猪PLE1基因启动子克隆及序列分析

通过巢式PCR方法获得猪PLE1基因5′端上游启动子序列,通过T/A克隆法对PLE1基因的启动子进行克隆,并对PCR鉴定为阳性的克隆子进行测序,参考人、啮齿类的羧酸酯酶家族的启动子结构,并利用启动子在线分析软件对其进行生物信息学分析。结果成功克隆得到PLE1基因5′端上游1 153bp的调控片段,分析表明该调控区没有CpG岛,也不存在典型的TATA盒结构;有2个转录起始位点分别位于翻译起始密码子ATG上游-39bp和-37bp处,潜在的转录因子结合位点有C/EBP、Sp1、USF、CdxA、GATA-X、GATA-1、GATA-2、GATA-3、MZF1、AML-1a、SRY、Nkx-2、Lyf-1、deltaE等。另外还发现了7种基序分别为EGF_1、INTEGRIN_BETA、CTCK_1、ANAPHYLATOXIN_1、THIOLASE_3、TUBULIN、VWFC_1。研究结果可为进一步揭示PLE1基因转录调控机制提供理论参考。