PDGFA 在鼻咽癌中的差异表达及其功能分析

目的探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor subunit A,PDGFA)在鼻咽癌中的差异表达和可能的功能作用。方法利用基因芯片数据库(GEO数据库)中的基因表达谱数据,通过GEO2R在线分析工具分析PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组织与鼻咽癌组织中的差异表达情况,并通过STRING数据库和DAVID数据库分析该基因及其相关基因的功能作用,最后通过GCBI在线实验室分析其可能参与的共表达调控网络,并预测其转录调控因子。结果发现PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组织与鼻咽癌组织中具有差异表达。PDGFA基因及其相关基因功能富集分析发现,它们共同参与了12个生物学过程、4个细胞组分、3个分子功能和11个信号通路,并在肿瘤的发生、发展和转移过程中均具有显著的富集作用,如MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路、细胞增殖的正调控、细胞迁移的正调控、黏着、ERK1和ERK2级联的正调节、蛋白质自磷酸化的正调控等。另基因共表达调控网络和转录因子预测发现,PDGFA基因与许多基因、蛋白、转录因子以及microRNA具有相互作用。结论PDGFA可能通过多种途径,如细胞增殖和迁移的正调控、信号转导、蛋白质自磷酸化以及分子间的相互作用等参与鼻咽癌的发生、发展和迁移。

梅花鹿鹿茸组织PDGFA基因cDNA克隆及序列分析

为了探讨PDGFA基因的结构和功能,采用RT-PCR方法获得梅花鹿PDGFA基因,并运用生物信息学软件对其序列进行了分析。结果表明:梅花鹿PDGFA基因开放阅读框大小为591 bp,共编码196个氨基酸,蛋白的分子质量约为22 ku,理论等电点(pI)为8.53,是亲水性蛋白,具有信号肽。二级结构分析显示,含有47.45%无规则卷曲、39.29%α-螺旋、13.27%扩展链。进化分析显示,PDGFA蛋白与白尾鹿(Odocoileus virginianus texanus)、家牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)、野猪(Sus scrofa)、白犀牛(Ceratotherium simum)、小鼠(Mus musculus)、密西西比鳄(Alligator mississippiensis)、原鸡(Gallus gallus)、绒啄木鸟(Picoides pubescens)的蛋白质序列相似度分别为98%、97%、96%、94%、93%、89%、81%、79%、78%。

东北狍PDGFA基因cDNA克隆及表达分析

为了研究血小板衍生生长因子A（PDGFA）基因在狍茸生长发育中的调控作用,试验采用分子克隆技术得到PDGFA基因全部编码区的cDNA序列并结合生物信息学方法进行分析。结果表明：获得的东北狍PDGFA基因cDNA长度为653 bp,其中包括594 bp的开放阅读框（ORF）,编码197个氨基酸。PDGFA基因编码蛋白为不稳定蛋白,相对分子质量为22 259.65,等电点为8.53,具备信号肽,属于分泌性蛋白。蛋白质二级结构由α-螺旋、扩展链及无规则卷曲结构组成。通过构建系统进化树发现,狍与白尾鹿亲缘关系最近,与野牦牛、水牛、野猪、绵羊的亲缘关系较近,与原鸡、人、褐家鼠、斑马鱼的亲缘关系较远。实时荧光定量PCR分析显示,PDGFA基因在狍茸顶端组织不同组织层表达存在差异,其中前软骨层和软骨层的相对表达量显著高于皮肤层和间充质层（P〈0.05）。

雌雄驯鹿茸顶端茸皮组织PDGFA基因克隆及表达分析

为探索驯鹿(Rangifer tarandus)PDGFA基因的生物学特性及在雌、雄鹿茸顶端茸皮组织表达量的差异,试验取驯鹿顶端茸皮组织,利用RT-PCR和克隆技术获得PDGFA基因的cDNA序列,并将其编码的氨基酸序列与其他物种进行同源性比对,构建系统进化树,对PDGFA基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,利用qPCR技术检测雌雄驯鹿茸皮组织中PDGFA基因表达量的差异。结果表明:驯鹿PDGFA基因CDS区序列全长为591 bp,共编码196个氨基酸;PDGFA蛋白是相对分子质量为22 146.49的中性蛋白质,其二级结构主要以无规则卷曲为主;PDGFA基因氨基酸序列与其他物种同源性在89%~100%之间,其中与白尾鹿同源性高达100%;驯鹿与白尾鹿亲缘关系最近,其次为马鹿、山羊,与原鸡的亲缘关系最远;雄鹿茸皮组织中PDGFA基因的表达量是雌鹿的(91.978±19.132)倍。说明PDGFA基因在近缘物种间高度保守,在雌雄鹿茸生长发育中的生物学作用可能存在差异。

乌司他丁和泰索帝对人原代乳腺癌细胞增殖、侵袭及细胞因子IGF-1R、PDGFA和PAFR表达的影响

目的探讨乌司他丁(Ulinastatin,UTI)和泰索帝(Taxotere,TXT)对人原代乳腺癌细胞增殖、侵袭及胰岛素样生长因子受体1(Insulin-like growth factor 1 receptor,IGF-1R)、血小板衍生因子A(Platelet-derived growth factor A,PDGFA)和血小板活化因子受体(Platelet-activating factor receptor,PAFR)表达的影响。方法将原代培养的乳腺癌细胞分为4组:UTI组(800 IU/ml)、TXT组(3.7μg/ml)、UTI+TXT组和培养液对照组,MTT法检测细胞的增殖活力;Transwell小室法检测细胞的侵袭能力;流式细胞仪检测细胞凋亡情况;RT-PCR和Western blot检测细胞中IGF-1R、PDGFA及PAFR基因mRNA的转录水平及蛋白的表达水平。结果 UTI和TXT均可显著抑制人原代乳腺癌细胞的增殖和侵袭能力,诱导细胞凋亡,下调细胞中IGF-1R、PDGFA及PAFR基因mRNA的转录水平和蛋白的表达水平,且UTI与TXT联合使用时效果更为明显。结论 UTI能够增强TXT对人原代乳腺癌细胞的抑制作用,二者具有协同效应,这种机制可能与UTI影响IGF-1R、PDGFA和PAFR的表达有关。

血小板衍生因子A的生理功能研究进展

血小板衍生因子A(platele-derived growth factor A,PDGFA)是PDGF家族中的一种多肽,具有促进细胞生长、刺激细胞与细胞间质相互作用、影响毛囊生长的功能。从PDGFA的蛋白结构、主要基因表达通路Wnt、SHH、BMP和在皮肤、肺部以及绒毛生长中的作用进行综述,探讨PDGFA在毛囊生长和周期维持中发挥的重要作用,以期为进一步研究绒毛生长机理提供参考。