基于Perl语言的序列同源性分析过程自动化的实现

Perl语言已经成为用于生物信息学应用程序开发最流行的语言。为了简化本地的序列同源性分析过程,作者基于Perl语言设计开发了序列同源性分析的自动化程序,该程序具有无需编译、可移植性好、简单易用等优点,大大提高了工作效率,充分体现了Perl语言在生物信息学研究中所具备的优势。

Perl语言在群机系统中的应用

Perl语言是实用性很强的一门程序设计语言。本文介绍了Perl语言的特点、功能,以及Perl 语言的效率问题。另外,还讨论了该语言在群机系统领域,特别是系统管理软件中的重要应用。

Perl语言环境下生物信息学的数据库技术

生物信息学是一个集成了生物学、数学和计算机科学的新兴学科.而Perl语言是一种在生物信息学研究领域功能强大的脚本语言.本文综述了在Perl语言环境下应用于生物信息学的数据库技术以及互联网应用.

Perl语言环境下XML文档解析方法

数据准备是生物信息学研究中的重要步骤,数据准备过程中常常需要进行复杂的数据解析。本文详尽地描述了在Perl语言环境下如何利用XML::Smart模块对NCBI发布的同源基因数据集HomoloGene进行解析提取其中目标数据的方法及其技巧。对单个XML项目用对象实例->{‘项目名’}解析;对同层有多个项目的情况用对象数组解析。

使用perl语言生成高质量结构工程计算书的方法

为了解决基于MS word程序生成的结构计算书排版质量不佳的问题,使用perl语言结合Latex文字排版系统开发了排版良好的计算书生成工具。该工具包括:一个Latex模版;一个用perl语言编写的转换程序。转换程序使用正则表达式根据计算结果以及计算书模版自动替换模版内的变量,生成Latex文件。然后,使用Latex内置程序生成pdf格式的计算书。实践表明,上述开发方式可以开发出高质量的计算书生成程序。

基于Perl语言的含能材料耐热性能模拟

含能材料中聚合物的玻璃化转变温度(Tg)的高低可以作为其耐热性能的一个重要指标,为了方便快捷地使用Materials Studio分子模拟软件预测出含能材料中聚合物的Tg,在使用Materials Studio软件时引入Perl语言,开发了能自动进行升温的模拟程序,并在Perl语言环境下结合XML语言,设计与实现了一种基于XML的图形界面化的预测聚合物Tg的程序。以聚合物(PE)为算例预测了其Tg,实验结果表明该方法能自动、方便地对给定的分子模型进行阶段升温(降温)MD模拟,同时获得模型在不同温度下的密度,通过对模拟得到的密度-温度作图,可求得模型的Tg。其模拟结果与实验值相比,吻合得较好,表明该方法可以快速而有效地对聚合物的性能进行自动预测。

Perl语言在基于Win32的Web服务器上的网络编程实例

用 Perl 语言在 Windows NT 的 IIS上实现在网络管理中常用的 Ping 命令的功能，并用 Perl 语言对 Ping 命令的输出进行分析判断，并将判断结果以HTML表示出来，用来判断网络中某个结点是否在线。

Perl语言整合5款软件进行真菌效应蛋白预测

目的:效应蛋白在真菌与植物互作过程中发挥了重要的作用,它由真菌分泌进入植物体内引起植物细胞结构和功能改变,使植物表现出抗性抑制病菌侵染或者加速病菌侵染表现为感病。效应蛋白的预测目前尚无公认的方法,我们拟建立真菌效应蛋白预测流程,供研究人员参考。方法:根据真菌效应蛋白无典型结构及属于胞外分泌蛋白的特点,利用Perl语言整合5款软件(Signal P、Prot Comp、TMHMM、Target P、Wo LF PSORT),设计2种真菌效应蛋白预测方法。结果:对香蕉枯萎病菌蛋白质组进行测试,发现348个潜在效应蛋白,该结果与其他文献报道的结果一致。结论:建立了2种真菌效应蛋白预测流程,可供研究者选用。

Perl语言在电路设计中的应用

一种可在Unix操作系统下编程的模块化的高级语言Perl。在简要阐述Perl语言的基础上,以实例描述了Perl语言在电路仿真测试中的应用。

Perl语言统计核酸GC含量程序开发

生命科学领域中无论是PCR还是测序,都需要了解目的核酸的GC含量。由于目前缺乏独立统计核酸GC含量的程序。该文采用Perl语言编程,设计处理了核酸序列统计GC含量的程序。程序采用了BioPerl环境,利用字符串拆分、遍历算法和正则表达式对核酸序列进行GC碱基的挖掘。最后该脚本可以应用于Windows和Linux系统。适合用于多环境。

基于Perl语言的IP集成端口信息处理方法

介绍了在SOC集成过程中,使用Perl语言中的哈希来处理IP端口信息,加快SOC集成流程的方法,并分析总结了Per1相对于常用C语言的优缺点。

Perl语言安全性研究

Perl语言一经问世就受到许多关注,是一种很流行的脚本语言。本文将对在Linux系统中的Perl语言使用的安全机制进行入手,从程序员容易忽略的问题出发,提出一些编程技巧提高Perl脚本语言的使用安全性,从而对Perl语言的使用安全性进行详细分析。

Perl语言在字符编码转换中的应用

字符编码有很多种,不同编码之间如果处理不当会产生乱码。介绍了Perl语言的特点,在各种字符编码转换中的应用,以及在decode、encode函数、MIME编码解码、Url编码中的使用方法,确保字符能正常显示。

Perl程序设计语言综述

Perl语言是在吸收了众多程序设计语言的长处基础之上发展起来的是一门优秀的程序设计语言,在很多领域都有所应用。论文试图对该语言作一个较为全面的介绍,并期待该语言能在我国的计算机应用领域得到广泛的应用。

基于Perl语言的交联环氧树脂分子模型的构建和性能仿真

基于Perl语言与Materials Studio分子模拟软件,设计了能自动、快速和高效生成交联环氧树脂分子模型的算法程序,介绍了该程序的工作原理、工作流程及主要程序代码,并以多官能团耐高温环氧树脂4,4-二氨基二苯甲烷四缩水甘油醚(TGDDM)预聚物和固化剂4'二氨基二苯甲烷(DDM)为算例对程序运行结果进行验证。计算结果显示最终通过Perl语言建立的交联TGDDM/DDM结构的玻璃化转变温度(T_g)为520 K,与实验值515 K比较接近;其力学性能随交联度的增加而增加,与实验值在同一数量级。这些充分表明通过该方法构建的交联环氧树脂分子模型结构合理,与实验值吻合,可以很好地对实验结果进行预测。

用PERL编程对自然语言(英语)的识别与分析

欧美国家医学部门如何自动识别门诊病历中的医学术语,是自然语言(英语)识别的一项重要课题。作者使用了Perl语言编程,并采用标准医学术语(Medical Concepts and Terms)数据库MRCON为样本数据库,并对MRCON进行了字段删减、库记录倒置和采用剔除查找时产生的冗余记录的算法等等,经对多例门诊诊断和放射线报告进行了识别和分析处理,取得了较高的关键词识别准确率和低冗余度,同时也为用Perl语言分析处理自然语言(NLP)探索了一条新的道路。

Perl 语言及其应用

Ｐｅｒｌ语言最适于扫描任意的文本文件，并可以从中提出并报告有关信息。本文首先说明了Ｐｅｒｌ语言的使用范围、特性和基本数据类型、语法，然后将Ｐｅｒｌ语言与常用的Ｃ语言进行比较，总结了Ｐｅｒｌ语言的优点及弱点，最后介绍了作者以Ｐｅｒｌ语言为工具所做的一个应用软件－ｈｔｍ１２１ａｔｅｘ，并说明了作者使用Ｐｅｒｌ语言的体会。

Perl语言菜鸟入门

自从WebDAV漏洞开始，使用率最高的莫过于isno用Perl编写的WebDAVX3．pl了，而且，最近越来越多的CGI漏洞也是闹得十分热闹，那么，想必很多朋友因此也开始注意perI这门古老而又年轻的语言了。

Perl语言和程序员的三大美德

1987年，程序员Larry Wall发现用当时现有的语言或工具，譬如象awk(包含在很多UNIX操作系统版本里的一种解释性语言)，或shell(作为操作系统内核的界面，把用户指令传给内核执行的指令解释器)，不能很容易地解决他的问题。