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1个含有SDR结构域PKS/NRPS基因的克隆 被引量:1
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作者 原晓龙 李娟 +1 位作者 李云琴 王毅 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1247-1253,共7页
聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中... 聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中分离得到1个PKS/NRPS基因(命名Bbpks2),利用生物信息学分析对其功能进行预测并检测该基因在以6.0 g·L^-1麦芽提取物和3.0 g·L^-1酵母提取物为基本氮源培养基,7种碳源添加物和以1.8 g·L^-1麦芽糖和6.0 g·L^-1葡萄糖为基本碳源培养基,4种氮源添加物培养基上的具体表达情况,其中每种添加物含量为4.0 g·L^-1。结果显示:Bbpks2基因长度为12 051 bp,编码4 016个氨基酸;其结构域组织顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR,是一种含有SDR结构域的PKS/NRPS;系统进化分析发现,BbPKS2与球孢白僵菌JEF007菌株(PMB64475.1)、头状虫草Tolypocladium capitatum(PNY25600.1)等的PKS/NRPS蛋白聚在同个分支中,可能参与一种聚酮/非核糖体多肽类化合物的生物合成;比较不同氮源、碳源添加物对Bbpks2基因表达的影响,发现该基因在添加了乳糖的培养基上的表达量是其他碳源添加物的3.4倍以上,添加了牛肉浸粉的培养基上表达量是其他氮源添加物的1.3倍以上。该研究为下一步通过异源表达鉴定Bbpks2基因的具体功能,及其调控机理研究和基因资源利用奠定基础。 展开更多
关键词 森林保护学 球孢白僵菌 杂合pks/nrps 生物信息学分析
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球孢白僵菌Bbpks1基因的序列分析及其最佳表达培养基的筛选
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作者 原晓龙 李娟 +1 位作者 李云琴 王毅 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第4期423-428,共6页
采用基因组挖掘的方法从球孢白僵菌基因组中获得了一条杂合PKS/NRPS基因(命名为Bbpks1),通过生物信息学分析预测了该基因的功能,检测了该基因在不同碳源、氮源培养基上的表达情况.结果显示:Bbpks1基因长度为11838bp,编码3945个氨基酸,... 采用基因组挖掘的方法从球孢白僵菌基因组中获得了一条杂合PKS/NRPS基因(命名为Bbpks1),通过生物信息学分析预测了该基因的功能,检测了该基因在不同碳源、氮源培养基上的表达情况.结果显示:Bbpks1基因长度为11838bp,编码3945个氨基酸,其结构域顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR;BbPKS1蛋白与布氏虫草、半翅轮枝菌、塔宾曲霉等真菌中的杂合PKS/NRPS蛋白序列(GenBank登录号分别为OAA40809.1、CEJ94083.1、OJI88893.1)聚为一个分支,且与参与细胞松弛素和伊快霉素合成的蛋白的亲缘关系较近,可推测该基因在球孢白僵菌中参与2,4-吡咯酮型化合物的合成;Bbpks1基因在含有乳糖、肌醇碳源的培养基上表达量较高,在以麦芽糖作为碳源的培养基上不表达,在含不同氮源的培养基上均大量表达. 展开更多
关键词 球孢白僵菌 杂合pks/nrps 聚类分析 基因表达
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粤蓝链霉菌代谢产物的抗菌抗肿瘤活性及相关基因的初步研究 被引量:5
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作者 邓名荣 郭俊 朱红惠 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2010年第3期367-372,共6页
粤蓝链霉菌(Streptomyces vietnam ensis)是新近报道的物种,能在多种培养基中产生水溶性紫罗兰蓝色素。本研究发现发酵液乙酸乙酯粗提物对革兰氏阳性细菌有较强的广谱抗菌活性,对部分革兰氏阴性菌也有不同程度的抑制作用,TLC生-物显影... 粤蓝链霉菌(Streptomyces vietnam ensis)是新近报道的物种,能在多种培养基中产生水溶性紫罗兰蓝色素。本研究发现发酵液乙酸乙酯粗提物对革兰氏阳性细菌有较强的广谱抗菌活性,对部分革兰氏阴性菌也有不同程度的抑制作用,TLC生-物显影试验进一步表明,两个蓝色组分B1、B2是主要的抗菌活性成分;同时,粗提物在20μg/mL的浓度下对HeLa细胞的生长抑制率达96.7%,显示了极强的抗肿瘤活性。利用简并引物扩增PKS/NRPS基因保守区域,获得相关序列4条,其中两条所代表的PKS基因簇有可能是粤蓝链霉菌产生次级代谢产物的重要途径,这些新基因的发现为组合生物合成提供了更多的基因资源。 展开更多
关键词 粤蓝链霉菌 次级代谢产物 抗菌活性 抗肿瘤活性 pks/nrps基因
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Molecular Evidences for the Biosynthesis of Pederin by Endosymbiont 被引量:1
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作者 LIU Zhi-ping WU Xuan +1 位作者 WANG Jin-jun HUANG Fang 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2009年第11期1339-1350,共12页
Pederin belongs to a group of antitumor compounds found in terrestrial beetles and marine sponges. It is apparently used by some members of the rove beetle Paederus as a chemical defense against predators. A recent cl... Pederin belongs to a group of antitumor compounds found in terrestrial beetles and marine sponges. It is apparently used by some members of the rove beetle Paederus as a chemical defense against predators. A recent cluster analysis of the putative pederin biosynthesis gene (ped) strongly suggests that pederin is produced by bacterial symbionts. This paper reviewed the criteria for proving symbiontic origin of bioactive metabolite, indirect and molecular evidences for pederin bacterial origin, as well as three sets ofped clusters and putative biosynthesis process of pederin. 展开更多
关键词 pederin pks/nrps ENDOSYMBIONT
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