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中国荷斯坦奶牛PDE10A基因多态性及其与乳品质性状的关联分析
1
作者
陈佳怡
李嘉灵
+5 位作者
刘娟
吴昊宸
范静
姜平
赵志辉
尹福泉
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1065-1071,共7页
旨在探究中国荷斯坦奶牛磷酸二酯酶10A(phosphodiesterase 10A,PDE10A)基因的多态性及其与奶牛乳品质性状的相关关系。对104头中国荷斯坦奶牛基因组DNA,采用PCR扩增技术获得PDE10A基因的目的片段,通过直接测序法筛选相关多态性位点,并...
旨在探究中国荷斯坦奶牛磷酸二酯酶10A(phosphodiesterase 10A,PDE10A)基因的多态性及其与奶牛乳品质性状的相关关系。对104头中国荷斯坦奶牛基因组DNA,采用PCR扩增技术获得PDE10A基因的目的片段,通过直接测序法筛选相关多态性位点,并将其与乳品质性状进行了关联分析。同时,应用Haploview 4.2软件对相关SNPs进行连锁不平衡分析获得单倍型,解析PDE10A基因单倍型与奶牛乳品质性状的关联性。研究结果发现,PDE10A基因内含子12、13中共检测出3个SNPs位点,其中I12-3228 A>G、I13-13 A>G位点与中国荷斯坦奶牛产奶量、乳脂肪、乳蛋白、乳糖、体细胞数、干物质含量及矫正奶量均呈显著相关(P<0.05)。H1H3单倍型的中国荷斯坦奶牛具有更高的产奶量以及较高的乳脂肪、乳蛋白及乳糖含量。本研究结果表明,PDE10A基因可作为影响中国荷斯坦奶牛产奶性状的候选基因用于动物育种的标记辅助选择。
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关键词
中国荷斯坦奶牛
pde10a基因
单核苷酸多态性
乳品质
原文传递
红鳍东方鲀低温胁迫应答主效QTL候选基因的表达特征分析
2
作者
朱理光
刘志峰
+6 位作者
马爱军
王新安
孙志宾
常浩文
刘圣聪
包玉龙
马得友
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2023年第6期74-82,共9页
红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)为暖温性、广温性鱼类,低温的冬季海水会对其生存造成很大影响,因此,选育具有抗寒性状的品系对其产业发展具有重要意义。本研究在利用QTL(quantitative trait locus)定位分析筛选出6个与红鳍东方鲀耐低温...
红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)为暖温性、广温性鱼类,低温的冬季海水会对其生存造成很大影响,因此,选育具有抗寒性状的品系对其产业发展具有重要意义。本研究在利用QTL(quantitative trait locus)定位分析筛选出6个与红鳍东方鲀耐低温相关的候选基因(tacc2、fsip1、exoc4、arhgap44a、pde10a和unc5b)的基础上,通过Real-time PCR检测这6个基因在低温胁迫下在肝脏、心脏和肾脏中表达量的变化。实验用鱼为课题组建立的同一家系的8月龄鱼,共设置3个温度梯度(8℃、13℃和18℃),8℃和13℃为低温组,18℃为对照组。结果显示,6个基因在不同温度下的3个组织中均有不同程度的表达。其中,pde10a基因在3个组织中的表达均呈先升高后下降的趋势;tacc2和exoc4基因在8℃组肝脏、肾脏以及心脏中的表达分别呈先下降再趋于稳定、先升高再趋于稳定和先上升后下降的趋势;unc5b基因在肝脏和心脏中的表达量较低,在低温组实验前期的肾脏中呈现高表达;arhgap44a基因在肝脏中的表达呈上升趋势,在心脏和肾脏中整体表达无明显变化;fsip1基因在肝脏中的表达呈下降趋势,在心脏和肾脏中的表达呈先上升后下降的趋势。这6个基因在红鳍东方鲀组织中均随着时间和温度变化具有差异性表达,在低温胁迫下呈现积极响应,表明这6个QTL候选基因在红鳍东方鲀低温适应中具有潜在的重要作用。本研究可为红鳍东方鲀耐低温相关信号通路研究以及耐低温品种选育提供理论依据。
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关键词
红鳍东方鲀
pde10a基因
tacc2
基因
unc5b
基因
exoc4
基因
arhgap44
a基因
fsip1
基因
低温胁迫
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题名
中国荷斯坦奶牛PDE10A基因多态性及其与乳品质性状的关联分析
1
作者
陈佳怡
李嘉灵
刘娟
吴昊宸
范静
姜平
赵志辉
尹福泉
机构
广东海洋大学滨海农业学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1065-1071,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(32072717,32002165)
广东省自然科学基金资助项目(2021A515010867)
广东海洋大学2021年校级教育教学改革资助项目(010201052106)
文摘
旨在探究中国荷斯坦奶牛磷酸二酯酶10A(phosphodiesterase 10A,PDE10A)基因的多态性及其与奶牛乳品质性状的相关关系。对104头中国荷斯坦奶牛基因组DNA,采用PCR扩增技术获得PDE10A基因的目的片段,通过直接测序法筛选相关多态性位点,并将其与乳品质性状进行了关联分析。同时,应用Haploview 4.2软件对相关SNPs进行连锁不平衡分析获得单倍型,解析PDE10A基因单倍型与奶牛乳品质性状的关联性。研究结果发现,PDE10A基因内含子12、13中共检测出3个SNPs位点,其中I12-3228 A>G、I13-13 A>G位点与中国荷斯坦奶牛产奶量、乳脂肪、乳蛋白、乳糖、体细胞数、干物质含量及矫正奶量均呈显著相关(P<0.05)。H1H3单倍型的中国荷斯坦奶牛具有更高的产奶量以及较高的乳脂肪、乳蛋白及乳糖含量。本研究结果表明,PDE10A基因可作为影响中国荷斯坦奶牛产奶性状的候选基因用于动物育种的标记辅助选择。
关键词
中国荷斯坦奶牛
pde10a基因
单核苷酸多态性
乳品质
Keywords
Chinese Holstein dairy cows
pde
10
Agene
single nucleotide polymorphism
milk quality
分类号
S823.9 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
红鳍东方鲀低温胁迫应答主效QTL候选基因的表达特征分析
2
作者
朱理光
刘志峰
马爱军
王新安
孙志宾
常浩文
刘圣聪
包玉龙
马得友
机构
大连海洋大学水产与生命学院
中国水产科学研究院黄海水产研究所山东省海洋渔业生物技术与遗传育种重点实验室青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室
海洋生物学与生物技术功能实验室
唐山牧海水产养殖有限公司
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2023年第6期74-82,共9页
基金
国家重点研发计划子课题(2018YFD0900301-12)
国家重点研发计划子课题(2018YFD0900102-5)
+2 种基金
国家自然科学基金项目(32002362)
山东省自然科学基金(ZR2019BC089)
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2020TD25)共同资助。
文摘
红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)为暖温性、广温性鱼类,低温的冬季海水会对其生存造成很大影响,因此,选育具有抗寒性状的品系对其产业发展具有重要意义。本研究在利用QTL(quantitative trait locus)定位分析筛选出6个与红鳍东方鲀耐低温相关的候选基因(tacc2、fsip1、exoc4、arhgap44a、pde10a和unc5b)的基础上,通过Real-time PCR检测这6个基因在低温胁迫下在肝脏、心脏和肾脏中表达量的变化。实验用鱼为课题组建立的同一家系的8月龄鱼,共设置3个温度梯度(8℃、13℃和18℃),8℃和13℃为低温组,18℃为对照组。结果显示,6个基因在不同温度下的3个组织中均有不同程度的表达。其中,pde10a基因在3个组织中的表达均呈先升高后下降的趋势;tacc2和exoc4基因在8℃组肝脏、肾脏以及心脏中的表达分别呈先下降再趋于稳定、先升高再趋于稳定和先上升后下降的趋势;unc5b基因在肝脏和心脏中的表达量较低,在低温组实验前期的肾脏中呈现高表达;arhgap44a基因在肝脏中的表达呈上升趋势,在心脏和肾脏中整体表达无明显变化;fsip1基因在肝脏中的表达呈下降趋势,在心脏和肾脏中的表达呈先上升后下降的趋势。这6个基因在红鳍东方鲀组织中均随着时间和温度变化具有差异性表达,在低温胁迫下呈现积极响应,表明这6个QTL候选基因在红鳍东方鲀低温适应中具有潜在的重要作用。本研究可为红鳍东方鲀耐低温相关信号通路研究以及耐低温品种选育提供理论依据。
关键词
红鳍东方鲀
pde10a基因
tacc2
基因
unc5b
基因
exoc4
基因
arhgap44
a基因
fsip1
基因
低温胁迫
Keywords
Takifugu rubripes
pde
10a
tacc2
unc5b
exoc4
arhgap44a
fsip1
Low temperature stress
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国荷斯坦奶牛PDE10A基因多态性及其与乳品质性状的关联分析
陈佳怡
李嘉灵
刘娟
吴昊宸
范静
姜平
赵志辉
尹福泉
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
2
红鳍东方鲀低温胁迫应答主效QTL候选基因的表达特征分析
朱理光
刘志峰
马爱军
王新安
孙志宾
常浩文
刘圣聪
包玉龙
马得友
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2023
0
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