慢性髓系白血病PDLIM4基因表达与其启动子甲基化水平的关系

目的:分析慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)患者PDLIM4(PDZ and LIM domain 4)基因转录本表达状况、启动子高甲基化改变及临床相关性。方法:应用实时定量PCR(RQ-PCR)及实时定量甲基化特异性PCR(RQ-MSP)技术分别检测CML患者PDLIM4基因转录本及启动子甲基化水平。结果:8/36例(22%)CML患者存在PDLIM4低表达,低表达率与21例对照组间差异有统计学意义(P=0.021);PDLIM4表达水平和CML患者bcr/abl融合基因转录本正相关(r=0.434,P=0.043)。13/59例(22%)CML患者出现PDLIM4启动子高甲基化改变,而24例对照未显示高甲基化,两组差异有统计学意义(P=0.016)。PDLIM4高甲基化与患者血液学相关参数无明显相关性。PDLIM4启动子高甲基化频率随疾病进展而增高,在慢性期、加速期及急变期中分别为16%(7/44)、33%(2/6)及44%(4/9)。结论:PDLIM4基因启动子甲基化改变可能与CML的疾病发展有关。

PDLIM4基因对胶质瘤预后及胶质瘤细胞放射敏感性的影响

目的 分析PDLIM4（PDZ and LIM domain 4）基因与胶质瘤预后及放射敏感性的影响.方法 应用生物信息学技术对GSE53733芯片进行分析得出差异性表达基因,并使用免疫印迹法（Western blot）检测PDLIM4蛋白表达,实时荧光定量PCR、siRNA、MTT、流式细胞法检测、X射线照射等方法研究PDLIM4基因对胶质瘤预后及胶质瘤细胞照射敏感的相关性.结果 生物信息学分析结果提示PDLIM4在芯片中表达差异最明显（logFC=1.055897,P〈0.05）.通过40例胶质瘤的qPCR结果证实PDLIM4在高级别与低级别胶质瘤中差异表达（t=4.44,P〈0.05）,并与患者生存时间具有相关性（χ^2=5.52,P〈0.05）,且PDLIM4基因与胶质瘤细胞的放射敏感性相关（t=35.99,P〈0.05）.结论 PDLIM4基因表达水平与胶质瘤恶性程度及预后相关,并参与了细胞的X射线抵抗.

人PDLIM4基因启动子报告基因载体的构建及其在人类肿瘤细胞中的表达

目的构建人PDLIM4基因启动子荧光素酶报告基因重组质粒pGL3-promoter,检测其在不同肿瘤细胞中的表达。方法据Genebank中人PDLIM4基因启动子序列分别设计上下游引物,扩增其启动子片段,并插入到pGL3-Basic报告基因载体,分别得到含有3kb和1.2kb的PDLIM4基因启动子的两个报告基因质粒pGL3-PD-LIM4-3kb和pGL3-PDLIM4-1.2kb。序列为1.2kb的启动子利用Erase-a-base试剂盒,经外切酶Ⅲ从5'端逐步酶切得到5个含不同长度启动子序列的报告基因载体:pGL3-PDLIM4-1.2D1、pGL3-PDLIM4-1.2D2、pGL3-PDLIM4-1.2D3、pGL3-PDLIM4-1.2D4、pGL3-PDLIM4-1.2D5。将构建的报告基因载体分别瞬时转染以下细胞株:Hela、MDA-MB231、KB、PC-3、LNCaP,检测其荧光素酶表达活性。结果所构建质粒经酶切、测序鉴定,其片段长度及序列均正确。转染结果显示,长片段的3kb和1.2kb启动子序列在所测试的细胞株中均有表达,但在人激素非依赖前列腺癌PC-3细胞株、人激素依赖前列腺癌LINCaP细胞株中表达较低。而不同长度的启动子报告基因质粒转染PC-3、LNCaP的结果显示,pGL3-PDLIM4-1.2kb表达活性最强,pGL3-PDLIM4-970bp表达活性最弱。结论成功构建了7个分别含有不同长度的PDLIM4启动子报告基因载体,其在不同的肿瘤细胞株中均有不同程度的表达,而在前列腺癌细胞中表达较低。

抑癌基因PDLIM4在前列腺癌细胞中的差异表达

目的探讨PDLIM4基因在正常前列腺上皮细胞(RWPE1)、前列腺癌细胞(PC-3、DU145、LNCaP)、前列腺癌多药耐药细胞(PC-3/Doc)及其他耐药细胞(K562/A02、H460/Doc)中的差异表达。方法采用定量PCR(qPCR)、Western blot、免疫荧光等方法检测PDLIM4基因在各种细胞株中的表达;利用Western blo和DNA甲基转移酶(DNMTs)活性检测分析细胞中DNMTs的表达及活性。结果 PDLIM4基因在RWPE1高表达,在DU145、LNCaP细胞中基本无表达,在前列腺癌PC-3细胞中表达甚低,而在与其对应的多药耐药PC-3/Doc细胞中高表达(P<0.05),并且在耐药细胞株中的高表达具有组织特异性。DNMTs在RWPE1表达水平低于前列腺癌细胞,但在PC-3和PC-3/Doc中无差异。酶活性分析表明,PC-3/Doc中DNMTs的活性低于PC-3细胞(P<0.05)。结论 PDLIM4基因在前列腺癌细胞中低表达,这种特异性的在前列腺癌耐药细胞中表达显著上调可能是由DNMTs活性降低所致。