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高氧诱导miRNA差异性表达介导新生大鼠的肺损伤
1
作者
王丽娜
章容
+3 位作者
康兰
雷小平
何红霞
董文斌
《中国组织工程研究》
CAS
北大核心
2023年第11期1692-1700,共9页
背景:支气管肺发育不良主要的病理特征是肺发育停滞和较轻微的组织结构损伤,胎儿肺发育需经历5个时期,到囊状期的胎儿生后才可能存活,因此,早产、高氧诱导支气管肺发育不良的发病机制研究重点关注了囊状期和肺泡期。目的:探讨2个发育阶...
背景:支气管肺发育不良主要的病理特征是肺发育停滞和较轻微的组织结构损伤,胎儿肺发育需经历5个时期,到囊状期的胎儿生后才可能存活,因此,早产、高氧诱导支气管肺发育不良的发病机制研究重点关注了囊状期和肺泡期。目的:探讨2个发育阶段——囊状期和肺泡期中起调控作用的差异miRNA在高氧相关的支气管肺发育不良中的作用。方法:将新生SD大鼠随机分为4组:0 d组(n=10)出生后即取肺组织;4,7,14 d组均设置2个亚组,高氧组(n=10)出生后进入持续高氧环境中(氧浓度85%-90%),分别于4,7,14 d后取肺组织,空气组(n=10)出生后进入空气环境中(吸入氧浓度21%),分别于4,7,14 d后取肺组织。采用miRNA-Seq技术获取肺组织miRNA并建库,Illumina平台测序,Deseq2(Version 1.10.1)、Venn图组间比较依次筛选DEmiRs,GO富集、PPI分析预测差异表达的miRNAs靶蛋白。结果与结论:①0 d组有633个miRNA,4,7,14 d组中的高氧亚组分别有609,614,584个miRNA,空气亚组分别有629,608,581个miRNA;②在出生0-4 d(囊状期)、4-7 d、4-14 d(肺泡期)时,高氧组分别获得130,3,114个差异表达的miRNAs,空气组分别获得106,0,111个差异表达的miRNAs,各时期两组均差异表达的miRNAs分别为91,0,79个;③在囊状期和肺泡期,高氧组新生鼠肺组织中miR-34a-5p、miR-21-5p显著表达,miR-34a-5p靶蛋白有198个,围绕PDGFRB/PDGFRA/NGFR;miR-21-5p靶蛋白302个,围绕MAPK1/STAT3;④结果显示,miR-34a-5p、miR-21-5p各自在囊状期和肺泡期受高氧诱导显著表达,分别调控靶蛋白PDGFRB/PDGFRA/NGFR、MAPK1/STAT3,介导阶段性肺发育过程的信号通路,参与支气管肺发育不良的发生发展。
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关键词
支气管发育不良
miRNA高通量测序
miRNA-21-5p
miR-34a-5p
MAPK1/STAT3
pdgfrb/pdgfra/ngfr
下载PDF
职称材料
嗜酸性粒细胞增多患者的细胞遗传学和分子生物学特征的研究
被引量:
11
2
作者
曲士强
艾小菲
+5 位作者
李承文
李庆华
徐泽锋
秦铁军
张悦
肖志坚
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期1216-1220,共5页
本研究旨在探讨嗜酸性粒细胞增多患者的细胞遗传学和分子生物学特征。通过间期荧光原位杂交(FISH)和逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)的方法对79例嗜酸性粒细胞增多(嗜酸性粒细胞计数≥1.5×109/L)患者的PDGFRA/B和FGFR1基因重排进行检...
本研究旨在探讨嗜酸性粒细胞增多患者的细胞遗传学和分子生物学特征。通过间期荧光原位杂交(FISH)和逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)的方法对79例嗜酸性粒细胞增多(嗜酸性粒细胞计数≥1.5×109/L)患者的PDGFRA/B和FGFR1基因重排进行检测,并对44例患者的T细胞受体(TCR)基因重排进行了检测。结果显示:79例患者中检出FIP1L1/PDGFRA(F/P)融合基因阳性19例,检出CHIC2缺失19例,检出PDGFRB基因重排4例,未检测到FGFR1基因重排患者。按照2008年WHO分类修订诊断后,有42%(20/48)的高嗜酸性粒细胞综合征(HES)和83%(5/6)的慢性嗜酸性粒细胞白血病(CEL)患者更正诊断为伴PDGFRA/B重排的髓系肿瘤,17%(1/6)的CEL更正诊断为慢性嗜酸性粒细胞白血病,非特指型(CEL-NOS)。染色体核型分析检出克隆性细胞遗传学异常4例,1例为CEL-NOS,3例为伴PDGFRB重排的髓系肿瘤,所有21例伴PDGFRA重排的患者均未检测出4q12异常。伴PDGFRA/B重排的髓系肿瘤、HES和继发性嗜酸性粒细胞增多3组患者的克隆性TCR基因重排检出率分别为33%(5/15)、40%(6/15)和36%(5/14),3组间无明显差异。结论:在既往诊断HES和CEL的患者中存在较高比例的PDGFRA/B基因重排,通过间期FISH和PCR方法可以提高伴PDGFRA/B重排的髓系肿瘤的诊断。
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关键词
嗜酸性粒细胞增多
FIP1L1-
pdgfra
融合基因
pdgfrb
基因
FGFR1基因
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职称材料
题名
高氧诱导miRNA差异性表达介导新生大鼠的肺损伤
1
作者
王丽娜
章容
康兰
雷小平
何红霞
董文斌
机构
西南医科大学附属医院新生儿科
出处
《中国组织工程研究》
CAS
北大核心
2023年第11期1692-1700,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(81571480),项目名称:去乙酰化酶SIRT1的SDMO修饰与早产儿高氧肺损伤的临床实验分析,项目负责人:董文斌。
文摘
背景:支气管肺发育不良主要的病理特征是肺发育停滞和较轻微的组织结构损伤,胎儿肺发育需经历5个时期,到囊状期的胎儿生后才可能存活,因此,早产、高氧诱导支气管肺发育不良的发病机制研究重点关注了囊状期和肺泡期。目的:探讨2个发育阶段——囊状期和肺泡期中起调控作用的差异miRNA在高氧相关的支气管肺发育不良中的作用。方法:将新生SD大鼠随机分为4组:0 d组(n=10)出生后即取肺组织;4,7,14 d组均设置2个亚组,高氧组(n=10)出生后进入持续高氧环境中(氧浓度85%-90%),分别于4,7,14 d后取肺组织,空气组(n=10)出生后进入空气环境中(吸入氧浓度21%),分别于4,7,14 d后取肺组织。采用miRNA-Seq技术获取肺组织miRNA并建库,Illumina平台测序,Deseq2(Version 1.10.1)、Venn图组间比较依次筛选DEmiRs,GO富集、PPI分析预测差异表达的miRNAs靶蛋白。结果与结论:①0 d组有633个miRNA,4,7,14 d组中的高氧亚组分别有609,614,584个miRNA,空气亚组分别有629,608,581个miRNA;②在出生0-4 d(囊状期)、4-7 d、4-14 d(肺泡期)时,高氧组分别获得130,3,114个差异表达的miRNAs,空气组分别获得106,0,111个差异表达的miRNAs,各时期两组均差异表达的miRNAs分别为91,0,79个;③在囊状期和肺泡期,高氧组新生鼠肺组织中miR-34a-5p、miR-21-5p显著表达,miR-34a-5p靶蛋白有198个,围绕PDGFRB/PDGFRA/NGFR;miR-21-5p靶蛋白302个,围绕MAPK1/STAT3;④结果显示,miR-34a-5p、miR-21-5p各自在囊状期和肺泡期受高氧诱导显著表达,分别调控靶蛋白PDGFRB/PDGFRA/NGFR、MAPK1/STAT3,介导阶段性肺发育过程的信号通路,参与支气管肺发育不良的发生发展。
关键词
支气管发育不良
miRNA高通量测序
miRNA-21-5p
miR-34a-5p
MAPK1/STAT3
pdgfrb/pdgfra/ngfr
Keywords
bronchopulmonary dysplasia
microRNA high-throughput sequencing
miRNA-21-5p
miR-34a-5p
MAPK1/START3
pdgfrb/pdgfra/ngfr
分类号
R459.9 [医药卫生—治疗学]
R319 [医药卫生—基础医学]
R722 [医药卫生—儿科]
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职称材料
题名
嗜酸性粒细胞增多患者的细胞遗传学和分子生物学特征的研究
被引量:
11
2
作者
曲士强
艾小菲
李承文
李庆华
徐泽锋
秦铁军
张悦
肖志坚
机构
中国医学科学院
中国医学科学院
中国医学科学院
中国医学科学院
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期1216-1220,共5页
基金
科技部国际合作项目(编号2010DFB30270)
天津市自然科学基金重点项目(编号12JCZDJC23900)
+1 种基金
卫生公益性行业科研专项经费项目(编号201202017)
国家科技重大专项(编号2011ZX09302-007-04)
文摘
本研究旨在探讨嗜酸性粒细胞增多患者的细胞遗传学和分子生物学特征。通过间期荧光原位杂交(FISH)和逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)的方法对79例嗜酸性粒细胞增多(嗜酸性粒细胞计数≥1.5×109/L)患者的PDGFRA/B和FGFR1基因重排进行检测,并对44例患者的T细胞受体(TCR)基因重排进行了检测。结果显示:79例患者中检出FIP1L1/PDGFRA(F/P)融合基因阳性19例,检出CHIC2缺失19例,检出PDGFRB基因重排4例,未检测到FGFR1基因重排患者。按照2008年WHO分类修订诊断后,有42%(20/48)的高嗜酸性粒细胞综合征(HES)和83%(5/6)的慢性嗜酸性粒细胞白血病(CEL)患者更正诊断为伴PDGFRA/B重排的髓系肿瘤,17%(1/6)的CEL更正诊断为慢性嗜酸性粒细胞白血病,非特指型(CEL-NOS)。染色体核型分析检出克隆性细胞遗传学异常4例,1例为CEL-NOS,3例为伴PDGFRB重排的髓系肿瘤,所有21例伴PDGFRA重排的患者均未检测出4q12异常。伴PDGFRA/B重排的髓系肿瘤、HES和继发性嗜酸性粒细胞增多3组患者的克隆性TCR基因重排检出率分别为33%(5/15)、40%(6/15)和36%(5/14),3组间无明显差异。结论:在既往诊断HES和CEL的患者中存在较高比例的PDGFRA/B基因重排,通过间期FISH和PCR方法可以提高伴PDGFRA/B重排的髓系肿瘤的诊断。
关键词
嗜酸性粒细胞增多
FIP1L1-
pdgfra
融合基因
pdgfrb
基因
FGFR1基因
Keywords
eosinophilia
FIP1L1-
pdgfra
fusion gene
pdgfrb
gene
FGFR1 gene
分类号
R557.3 [医药卫生—血液循环系统疾病]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高氧诱导miRNA差异性表达介导新生大鼠的肺损伤
王丽娜
章容
康兰
雷小平
何红霞
董文斌
《中国组织工程研究》
CAS
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
嗜酸性粒细胞增多患者的细胞遗传学和分子生物学特征的研究
曲士强
艾小菲
李承文
李庆华
徐泽锋
秦铁军
张悦
肖志坚
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012
11
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