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对流扩散方程的摄动有限体积(PFV)方法及讨论 被引量:19
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作者 高智 柏威 《力学学报》 EI CSCD 北大核心 2004年第1期88-93,共6页
在有限体积(FV)方法的重构近似中,引入数值摄动处理,即把界面数值通量摄动展开成网格间距的幂级数,并利用积分方程自身的性质求出幂级数的系数,同时获得高精度迎风和中心型摄动有限体积(PFV)格式.对标量输运方程给出积分近似为二阶、重... 在有限体积(FV)方法的重构近似中,引入数值摄动处理,即把界面数值通量摄动展开成网格间距的幂级数,并利用积分方程自身的性质求出幂级数的系数,同时获得高精度迎风和中心型摄动有限体积(PFV)格式.对标量输运方程给出积分近似为二阶、重构近似为二、三和四阶迎风和中心型PFV格式,这些PFV格式的结构形式及使用基点数与一阶迎风格式完全一致,迎风PFV格式满足对流有界准则;二阶和四阶中心PFV格式对网格Peclet数的任意值均为正型格式,比常用的二阶中心格式优越.用一维标量输运和方腔流动算例说明PFV格式的优良性能,并把PFV方法与性质相近的摄动有限差分(PFD)方法及相关的高精度方法作了对比分析. 展开更多
关键词 对流扩散方程 计算流体力学 数值摄动 摄动有限体积法 笛卡儿网格 雷诺数
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基于改进PFV策略的双车道连续元胞自动机模型
2
作者 赵子翔 彭勇 沙晓宇 《公路与汽运》 2022年第1期17-20,25,共5页
根据道路实际情况,提出考虑多车信息的改进PFV策略,并进行参数标定;将跟驰策略和换道规则相结合,建立双车道连续元胞自动机模型,采用周期边界式条件进行模型仿真,比较不同密度下双车道交通流变化情况和车辆换道行为,通过仿真结果的时空... 根据道路实际情况,提出考虑多车信息的改进PFV策略,并进行参数标定;将跟驰策略和换道规则相结合,建立双车道连续元胞自动机模型,采用周期边界式条件进行模型仿真,比较不同密度下双车道交通流变化情况和车辆换道行为,通过仿真结果的时空图显示车辆换道造成的系统速度延迟,通过比较双车道系统的交通流密度-交通流量、交通流密度-行驶速度关系分析车辆在双车道环境下的行驶状况。仿真结果表明所建立的模型合理,能用于道路交通流分析。 展开更多
关键词 公路交通 交通流 连续元胞自动机 双车道 跟驰策略 换道规则 改进pfv策略
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考虑慢车影响的双车道PFV跟驰模型研究
3
作者 彭勇 周欣 沙晓宇 《公路》 北大核心 2021年第6期256-260,共5页
在双车道交通系统中会有较多的因素影响跟驰行为,针对单车道提出的跟驰模型能否直接适用于双车道系统值得研究。双车道交通系统中的车辆存在换道行为,因此,在研究双车道跟驰行为时不仅应考虑本车道前后车辆的影响,还应该考虑邻近车道车... 在双车道交通系统中会有较多的因素影响跟驰行为,针对单车道提出的跟驰模型能否直接适用于双车道系统值得研究。双车道交通系统中的车辆存在换道行为,因此,在研究双车道跟驰行为时不仅应考虑本车道前后车辆的影响,还应该考虑邻近车道车辆的影响,合理地将换道规则引入跟驰模型中。考虑慢车影响,基于PFV跟驰策略建立了双车道跟驰模型。仿真结果表明,相较于FVD策略而言,采用PFV策略,慢车在双车道交通系统中造成的车辆延误较小且无碰撞发生,可以更好地描述车辆在双车道系统中遇到慢车时的跟驰行为。 展开更多
关键词 综合交通运输 双车道跟驰模型 pfv策略 换道行为
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Lnc-RP5 Regulates the mi R-129-5p/Notch1/PFV Internal Promoter Axis to Promote the Expression of the Prototype Foamy Virus Transactivator Tas 被引量:1
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作者 Shanshan Xu Liujun Chen +12 位作者 Yinglian Tang Peipei Yuan Jun Yan Yingcheng Zheng Li Huang Zhi Li Yan Sun Song Han Jun Yin Qin Pan Biwen Peng Xiaohua He Wanhong Liu 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期73-82,共10页
Prototype foamy virus(PFV)is a unique retrovirus that infects animals and humans and does not cause clinical symptoms.Long noncoding RNAs(lncRNAs)are believed to exert multiple regulatory functions during viral infect... Prototype foamy virus(PFV)is a unique retrovirus that infects animals and humans and does not cause clinical symptoms.Long noncoding RNAs(lncRNAs)are believed to exert multiple regulatory functions during viral infections.Previously,we utilized RNA sequencing(RNA-seq)to characterize and identify the lncRNA lnc-RP5-1086 D14.3.1-1:1(lnc-RP5),which is markedly decreased in PFV-infected cells.However,little is known about the function of lnc-RP5 during PFV infection.In this study,we identified lnc-RP5 as a regulator of the PFV transcriptional transactivator(Tas).Lnc-RP5 enhanced the activity of the PFV internal promoter(IP).The expression of PFV Tas was found to be promoted by lnc-RP5.Moreover,mi R-129-5 p was found to be involved in the lnc-RP5-mediated promotion of PFV IP activity,while the Notch1 protein suppressed the activity of PFV IP and the expression of Tas.Our results demonstrate that lnc-RP5 promotes the expression of PFV Tas through the miR-129-5 p/Notch1/PFV IP axis.This work provides evidence that host lnc RNAs can manipulate PFV replication by employing mi RNAs and proteins during an early viral infection. 展开更多
关键词 PROTOTYPE foamy virus(pfv) lnc-RP5 Transactivator(Tas) Internal PROMOTER miR-129-5p
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以荧光素酶为报告基因定量检测原型泡沫病毒的指示细胞系的建立 被引量:2
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作者 许丰雯 徐丹 +2 位作者 李森 王明晓 乔文涛 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期80-84,共5页
原型泡沫病毒(prototypic foamy virus,PFV)属于反转录病毒科泡沫病毒亚科.为了在细胞水平定量检测PFV的感染,建立了以萤火虫荧光素酶为报告基因的指示细胞系.在幼小仓鼠肾细胞BHK-21中转染含有PFV LTR启动子及其控制下的荧光素酶报告... 原型泡沫病毒(prototypic foamy virus,PFV)属于反转录病毒科泡沫病毒亚科.为了在细胞水平定量检测PFV的感染,建立了以萤火虫荧光素酶为报告基因的指示细胞系.在幼小仓鼠肾细胞BHK-21中转染含有PFV LTR启动子及其控制下的荧光素酶报告基因的质粒,经过G418筛选得到稳定整合的细胞系.当PFV感染指示细胞系时,其反式激活因子Tas激活LTR启动子,诱导下游报告基因的表达,通过检测荧光素酶的活性即可对PFV的感染进行定量检测.结果表明,该细胞系可特异指示PFV的感染,相比于传统观察细胞病变的方法,该指示细胞系更为灵敏,是PFV相关研究的有力工具,具有潜在的应用价值. 展开更多
关键词 原型泡沫病毒pfv 荧光素酶报告基因 指示细胞系
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T形微通道中互不相溶两相流数值模拟 被引量:8
6
作者 董贺飞 张德良 +2 位作者 赵玉潮 陈光文 袁权 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1950-1957,共8页
采用摄动有限体积(PFV)算法和水平集(level set)技术对T形微通道内互不相溶两相流动进行了数值模拟研究。考察了两相界面张力和微通道壁面润湿性对流动的影响,精确地捕捉到了油水两相流动的界面。对一些典型的T形微通道油水两相流动进... 采用摄动有限体积(PFV)算法和水平集(level set)技术对T形微通道内互不相溶两相流动进行了数值模拟研究。考察了两相界面张力和微通道壁面润湿性对流动的影响,精确地捕捉到了油水两相流动的界面。对一些典型的T形微通道油水两相流动进行了数值计算,模拟结果和实验结果吻合较好。分析总结出了微通道内两相流动过程中的一些基本规律,为微通道内的液液两相流动实验设计和工业应用提供了新的数值预测手段。 展开更多
关键词 微通道 摄动有限体积 两相流 微反应器 微混合器 油-水
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蛋白酶的电化学研究
7
作者 李根喜 《上海大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期567-572,共6页
电化学作为现代仪器分析重要的组成部分,在生命科学领域正扮演着越来越重要的角色.随着蛋白膜伏安法(protein film voltammetery,PFV)的不断完善,以及表面修饰技术、纳米技术、分子标记与分子识别技术等相关技术的不断发展,在蛋白酶研... 电化学作为现代仪器分析重要的组成部分,在生命科学领域正扮演着越来越重要的角色.随着蛋白膜伏安法(protein film voltammetery,PFV)的不断完善,以及表面修饰技术、纳米技术、分子标记与分子识别技术等相关技术的不断发展,在蛋白酶研究领域,电化学正逐渐克服以往手段较为单一、研究目标不够多样、获取信息不够丰富等弊端.以本课题组在该领域所取得的一些研究成果为主,综述蛋白酶电化学研究的现状和发展趋势. 展开更多
关键词 蛋白酶 电化学 蛋白膜伏安法
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α-Enolase抑制人泡沫病毒反式激活因子Bell介导的反式激活作用 被引量:1
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作者 吴亚锋 张其程 +3 位作者 李哲 汤书兵 许丰雯 陈启民 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期86-91,共6页
泡沫病毒能在宿主细胞内长期潜伏感染,且不伴随任何病理现象.为了阐明这一病毒潜伏感染机制,关键要研究病毒与其宿主之间的相互影响,尤其是宿主对病毒基因转录水平的影响.Bel1是人泡沫病毒的反式激活因子,它能够激活该病毒LTR和IP两个... 泡沫病毒能在宿主细胞内长期潜伏感染,且不伴随任何病理现象.为了阐明这一病毒潜伏感染机制,关键要研究病毒与其宿主之间的相互影响,尤其是宿主对病毒基因转录水平的影响.Bel1是人泡沫病毒的反式激活因子,它能够激活该病毒LTR和IP两个转录启动子.该研究利用酵母双杂交技术筛选到Bel1的相互作用蛋白α-Enolase,并用免疫共沉淀技术确定了这两个蛋白的结合涉及α-Enolase的243~372位氨基酸及Bel1的223~275位氨基酸.细胞转染实验发现α-Enolase蛋白能够抑制Bel1介导的反式激活作用. 展开更多
关键词 人泡沫病毒 人泡沫病毒反式激活因子 α-Enolase
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杀菌剂氟苯醚酰胺的创制 被引量:1
9
作者 曾令强 罗睿童 +3 位作者 陈琼 郝格非 朱晓磊 杨光富 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期895-903,共9页
琥珀酸脱氢酶(succinate dehydrogenase,SDH)是重要的杀菌剂靶标之一,而很多植物病原菌对靶向SDH的杀菌剂已经产生了较为严重的抗药性,因此新型靶向SDH的杀菌剂设计显得尤为重要。基于药效团连接碎片的虚拟筛选(PFVS)是一种独立于生物... 琥珀酸脱氢酶(succinate dehydrogenase,SDH)是重要的杀菌剂靶标之一,而很多植物病原菌对靶向SDH的杀菌剂已经产生了较为严重的抗药性,因此新型靶向SDH的杀菌剂设计显得尤为重要。基于药效团连接碎片的虚拟筛选(PFVS)是一种独立于生物物理技术的高通量药物发现方法,采用PFVS方法成功获得了靶向SDH的新型杀菌剂候选化合物—氟苯醚酰胺。本文主要从PFVS原理、先导化合物的发现、取代基的修饰以及杀菌活性研究等方面对氟苯醚酰胺的创制进行系统分析。氟苯醚酰胺创制的案例分析可为农药研究工作者提供新思路和新方法。 展开更多
关键词 药效团连接碎片的虚拟筛选 琥珀酸脱氢酶 氟苯醚酰胺 杀菌剂
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SLFN12与原型泡沫病毒Tas蛋白相互作用抑制其激活病毒启动子
10
作者 郭鸽 胡笑梅 +2 位作者 解英朋 谈娟 乔文涛 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1180-1187,共8页
Schlafen(SLFN)家族多个成员具有抗病毒活性,但Schlafen家族成员12(Schlafen12,SLFN12)的相关功能尚未见报道。本研究从B细胞cDNA文库中克隆获得SLFN12全长cDNA,亚克隆构建一系列真核表达质粒,分析SLFN12对原型泡沫病毒(prototype foamy... Schlafen(SLFN)家族多个成员具有抗病毒活性,但Schlafen家族成员12(Schlafen12,SLFN12)的相关功能尚未见报道。本研究从B细胞cDNA文库中克隆获得SLFN12全长cDNA,亚克隆构建一系列真核表达质粒,分析SLFN12对原型泡沫病毒(prototype foamy virus,PFV)复制的作用。将SLFN12全长质粒与PFV的感染性克隆(pcPFV)共转染HEK293T细胞。结果显示,当两者的转染质量比为1∶3时,SLFN12过表达使以游离病毒颗粒(cell-free)或细胞共培养(cell-to-cell)方式感染的PFV滴度分别降低了95.21%(P<0.001)以及97.91%(P<0.01),同时病毒蛋白质的表达量也减少,说明SLFN12能够抑制PFV的复制。共转染pcPFV与SLFN12的AAA结构域截短质粒进行同样的实验,PFV滴度分别对应下降了61.88%(P<0.05)以及72.28%(P<0.01),表明AAA结构域参与了SLFN12抑制PFV复制的功能。随后,利用报告质粒系统探究SLFN12对PFV启动子转录活性的影响,观察到SLFN12不影响病毒内部启动子(internal promoter,IP)(P>0.05)及长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)(P>0.05)的基础转录活性,但抑制泡沫病毒反式激活因子(trans-activator of spumaviruses,Tas)的表达。当SLFN12和Tas表达质粒的转染质量比为1∶1时,Tas对IP以及LTR的转录激活作用相较对照组,分别减弱了66.27%(P<0.01)以及73.91%(P<0.01)。同时,免疫共沉淀实验观察到,Tas蛋白与SLFN12蛋白之间存在相互作用,表明SLFN12通过与PFV Tas相互作用削弱其表达,从而干扰Tas对IP和LTR的反式激活来抑制PFV复制。本研究发现,SLFN12具有抗病毒活性,拓宽了对SLFN家族抗病毒活性的认识,对于研究泡沫病毒潜伏感染的机制也具有参考价值。 展开更多
关键词 原型泡沫病毒 Schlafen家族成员12 泡沫病毒的反式激活因子
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三种侵染百香果的马铃薯Y病毒属病毒外壳蛋白比较 被引量:1
11
作者 王泳植 刘宇 +3 位作者 窦润秋 阴勃廷 周雪平 王亚琴 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期715-720,共6页
Potyviruses are plant viruses that infect various kinds of economic crops and cause enormous losses.Here w e identified three potyviruses,East Asian passiflora virus(EAPV),telosma mosaic virus(TelMV)and passion fruit ... Potyviruses are plant viruses that infect various kinds of economic crops and cause enormous losses.Here w e identified three potyviruses,East Asian passiflora virus(EAPV),telosma mosaic virus(TelMV)and passion fruit severe mottle virus(PFV),from passionfruit leaves show ing mosaic,chlorosis,and curly-leaf symptoms collected from Yuanmou County,Yunnan Province.Comparison of their coat proteins(CPs)show ed several similar characteristics and some differences.How ever,several basic physicochemical properties and secondary structure of their coat protein and some other properties are similar to each other.These results may provide useful data for the development of antibodies specific to these viruses. 展开更多
关键词 passionfruit EAPV TelMV pfv coat protein
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原型泡沫病毒Bet蛋白与SUMO1的相互作用及功能初探
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作者 柴克莉 李丽爽 +2 位作者 张俊士 乔文涛 谈娟 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期14-19,共6页
原型泡沫病毒(prototype foamy virus,PFV)属于反转录病毒科泡沫病毒亚科,Bet是其编码的1个非结构蛋白.研究表明Bet蛋白在调控病毒蛋白的表达及病毒释放等过程中发挥重要作用.为进一步探究Bet的其他功能,通过酵母双杂交实验,以Bet作为... 原型泡沫病毒(prototype foamy virus,PFV)属于反转录病毒科泡沫病毒亚科,Bet是其编码的1个非结构蛋白.研究表明Bet蛋白在调控病毒蛋白的表达及病毒释放等过程中发挥重要作用.为进一步探究Bet的其他功能,通过酵母双杂交实验,以Bet作为诱饵钓取到与之相互作用的蛋白SUMO1,并初步探究了Bet对SUMO1功能的影响.实验结果表明,Bet与SUMO1在真核细胞中存在相互作用;Bet能够影响SUMO1在细胞中的定位,进而影响核定位蛋白NS1mut的SUMO化修饰. 展开更多
关键词 原型泡沫病毒 Bet蛋白 SUMO1 酵母双杂交
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