Pt15-‘云麦34’)互作过程中均受到不同程度的诱导表达,但非亲和互作中在侵染更早期就已受到诱导上调表达。3)叶锈菌特异性PCWDEs基因簇中有4个PCWDEs被鉴定为类扩展蛋白,其在侵染过程中受到诱导表达,说明类扩展蛋白可能在降解纤维素突破侵染屏障中发挥重要作用。综上,在小麦3种锈菌全基因组范围鉴定了PCWDEs基因,初步明确部分基因在锈菌侵染过程中的表达模式,PCWDEs可能在小麦锈菌致病过程中发挥重要作用。
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关键词
小麦锈菌
pcwdes
生物信息学分析
QRT-PCR
侵染机制
原文传递
题名
小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析
1
作者
吴珂妍
千慧敏
赵俊溢
李闯
路亚南
邢国珍
刘娜
郑文明
机构
河南农业大学生命科学学院
省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室
出处
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期113-127,共15页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1401000)
河南省重大科技专项(221100110100)
河南农业大学拔尖人才项目(30500924)。
文摘
为挖掘小麦锈菌侵染过程中发挥关键作用的植物细胞壁降解酶(Plant cell wall-degrading enzymes,PCWDEs)基因,通过生物信息学方法对小麦3种锈菌(叶锈菌、条锈菌和秆锈菌)基因组中的碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes, CAZymes)进行预测分析,在此基础上对其中的PCWDEs基因家族进行全基因组范围的筛选鉴定,并利用qRT-PCR方法对叶锈菌PCWDEs家族成员在侵染过程中的转录水平进行了检测分析。结果表明:1)小麦叶锈菌、条锈菌和秆锈菌基因组分别编码355、322和345个CAZymes家族成员基因以及160、153和158个PCWDEs基因;小麦3种锈菌共含75个保守CAZymes基因亚家族和94个PCWDEs直系同源基因簇。2)16个叶锈菌特异性PCWDEs基因在亲和(Pt15-‘中国春’)/非亲和(Pt15-‘云麦34’)互作过程中均受到不同程度的诱导表达,但非亲和互作中在侵染更早期就已受到诱导上调表达。3)叶锈菌特异性PCWDEs基因簇中有4个PCWDEs被鉴定为类扩展蛋白,其在侵染过程中受到诱导表达,说明类扩展蛋白可能在降解纤维素突破侵染屏障中发挥重要作用。综上,在小麦3种锈菌全基因组范围鉴定了PCWDEs基因,初步明确部分基因在锈菌侵染过程中的表达模式,PCWDEs可能在小麦锈菌致病过程中发挥重要作用。
关键词
小麦锈菌
pcwdes
生物信息学分析
QRT-PCR
侵染机制
Keywords
wheat rust fungi
pcwdes
bioinformatics
qRT-PCR
pathogenic mechanism
分类号
S512 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析
吴珂妍
千慧敏
赵俊溢
李闯
路亚南
邢国珍
刘娜
郑文明
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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