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牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
赵姝君
王敬姣
+3 位作者
王梦楠
吴茜红
李冬杰
李世杰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期505-510,共6页
在人、鼠和猪中,Phlda2基因是一个母源表达的印记基因,编码一种胞浆蛋白,具有与血小板同源的结构域。在牛中,Phlda2基因的结构和功能还不清楚。本研究首先利用RT-PCR方法对Phlda2基因在牛组织中的表达进行了分析,进而采用生物信息学方...
在人、鼠和猪中,Phlda2基因是一个母源表达的印记基因,编码一种胞浆蛋白,具有与血小板同源的结构域。在牛中,Phlda2基因的结构和功能还不清楚。本研究首先利用RT-PCR方法对Phlda2基因在牛组织中的表达进行了分析,进而采用生物信息学方法对牛Phlda2基因的分子进化、启动子及蛋白的高级结构进行了分析和预测。结果表明,Phlda2基因在牛的心、肝、脾、肺、肾、大脑、骨骼肌、皮下脂肪、卵巢和胎盘10个组织中均有表达。对包括人、小鼠、牛、猪、原鸡、非洲爪蝉、斑马鱼和袋鼠在内的8种动物Phlda2基因mRNA序列进化进行分析,发现这8种动物的遗传距离小于0.435,且牛和猪遗传距离最近,为0.148,与基因系统进化树分析的结果一致。牛Phlda2基因的启动子最可能位于该基因起始密码子上游487-737bp区域,包括20种转录因子结合位点。牛Phlda2基因编码亲水性蛋白,其二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主;蛋白三级结构包括一个由β片层和α-螺旋构成的血小板同源结构域(PH)。以上研究结果将为进一步研究Phlda2基因的功能和分析基因表达调控的分子机理奠定基础。
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关键词
牛
phlda2基因
生物信息学
组织表达
原文传递
印迹基因PHLDA2在孕妇子痫前期胎盘中的差异表达和甲基化状态
2
作者
朱好
胡蓉
顾蔚蓉
《复旦学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期128-131,共4页
了解印迹基因PHLDA2在孕妇子痫前期胎盘中表达水平及甲基化状态变化,我们收集2017年6月—2018年12月于复旦大学附属妇产科医院分娩产妇的临床资料和胎盘组织,分为早发型子痫前期4例,晚发型子痫前期16例,正常对照组30例。采用Real-time ...
了解印迹基因PHLDA2在孕妇子痫前期胎盘中表达水平及甲基化状态变化,我们收集2017年6月—2018年12月于复旦大学附属妇产科医院分娩产妇的临床资料和胎盘组织,分为早发型子痫前期4例,晚发型子痫前期16例,正常对照组30例。采用Real-time PCR和焦磷酸甲基化测序检测和比较三组胎盘组织中印迹基因PHLDA2的相对表达量和甲基化情况。结果发现,与对照组比较,早发型子痫前期PHLDA2 mRNA的相对表达量差异无统计学意义(P=0.406),胎盘组织中PHLDA2启动子区甲基化程度差异性增加(P<0.001);而晚发型PHLDA2 mRNA的相对表达量有差异性下降(P=0.019),胎盘组织中PHLDA2启动子区甲基化程度差异性增加(P<0.001)。推测子痫前期孕妇胎盘组织中PHLDA2基因的低表达、启动子区高甲基化可能与子痫前期的发病有关。
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关键词
子痫前期
印迹
基因
phlda2基因
胎盘
甲基化
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职称材料
印记基因PHLDA2表达与骨肉瘤辐射敏感性的研究
被引量:
2
3
作者
李懿
陈宏
+3 位作者
刘均
林旭
黄丽春
李继聪
《中华临床医师杂志(电子版)》
CAS
2013年第5期31-33,共3页
目的探讨印记基因PHLDA2在骨肉瘤放疗疗效评估中的意义。方法采用免疫组织化学S-P法和RT-PCR方法在36例放射治疗后的骨肉瘤组织及其配对的癌旁组织中检测PHLDA2分子的表达,并结合临床病例参数及辐射敏感性探讨PHLDA2表达的意义。结果放...
目的探讨印记基因PHLDA2在骨肉瘤放疗疗效评估中的意义。方法采用免疫组织化学S-P法和RT-PCR方法在36例放射治疗后的骨肉瘤组织及其配对的癌旁组织中检测PHLDA2分子的表达,并结合临床病例参数及辐射敏感性探讨PHLDA2表达的意义。结果放射治疗后的骨肉瘤组织中PHLDA2分子mRNA和蛋白的表达一致,明显低于配对的癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05);辐射缓解组中PHLDA2的表达阳性率高,与辐射抵抗组差异有统计学意义(P<0.05);但PHLDA2表达与骨肉瘤患者的性别、年龄、病理分型不相关,差异无统计学意义(P>0.05)。结论骨肉瘤组织中PHLDA2的表达显著降低,其表达可作为一种骨肉瘤放疗疗效评估的参考指标,值得在临床上推广运用。
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关键词
骨肉瘤
放射疗法
phlda2基因
原文传递
题名
牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
赵姝君
王敬姣
王梦楠
吴茜红
李冬杰
李世杰
机构
河北农业大学生命科学学院
河北科技大学生物科学与工程学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期505-510,共6页
基金
国家自然科学基金(31372312)
河北省自然基金项目(C2011204001)共同资助
文摘
在人、鼠和猪中,Phlda2基因是一个母源表达的印记基因,编码一种胞浆蛋白,具有与血小板同源的结构域。在牛中,Phlda2基因的结构和功能还不清楚。本研究首先利用RT-PCR方法对Phlda2基因在牛组织中的表达进行了分析,进而采用生物信息学方法对牛Phlda2基因的分子进化、启动子及蛋白的高级结构进行了分析和预测。结果表明,Phlda2基因在牛的心、肝、脾、肺、肾、大脑、骨骼肌、皮下脂肪、卵巢和胎盘10个组织中均有表达。对包括人、小鼠、牛、猪、原鸡、非洲爪蝉、斑马鱼和袋鼠在内的8种动物Phlda2基因mRNA序列进化进行分析,发现这8种动物的遗传距离小于0.435,且牛和猪遗传距离最近,为0.148,与基因系统进化树分析的结果一致。牛Phlda2基因的启动子最可能位于该基因起始密码子上游487-737bp区域,包括20种转录因子结合位点。牛Phlda2基因编码亲水性蛋白,其二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主;蛋白三级结构包括一个由β片层和α-螺旋构成的血小板同源结构域(PH)。以上研究结果将为进一步研究Phlda2基因的功能和分析基因表达调控的分子机理奠定基础。
关键词
牛
phlda2基因
生物信息学
组织表达
Keywords
Bovine
phlda
2
gene
Bioinformatic analysis
Tissues expression
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
印迹基因PHLDA2在孕妇子痫前期胎盘中的差异表达和甲基化状态
2
作者
朱好
胡蓉
顾蔚蓉
机构
复旦大学附属妇产科医院产科
出处
《复旦学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期128-131,共4页
基金
国家重点研发计划(2016YFC1000403)。
文摘
了解印迹基因PHLDA2在孕妇子痫前期胎盘中表达水平及甲基化状态变化,我们收集2017年6月—2018年12月于复旦大学附属妇产科医院分娩产妇的临床资料和胎盘组织,分为早发型子痫前期4例,晚发型子痫前期16例,正常对照组30例。采用Real-time PCR和焦磷酸甲基化测序检测和比较三组胎盘组织中印迹基因PHLDA2的相对表达量和甲基化情况。结果发现,与对照组比较,早发型子痫前期PHLDA2 mRNA的相对表达量差异无统计学意义(P=0.406),胎盘组织中PHLDA2启动子区甲基化程度差异性增加(P<0.001);而晚发型PHLDA2 mRNA的相对表达量有差异性下降(P=0.019),胎盘组织中PHLDA2启动子区甲基化程度差异性增加(P<0.001)。推测子痫前期孕妇胎盘组织中PHLDA2基因的低表达、启动子区高甲基化可能与子痫前期的发病有关。
关键词
子痫前期
印迹
基因
phlda2基因
胎盘
甲基化
Keywords
preeclampsia
imprinting gene
phlda
2
gene
placenta
methylation
分类号
R714.245 [医药卫生—妇产科学]
下载PDF
职称材料
题名
印记基因PHLDA2表达与骨肉瘤辐射敏感性的研究
被引量:
2
3
作者
李懿
陈宏
刘均
林旭
黄丽春
李继聪
机构
成都军区昆明总医院肿瘤科
出处
《中华临床医师杂志(电子版)》
CAS
2013年第5期31-33,共3页
基金
国家自然科学青年基金(81201756)
云南省自然科学基金(2011FZ316)
文摘
目的探讨印记基因PHLDA2在骨肉瘤放疗疗效评估中的意义。方法采用免疫组织化学S-P法和RT-PCR方法在36例放射治疗后的骨肉瘤组织及其配对的癌旁组织中检测PHLDA2分子的表达,并结合临床病例参数及辐射敏感性探讨PHLDA2表达的意义。结果放射治疗后的骨肉瘤组织中PHLDA2分子mRNA和蛋白的表达一致,明显低于配对的癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05);辐射缓解组中PHLDA2的表达阳性率高,与辐射抵抗组差异有统计学意义(P<0.05);但PHLDA2表达与骨肉瘤患者的性别、年龄、病理分型不相关,差异无统计学意义(P>0.05)。结论骨肉瘤组织中PHLDA2的表达显著降低,其表达可作为一种骨肉瘤放疗疗效评估的参考指标,值得在临床上推广运用。
关键词
骨肉瘤
放射疗法
phlda2基因
Keywords
Osteosarcoma
Radiotherapy
phlda
2
gene
分类号
R738.1 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析
赵姝君
王敬姣
王梦楠
吴茜红
李冬杰
李世杰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
原文传递
2
印迹基因PHLDA2在孕妇子痫前期胎盘中的差异表达和甲基化状态
朱好
胡蓉
顾蔚蓉
《复旦学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
3
印记基因PHLDA2表达与骨肉瘤辐射敏感性的研究
李懿
陈宏
刘均
林旭
黄丽春
李继聪
《中华临床医师杂志(电子版)》
CAS
2013
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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