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海南原鸡PDCD10的克隆、表达及其蛋白的生物信息学分析 被引量:5
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作者 陈欢 陈品林 +8 位作者 杜丽 曹献英 成鹰 刘涛 雷明 吴科榜 王学梅 胡日查 王凤阳 《中国家禽》 北大核心 2010年第18期10-14,共5页
通过克隆、表达海南原鸡程序性细胞死亡分子10(Programmed cell death10,PDCD10)基因,对其蛋白进行生物信息学分析。采用RT-PCR方法克隆得到海南原鸡PDCD10基因CDS区,将扩增产物与原核表达载体pET42a连接,构建pET42a-PDCD10重组质粒,经I... 通过克隆、表达海南原鸡程序性细胞死亡分子10(Programmed cell death10,PDCD10)基因,对其蛋白进行生物信息学分析。采用RT-PCR方法克隆得到海南原鸡PDCD10基因CDS区,将扩增产物与原核表达载体pET42a连接,构建pET42a-PDCD10重组质粒,经IPTG诱导表达后,进行SDS-PAGE和Western blot分析;运用生物信息学软件对所获得基因的核苷酸序列进行分析,并预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等。克隆获得了PDCD10639bp的CDS区核苷酸序列,融合蛋白分子量约为57ku,生物信息学分析发现,PDCD10CDS区包括1个639bp的开放读码框,编码212个氨基酸。该蛋白不含信号肽,无跨膜区,二级结构中存在大量α-螺旋。研究结果为进一步开展海南原鸡PDCD10的功能研究奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 海南原鸡 pdcd10 克隆 表达 生物信息学分析
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miR103通过靶向PDCD10逆转顺铂诱导的前列腺癌细胞耐药 被引量:4
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作者 付晓亮 杨增悦 +1 位作者 舒涛 王东 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第4期511-515,共5页
目的:探讨miR103在前列腺癌细胞耐药中的作用及机制。方法:RT-PCR检测miR103在人前列腺癌细胞系PC-3、LNCap、22Rv1和DU145以及顺铂耐药细胞株PC-3/DDP、LNCap/DDP、22Rv1/DDP和DU145/DDP中的表达。以PC-3/DDP细胞系为研究对象,采用miR1... 目的:探讨miR103在前列腺癌细胞耐药中的作用及机制。方法:RT-PCR检测miR103在人前列腺癌细胞系PC-3、LNCap、22Rv1和DU145以及顺铂耐药细胞株PC-3/DDP、LNCap/DDP、22Rv1/DDP和DU145/DDP中的表达。以PC-3/DDP细胞系为研究对象,采用miR103 mimic或inhibitor转染细胞,流式细胞仪检测细胞凋亡,Western blotting和RT-PCR检测PDCD10的表达。采用PDCD10过表达载体转染过表达miR103的细胞,流式细胞仪检测细胞凋亡,Western blotting和RT-PCR检测细胞P糖蛋白(P-gp)的表达。结果:与亲本细胞系比较,miR103在顺铂耐药细胞系中低表达。上调miR103,顺铂诱导的细胞凋亡显著增加;下调miR103,顺铂诱导的细胞凋亡减少,但不具有显著性。过表达miR103,PDCD10的表达显著减少。转染PDCD10过表达载体显著减少miR103 mimic诱导的PC-3/DDP细胞凋亡,逆转了miR103 mimic对P-gp表达的抑制作用。结论:miR103通过靶向PDCD10抑制P-gp的表达逆转前列腺癌细胞耐药。 展开更多
关键词 miR103 pdcd10 P糖蛋白 前列腺癌
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MTDH和PDCD10在结直肠癌组织中的表达及临床意义 被引量:7
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作者 吴云 沙琳琳 《中国现代普通外科进展》 CAS 2017年第9期677-679,683,共4页
目的:探讨异黏蛋白(MTDH)和程序性死亡因子10(PDCD10)在结直肠癌组织中的水平及临床意义。方法:选取2014年12月—2015年12月55例结直肠癌和55例肠息肉患者。采用实时荧光定量技术(RT-PCR)检测MTDH和PDCD10。结果:经RT-PCR检测,结直肠癌... 目的:探讨异黏蛋白(MTDH)和程序性死亡因子10(PDCD10)在结直肠癌组织中的水平及临床意义。方法:选取2014年12月—2015年12月55例结直肠癌和55例肠息肉患者。采用实时荧光定量技术(RT-PCR)检测MTDH和PDCD10。结果:经RT-PCR检测,结直肠癌组织MTDH、PDCD10mRNA高于癌旁组织、肠息肉组织,差异有统计学意义(P<0.05);癌旁组织、肠息肉组织MTDH、PDCD10mRNA水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结直肠癌组织中MTDH、PDCD10 mRNA的水平在不同年龄、性别患者之间差异无统计学意义(P>0.05),随着患者恶性程度的增加,MTDH、PDCD10mRNA水平不断升高,结直肠癌组织中MTDH、PDCD10表达与患者TNM分期、是否伴肝转移、出现淋巴结转移有关(P<0.05)。Ⅲ~Ⅳ期、伴肝转移和淋巴结转移的结直肠癌患者,组织中MTDH、PDCD10表达高于Ⅰ~Ⅱ期、无肝转移和淋巴结转移的结直肠癌患者(P<0.05)。结直肠癌组织中MTDH的表达与PDCD10的表达呈正相关(r=0.409,P=0.012)。结论:结直肠癌组织中MTDH、PDCD10的表达高于正常组织和肠息肉组织。结直肠癌组织中MTDH、PDCD10与TNM分期、分化程度、远处转移及伴肝转移有关。 展开更多
关键词 结直肠癌 MTDH pdcd10 临床病理 相关性
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五指山小型猪PDCD10 cDNA的克隆及生物信息学分析
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作者 杜丽 荣辉 +6 位作者 张珈宁 侯冠彧 周汉林 郭莳雨 贾晓哓 史巧芸 王凤阳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第4期40-42,174,175,共5页
为了克隆五指山小型猪程序性死亡因子10(PDCD10)cDNA基因并进行生物信息学分析,试验以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR的方法,克隆得到PDCD10全长cDNA序列,运用生物信息学软件分析其核苷酸序列并预测其编码... 为了克隆五指山小型猪程序性死亡因子10(PDCD10)cDNA基因并进行生物信息学分析,试验以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR的方法,克隆得到PDCD10全长cDNA序列,运用生物信息学软件分析其核苷酸序列并预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等。结果表明:经比对分析发现,五指山小型猪PDCD10基因的核苷酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、牛、鸡、非洲爪蟾、斑马鱼、黑腹果蝇等具有较高的相似性。生物信息学分析结果表明,该cDNA序列全长1 250 bp,在序列3'末端有终止信号AATAAA。含636 bp(184~819 nt)的开放阅读框,编码212个氨基酸。该蛋白理论等电点(PI)及分子质量分别为7.80和24 701.57 u。 展开更多
关键词 五指山小型猪 CDNA文库 程序性死亡因子10(pdcd10) 克隆 序列分析
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针对药靶基因PDCD10和MST4抑制剂体外筛选方法的建立及化合物的筛选
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作者 张慧 黄卉 +2 位作者 李娜 杜培革 石太平 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1527-1532,1541,共7页
目的:以人程序性细胞死亡分子10(homo sapiens programmed cell death10,PDCD10)和Ste20激酶家族成员MST4(Mst3and SOK1-related kinase)为靶标,建立体外小分子抑制剂筛选方法。方法:将PDCD10和MST4的开放读码框插入到原核表达载体pGEX4... 目的:以人程序性细胞死亡分子10(homo sapiens programmed cell death10,PDCD10)和Ste20激酶家族成员MST4(Mst3and SOK1-related kinase)为靶标,建立体外小分子抑制剂筛选方法。方法:将PDCD10和MST4的开放读码框插入到原核表达载体pGEX4T-2,采用亲和层析纯化法纯化重组人GST-PDCD10和GST-MST4蛋白并通过Western blot进行鉴定。利用ELISA方法对重组蛋白进行活性检测。利用该ELISA方法对825个小分子化合物进行筛选,并通过其对Elk1通路的作用进行验证。结果:成功建立了针对药靶基因PDCD10和MST4抑制剂的体外筛选方法,筛选得到1个对PDCD10和MST4活性有抑制作用的化合物。结论:该方法具有较好的平行性和可重复性。筛选得到的化合物可以抑制PDCD10和MST4对Elk1通路的活化作用。 展开更多
关键词 pdcd10 MST4 抑制剂 ELISA Elk1信号通路
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CircBAGE2(hsa_circ_0061259)regulates CCND1 and PDCD10 expression by functioning as an miR-103a-3p‘sponge’to alter the proliferation and apoptosis of prostate cancer cells 被引量:2
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作者 Chunlei Zhang Dan Liu +3 位作者 Qinqin Tian Qi Yang Xiaoyuan Zi Yinghao Sun 《Oncology and Translational Medicine》 CAS 2021年第5期221-228,共8页
Objective The aim of the article is to explore the function of circBAGE2(hsa_circ_0061259)in prostate cancer(PCa)cells.Methods Sequencing results of circBAGE2 were verified by quantitative RT PCR(qRT-PCR)and Sanger se... Objective The aim of the article is to explore the function of circBAGE2(hsa_circ_0061259)in prostate cancer(PCa)cells.Methods Sequencing results of circBAGE2 were verified by quantitative RT PCR(qRT-PCR)and Sanger sequencing.Agarose gel electrophoresis was used to detect the resistance of GAPDH,BAGE2,and circBAGE2 to RNase R and their expression as cDNA and gDNAin 22RV1 cells.The biological functions of circBAGE2 were investigated by CCK8 assay and flow cytometry in 22RV1 cells transfected with siRNAs.Multiple databases were used to predict the target binding sites between circRNAs,miRNAs,and mRNAs.Western blotting was used to detect the expression of CCND1 and PDCD10.Results CircBAGE2 was significantly upregulated in PCa samples and PCa cells compared to that in matched normal tissues and normal cells,and CircBAGE2 knockdown inhibits cell proliferation and promotes apoptosis.Downregulation of circBAGE2 compromised the expression of CCND1 and PDCD10.The 3’UTRs of CCND1 and PDCD10 were matched by miR-103a-3p,which shared binding sites with circBAGE2.Conclusion CircBAGE2 contributes to PCa progression by upregulating CCND1 and PDCD10 expression through its role as a‘sponge’of miR-103a-3p.CircBAGE2 may be a potential therapeutic target for PCa. 展开更多
关键词 prostate cancer(PCa) circBAGE2 CCND1 pdcd10
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miR-206通过调控PDCD10抑制前列腺癌细胞增殖、侵袭和迁移 被引量:2
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作者 聂永莉 彭芳 +2 位作者 汤世敏 许涛 毛永荣 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1398-1404,共7页
目的:探讨miR-206通过调控程序性细胞死亡因子10(programmed cell death 10,PDCD10)对前列腺细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法:选取国药汉江医院手术切除的前列腺癌标本61例,另选40例良性前列腺增生组织作为对照,采用原位杂交检测miR-... 目的:探讨miR-206通过调控程序性细胞死亡因子10(programmed cell death 10,PDCD10)对前列腺细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法:选取国药汉江医院手术切除的前列腺癌标本61例,另选40例良性前列腺增生组织作为对照,采用原位杂交检测miR-206和PDCD10表达水平,分别分析miR-206和PDCD10的表达与前列腺癌患者临床病理参数间的关系;双荧光素酶实验检测miR-206和PDCD10在前列腺癌细胞中的相互作用;选取前列腺癌PC3细胞,分别转染miR-206 mimics+PDCD10pcDNA过表达载体、miR-206 mimics、PDCD10 pcDNA过表达载体、mimics NC组和mimics NC+PDCD10 pcDNA组。采用实时荧光定量PCR法检测PDCD10 mRNA的表达量,Western blot检测PDCD10蛋白的表达量;通过MTT、Transwell迁移和侵袭检测前列腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。结果:原位杂交实验染色显示,miR-206在前列腺癌组织中的阳性表达率(24.59%,15/61)明显低于良性前列腺增生组织的阳性表达率(87.5%,35/40)(χ2=38.248,P=0.000)。PDCD10在前列腺癌组织中的阳性表达率(73.77%,45/61)明显高于良性前列腺增生组织的阳性表达率(27.5%,11/40)(χ2=20.397,P=0.000)。miR-206与PDCD10均与TNM临床分期、Gleason评分等有关(P<0.05),与患者年龄、术前PSA水平等均无关(P>0.05)。线性回归与相关性分析发现,miR-206表达与PDCD10表达呈明显的负相关性(r=-0.9594,P<0.001)。miR-206 mimic与PDCD10野生型报告载体共转后,细胞中荧光素酶的活性降低(P<0.01)。miR-206 mimics组PDCD10 mRNA和蛋白表达水平最低。过表达miR-206可显著抑制PC3细胞的增殖、迁移和侵袭能力。过表达PDCD10可显著提高PC3细胞的增殖、迁移和侵袭能力,且过表达PDCD10可逆转miR-206对PC3细胞增殖、迁移和侵袭能力的抑制作用。结论:miR-206可抑制前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,其作用机制与靶向负调控PDCD10的表达有关。 展开更多
关键词 miR-206 程序性细胞死亡因子10 前列腺癌 增殖 侵袭 迁移
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siRNA敲低pdcd10基因表达可抑制人肝癌细胞增殖
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作者 郭志华 熊诗诗 +3 位作者 李海通 雒广渭 张瑞 张翔 《医学分子生物学杂志》 CAS 2018年第6期363-368,共6页
目的观察小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)抑制基因pdcd10表达后对肝癌细胞增殖能力的影响。方法设计针对pdcd10基因的siRNA,将实验细胞分为3组,siPDCD10#1组(转染PD-CD10-siRNAl)、siPDCD10舵组(转染PDCD10。siRNA2)、阴性对照... 目的观察小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)抑制基因pdcd10表达后对肝癌细胞增殖能力的影响。方法设计针对pdcd10基因的siRNA,将实验细胞分为3组,siPDCD10#1组(转染PD-CD10-siRNAl)、siPDCD10舵组(转染PDCD10。siRNA2)、阴性对照组(negative contr01)转染无关序列,采用脂质体Lipofectamine 2000将siRNA转染肝癌细胞系BEL-7404、SMMC-7721。qRT-PCR和Western印迹分别检测细胞pdcd10的mRNA和蛋白质水平变化;CCK-8实验检测增殖能力的改变;平板克隆实验检测单个细胞克隆形成能力;流式细胞术检测细胞周期变化。结果与阴性对照组相比,qRT-PCR和Western印迹结果显示PDCD10-siRNA能够下调pdcd10表达;CCK-8和平板克隆实验结果显示实验组细胞增殖能力下降(P<0.05);流式细胞术实验结果显示实验组细胞发生G0/G1期阻滞(P<0.05)。结论siRNA敲低pdcd10基因表达可显著抑制肝癌细胞增殖能力,pdcd10可能是肝癌治疗的潜在靶点之一。 展开更多
关键词 肝细胞癌 pdcd10 细胞增殖 SIRNA
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The multifaceted PDCD10/CCM3 gene 被引量:2
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作者 Mariaelena Valentino Elisabetta Dejana Matteo Malinverno 《Genes & Diseases》 SCIE 2021年第6期798-813,共16页
The programmed cell death 10(PDCD10)gene was originally identified as an apoptosis-related gene,although it is now usually known as CCM3,as the third causative gene of cerebral cavernous malformation(CCM).CCM is a neu... The programmed cell death 10(PDCD10)gene was originally identified as an apoptosis-related gene,although it is now usually known as CCM3,as the third causative gene of cerebral cavernous malformation(CCM).CCM is a neurovascular disease that is characterized by vascular malformations and is associated with headaches,seizures,focal neurological deficits,and cerebral hemorrhage.The PDCD10/CCM3 protein has multiple subcellular localizations and interacts with several multi-protein complexes and signaling pathways.Thus PDCD10/CCM3 governs many cellular functions,which include cell-to-cell junctions and cytoskeleton organization,cell proliferation and apoptosis,and exocytosis and angiogenesis.Given its central role in the maintenance of homeostasis of the cell,dysregulation of PDCD10/CCM3 can result in a wide range of altered cell functions.This can lead to severe diseases,including CCM,cognitive disability,and several types of cancers.Here,we review the multifaceted roles of PDCD10/CCM3 in physiology and pathology,with a focus on its functions beyond CCM. 展开更多
关键词 CANCER Cell signaling CELL-CYCLE Neurovascular unit pdcd10/CCM3
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程序性细胞死亡因子10抑制Ⅰ型干扰素表达并促进FMDV复制 被引量:2
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作者 曾宗波 马旭升 +2 位作者 罗志宽 齐亚银 郑海学 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期450-459,共10页
旨在探究宿主蛋白程序性细胞死亡因子10(programmed cell death factor 10,PDCD10)通过抑制Ⅰ型干扰素表达进而促进口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)的复制。首先,本研究验证了过表达和沉默PDCD10对FMDV复制的影响,接着... 旨在探究宿主蛋白程序性细胞死亡因子10(programmed cell death factor 10,PDCD10)通过抑制Ⅰ型干扰素表达进而促进口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)的复制。首先,本研究验证了过表达和沉默PDCD10对FMDV复制的影响,接着利用双荧光素酶报告系统探究PDCD10对Ⅰ型干扰素信号通路活化的影响,最后,利用实时荧光定量PCR探究PDCD10对Ⅰ型干扰素通路下游刺激基因(IFN-stimulated genes,ISGs)转录的影响。结果表明,过表达PDCD10显著促进FMDV的复制,沉默PDCD10显著抑制FMDV的复制。与对照相比,过表达PDCD10后感染仙台病毒(Sendai virus,SeV)的细胞培养液上清液显著促进FMDV复制,进一步,PDCD10显著抑制SeV诱导的IFN-β启动子以及NF-κB的激活且呈剂量依赖性,并且PDCD10负调控Ⅰ型干扰素通路信号分子转录,最后还发现PDCD10负调控Ⅰ型干扰素下游ISGs转录。本研究结果为深入探究PDCD10在抗病毒天然免疫中的作用积累了资料。 展开更多
关键词 程序性细胞死亡因子10 pdcd10 FMDV Ⅰ型干扰素信号通路 IFN-Β
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程序性细胞死亡因子10与肿瘤
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作者 朱晓妍(综述) 王德荣(审校) 《国际肿瘤学杂志》 CAS 2009年第6期419-421,共3页
程序性细胞死亡因子10(PDCD10)是一个在多种组织中保守表达的基因。研究表明,其具有细胞凋亡抑制功能及血管生成重建功能,且在多种肿瘤组织中表达明显上调,提示其可能在肿瘤的信号转导通路中起重要作用,并可能作为一个新的诊断肿... 程序性细胞死亡因子10(PDCD10)是一个在多种组织中保守表达的基因。研究表明,其具有细胞凋亡抑制功能及血管生成重建功能,且在多种肿瘤组织中表达明显上调,提示其可能在肿瘤的信号转导通路中起重要作用,并可能作为一个新的诊断肿瘤及预测预后的重要肿瘤学标志物应用于临床。 展开更多
关键词 肿瘤 细胞凋亡 新生血管化 病理性 pdcd10
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