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真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究
被引量:
1
1
作者
张昕
姜华
+7 位作者
王艳丽
张震
毛雪琴
柴荣耀
邱海萍
杜新法
王教瑜
孙国昌
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期635-646,共12页
PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEX11基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEX11p。酵母类真菌有1个或2个PEX11p,而大多数丝状...
PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEX11基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEX11p。酵母类真菌有1个或2个PEX11p,而大多数丝状真菌中包含2到3个,其中子囊菌中PEX11p的个数偏多,个别种类达到5个;(2)真菌PEX11p可分为3类,大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的PEX11p,类型Ⅱ是盘菌亚门真菌所特有的,可能与类型Ⅰ和类型Ⅱ在功能上有冗余;(3)通过MEME分析,发现PEX11p含有多个保守区域,其中C末端的Motif8具有很高的保守性,推测可能对PEX11p发挥功能具有重要作用。文章对进一步研究真菌PEX11p的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义。
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关键词
真菌
过氧化物酶体
pexll基因家族
生物信息学
进化分析
下载PDF
职称材料
题名
真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究
被引量:
1
1
作者
张昕
姜华
王艳丽
张震
毛雪琴
柴荣耀
邱海萍
杜新法
王教瑜
孙国昌
机构
杭州师范大学生命与环境科学学院
浙江省植物有害生物防控重点实验室--省部共建国家重点实验室培育基地
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期635-646,共12页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30900933
30970082
31170136)资助
文摘
PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEX11基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEX11p。酵母类真菌有1个或2个PEX11p,而大多数丝状真菌中包含2到3个,其中子囊菌中PEX11p的个数偏多,个别种类达到5个;(2)真菌PEX11p可分为3类,大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的PEX11p,类型Ⅱ是盘菌亚门真菌所特有的,可能与类型Ⅰ和类型Ⅱ在功能上有冗余;(3)通过MEME分析,发现PEX11p含有多个保守区域,其中C末端的Motif8具有很高的保守性,推测可能对PEX11p发挥功能具有重要作用。文章对进一步研究真菌PEX11p的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义。
关键词
真菌
过氧化物酶体
pexll基因家族
生物信息学
进化分析
Keywords
fungus
peroxisome
PEX11gene family
bioinformatics
phylogenetic analysis
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究
张昕
姜华
王艳丽
张震
毛雪琴
柴荣耀
邱海萍
杜新法
王教瑜
孙国昌
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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