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猪miR-22前体上游序列突变的PK15细胞系构建
1
作者
丁兆雪
王佳洁
+5 位作者
沈中浩
周晓龙
杨松柏
金航峰
赵阿勇
汪涵
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第9期1849-1855,共7页
猪miR-22前体上游序列片段突变可能对miR-22的表达起到重要调控作用,为进一步探究其功能,基于CRISPR/Cas9基因编辑技术,通过针对猪miR-22前体上游序列片段设计2个靶标sgRNAs(short guide RNAs),构建重组表达载体pX459-sgRNA1和pX459-sgR...
猪miR-22前体上游序列片段突变可能对miR-22的表达起到重要调控作用,为进一步探究其功能,基于CRISPR/Cas9基因编辑技术,通过针对猪miR-22前体上游序列片段设计2个靶标sgRNAs(short guide RNAs),构建重组表达载体pX459-sgRNA1和pX459-sgRNA2;随后将重组质粒转染猪肾上皮细胞系(PK15),经嘌呤霉素初步筛选后,提取基因组DNA,通过PCR及测序鉴定编辑效果;最后,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测编辑前后miR-22相对表达量的变化。结果显示,81个阳性克隆中,共产生6种突变类型,突变率达60.49%;qRT-PCR检测显示,编辑后miR-22的表达量显著下调约50%。本研究成功获得了miR-22前体上游序列突变的猪PK15细胞模型,为今后猪miR-22的功能研究提供了新的可应用研究对象。
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关键词
猪
微小RNA
突变
CRISPR/Cas9技术
pk15
细胞系
下载PDF
职称材料
一株内源性猪细小病毒的分离与鉴定
被引量:
12
2
作者
李昌文
仇华吉
+5 位作者
童光志
田志军
王玉春
韩孝成
刘红全
董齐
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
2000年第S1期90-93,共4页
本研究从不明病毒污染的PK15细胞培养物中分离到了一株猪细小病毒,从形态学、血清学、分子生物学几个方面对其进行了鉴定,同时克隆了该毒株VP2基因,并测定了其核苷酸序列。将该毒株命名为SY-99株。
关键词
猪细小病毒
内源性病毒
pk15
细胞系
VP2基因
下载PDF
职称材料
利用CRISPR/Cas9技术构建PERV敲除的PK15细胞系
被引量:
1
3
作者
蒙红毅
张健民
+1 位作者
李黎
高毅
《生物技术》
CAS
2018年第6期513-519,525,共8页
[目的]利用CRISPR/Cas9技术对猪内源性逆转录病毒(PERV)进行编码区的大片段敲除,获得PERV敲除的阳性PK15单克隆细胞系。[方法]通过对巴马小型猪基因组进行高通量测序,获得PERV高度保守序列,再根据CRISPR/Cas9的构建原理,设计2个gRNA,并...
[目的]利用CRISPR/Cas9技术对猪内源性逆转录病毒(PERV)进行编码区的大片段敲除,获得PERV敲除的阳性PK15单克隆细胞系。[方法]通过对巴马小型猪基因组进行高通量测序,获得PERV高度保守序列,再根据CRISPR/Cas9的构建原理,设计2个gRNA,并将其同时整合入含有PB转座子的可表达Cas9蛋白的载体中,即PB-CAG-2×gRNA-Cas9载体。然后以电转方式将打靶载体转入PK15细胞中,并通过药物(G418)筛选方法筛出单细胞克隆。通过PCR鉴定,挑出阳性克隆,并将其传代扩大获得细胞系。[结果]酶切、测序验证了载体PB-CAG-2×gRNA-Cas9的正确性,PCR结果显示7株单克隆细胞系均有约3600bp的PERV大片段敲除。[结论]构建了PERV敲除的基因打靶载体PB-CAG-2×gRNA-Cas9,并利用该载体成功打靶获得了7株PERV大片段敲除的PK15细胞系。
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关键词
猪内源性逆转录病毒(PERV)
基因敲除
CRISPR/Cas9
pk15
细胞系
原文传递
题名
猪miR-22前体上游序列突变的PK15细胞系构建
1
作者
丁兆雪
王佳洁
沈中浩
周晓龙
杨松柏
金航峰
赵阿勇
汪涵
机构
浙江农林大学动物科技学院·动物医学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第9期1849-1855,共7页
基金
国家自然科学基金(31802030)
浙江农林大学国家级大学生创新创业训练计划(202010341041)。
文摘
猪miR-22前体上游序列片段突变可能对miR-22的表达起到重要调控作用,为进一步探究其功能,基于CRISPR/Cas9基因编辑技术,通过针对猪miR-22前体上游序列片段设计2个靶标sgRNAs(short guide RNAs),构建重组表达载体pX459-sgRNA1和pX459-sgRNA2;随后将重组质粒转染猪肾上皮细胞系(PK15),经嘌呤霉素初步筛选后,提取基因组DNA,通过PCR及测序鉴定编辑效果;最后,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测编辑前后miR-22相对表达量的变化。结果显示,81个阳性克隆中,共产生6种突变类型,突变率达60.49%;qRT-PCR检测显示,编辑后miR-22的表达量显著下调约50%。本研究成功获得了miR-22前体上游序列突变的猪PK15细胞模型,为今后猪miR-22的功能研究提供了新的可应用研究对象。
关键词
猪
微小RNA
突变
CRISPR/Cas9技术
pk15
细胞系
Keywords
pig
microRNA
mutation
CRISPR/Cas9 technology
pk15 cell line
s
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
一株内源性猪细小病毒的分离与鉴定
被引量:
12
2
作者
李昌文
仇华吉
童光志
田志军
王玉春
韩孝成
刘红全
董齐
机构
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 兽医生物技术国家重点实验室
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
2000年第S1期90-93,共4页
文摘
本研究从不明病毒污染的PK15细胞培养物中分离到了一株猪细小病毒,从形态学、血清学、分子生物学几个方面对其进行了鉴定,同时克隆了该毒株VP2基因,并测定了其核苷酸序列。将该毒株命名为SY-99株。
关键词
猪细小病毒
内源性病毒
pk15
细胞系
VP2基因
Keywords
Porcine parvovirus
Endogenous virus
pk15 cell line
VP2 gene
分类号
S85 [农业科学—兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
利用CRISPR/Cas9技术构建PERV敲除的PK15细胞系
被引量:
1
3
作者
蒙红毅
张健民
李黎
高毅
机构
南方医科大学珠江医院
出处
《生物技术》
CAS
2018年第6期513-519,525,共8页
基金
国家重点研发计划项目(“基于hiHep/HepGL细胞和ZhJ-Ⅲ装置的混合型人工肝系统的构建与开发”,No.2018YFC1106400)
国家自然科学基金项目(“仿肝板结构肝组织三维培养回复并维持肝细胞极性的机制研究”,No.81470875
+5 种基金
“体细胞核移植培育CRISPR/Cas9技术敲除PERV基因克隆猪的研究”,No.81701580)
广东省科技计划项目(“ZhJ-3型生物人工肝系统组织工程构建与转化研究”,No.2015B020229002)
广东省自然科学基金项目(“生物人工肝应用基础研究”,No.2014A030312013
“纤维支架循环灌注大规模培养系统激活Rac-Par3通路重建并维持肝细胞极性的机制研究”,No.2018A030313128
“抑制mTORC2信号诱导肝细胞癌自噬性死亡的机制研究”,No.2018A030313214)
广州市科技计划项目(“人肝细胞特异性支架材料的优化和开发”,No.201803010086)
文摘
[目的]利用CRISPR/Cas9技术对猪内源性逆转录病毒(PERV)进行编码区的大片段敲除,获得PERV敲除的阳性PK15单克隆细胞系。[方法]通过对巴马小型猪基因组进行高通量测序,获得PERV高度保守序列,再根据CRISPR/Cas9的构建原理,设计2个gRNA,并将其同时整合入含有PB转座子的可表达Cas9蛋白的载体中,即PB-CAG-2×gRNA-Cas9载体。然后以电转方式将打靶载体转入PK15细胞中,并通过药物(G418)筛选方法筛出单细胞克隆。通过PCR鉴定,挑出阳性克隆,并将其传代扩大获得细胞系。[结果]酶切、测序验证了载体PB-CAG-2×gRNA-Cas9的正确性,PCR结果显示7株单克隆细胞系均有约3600bp的PERV大片段敲除。[结论]构建了PERV敲除的基因打靶载体PB-CAG-2×gRNA-Cas9,并利用该载体成功打靶获得了7株PERV大片段敲除的PK15细胞系。
关键词
猪内源性逆转录病毒(PERV)
基因敲除
CRISPR/Cas9
pk15
细胞系
Keywords
porcine endogenous retrovirus(PERV)
knockout
CRISPR/Cas9
pk15 cell line
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪miR-22前体上游序列突变的PK15细胞系构建
丁兆雪
王佳洁
沈中浩
周晓龙
杨松柏
金航峰
赵阿勇
汪涵
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
2
一株内源性猪细小病毒的分离与鉴定
李昌文
仇华吉
童光志
田志军
王玉春
韩孝成
刘红全
董齐
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
2000
12
下载PDF
职称材料
3
利用CRISPR/Cas9技术构建PERV敲除的PK15细胞系
蒙红毅
张健民
李黎
高毅
《生物技术》
CAS
2018
1
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