联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模。该蛋白是一个...联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模。该蛋白是一个主要为α+β结构的亲水性蛋白,预测其具有一个蛋白激酶C的磷酸化位点,一个N豆蔻酰化位点和三个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。Pla a 1具有较强的信号转导作用,且与拟南芥的果胶(甲)酯酶抑制剂在进化上具有较近的亲缘关系;所预测的三维结构基本能反映出Pla a 1真实的空间构象,这将为今后进一步理解和掌握Pla a 1结构和功能上的关系打下理论基础。展开更多
[目的]预测Pla a 1抗原的免疫原性及B细胞表位。[方法]联合运用多种方法预测Pla a 1的二级结构并预测其表面特性,如亲水性、可塑性及抗原表位。[结果]该蛋白是一个分子量约19 kDa,pI值约8.7,主要为α-螺旋的结构紧凑的球形蛋白。预测其...[目的]预测Pla a 1抗原的免疫原性及B细胞表位。[方法]联合运用多种方法预测Pla a 1的二级结构并预测其表面特性,如亲水性、可塑性及抗原表位。[结果]该蛋白是一个分子量约19 kDa,pI值约8.7,主要为α-螺旋的结构紧凑的球形蛋白。预测其亲水性区域:32-42,55-59,76-78,88-89,92-98,110-112,118-127,140-151,157-163;预测其可塑性区域:28-40,49-57,76-80,87-98,109-114,121-125,137-139,144-151,154-162;预测其蛋白质抗原表位区域:29-42,49-60,75-78,86-100,107-114,116-130,134-152,156-164;预测其转角结构区域:39-42,51,55,88-89。[结论]Pla a 1抗原蛋白具有较强的免疫原性;其主要的抗原表位集中于29-42,49-60,86-100,而这些预测结果为进一步寻求梧桐花粉变态反应的防治方法提供了依据。展开更多
文摘联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模。该蛋白是一个主要为α+β结构的亲水性蛋白,预测其具有一个蛋白激酶C的磷酸化位点,一个N豆蔻酰化位点和三个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。Pla a 1具有较强的信号转导作用,且与拟南芥的果胶(甲)酯酶抑制剂在进化上具有较近的亲缘关系;所预测的三维结构基本能反映出Pla a 1真实的空间构象,这将为今后进一步理解和掌握Pla a 1结构和功能上的关系打下理论基础。
文摘[目的]预测Pla a 1抗原的免疫原性及B细胞表位。[方法]联合运用多种方法预测Pla a 1的二级结构并预测其表面特性,如亲水性、可塑性及抗原表位。[结果]该蛋白是一个分子量约19 kDa,pI值约8.7,主要为α-螺旋的结构紧凑的球形蛋白。预测其亲水性区域:32-42,55-59,76-78,88-89,92-98,110-112,118-127,140-151,157-163;预测其可塑性区域:28-40,49-57,76-80,87-98,109-114,121-125,137-139,144-151,154-162;预测其蛋白质抗原表位区域:29-42,49-60,75-78,86-100,107-114,116-130,134-152,156-164;预测其转角结构区域:39-42,51,55,88-89。[结论]Pla a 1抗原蛋白具有较强的免疫原性;其主要的抗原表位集中于29-42,49-60,86-100,而这些预测结果为进一步寻求梧桐花粉变态反应的防治方法提供了依据。